Map Locations of contig_140988 (6706 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_140988

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_8049 1 606 bp AK355092 Not available Available None
MLOC_8050 1 974 bp MLOC_8050.1 Available Available LOC_Os11g10510.2, FRAME:+3, EVALUE:1e-82, 13111.m09210 protein dehydrogenase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_8049






CDS Structure of MLOC_8050






Contig Sequence (6706 bp)

>contig_140988 6706 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGCGCATAGATCAAGGGCCCGGTGGACCGTTGGGCCCACGCGGAAGAGATCAACCTAAC
ACTCGAGTCTCGACGCAAATATAGTTTGATCATTGTGAGCATTGATGTGTCTTTCTGCTT
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ATGTTCACTGCGCAAACACAAGCTCAGAAGATCAACACAAGAATGGCGCTCACCAATCTG
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GCCAACCTGCGCCAGTCTTTTGTCAACGCCGCTTCACGCGGACGTG