Map Locations of contig_139411 (3866 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_139411

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_7503 2 1291 bp AK250553.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_7503






Contig Sequence (3866 bp)

>contig_139411 3866 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AATACAAGTTGCATATTCCTAACAACAAGATCTTTGTATCAGCAATTGGGCATAAGCTCA
AAGACCACCTTATGCTTCTTCTCTATAAAATAACATATCCAGTAGCCTTCAAATTTTCTT
GGATCATTAGGAAATTGTGTAAGGAAAATTTGCACTTTTTGTACGTGCAGCCAACCAAGA
TGTTTTTCCTTGAAAAACCCTACTTCCAGCCTAATACGTATTGACCTGACTGTGGAAGGG
ATTCAATATAGTGTTGTAATAGTACCTGCAGATTATTTGATTGAGTTCTAGTTCACAGAT
TTATATGTGATTTCTCATTTTATGTTTACTCACTTATCAGGTGATACTGTCCTTGTGGTG
GATAGCCCTTTTGGACGATTGGGGCTTACTGTTTGCTATGATTTGAGATTTCCAGAGCTT
TACCAATGTTTGCGTTTTAAGCATCAAGCTCAGGTGTTGTGTATTCCACTGTACTGCACT
CAGTTTATAATACTCCCTCCGACAAAGTTGTACTAAAGCTGCGGCAAGTAATATGGATCA
GAGGGAGTATTTAAGATAGCCTTGTATTAAGATGTTATTCATCATACATTCATACCCTTC
GGAATGTTCAGAAATATTGCATAATTTTTGAGTCTTTTCTTAAATTTTCATTTTTTTTAG
GTCTTGCTCGTACCGTCTGCATTCACAAAGGTAACTGGGGAGGCACACTGGGAAATTCTC
CTTCGTGCTCGTGCAATTGAGACACAATGTTATGTACGGAAATCTAACCCTTCTCGCTGC
CCATTGACTTTTGAATGTAGGTTTTAGTTGTTTTAGTTGTTACTTAGCAACATGAGATAC
GATAATATATAAGTTAATGCCAGACTATTAGTACAGATACCTACGGTATTTGTAATTTTA
CACATGAAACACATGTGCAAACTCATCACATCAGTGGAGGTGAATAGTTGGTACATGAGC
TACTTGTTAATCCACCATATATAGGGTTGCCTCTGATTGCAGATTCAGAACAAGTGAGCT
ATGCTTATTTCAAAAGCTTTTGCTTTATGTGGAATTCAGTGAAATATCAAAATTATTTGG
TTGGCTTTCGAAGTTAGGCAACTTAAGAACACTTTTCCAATATTTCTTAGGTTATTGCTG
CGGCTCAAGCTGGAAAACACAATGAGAAAAGAGAAAGCTACGGTGATTCTATAATTATTG
ACCCATGGGGAACAGTTATAGCTCGACTTCCAGGTATGGCTTTTTACTTTGTTATACTTA
GCTGTTACTCTAGATACACCCGTTTGTGTGTCAACTAATTCCGGACGGAGGAAGTACATA
GTAAGTTATGATTCTTGTGTAGAGACTTGGAAGATTATATTGGGTTCTTTTCATGTTTTG
TACCTTAACAGTTAAGAACTATCAACAGTGACTTTCTGTTGAGCTCCTCGTCAGTATTTG
CTTCTTTCATATTGTTCTGCTGGAAAATAGTTGTCAATTTTTTCATGCTGATAATTTTGT
GTTCATTTTTATTCAATATTTTTAAAGTAATGTTCTATGGAACAAGTTTTACAAAGTATT
GCCACTAGTACCCTTTTTTATTGTTGGATGAATGATCTGAATTTTTGCTACAGATCGACT
GTCCACTGGATTTGCTGTAGCAGATATCGACTTGTCAAAAGTTGAGGCTGTGCGAACCAA
AATGCCAATCTCTGAGGTAATAATGTCTCATGTACCATCTGTTTGCTCCGGTCCAGGTAC
TCCAGAAGCTGTATTTTATCCTATGTTTTGCAGCTTCTCTAATGGCTTAATTATCCTATG
TTTTGCAGCACCGCAAGTTTGAGAGCATCTGGAAATCCTCGTCACCATAATAGTTGAAGG
TGGCCTTGTACGCTTCGCTGCTCTTATGCCCACGTTCTGGAGATTCTTCTTTTGTGTATA
ATAACTGCCATTTTGTTCACAAGAGGGTCCAGTTAGATTGGTATCTTCAGTGAGACATGT
CATAGAACAAAATAAGCTACAACTATGGTAGCATATCTAGTAAATATGGCATATCCACAT
GGCTCAGAGCACGTTATGATTGGGTTTGAGATGGCTTCTACCTCAGCTTATGGTCCAGAT
AAATCAAAAGCGGATCCAAACCCAAAGCTTAAGAACAGCTTAGGTTGTGTTTGATTGAGC
ACTTGGGTCTTTTAAGCCAAAAGCTCAACCAAACACCAAATCCAGGGAATTTGATGTTTG
TGTGTATGTTGACATGTACTCCCTCCGTTCCTAAATATAAGTCTTTCTAGAGATTATACT
AGAGGATTACATACGGATGTATATAGACATACTCTAGAGTGTAGGTTCACTCATTTTGCT
TCGTATGTAGTCACCTAATGAAATCATTTAAAAGAGTTATATTTAGGAACGGAGGGAGTA
AGTACAAATGCATGGCAGCAGTACTTGCATGAGTTCATGTCACTTCATTCTAAATATAAG
ATGTTTTGGATATTTCAGTATGGACTATGTATGGATTGAAATGAGTAAACAAACACACTA
AGGGCTCATTTGGTTGCTTGGGTTCTCCCCGGGATCCTTGTGTTTTCCCAGAGCGTGAAA
CTCACGCGGAAGCGTTCGCCAGGGAAAACGAGGCATTTGGACGACCAGTTCGCCGGGTAG
GTCTGCCCGAACCCTGCTCTTTTCCGGGGTAGAGGTCCCATTACTCGACACTCGTGGAGA
ACTTCCCCGCTTTGTTTCCCTCGCACCATCTGGCTATTTTTTTTTTAATATTGCATTTTT
TTATTCATTTTGAAAAATAATGCTCCAATTCGAAAATTTTCAAAAATAGTGCTGCTTCGG
CGTTGGCGTGGCCGACTGGGGCCTGTCGGCCTACGTGCGGCCAATAAGGTGCAGTCAGCT
TCTGTCTGGCCGATAGGGGCCCTGTCGGCCACGTGCCGGCCGATAAGTGGGCATGCCACG
TCGATGAAGCCCAGTCGGCTACGGTCAGGCCGACTGGACCACTCGGCCGGGGCTAGGCCG
ATAAGTGGCCAGCAAGCCGGCCAGGCTCCTCCGTGCCACCTTCTTCCTCCTTCCTCCCAT
TCTTCCTTATCTCCTTTCTCCCCTTTTCTTCCCACACAAAAAATCTAATATTCTTCCTAC
TTACCCATTTTTCTCACATTTTGCACCGTAGTTTTATTGTGTAAGGTCAGAGCAGCCAAA
CCATCCGTCTCACTCGTGATGGGTTAGTTCGTGGTTGTTTTTCTTAAGCTTTTTTTGGTG
CTGGTGGTGATGTGGATGAAGGTGGTTGTTGCAGTGGAGTTGGAGGTTGTGCTGTCGGTT
GCTCGTTCGTGATTATTGTCGGTGTTCGTCGAGCGTCGTTCGTCATTCATCACGCTTCAA
GGGTATTTTTTTTGTTTAGTGAACTAAGTAGTTGAATTTAGTGGGTTACATATTTTTAGT
TGGTTCGATAGATTTATATATATTTAGTTTAGTGAATTAAGTAGTTTAAATATTTTTAGG
TGCTCTGATAGATTTGTATATATTTAGTTTAGTGAATTAAGTAGCTCACAATTTTCTTAG
GTTCTCCCATACATTTGGGAAATATATTTAGGTTTGTCCTTCTAAATTTTTTACCTGTTG
AATAATTTATTAGGTCAGCAGAGATGCCTGATTTAGTGAAGTTATGTTTGCACTATGGTC
CTGGTACTGTTCGAATAAATGAGGTGGAAGTTGATCTTAGTGAATTTCAGTATGTTGAGG
TGCCAGTGTCTTCCCCTAAAACGTGGTCTGTTAATCAGTTGATAGAATGGCTGGCCAAAT
GTTTAGGGTTCAATATTGAAACTCATGCCGTCGGTGTTCATGCATTATGGACCCGGTCTA
GTGCAAATATTTTCTAGTATTTGAAG