| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
 |
 |
No map location |
Predicted Genes from contig_140688
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_7963 |
25 |
6475 bp |
MLOC_7963.10 |
Available |
Available |
LOC_Os02g55410.1, FRAME:-2, EVALUE:7e-82, 13102.m06352 protein MCM5 - Putative minichromosome maintenance MCM complex subunit 5, expressed |
CDS Structure of MLOC_7963
Contig Sequence (11083 bp)
>contig_140688 11083 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCGACCGGTCGACCATAGCGGCACCGTCATCGGTTTATCATCAAACGTTTTTCGGTGTT
TAAAACCCTTGTGTCGGGCCGCAAACCTCCCTTTCTTCTCAGCCCAACACATCTAAAAGC
CCAACCAGCCCAGCTAACCCTAGGGCGCACCCGAGACCGTCCGATTGCGATCCTATGGTC
AAAATCGGAGTCAAAAACTCTAACACTGGCCCCTTGTCTATAAATAGACACCCAGATCCA
GCCTCTCCTCGTTTCTCGTGCCCCCAAACCCTAGGTGCCGCAGCCTCTCCTCCCACCTCA
GCCGCCAGGCCGGCCAAGACACAGATTCGACCCTCTTGGGCCCGAAGGGTGACAACAGCC
TCTCATAGCCGCTCCCGCAGCCGTGCTCCACACCAAAGGCAGCCGCCGGAGCACGTGCCG
CAGCCGCTACCGGTCCCGTGCGCCGCCCCGCGCAGGGCCTCCCTTACTCCGCCGCGCTCA
GCCAGACCCGCAACACCGCCGCTCATAACACCGGTTGCCTTGTCAGCCCAACTGCCGTCT
CCTGAGGTGCCCCGTGCCACCTCGCTCCATTGTCGTCGCCGAGATCCACCTCCGCCGCCA
AGATCCGCCCCCGTCGAGGTCCCGCGCCCGGATCTCGTCAGATCCGTGGGCTTTTGCCCG
TTCCAGCCAGCCCTGTCACCCCTTGCTCTCCACCATGGTTTCCTCGCTGCAGTCTCGCTC
GCCAGCCTCGCATGGGCTGTCGCTGCCGCCGACCCAGCTGGTTACCTCGCGCCATGCCGC
GACCCATCGCCTGGCCCGGCCCCGCCTGAGCCACTACAGCAGGCCCAGCCCAGCGGCAAC
CTCCTCCAACCACCCAGATCTGGCCCAAGAGACCAAGGGTGATCGCCCTCGCCCCTATCC
TGTGCCTGGGTGAACTTTTGCTATCCAGCGCTCATCAGATCCGACCATAGTTGTTTTTAT
TTAACTTGCGAATTTGCTAATTTCAGAAAATTGCATTATTTTAAAACGCCTGCACCTTTT
AAACCGTGCATCGGATCGTAATATGTTTTATATGTAAAACATGTAGAATTTCGTGCAGAT
TAACATTTTCAAGCTTGAATGGGTATTTAAAAATGTTTGACCTGCTTGTTTGCATAGATT
TGCCTGCTATTATATTAAGACGTATTATACTATAGCTATTTAAGCATGCATCCGATTTAT
CAAACCTAGTATGTAAAATGTTCATGTTGTTTGCAATGCATTTCCATGCATGGTAAAATA
GTCATCTCGTTGTTTTCATGTAGGTGGCATAAATAGTTTGCTATGTCGGGTTTATGGCAT
ATTCTCGCATATATGTGGTGGCATTGGTTTTATTTAGAACCCCAATATTATGTATGTTTT
CAGGGTAGAAAAATACATATAATTTATCTGAACATTTAGTTTTGTCTTTGGAGGAAGTTA
GCGAGCATGATATTTTGCCATGCGACCCTTCGGTTTAATTCGTGTGAATTGTTCCGTCTG
TTCGTATGAATTTGTTTTGAACTTGGGATATGCCCTTGGATATGTATGCTAGCCCCTGGT
ATTTTTTGTTGCTATAGATATCCATGTTTAGGTGTTCTATTCTTGTTGCCAACATGCTAG
AAAATAGTGTTGATTTGAGATGGTGAAATATTTCTAAGCCTGGAATCTGTAATATTTTGT
TGCTGTTTTGCCACGAGATTTTGTAGTGATCCACAGCCCCTTTGGGGTTGGTGCAATGGA
GTTACTTGTAGTGCTTAAGATTCGCTAGCATGTTGTAAATTTTCATGCCATTCGATGCCA
TGTAGCATATAGTTTTACTGCTACCAATATGCCGTCTGGTTAAAAATTGCACTGTCAAAA
CTGTATTTTCACAAAGTCTGAAATTGTGTGCAACTTGCCATTTTATGAGTTATTTCCCTA
CACTACACCACGACACTCCTTCCCCTACAGATGGATCGGTTGGGAAAACAACTTCCGCCA
ATAGACAATCGGTCGGGAAAACTATGGCCGACGAAACGGTCTGTTGGGGAAAGTCCAAAC
GGGAAAGACCTTTCCCGACCGACCTATTCTTACCGATCGACTATTGGACAGCTATAGGAA
ACATTACTGACCGACATGTTGTTCGCACTGCCTTGGACCTTTCCCAACTGACTTGCTATT
ATGAACTTTTCCCGGCCGACTATTCAACGACAATACCTTTACCGACCAACTTTCTGTTGG
CTCTACCATGAACATTTCTCGACCAATAATCCGATGGTATAATTTTGACAACTAACAATC
CGATGGTATTAGTTTTGCCGACCAACTTTCCAATGGCCCTACCATTAAACTTTCCCAACC
AACTATAGAATGGTGTTTCATTTTGCCGACCAACAGTTTGTATGCATTTTGCCGATTGTA
TTTGGCATATTACCTTGTCAAAACAATATCAATCAGGTTACATTTCTCATTAATATCTAT
CAAGTTACAATAACTTGTAAGTACTCTGGAAATATTAAACCAAAACTAAACAAAAATAAC
ACTAATAATGCCCATAATAAAGGTAAGTAAGTAAAAGGAAACATTTGGCCGTTACAGAAT
GATAGATCCGTTACCAAGACATTCTTTACAAAATGATAGCTACGAGATCGATTTTTTTTA
CACCATTACAGAAGATATCTAGTTGACTCTAAATAACAACATCATGGTTCCCTTCATGGT
CCTCTTTGTCTTTAGGAAGTGTTGAACTAAGAATAACCAAAGTTGAACAGGAGACGCGAC
CCAAAGTTTTGAGAAATAGTTGGATGATTGAACCATTTCGTGACTATGTTCTTGTGATTT
ATATCACAGGAGGAAAGAAATGTTCTGGACCGAACGATTTATGTCATTCTGTCAAACTGG
AAATAATTCATGTCGGGGTGCACAACCAGGAACATAAAAAAAGGTTATAGCTATAGTTGT
GTTGCCTGTTACACTCATCTAGTTAAAACTTCAGGACGCTAAGTACAAGCTGCCTTTCAA
GAATGATGGCGAAGAAAATATATATTCTCACGTTTTCTTCCTGATGTCAGCAATACATAC
ATGGACAACCGAAAACAGAATGATATCTTCCGGGTAGCAGCAATAGCTACATGAACACTG
AAAACAGAATGCTATCTTCTTGGTGGTAGCAATACATACATTGGGGATACTACAGTTTGT
AAAATCATGGTATACACTTGGACCAAACACCTCAAAGTATTTTCAAAACTATAACTCTTT
TCTACAAAAGACGACTAGTTTTTTTCTTTCTCTTCTCTTGGGTGGAAAAGACTAGTGCGT
CTGACTATTATATTAATAAATGCATCAGAGAAAAACATATGTACTTCAGTGCCACAAATT
ATATTAAATTAACTCATTATTTTCAGAGAAGCATATGTACTGTACATACAAATCTTCATA
GGTATCAAAGCCAGAACCTAGAAAACATTATGTTACGCATAAGAAAAACAAAGAACATAA
ATACTAGATTGGCCTAGAAACAAGATTCAGAAACAAAGATTACAAATTCGATGGATTAAA
TATAAAGAGAGGAGTAGGATAGAGAAAATGTGGACAAATCATTAGGAACTAGGAATAGTA
CCACACCTAGTCCTGAAAAATAGTGACTCGCCTAACCGAGGCATGGAGCTACTCGTGGTC
GCTCATCAACGGAGGTACCTAGTTGAATAAAGCACATGGCAACAACTTGTACAATTAAAA
AATATCAGGTCATAAAACACATAAATGGTAAATTGCGAACAATGGCATGTTGAAGTATCT
ATTTGAGTCTATAAAATTAGTTTCGTATATAAATCACTCTATAGAGGTTAATTTTAGCAC
ACATCATTCAAGTAAAATTAAATTTCAGTCAGTTAGAACAATCTTCATCTTATCTCGTTA
GACTGCAGAACAGATGCCATGTTGATCTATTGCTTAAATCCAAATATAATGTTTAACTGT
ACCATTTTTCTCTTGCTGGAATTACAGTTATGCAATTGTTCTTAACTAGCAGTCCCTTGT
TCCTTTATCTCACAAACTATATAAGAGTAGATGCTTTACATAAGTATAGCTTGTTAAAAA
TGAAGCTAAAGGTCTACACAACCATCCTTTACTTGAGACGCGTCAGATGCATGCGATGTC
TCCCTAACTAAATATAAGTGTTCCAGGAATTGAACTTCATCAGAAACAATTCAGTCTATC
AAGAATGCACGATATCAATATCGAATAGATTCTAACAGTATAATAATATACCTTGTGGAA
ATCCACACGTTGTTCAGATCCCGCTGGTTAGTAGGTTTGGCCCCCCTTCTTTTGTCCAGG
CACTGCTTTAAGTTAAGTGTTCACCAACAATATTATACAGTTGATGTCCTACAGTTGTCC
ATAAATATATGCAAGTAGGATATAGTACCAAGAAGCAAAAATCAGTATTTGTTATAGTAC
TACGTGCATATTTAAAAGTCTGATGCTACACACAGGGCTGAAGATTCGCAAGCATTGCCA
AGATTATTGTTGCCTTACCAAATTTGTTACACACAGGGCTGAAGATGCAACACCAAGCTA
TGGACAACAATGGTAACAACGGCATGTGACAGCGGCTAGGTTTGCATTTTAAAATCTTAA
CCTTTACATTATGTTGCTACCTATGAAAATCTACTCTATAGGTGGAAGAACATATATCAT
ATAAAGTGCGAAAACTGAACCTGTACACTCTGTTTAAACTTTAAACTAAAAAATGAACAT
CTACATATATTTAGTGTGAAAACTGAATATATGCCAATATTCAGTACATAAACTGAATAT
GTATGCGAGTACATAAACTAAAAATATATGCTCATTTTCAGTGTACTAAGTGAAAATATT
CAGTGGTTAAAGTGAATATGTATGTCATCGTTGTGTCTAAAGTTAAAACTTTACTTTATT
TTAAATTAAAAAACTGAACATTTGATGATATTCAGTGCAAAAACAGAATGTATGGTATGT
TCAAGTGCACAAACTAATGATTGACTTTTTTATATACAAAAACTGAATATACATGTGTGC
AAAATCTTTACATTAACTCCGCATAAGTGCAAGCGAAGAACATTTACTCTATTTATGAGA
AAAAAATGAATATATGCTCTGTCTATGTGAAAAAATAGAATCAACATTGGCCCCAAAGCA
TTTTCTAGACTAAACTCTACTTATAATCCAGTTTATGGCCTAAACTACGCAGATTTGACT
TCAATGAGGATGAGGATGAAGATTGCGCCTCCAATGTTTATAGTTGAGGCCGATCTGTTG
CTGGTGAAAGTGGAAACAAGAGCTGGCTGAACCTACAGCCGAGCTGACAGCCAAATGCCT
TGATTATCTAGACGAACATGCACCTGCTCCATCCAAAAAACGTAAATTGCATCAAGGAAG
GGAGGGGGAGGGGAGAAGAGGAATGGAAGATGGATCTTAGAAAGAGTACTAGAGTCTGAG
CGGCGCCCCCAAATAGTCCATAGCATGGGCAACGACCGGCGTGTGAGCATCTTCGTCGAG
GCCCTTGACGACGGTGTGGATCATCGATCTGGCTGCCGCCTAAGGTGAGGAAAGGAGGGT
TGGCATGGAGCAGGGAACCCATCTCCTCCCTCACGAACAACCGCGTCGACAGAGGTAGAC
CTAGGACTCCTTGCTCGATGTCTCTCCTCTATTATCTTGTGATGAGGGGAGGTGAGGGGG
AGGGGGGAGGCGGGTGTGGGTCTGGATTATGGTTGTGGGGGAGGCCATGGTCGTTGTGAG
GAGACGTGGTGGTGGATCACGGCGCCTACGAGAGGAATTTGTGGCTGCGTGGAAAGGAGG
GATAAGATGTGTTTGAGCCAGAGGGATTAGGTTTTGGAGCGGCGAAGGAAAAGAAAATGA
GGGAGGCTTCGTGGGCTAGGGAAAAAAGAGTGCCACTACTTAAACTAGTAACCATGCACG
TGCATGCGCACGTGTAACCATAGGACCAAAGAATGCATTTTTTTCACGATATTTACTTCA
TGTTTTCAGTAAAAAATGTGTATTGACACTTGTATTGCCTTGTATACATGAGCCATTCCC
CGTCTCAATGGCCAAGGGACGGCTTTCACAACCGTGCCTACCAAGTAGATACGGTAATTA
GAAATGACAAAACCCAGATTTTTCTTATAAATAGTGAATAACAATTAATAATTATGAACT
ACACACGCTTTTGAACCGACACTATGGTTGACATACATATATACAACCTCTCAATATATT
TAAATTTAAAATGATCTAATTTAGAAAGCCTCTGGTATGAATTTAGCATAGTGCAATAAA
TATACACATGAAACATTTTATTTATTTGTAAACCACAATGTCATAGTTTACATTAAAATT
ATCAGCTTTGTTTTTTTGCAAGGTACAAATACTACAGTAGCAGTATATATATACATGTTT
GATGATTGTTTCTTCTTTCAAATCAACATCTCCGATTCTTCACAACCTACTGTACAATGT
AAAAGAGTTAGTAAGAAGTCCTAGAAATGAAAAAAAATACTCCAAATTCACGGAAGAGTT
CATAACAAAAACACTCTAGAAAAGAAAGATCAACAAGAAGATTAGGTGTACACCACTGGA
TAGACTGGATAAAGTAATATCTTATGCACACAGATCGCACAAGTCTATACATCAAAGTTA
CCCCAAACAAATGTGTAGCCGTCTTACATATCTCTCAACAGAACTGAAGTTCACATGTTT
CTCCTCTAGCAAAATATCTTCCTTGTTGTATTTGTTCCAGTCTAGACCTCGTCGCTTTCA
AAGGTACGAACAAAACAACTGCAAAACATAATGGTGGCACAGATGATGATTCATCATCTA
CATATTATAAAGAAAGAACGAAGGAGAGGCAGTGGTGACTTGTCGGATGCGAGGTGTGGA
CAACTTGGGCAAGTCGTCGTGCAGCCATGGGGCATGGTGAGACAGCAAGCCCAGGGGCGA
GTGCCATCGATCGGGCATCCTATGAGTAATAGCGACTTACTTCCATGTTGGGTCGTCCGT
TTCACATAGCTGGATGCAAGGAGCACCGCTACTGGGTGGCTGAATGTAGGGATCGATGGC
GTCCTACGTAAAATGAGGCCTGGATGTAATCTTAAATAATTTCATCTGCACGTCAACTAA
AATCAGTGCCCAAAAAGATAAATCAAAGTTTAGATAGAATAAACAAATACTGAAATAGAT
TGGCCGCAGTGAAACTTGTTATGAATAAAAAACATTAAGAGACTTTCTTGATAAGGTAAT
AATGGTGTAGAACAAGATAGAGATATTGCACGTCCTAGATTGAACAACCAATTCTTACGA
GATCTAAATACCCTTTTGATAATCAACTAAACCTAGGAACAACAACTAAAGGATCTTTGG
CCACTAATAAATACAAAATGAAAATCTAATAAATGAGTACAGGAGAAGGTGTAACCTTGA
AGAAGATGCTGAATGAGATGTGAAACAACGCCATGTATCCTCTGTACAACACAAAATTTA
TGTAATAGACACGTAGATAAAATATCAAACACTTGGTGTGCAAAAACAAATACCGTTAAC
CATCAGTTTCTGCATATTCATAAGGATATATAAGTTCAGTCGCTCTCTACTTCCGATCAT
CTGATAATCCATGTGATATGAATACCTGAACTCTTTACCTTGCCACGGTAATTCCAGATG
AGCAAAAAGTTAACAGTGGCTTCAAGCTTTCAGGCCTGTCACTCAGCTAGTCATCTTTGA
AGATATAAATTGTAGAGAAAGTGCATCCCATTCCATTGGGTTGTCATCCTTGTCCCTGAA
ATTGACATAAACAGACCACATTTTTCAGATTCACAATTGTACTCATCAGACACATCTCTG
ATTCATGTAAAATCTCGCATTATATTTGATAAGACATAACGTTTCTCATCATATAAGGTC
TCTTTGAACTTGAGGTATTGTGTTGGTGTAATTTCGTCGACTTACACACTATTTGAATGT
TCTTCGACGTATTCCAAGATTACATGATTTATTCAAACACCAGAAAAATAAAATACCAGG
AAAGCAGAGAACGTCGTTCTGGGAATGAGGTTACCACTGGGAGGCCCGTGCTAGGAGAAT
GGGTGTACCTCTGTAAATGCCCAAGCAACAAATATGCAAGTAGGTTCTGAAACATACTTG
GTTGTCCCAGATGCTTGGAATACGTTGTATATGTCAACCACAGTTAATCTAGTTCCTGGA
ACAATTGTGTGAACAAGATGTCTGTCTACAGAAAGCAACACATTCCGTGGAAGCTCACCG
GTTGGAACATCCTGGAAGATGGTATTAACAAAGATTGATGATTATTGACATGTTACAGTA
GTTGGCAAGTGAACATCCTATAAAAACGAATTACTGCGCAACTCAGCATTTCTGCAGGGA
GCATAATAATAACCTCGGGATTTTCCTGCAATTTGAGAGTCTGTAGATCCACATACTTGC
TCTTGTCAGGGACTGCAATCTAGGGGTCCAGGGGCAAGGCTCTTCTCCAGGCTAAGGAAA
TGAGAAAATCAGATACATCAGTACAACCACCATTAACAATAGAAAAACTAAACATCAGTG
CAATGATTGAACATGATTACTGAGAAATATACCTGAGGAACATGATCACACGACCGTGGG
ACAATAGCGCCACCTAGCGCACAGCAAAGTCCTCACACTCATGCAGTTCTTGCAGAGCAG
AGTCACATGAGTGGCCTTGGCTTTCACCCTCGAAGCGGCACTTGCAATATCCGCAATCTT
CACCAGTTTCGACATGTAATCTGCATGTACTATTTTTTTGTTGGTTGTCAAAATGGAGTT
CATAAAACTCTCTGAAAATCGGCTAATTTGTAGAATTGGGTTCAGAACTGACCCCAATAG
ATTTCATGGAGACGCAATTCTCCTTGGAGGATAGGAAGATCTGCACATCGCCGGTGACAG
GCTCCTCCATTTCCCAAGTCTCGCCGGCGACCTTCGACCTAAGGCTGGCGAGAACCTCGG
ACCCGGCCGTCTCAAACTGCATAAACCCACCACATGAATACTTAGAGACAACTCTGAATC
AACAGATAAAAGACAGACATGAAATAGTTTCAGATAATTCGTCAGACAAAAAAAAGGCAG
TTCAGATAGGGCAACACACCAGCAGCAGGTAGTCTGCGGGCGCCTTGCGGATCCTATCGG
CGAGCTCGGCGTCGAGGTCCTCGATGGCGACGGTGACATGGTCGCGGTTGTGCACGAGGC
TCTCGTTGGGGACAGGGAAACACGTACACGGGTCAGCCTGGCCCGATTCGACAACGACGC
CAGATCTGGCGAGGAAAGGGGAGGGGGAGGATGGAGGAAGGAGGGGAGCGATAGCGTGTG
CGCGATGCGGCTTGGCTTCACCTCGTTGTAGATGGATGCGAGGTTCCCAGGCACGGGCGC
GTTGGATGCAGCGCCCCTGTTGGAGGTCGCAGCCACCATGTGACGATGAGCCTGTGAGAC
ACTGCGGGCGACGGAGCGAGGCGAGGGGGTCAGAGGTGGAGCGAGGGTTTGTTTTTTACT
GGCGTGAAATTTTTTCTGGCTTAACAAGTACGACGCGGTTTTGCAGAGTTTCGTCCGCCT
GTGTAAAATGCTAAACGTACTTTCGGTGGATTAGTAGTTAATCTTAACGGTTAGTATAAA
TGAGTTGGTTTGATCGTAAGGCTCTAATGGTTTGATGATTTTCTGTGTATATTAGACAGG
CTGTGCTTAGAAAAGAATATGTTGGATTGTTTAATAGTAGTATAGATTTAGCGCGTGCGC
ATCGATCGCGGGTCAGGCTATTTACCTACTGGTCGTCGGCTGGGATGTTTTGCCGACCGA
CCGTTCATTGTTGATAGAAGTATTGCCGACACACAGTTCGATTGTACATATTCTGGCATT
CTCGACCGACTATCGGTCGCTGTGCATGTGTTTTCCTGACCAACACTTAGTTAGCAGTTT
TCCTAACCAATAGTCGGCCGGCAATAATTATTTTTCCCAACACGCGTCCGTTTGAAATAT
GGTGTCGTGGTGTAGTGCTAGTGATCCATGTTTCCATGCTAGTTGTATTTAGTAGGGTGG
TGTTGTACATCTGGACCACTACTACCACATGTCTTGTTTGATCCTTTTATAATTATGTAG
CTTGTTGTCTCGGGTGTAGAAAATGCCATGTTGCTGTCTTGGGCAGATTGTAGCTATTTC
TTGTTTTGCTTGTAATTATTGAACCTTTGCTCAGTTTGAAACGTGGCATATATGAATCTT
GCATAAAATCTCGTGTAGTTTCGTTATAACTTGCTTCCTTCATGGTTTGGAATGCTTGTG
ATTCTCATTTGCATACATATTGCATTCATGGCACCATATCTTGCGGCGATCATATCTTTT
GAACTGTAGCTTCGTTTGCAATGATCTCTATATGTAAGTCGACTATAATGACTCGAGGAA
TCACGTGAACCTCTTTATCTGCTGTTTAACAAACGCTAAAACATGCTTGTTCATATGTGG
ACATAATTCTAAATTAACTTATGGGGTCATGTCAGAGATGCTATAAGTTGTTTCCGACCT
CATTTGGAATGCCTAGATAGGTAGTTTAATTATGCTTCACCTCGTGCCATGTTTAATAAT
ATTTAATATTGGTGTGTACCGTGCCTTGCATAATTAAACTAGACATGCACCATATGTGGT
GTGCATCATGTCTTGAATATGTGTCGTGTTACCGTGTGTTGATTGTTGTTCCGGATTGTT
TCTTCTTGATAGAATTCCGAACCACTTCGGAGTGTGAGGATTCATACGACTACATCAGTT
CATCTTCTTCACGGAGTCAATCTTCTTCCAACCTGGATCACATGCGAGATGACCATTTTC
CCAGATACCATTACTATCGATGCCATGCTAGTTGTCCCCTTTCTTTTGTTATGTCTCGCT
GCCTACCACCTGTTAAATGTCAGACTCTCAGCATTGCCTTAGAAACCTTCAACCTTTCTA
CAACCTNNNNNNNNNNNNNNTGGCTACGTTACCGCTTGCTTAACAATTTAATAGTGTTGC
TAGTTGCAGGTGCAGTCTCTTCCATGTGATAACATGGGTTCCT
