Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_138011 (6639 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_138011

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_6725 5 2837 bp MLOC_6725.2 Available Available LOC_Os09g33940.1, FRAME:-2, EVALUE:7e-78, 13109.m03398 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_6725






Contig Sequence (6639 bp)

>contig_138011 6639 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAGGCCGGAGGGGCGGGAAGGGAGAGCCAGAGAGGGCCGACCGCCGGGCAGCCGACCGGA
TTGGAGGAGAGAGGGAGGGAGAGGGTCGACCGCCGCAGCCGCCGCGGCCCGCGGGTTGGT
TAGGGTTGAGGGCTTGGGGCGGGAGGACAGGGAACGAGGGGGAGGGGAACATGGGGGATT
GATGTTTTGGCGTCTTGGGCTGGCTCGCGCGGGTTACCAGACGCCCTCGCTGGCTCGTTT
TTCTGCCTCGCTGGATTAATATGCCTATTTAAAAAATGAGCGAAAATCTTGGGTATTCTA
GGGAGGTCCAAGGAATACCACAAGTGTCGCCGATGAGTTCAAGTCCTGACTATGGTAATT
TATCAAAAAATGTTGTTGCCCCCCTTTGTGTCCATGTATAGGCCTCTTGGGCCATACCTC
TGAGTCTAATTACGTGTTGACCTCCCGCGTCACAGGTGAGAGGGGGTGTTGAAGTGTATA
TGTGGATTGCCAATTCTTTTTCATCAGTTCAAACTTTTAATTGCGTTGGCTAGTTCATGA
AGCTTAAAACACCTAAGGACATGAGATATGTGATATTTTTGTATGCTCTGTCATAGTACA
TACAACATCTTTATTGAAATTGATGTAAGGCAACGAGACTAAACACATCAGCAAACACAT
CTTCTAAAACTTGCCAACCAAATAAAGGATCGCTACTCACATATGCCGTTTAATATTAAA
ACACCTAAGCTGGGCTCTTGGTATCCTGCTGACAACAATACCTAATGATCCAATAATAGC
AACAACAGTTAAATACTCTACGAACATCATGCGGCAATAAGAATTCAAGAAATAACTAGA
TAATTTGTGCTCACTCACATGATGAAACAGACAGCGCAACCGAAGCGTCACAGAATTTTG
AAATAACAGTCTGGGATTTATCACGACCTTAGTAATCAGCCATAATACCAACAACAACAC
AAGGAGTCAACCTCCGGAAGGTAAATAGCTAAACAAGGTACCAACACGATTAGGTATCTC
AAGAATTCTTATTCAAAGTTGCAATGACTAAACAACTGGTTCCAGCTACCTGCAATTTCC
CGGATTCTGGAGTTTAACAAGGTGGTTTTGCGTCAGGTACCCTACTGTTCTTGCTCCGCC
TTCCTGTGAAGCTCCAGTATCATATTGGCAGCTGCAGAGCACTTCGCCTCGTGTGGGGTA
GGACGAAGACCACCAGTGATGCTCATCTCAAAATCAGGGCATCTCAAACGTACGCTGGCG
TGGTACATTCCTGAAAAGATAGGAAAAGGACTGGTGAAGAAGTGCTCAAAAGTCAAAAAA
CTGGTTATTGTAACCGGCTAATCAGTCTGATCTAAGATGAAGCCTACAAGGGCGCACGCA
TGTCTTCGGTAAGCATTGATTGAATGTTAAACAAACCTAACACTTGGACAGAGCATACCA
TGTGCTAATAAACAAGCAGCCTATTTGGATTGCTACTTGACATTAAAAGAGCAAACCCTG
CCTATTGATCTGACACCTTGAAAACACTTTTCGTCTAAATATGGTTAGCGTAGCACCCTA
TTTATGTTATCAGCACAATGCACAAAACGAACCAGGGCCTGTAGGGATTGAATTCGATAA
ATGATAATCAGGAAGTACGTGGCACAAGACCCATTCATATGATATGCCTACATGGTCCAA
GAACCTAATACTTGCCTATCCAGAAAATCTAAGAGATAAAAGTAAACATTTATACATACC
ATCTGATACTGAAGGTACTACTGTGTATCTTGGGAATATCCAATGGGCCCCACGGCAGAT
CTCATAAAGGTCCTGTAGTGACAAGTGTCAAGGGTACAAGTGGCATTTAAAATTGCGATA
CATAAGTTCAGCTTGGGTTTTCCTACCTCGTATGAATTGTGCCGTAGGAGTGCCTCCCTC
AATCTCTTCCTCTTAGTGATGGATTGGCCACCATCTCCAGAGCAAGACGAATTGGCAACT
TCCGTCATATCTGAGCAAGTTTCCTTGTATTTACTTATTATTGGTACAGCTTTAGGTGTC
ATCTTTCCTTCTGCATAAGTTTCAAAACATGATGAGTACAAGAAATGCGGAACCAACATA
GAAGCAACTTCTTGCTAAAACATTTCAAAAAAATAATCAAAAAAAAATCCTGCCAAAATT
TGCCACAGTTCTGACGGACGATCTGTACGTCACAACGTGCGGCGGACGATTTGTTCACAA
TGAAAAGTGTGATACACCACAGTTTAACACAGAACTTTTGGAAACGTATGGCTCCCAGAA
AAACATGCCCACAGTGTTGACCGCAAAACTGTAACAGTTCTACAGCGTGATTGTAAATGT
AAGCATGTTTAGAATGTGACAAGGGTAGGATACCACTCAAGAGTGTCTGGATGTCCATAT
CACACTGAGCACTTCGTTCTTGAAGTATGCTTTCCTTGCGAAGCTGAAACGAAGAGAGAA
TAGGAGAGTTCACATCTGATTCTCAACTAGAAGAAAGTTCTAGGAAACAAGCATAATTTT
TCCCCTGAAATAAGAGAAAAGACATATAACATACAATTTCATCCCGTATTTTCTGAATTG
ATCGCAGTGAATCCTCTATCTGGTCATCATCGTTGTACTCAGTGGTGCCGCCTTCAATGA
AATTTGGAACACAGATTAAATACTTGGAGGACCAATAACCAATAATATGAAAATAAGTAG
TTTTGTGTAGGTTTAATCGAACCTGGCTTTCCTGACAAATCCATATTTTCGCATTCCAAA
ATGCGGTTCTTCACTACATCAGCATGCGGTGCCTGATACACAATTAGTTCTTCAAATTAA
AGCAGAGTGAACGTATCACACGAAAAACTTGGCCTATACATCACCTACTCATCTGAAACT
GATTTATGAAAAGGATGAATCCTTCTTTTGATTGATTGAGCACAGTGGGTGTGGCTCCTC
TCTTTGTATGGAGATGATTTATTAGGGTGTGGCTCCTAATAATAGGATCTACCAATTGAT
ACTTTCCTAACAACAATAGTTTTTTCTTAACTAATACACTATCCTTAATAAATAGGACAT
TATCCCTTATTTGATAGGAATAGATTGTGCCGGCTTCCCCTCATTTCCCTCATCCTAATA
CCTAACAGAAGTGTGTGCTGTCACACTTTTCCAAACATTCACGTGGCAACATGTGGTAGC
CAAGGAGAAATGCTCTTAAGTCCATGCCACTAGTTGAGTGTGTATGAGAACAAAACAAAT
AGAATAAAGAGCAACATTCATCATGATAACATTTGTATAGACAAGGACAGAACCATACAA
TTTATGTTGTTAACAGTCCGTCATATTTGAAGTTTATTTTGTATAACCATTTTTGAGGGT
GCATGTGATCCTAATGCATCCTAGTATTGTAGTTTTCTATACTTTCAATCTGTAATTTAG
CTTACCTCTGTAGGAAAGACATCTTGGGGCATATTGTCACATTTAGACTGCTCCTGTGTT
TTGTTCTTCTCCACTTGAACACCTAGAGTTGATTGTATCAGAACACAAATAAGGAACAAT
GTGATCAGTAAAATGTAAAGACAGTTACAATGACTAACCCGCTTGTAGGATTTTAGTTTC
TCCACTTGCTGCTGTTGCTGCAGCTTCTGTTTTTCTTGACTTGGTCATGGGTTTTGAAGT
TTCCACCTCAATAACATGTTTTATTGTGGGAATCTCACTATCCGGACTCTCTGCACAGGC
ATCAGCTGCAGCCATGGAGGCTTCAGATTTTCTTTTGCTGCTTTTCTTGTGCTTGCTGGC
ACCAATTGCTTGTTTGCTTTGCTTTGGAGTTGACACTTTTGTAATCCGTTTTTGCAGCTT
AGACGTGCTATTCTCATCTTGCTCTTCCACATTTTCATCTATTACGGAGTGAAATGAACC
TTTTCCATGTCGACGTGATTGCTCGTTTGGTGAAGAACCAGAAGACCATTTCCTGAAACA
CGTGAAGTGTCATATTTACCATGATCGCAAAAAGTTAGTGTCCTACTTTCACGCATAAAT
AACTCACAATAAATCTTATGTTACCTGTGGAGGAGTTGAGACAAAATCTCTTTGTATGGA
AGAATGTGATAGTACTCAACTACAGATGTCGTTTTTGGAAATGGATCATTCACAAATAGC
GGACCAGTCATACTGTGAAAAAGGAAACCGGAAAATGTCAGTATCCTTGAGAAAGGGTAT
CAGTTTTCATCAGGATGTACCATACAATGGTCTTATTTAATAAACTGACTAGTGGTTGAT
AAAAAGGGATGTAACCTAAAATCATAAAACTATCTAGTAGGTAAAGGCAAACCTGGTAAT
CAACTCTTCTAGAGACATTTCCTCAAGGTTGCCTTTCATGGTTTGCCCATACTCCACAAT
GAATACCTTGGTAGCTGCCCTTTCTTTACTCAATGAGTATGCCAAGGTTTCATCAACAAG
ACGAAAGTTTGAGGCCTTCATACCTATTAAGACCGTAAGTTTACCATAGTGAGCAGCAAA
CAATGCATAGTTCGTTCAAACAGAAAATGAACATACTATTAACAAAATCGAGTTCATAAA
TTACAACTTTTGCACTGTTATATTAAAAGAACCAAATAAATAGCATTCTCTAGCAAATAA
TTGGTGGCTATCAGGTCATGTACAACAAGTACAGGGGAATCAACCATTATAGCATCCCAA
GTTATTTTCAATCTTCTAGCTGATGAGACTAAATCAAGTTTCAGTAACTCACAGTTTGTA
CATAACCAAAACAAAGGAGACGGACAATGCGATAGCATTATGGCAAACAATTTAAGTAAT
TATATTTGCTGATGTTCTTGTTTATCCCAAAACTAAATGGTTTTACACTAGTTAAAAGCA
AGGCAGAGGTACTACAGTTTTGCGTACATTCTGGGACTGCACACTTGTTCTTGTTTGCTG
TAAAGCAACTGTACAGCTCAAACTCATTTCTTTGGCTTCATTAGCAGTTCAAATTTTGGA
CAATTTGCATAGTAACTCATGTAAATACTTATTTACCAGAAACTCTGATCCACATTCTAT
AATACTAATAGTCACCTGATCAATGTGAGGAACCTACAGAGACATGGCTCTGTAGGCACA
AAGGTTGCATACTTTATCTCAATGCTCTAGGATGAAAATTAACAGAATTGACCGTATATT
ATCTAATAGAAGCAACACCTTGCCAACTCAAAGAAGAAGAAGAAAATGACAGATATGGGT
ATATAAAATTAAGGGCTGCAATGAAAAATCTGACCTGTTCTACGCTCCACCTCTGAATAT
GCTTGTCGCTGAAGCATAATTGGTGTATGTGAAGCACCAACGTTCCCTTTAGCTGTCGAT
TCCTGGCCTGCTGGCTGGTTCGTACTGTGTGAATTACCAGCTGGCGCATCTAATTCCTTC
TCTATGATTGACCATATACCCTTGGTATCAGCACTATAGTCAACCAAACATTTTTTTCTT
GTCGGGTCGAGAAGAAGCACAGCAACTTTTGATATTTGCCACGTTGTCAAGTCTGGAGAA
TGTTTGCTCGCGTCGAGTTCTTCAGCGATCTCACATGCCTGTAGTGCTGCTTTGTCAGTA
ATAGATAACTTGGCATGCTTGCCAGAATTGTTCTCACGCTCGTGGACCATGCTCAAGTAT
GCGAGCAGATCTTCTCCAACAGAAAGAGAAGCACACTTAAAAAACCGTTTGGCATCTGCA
AAAGCAAGCTGCGGAGACATCTTCCTGTGGTAGTAGTTGTACAAAATGATAGCCGTGTGA
ATCTGCCAAACCACACACCGGTGTGATGAGTTAGCAGGTAAACAGCTACATATGTATTAC
AAGCATTAATTGTATCGTATGCACAGAGGAACGCTGTCTTAAATGTATCTGACAAGAAAT
ACAATCACAAAAACATATTGCAGTGCACGAAAACAAAATTTGCATTTCGTGGGTACACCG
TGGGACATGACCACGAATACCAAAGAAAAGAACACTAACACAATCACAATGCTAAACTGA
CAGGGGTAATGTAGGCATGGCAATGACTTGAATCAAACTAGTACGTCACGCGATCGAATC
CAATTCAACTTCATAGATAGATTTGAAAAATATTGCAAGGTCAAATTGATGGGCAAATAG
TTTCCTGTTTTCAGGGCCATGGCCAGATAATTTCCTCTGAAGTAACGCACAACCAACCTT
TCTGCTTGAGTTGTACAGCACATTTGTGCCGAGCAGTTTGCACTGTCTGAGAAAACAATT
TTACAGAGCTAGCCTCTCCTACTTTCTTCTTCTTCTAGAATACACCATGGAAAGATGCAT
CATTTTCTTAGAAGAAGAGGGAAAACCGGCTGATACAACGTTTTTCGGCCTACGATGCTA
ACCTACGGGATTAGCAACCAAGATTGGCAATTTCTACTGACAATTACGGTGATAGCTGAC
AGGAAAAGTACAGAAACTAAGGCACGATTGCGGCTTGCCTTAGCTCCCTAGCGGCTGCTC
AACCCGCGATGCCGCCTCCCAACCATCCTCCTACGCGGTGCGCTCTCGCCGCCGCTGGCC
GCGAACACGAGAGTACGCCGCACCTGCCGCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCTCTCC
CACTCCGTCGCCTACCGCAGCGCCCACCGCGCGCTCCCC