| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_138255
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_6887 |
2 |
1866 bp |
MLOC_6887.1 |
Available |
Available |
LOC_Os11g36340.1, FRAME:+2, EVALUE:4e-120, 13111.m03556 protein lymphoid organ expressed yellow head virus receptor protein, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_6887
Contig Sequence (11413 bp)
>contig_138255 11413 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCTATGCTTGTGGGTCATCAATGAGGAGGATGAAAAGAAAACTACTTTCAAGACTCACC
ATGGTCATTTTCAATTCCGCGTGATGCCCTTTGGAGTCACCAACGGACCACCAACCTTTC
AATGCCTCATGAACTCGGTCTTCATCTGGACGAATTGTAATTTTTTCATCACGTTTTTAG
ATGGCATCTTGGTCTTCAGTCAAACATTACAGGAACACGTGGAGCATTTGCGCATGGTGT
TTACCATTCTCCGCAAACATCATTTGTACGCCAAGAAATCCAAGTGCTCCTTGGCGCAGT
CAAGAATTGAGTATCTTGGGCATGTGATTTCGCTGGACGGCATCGCAGCCGATCCAAGCA
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TTGGCCTGATGGGCTACTACCGCAAATTCATGTCGCAGTATGGCATTCTGGCCAAGCCCC
GCACACAGCTGCTGACCAAGAAAGGATTCTTGTGGATAGAACAAGCCCATGCGACATTCA
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GCTTCTTCTTCTCTCCCTAATTTCCCCTTGTAGCTATCGATCGATCCTTCCAGGTTGCGG
TCATTACAGGCCGTGATACGGGGAGGTCCTGGCTGGATCTCGGTCGGTGTCCGGCGCGGA
TCTGATACGCGGGGATGGAGGGCGAGTGCGAGGAAGGTGCGGCAGCTAATGGACTTGGAG
GGGAGGACAACATCGTCGTCAAGGCCCGCAAGGAGGACGTCGCCGTGGCCGCGCCGGTGG
ATGTGGATGGTGGTGATCACGTGGATCTCGCTGACGGGGATGCGGTGGTTGGATCTGCAA
CCGCTGTGGCGGCTCCCGAAGAGCCGGCCAGGGCGCCTACCAAGGTGCAGGGGTGGCGGA
ATTCTGGTTCTCGGTTTACTCCGTGGCATACTTTGGTGCATGCTAATACATTGCTGCCGC
TAACGGTGTGTGTTGGTGTGCGCAGAAGGTTGGATCTGCGGACGCGGGCGGGAGGAAGAA
GGGGAATGTGCTGAACGGCAAGGTGGTGTCAGCCTCGGCGGCACCGCGGGGGAAGAAGCC
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AACTGCAGCGTCCTCTGGTTAGTTTTGGGCTTGTCATTAAGTTAGCCTGTGACGGTTGCT
GTTGGGTTTACATAAATAATGAGTTAAATGTATATAATCCCCTAAACTTTCCGATCTAGG
CTACATCACCCCCTGAACTCCAAAATGGCTTACTTAATCCTCCTAACTTTTAAAAACCAG
ACAAATAACCCCCTAGCCCTCTGGTAAGTGGTTTTTAGAGTGGTTTGGCCTATGTGGGTC
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ATGGCCCTTGTCATCCCGACGCCCGTGCGCAACAGTCCATACCTTTGCCTCAGCAGCGGG
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GGGCTTCCGTACTTCCTCTACCCAGCCTGCAGGGCGCTGTCACCGTGCCAGTTTCAGCGC
TACACTACAAAGCCAACGATTGTCAGCGCTGCCGAGGCGAACATGCTTATCGTGAAGAAC
TAAAGACCACACGGGGCCAATTTCCTGTATGGCGGCCAATTGAACGGTATGGTGGCAGAT
GGGCTCGTCGCACCCGTCGCACGGTCGCCTCAATTGGGTAGAGTGTGAGATCGGTTGCCC
CGTCCTTCAAAAGGTCAACGCGAGTAACACAGCCACTCCAGCGTGGCGCGGCTGACGCTC
TTTCGGGCAAGGTCGCTTTTCGGCATCGTGGATGCGTCCTGGGGGATCGGTGTCACAAAC
GCTGGGTTGGTGCATCGGTGTCCGTCTCCTCGAGCGTGCGAGCTTTGTGGCTGCGGCAGT
GATACACCGAAACACGCACTGTAGGGTGGTTCTGGACAGAGCTGGGCTGGCAAAATCTGG
GGCCATGTGCGAAACTAAAAAATGGGACTCTATCTCACTGCAAAAATGAGTTAACAAGCA
ATTATAGGAACCAAACTAATGTTTTCCACGATAACGCAAATCTGTATTATTGAAGCACGA
GATAAAAAGATGAATTAAATTAAATTGAATTATAAAGTAGCATATATTAATTAGATATCA
TGCATCAATGTTTGGATATTAGACCAACCGTTTAACTTACCTAATTTTGGGTCATGTCCG
GTTGAACTGCTAAACTATGTTCTTTAACCGAGGAGGTAAATGCCGATCTCTAACGAAGTA
ACGATCCTTGCCAAAAGTTAACTAAGAAATTTGGAACTAGGAATAGGAACCGAAGTTAAT
CGAAAAGGAGGACTCGCTAAGCACTTGAAGGCTAGAGCCACGGATCGATCCGACGACTTT
GAAATTTGGGAGAGGAAGGTATGAAGGCAACAACGACAACAGTCTAAATGCGATCGATAT
GATGAGACGAACATGACGAGACGCTCCTGTTCCCTATAGCGACGGTACCCTTTTTAGACT
GACTGTAGCGTTTCCATATTATCGATCGAGGTATTTCCTCCTTTCTTTTGAAAAATATCG
ATCAAGCATATGTGCTTGATGGCCTCGACTTGGGCCCAACTCCAGCTTCCGATTGACTTA
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TTGGCCCCCCCTAAAATTGTGGGTCCTGTGCAAGTGGCACATTTGGCACCATTGTTGGCC
CGACCCTGGTTCTGGATGTGTCACATGAACCAAACGGAAGCGGGTTAAAGCAACGAGCTG
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CATTCCCACCTTTCTACAAGCCTCGGCCTCCACGTAGGCAAAACTAGTGTCCCAAACCAC
TTATGAGGGGCTGGGGGTGGGTGTTATTTGTCTGTTTTTTGAAAGTTGAGGGGATTAAGT
AAGCTGTTTTGGAGTTCAGGGGGTGATGTAGCCGAAACCTGAAAGTTTAGTGGGGTATAT
ACATTTAACTCCATATATAATTGGTGTGGAATTGCAGGACGGGGCATGGAGAAGAAGGCG
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TTTGTTATTTCGGTTATTGCTTTCTATCTGTACTGTACAATAAAAGTTAGTCCACTGTAG
CGTTACACTAATTGATCAATGTAATAAAAACAATTTTTTATCTGAACTTGTTGCTTTCTT
ACACTCAAATGGTTGTCATTCCTTCACAGGTCAAATGAGAACACTGCCAAACCTTACAGA
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TTGCTCATAATTGTTGCTCAGTTATTTTGTATGATGGTGTTAATACAGAATGCTGCCATT
TGGTGTTGTGTTACAGGAGCACCAATACTCAACGCAAGAATGCTGCTGTCTCTGGTTTTA
GTTTCCGACTTGAGGAGCGTGCTGAGAAGCGCAAAGAGGTAACTAATTTCCACAGTGGCA
TTGTGTTAATTAGTCGTTGCATGTTTGTTTCTGTTTTATACTAAGCATGCACTTGTTCCT
TTCTTTCAGTTCTTAAAAAAGCTTGAGGAGAAAATTCATGCCAAGGAGATTGAACAAACG
AATTTGCAGGAAAAATCTAAGGTGAGAACTACTTCCATATAAAGCCTTTTGATCATCTGT
ATGCTTTGATTCTAAGAATTAGTTCACTAGTCTATGTGAGAGCTGCTTTTGTATTATTCA
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TCTTTGTATGGTTCTATTTCCTGTTGTTAGAAGGACGTAGATATGTTACTAACTGTTTGT
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ATGGGCACACTTGTTAGAGAAGATGAGTATGTGAATACACGTTACGAGATCCAGTAAACT
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AGTAAGCTAGGTGTAGTCTGTTCCAAAATGCACTAATAAATTTGAGAATATGATCCGTTT
TGATGCCATATCAGTTCCGAAAAGACAATGTTTTAGCAAGTAAGTCCAGACGCAACTATC
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TTATTTAGCGAGTGTTCTTGTTAAGATTAATTTGTTAGTGGCTTACTCAAAATGCATAAT
TTTAAGATGCATTGTCCACATATGCCTACTTTTAGTAAAAATGTGTAATTCTGGGTATAA
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TTATGCCTACAATATCAACTATATATATCATATGAAAGAATATTTATGATAAATCTGATG
GTATTGATTTGGTATCCTAGATGTTGACAATTTTTTCTACAAACTTGGTCAAAATTAACA
ATTTTGATTTTGAAAAAAATCTAATACGCACTATATTTTCGGATGGAGGAGGTATGCCAT
AATTTCATTGGCTTACCAGTCTTGGAGGGCTTACTGATCTGGTTGTATTCAGTTTCTTTT
TTGCTTTCGATTTCATACAACCTCCGTCCCAAATTACTTGTCTTAGATTTTGTCTAGATA
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AACTAATTTGGAATGGAGGGTGTACTTCCTAATTTTCAAATTTTATTGCACGTTACCTTT
GCACCCATGCCAAGAGTACCACTGAATGTTCAGTGGCTCATGGATAAGGCCCAACACATA
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TGCATTGAAATAACTATACAACTTATAATGCTTCTGCGATACTGACTCGATAGGTCTTGT
TGTTTTGTCTAACAACTATTTAGGATAGTGGATCAAACGGTTTCTTGCTAATCTAGGTGG
CTAGGTTTATGATATATGTCGATGCACATTTGAATTTCAGGATCTAATAACACATTCTCC
ATTGTATGTCATTGGTTCACAAGTTAGATTAAGTTCCTTATTGGTTGATGATGTTTGAGT
GCTTTTTCTCGTGTATATACTGTTACAGTATATGTGGATTGCACTAGCCCTTTCCATCAG
TTCGGATTTTTGGTTGCGTTGGCTAGTGCATGAAGCTTAACATGGTATCGGAGCTCTGGT
CTTGAGTTCAAGTCTTGGCTTTCACACCCCTTTGTGTTCACGTAGAGGCCTCTTGAGTCA
TACGTGAGTTTCGCGTGCCAGTCGCTCTCTTCCGGTTGCACGTGTTGACTTGTTTTCTCC
GTCACACGTGAGAGAGGGTGTTACAGTATATGTGGATTGCACTAGCCCTTTCCATTAGTT
CAGACTTTTGGTTGCGTTGGCTAATGCATGAAGCTTAACATATACAATGTATATCTGCTA
GTTTGTACTAAAAGATGTTAAAAGTGCTCACTGCATGTCCTGTTCATGTAAATATTTGCA
GTGTTACATTTTTTTTTCCTGAAACGAAGGCAAAAGATTTGCCTCGTCGATTAAATGAGA
GGAGAATAGAGTTACAGAGTGTTACAAAAACACCGAGAAAACGGCATGACAATTATTCGG
TGCTACATTCGTAAACATGGTATTCTGATATAAACTTGTGTGGCCTTTTGCAGATTGCAC
CAACACGTGCTAGGTCACCGAAGCTTGGCCGACACAAGCCAACCAGTTCTACTGCTGCTT
CTGTAGATGGCTCTGTCTCATGTGAGAGCCTACGGCGCACAACTAATCCAGCCAAGGTAA
ACAGAGGTGTGGAAAATAATAAACCTAGGGTTACTGTCCAGAGATTGGTCACAAAAGTTC
CCTCCCTAGCATCTACCACTGCAAAGGCGGAAACGCGACCTGTCGCTACAAAACAGAAAA
CCTCCAAGACAAAACCAAAAGTTTCAAGAGAAAAGGTACAGCAGCTGCAAGAGAACCCAG
TAGAACCCCCCCCCTGCTGAACTTTCTGCCTTGGAAGCCCTTGCTGCTGAACCAAGTGTT
GAAGATGAGACAGGACTCGGCTCGACTGCCCCTCCGGTCACTTCAAATGAAGTACTGGTC
CATGGCTGATCTATTGCTCATTTTTTTATTTTTGTCCTTGCAGTCTGTGAATAGTGAGGT
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TCATGTTTAAACTTTTTGAGTTCTTGTGTACATTGAATTTGTACGTCGGCAACATGAATG
CAACTTGCAAAATTCATTTGTGTCCAGAAATTCCTATCTGTTGTCGTTTTTACCATCTTA
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TTGATTTCTCTGATGCGCTGCGTCGACGAAAACAGAGTTCTTTAGAAAAACAGAACTACA
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CCCCTTCCCTTTCCCTCATCCGCTCATTGTTCTCATTTTTCCCCTTCACCGTGCGGCCCA
CCCTCATAAAAGTCTAAACCGGGGTTTGTCGTTTGGTCAAACTCTTTGACCGTTCCTTGG
CGCGGTCATTGAAGCCTGTGGGACGCCCATGTTAGCGGTTGCGTGGTCATAGATGTGGGC
TCTTTAATAGTTACTTAGCGCGGTCATTAAAGCGTGTGGGACATCCATATCAGCAGCTGC
ATGGTCATACATGTAGACGCATATATTGACTTGTGGGACTCCTCCGACGGTGCCCTCTGT
CAGCGGCCGCGTGGTCGTAGGTGGGCGTTCTCACTGACGCGTAGGACACCCATGTTAGCC
GCAGCATGGCCGTAGGTGGTGGGCGTAGTTTTTGACGCGTGGGACCCCAACAGTGAGCCA
ATCTGTTCGTGAGTGCGCAATGGTATGCAGACGCTATCACTGATGTGTAGGGCACCCATG
TCAGAGGTAGCTTGGTCGTAGGTGGTGGACGTAGTTACTGATGCGTGGAACCCCAAAGGT
GGGCCCATCTGTCAACATGTGCGCAATTGTATGTGGTCGCTCTTAGTGATGCGTGCGACG
CCCCTGTTAGCGGGCTCATTTGTCAGTGGCTGCACGATCATAGATGGATAGAATGGGTCA
GAAAAAAGAGATGGTTTATTATCCTAGGAAGTTTACTCGAACTGGAGACCACCACTTAAA
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TTCAAACGAACACCAAGTATTCTTATTCTTTTCCTTTTTAAATCTTTTTATCCAAAGAGT
GGCCTATATTCTTTTGCTCTAATGTTTGCAACAGTGACCACTAATATCAAACGAAGGAAC
AAGTATTTGGAAGCAATAGACAACCACATTAATATGAAATTCAAGTTTATGCAAATAAAA
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GAAGTAGGCATCAAAGCGGTTGGTGAAGTGAGCAAGGAGACCAATCACAATGCCTCTCTT
GGCATGAACCTCTTGTCGGGGAACGTTGCATGAGAAACAAAAAATTTCCTACGTCCACGA
AGACCTATCATGG
