Map Locations of contig_137467 (17156 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_137467

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_6381 1 1035 bp None Not available Available None





CDS Structure of MLOC_6381






Contig Sequence (17156 bp)

>contig_137467 17156 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATAGGTGCACTAGCTCGGCGAAGAGATGGTAATACAAATGTAGTATGGATAGTATAAATA
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AAAATTTAACATTTAGAAAAGTAAATAACAATACAATTGTTTTCTAGTTAATGAAGTAAC
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GAAACAACTCAGATCGGAAAGAGGCAAGTAAGCAGTCTAAAAATACAAATCATTTACTTA
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CTTATAACGAGTATTTGATGGTCCAGTATAGTTCCAACAAGAATATGTGTATGTCTCGAA
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AATGTATAATTCCATACAAATTTACATGTAAATAAAACTCTTAAAGTTGCATCCTTTTTC
CATTTAAAATATCATCTATTTTTGGTTGATGCGGTAATATACTTTGTCTTTATTTCTTCA
AGATACATAAAGATTGGGCTGATTCTTTAGTGTTGTCTTAATTCTTTTAGAATAACAATC
TCATATGAACATATTGTGTTTATAGTTTCATTCTTTAGATGTGATATCTACCCTTCAAGA
GATTCCACGGTGTACTTGCACAAATTTCTTCACCATCAACATATTCTTGCATTCCAGATG
CTTTGTATTGGGTATGTGCATAACATTTGTATGTTTCCAAGTGATATATCGTAACCTAAT
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AAGACCCATGAGTATCTAATTCTTAAATCGGCACCATAACATCTCATTCAATGTATTTAT
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CCTGCTCCACCTTGTCGTAGAATTTGTCTGGCATTATCGCAATAAGCCATGAGCTCAAAG
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AGTAGCTCTCAACAAACTTTGATAACATCCATCTCTTATCAAGTTGGATTAATGTAAGAA
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TAGCCAGCAGGCCAAGGAGAAGCCCCTCGCCTGGCTTGTGGACAAGCAGCTCGGACAAGC
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TCTTCGTCCGAATAACCATTGTACAAGGATGCCTCAGGCCGTTTATGTTTGCACAGTTTG
TGGCGATGTCGAGAGCAGATTTTTGGTAACCGATGACAGTGACGAACTTGCCTTTGATGA
GTTCAGTGGCCTCTACATCATCCATGTTGGAGTAATCCATGGAGTGGATCGCTGTGCCAT
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GTCCCACGCATAGCACCATGAAGTCCGCCATGTGTGTCTACATATGCCATAAATGATCAA
TATTGACCAATCTGCTGGCATTATATATATATATATATAGGAAAAATGTTTCCTACCACC
CGATGATATATAGTTACCATCACCTGAGTTTTGTATGTTGTATGTAATATCTATTAAATC
GGGAAGTATGTACGCATACTATGTAGTATACGATAATGTGTAGGGAGTATATATATACTA
TCTTTTTGGTATTATGTCTCATATTTTGAGTATTCTCCTTTTAACGTACATATATAAGTA
TTTCATAAATATAATAAAACCATGAGCCAACATGCAATTTTTTCATCTAACCCACTTTGA
AATATCTTATATATAATATATCAACATACATACAAGGATAAAGTACTATATATATACTGC
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TGGCACTATGGAAGCACAAAAGTTTGAAAGAATTCTGAAATCAAAGACGAAGGATGAAAG
AACATTCCAGTTTTCTTGTTTGTAAATTTAATTATGTTGAAGAAAATTCAGGGAAACAAA
TTCGTCATGTTAATTTAGAGGAAGAGGGTTCCTGCCCCAGCTCCATTGTACCCGCATCTT
CACACAATTGAAAAATTAAAGTACCTCTGAAGATTAAGATTTATATGTGGTTTGTTCACA
AAGGAGTTATACTTACGAAGGATAACTTGGTTAAACGGAATAGGGTAGGTAACTCTAGAT
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CCTTACTCACACCTGCGGAGTACATGGAGACTATGATTATTGGGTGCAGCTGATGAAAGA
CGCTAGCACTGGATATCTTCAATCGATATAGATGGCGAAACACTAATACACTATATGTTT
AGTCATCATAGCCTATTTCTTTTTACCTTGCCGGTGTTGGCATGTAATCCTTTTTTTGGT
GTGACTCATTCAGACAACTTCTGAATTGCTTTGTTTCAAATTACGGCATTTAATAAAACA
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GCAAGGGACATATTTCAAACTTAGATAGTTAAGTAAGTAAATAATATTTTTTGCCATTTT
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CTGCTGCCGAACGCCTGGCCGTTGCCGGCCCACATTTCCCATGCCATCATCTCCTCCTCC
TCGGCACTAGTGTACTCCAGAGCAGCAACCCGGCTGCCGAACCTAATGCACTCTAGCAGG
CCAAAGTGGCACGCATACGAGCGAAGGTACTCGATGACCTCGTTATGGCCCGGGTACAAA
TCTGACACGCTCGGTGGCCATGGGAAGTCCGTGAACTCGTATAGTGGCCGTGGGGTCTGC
AGGCGCGTCGAGGCGAGCGTGTGCGCCCACACACCGCCAATGGTGTCGGCGGCCTCGAAC
ACGACTGGCCGGAATCCATGCTCAAGCACGTGCTTGCAAGCCGTGAGGCCGCTCATGCCG
GCGCCGATGATGGCCACCCGTTTCTTCTCCATGGAACTTGCGCAGGAAATATGGTTTTTC
CTGGTGAATTGTGATACACGCTTTGTGAAACACGACCATATGTACTGGATTTTGTTTCTG
CGAGCGAGATGGAGAGGTAATATAGGCTAAGCTTGTGGCTGGTTCTGGCCTTCTGTACAT
TTACATCACATTTGGTACGATAGAACCATATATGTCACTGCCATTCTTTCAAGTAATTTG
TTTTTTGGGTTCAATTGTGTTTTATATCATTTCTTTCAAGTTCTCTGTTTTTTGGGTAAA
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ATTCGAGGGAGCTGAATGTGTGCCACTCTCAACACGCCTCCCTCGTCTTTTCGGAGTTAT
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TCCATGGGTTCAGAGCAATAAACTGAACAATCATCAGTTTCTTCTTCCTTGGAACCATAA
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GCTGCGTTTATTCAGTGGGGTAAAACTTCCGCAGTGTCATGCTGCGTTTATTTAGTATTC
TCCCTCCGTTCGGATTTTCGAGTCCTTCTTTTATTCTGAGTTAACAATGAATTTGACCAG
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CTGCTCAGGCAGGACATTGATGGTAGGCAGTGGTATTCTAGACTTGATAAGTTAGTTGCA
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TGGAACTGATGATTTGCACTACACAACATTTTAAAGAAATATTTGGGTGCATCAAAACTT
TTATTGGTATATGTATCCATGTTTAAAAATGCAGTCCCTGCCGCTAGAGCATCACGCTTA
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TGGAATTTGAAGGTTTTTTGCTGCCGTGTATGAGCACACCAAGTTGAATACAAGTAGCGC
AGCCCTATATTTGTAGTATAAAATAGATACTTCCCTTGCGATTCACAAGCATTAGTTAGT
CTCTTTCACAGCTCAACTCCTAAGGAACTGGCGTACAAACATCATGAAAGACTTTGTGCA
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GCTCGTACTTGTACACTACTCGTTAACTAGGTTCGCCGCAAAGAAAGCAAACATGCAGCA
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GCTCCTCCAGCTCGGCGCCGTGCCTACTCTCATCGTGTCGTCACCCCGTGCTGCTGAGGC
GGTGCTTCGCACGCATGACCACGTCTTCGCATCGCGGCCACACTCTGTTGTCGCCCATAT
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TGAAAAATATTCATGAGCTAATTTGGTCATTTATGCCGGATATATGGTATTCAATAGACG
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CGTGATTGTCCTGTAGGCTAGGTGGTGGTACAGTTGTATTCCCTCCGTCCCAAAATAATT
GACTTAAACTTAGTGTAACTTTGTACTAAAATTAATACAAATTTGAGACATTTATTTTGA
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GGCCAAACGAAGGCTAGGGTTCACAAGATGGCCTTCACGTAATTTACATGCCGATATTGG
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GTTTTCAAGTAAAACAGGTGAAAAAACCAGAAAAATGAGGGAGAACATGAAAATGGGAGA
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AGAAAGAATAAATTTCATTTTGTAGCGGCGAATAGCTGTGATAAATTAGCTAGCCCTGAT
GTCCTCACATATATGAATGATAGGTGAGCATTGCCATGGCCAAGATCAATGAGGCGGTCG
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GTCGTGCCATATCAGGCAAGTTCTTCCGAAAAGAAGGGCGGAACAAGCTGTTCCAGGATC
TGATCAATGATAGCACACAACTGCTAGGAGGATTCATCCTTGAGGAGTACTTCCCTGTCC
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ATCTAACCAAAGAGCACATCTTAGCTATGCTGACAGTAAGCACCCATGGTTCCGGTTGTA
TTTTCTAAAATAATTACACATGTCATGCACACCATCATTTCATAGGGGAGACAATACATT
GGATTTGGTTAGGCTGATCTAACAGTTCTCTTGTTAATATTCACAGGACATATTTTTTGG
AGCAACAAGCACATCATGTCAAACCCTTGATTTCGCCCTTGTTGAACTTGTAAAGAGGCC
ACACATGATGACGAAGTTACAAGATGAGGTGAGGAGTAACAGCTTGCATCGGAGAGAAGG
ATCATTCAGCAAACTTAACCAGAACAACATGATCTACCTGAAAGCAGTAATAAAAGAATC
GCTACGGCTACATCCTGTGGCGCCTCTCCTTTCTCCGCATCTTGCAATGGCTGATTGTTG
CATCGATGGTTACACAATTCCGACTGGCACACAAATCTTTGTCAATGCTTGGGCTATTGG
CAGGGACACAAGCTCTTGGGAGGAAGCAGAAGAATTCATGCCTGAAAGATTTTTAGACGA
CGGTAGTGCAGCGCATGTAAATTTCATGGGAAATGATTTCCAATTCTTGCCATTTGGGGC
AGGACGAAGGATGTGCCCTGGAATTAACTTTGCGATTGACAGTATAGAGATCATGTTGGC
GACACTTATGTACTATTTTGACTGGGAGCTGCCCCAAGGGTTGGAACCAAAAGATATTGA
TATGACGGAGGTGTTTGGGCTAACAGTGCGCAGAAGGGAGAAGCTGCTCTTAGTTCCCAA
GTTATCTAGCGAGCTACATGGATTGGATATTGCACCTTCATAATAGCATCATCTTCTTCT
CTTAAATATATACGAAGTGTAATAAAGTACGGACATAAACCTTTCCTTTTTGTCGAAAAA
TATAAATAATCAATTTGTGTTTGATTCTCCAAGCTCTGCTCCAAGAGGATGCAAACACTA
GTGGAGAATCAGGCAATAGTCCGACTTCGTAAGGCAACCGACACTAAAGGGTGGGGACTA
AAGCCCCCCCCCCCCTTAGTGCCGGTTCATGCCCACCACGTGGCACGAGCCCGCNNNNGG
GGGCTGGGGGCCTTTAGTCCCAGTTGGTTAAAGGTTTAGGGTTTTGGGGTTTCTGGTTTA
TTTTTCCTTTTAATTTTTTGTTTTCCATTTAATTCTTTTCATTTCAAACATATTTTACGC
TACTACATATTGTACACGTTATGCGTATATAAAAATAGAATTTCTCGTAGAACCGGTCAT
ATACATATCATCGAATTTCTCGCACGACCGTTCACACATACACATGTATATATATAATTT
CTCCTACAATTTGCAGATCATTACATGAAGGCATTACAACTTGTAATAGTATTCTCCTTT
GGGCTCTATGACCTAGTCGAGCAAAAATCCCGTTATTCCTCTTGAATTGCGGTTGGAACA
AGCTGAAATCAAAAGTTGGAGGAAAACAAAAATGTAAGAGCCAAGGAGGTGCGGTTGGAA
CAAGCTGAAACCAAAAGTTCTTGTCTGGAATTTCTTAGGTCACTCAAAGTAAGATTAACA
TTTTATGGGGTATGTGTCTGGTATATAAATTGCGAACCGCGGTGACCTTTTGAACTTCCA
GGAGAATGGTCGCATCATGCAAACAATAGCAGAGGGTCAGGAGCGCCCTGTTATGCCAGA
AACATGTTTGTCCAGTTTAGGTGTTGTGTGTGTCTCTGTAGCGTGTTCATGTGTGCTTAT
ATGATTCCTGTAATCTGAGTTGCCATCCCACAAAAACACAATACTATTCGTGGTCTTCAT
GTGTGTTTTGGCAGTGCTCTTGTGTGTTGTTTTTCTATTGCATTGCTTGCTAATTAACTT
GTGTAACATGATTTTTCCAATAACAATATTTCCCATGTTACATATGTGGAGCCGCTGGTC
GTTTTTTATGGTTTCGTCACTACTCATCTAGTTTTCTTTAATAAGTGATTTGACTGAAAC
CCATCTGGTGTTAGCAATGCTCTATGTTTTAGGCAGCTGGAGCACTGTCCCTTAAGGATG
CATTTCGTGCTGACATCCTTCATAGTTTCGATATAGGAAACATCCTTGATAGTTTCGATA
TATATTGGGAGACGTTATCGTATCATTCTTTAGCTTCTTGCAAAAGAAGATTTAAAAAGA
GCATAAATAAGAAAATGACCATTTAGTCATAACTAATGCAGTGACGGTAATATAGATGAT
GGATGTGAATCGTGTTTTCTCCCGAGTTCCAATACTTTACGAGTTCATTCTATGGGGAAC
TCGGCAAACTTTCATCTACTATAGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGTAAGCT
AAAATTTTAGCTTTGACACGACAACTTCTGGCTCCTGGAACCAAAACTACAGTTGTGGAA
TATCTTTTTTCAAAATAGTCATTTACAAGTAATTTCCTATTTGGTGCATCCCTTTCTCTA
GTGTTTTCTTCTATGTTTGTATGTTATGGTAAAATTATTATTAAAGGGGGCCGAAAACTT
AGCTAAAATGTATCAATTAACGTATGACGCAATTCTGTCTTGATCTTGTGGACTTGGAAA
ACTTGCTGTTTTTACGGGATTGCGGTCCAAATGAACCCTATATCCTGGACGTCCATGATA
GCAAGGAGATCTGTGTCGGAAAATATTTAATTGCATATACGTTCGGTGGTAAAGGCAAGT
ATACATTACATGCGCATTACGACCGTATGTGGCAGGTGGGCCCGACCGTAACATGCTCGA
AAGTGGGTCAGTCGCTGTTAGCGGCTCCCGTAAACGGTGGGTACAGTGTTTGAAACTGCG
ATTTCTACCGTGCTAAGGATGCTGGATGGGCACCCAGCTTTCGGGCCGACCGACCAGCTG
CTGACCCAAAATAGTAAAAGCGGCTAGCGGATTAGAACGATGCATCACCGATCAGTTGAG
GAAGAACAGAAATCCCGGTTGACCAGAAAGCTGCGGCGACGCAAGCAAAAGATGGATTTC
CCGGTTGACCCAGTGGACAGGTGCAGGTATATAATTGTGAATCTGATGCCTTCAGACAGA
TTAAGCGCAGGCGCTGATGCTTCTCCACCATGCATGAGATTAATCCTAGCAAGATCATGT
ACCAGGTACGCATGCATGCCGGTGGATTGCAGCCTCTGCTGGCTGCCTTCCCCGCCGATG
CAACGCAGCCTCGGCTGGCTGTCGTCGCCGCGGTCATCATGATTTCCCTTCTTCTCCGTC
AGCCCCTTCTTGAGTACAAGATCTACACAAGATCATCTTCTCACTAGTAGTTCTTGTGTC
ATGGATGAACGGTTTGTGTGCTCCGTGTGGAAAGTCAGGAAATGCCCAGGTTGATCGCTA
GTAGTAGGTGCTCTAACTTGCCGTTTCCAATGGATATGGTGCGTGCAACGGAAGCCAACT
GTGGGGAGTGGAGTCGATCCGTCAACAGATACGATGGCGTGATAGTCATCCACTATTAAA
TGAACATGCTATGAGGTCTCTGGTAGTGTTTTGTTGTGCTCTTATATATTTCATTTGAAT
GGTGATATCTTTCATTTCTTGTTTTAGCAATGGTACCTTGTTGTTTTCAGAGTGTGAGCA
CGCTATATTTTATTTTTTGCAAAACGACGATGATCCTTGGAGGTGCGAGAGGGTCCTCAA
AAGGCTGTTTATTGTCAGAGGCCATGGCAAACAATGGGAACCATATCCTTGGATGGATCT
CACGAACTTAACGGCAGATTCTGAATCTTGGCTGTCCAGCAAAAGAACACCATTTTGATA
CATGGTGTGTTTGTCTTTTCAGTTAGTCATTCGGTTTGGCAGGTCCGGGAGGAATTAATA
CAGCTTTAACTTGTTGAGAAACTTTTCAGGTAGTCGTCATGAACTTTATTTATATTTTAT
TTCAGAATTTAAACAACTAGTTTGGGCCGTTCACACATAAGATTGTGTGACACTTTATTT
GTCACCGCTACATCGACATATACATCGACTAAACAACGGTGATCCAACTATATATTTCTA
GAGACCTTTTCTTATCATTAGACATCAACTCTAGTGCCAAAAGTCGGGTGGCATGATGTC
GTACAATGGCACATTAACATTGCACATCCTTGGTAGGGTACGCAGCGCAATGGAAGTCGT
CGCCTCAAGCTGAGCTATCTGGTGTGGCTGCAAGAAAACACTTTGTGGTACCTGCTGTGG
TTGACCAAGTTGTTGTGGTTGAGGTTGTTGGAAAGAACATTGTCCAACTTGCTCCTGCTG
CAACTGTTGTTGGGTTTGGGATACACCTTGGACCGACTGTTGGGGTTGTTCTTGCAGAAA
GATAGAGTAGACGATTGCACGGATTGCCTCATGGCGGAATTGTTCGGAGATTTGCGGCAG
TTGCTGGCAACATTGTTGCTGCAACACATGGCAACTGCTCTGCTGCAACATTTGCAACCT
AGGAATAAGTTGTGGCATTCGCACGGGGCTGCACTGCTGCTGGAGGAATACCTTGCATGG
GTTTAGCTGTTGCAAAATAGATGGATGAACATAGGGTATTTGTAGTTGCAGAAGCGTTTG
ATACAGTTGTCCTTGTGGGAGTGGTGTTTGTTGTGGTGTACATGGTTGTTGCTGCGATAG
AATTGGTTGTTGTAGCCCAAATGGTGGTTGCTGTGGAAATGGTTGTTGTGGCCAAAATGA
TGGTTGTTGTGGAAATTCTTGTTGCGGTGGGAAGGGTTGTTGTGGATATGGTTGTGGTTG
TTGTGGGTATGGTTGTGGTTGTTGTGGGATGGTTTGTTGTGGAAATGGTTGTTGCGGTTG
GAATGGTTGTTGTGGATATGGTTGTGGTTGTTGTGGGTATGGTTGTGGCTGTTGTGGGAA
GGGTTGTTGTGGAAATGGTTGTTGCTGTGCAAACGTACTTGTTGCCGCAATGACGA