Map Locations of contig_137429 (11454 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_137429

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_6361 1 2156 bp None Available Available None
MLOC_6360 1 610 bp AK369282 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_6361






CDS Structure of MLOC_6360






Contig Sequence (11454 bp)

>contig_137429 11454 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATACCTTGATTATCAACAAACTGTGGGAAATACTTATCTACTTTGTTGTATCACCCTTTT
CTCTTCAATGGAAAACAAACGCAAGCTCAAGAGGTAGTAATGACCCGACCTTTGGGGGAT
AGAGTTCGAAGTTTCAAGCAATTCACAAGACGCGACCCTTGGGGGCTATATAAGGATATA
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TGGCTTCCATATCCTCGCTCATCGAGAGGCGCCTCAGATATACAGTGTGCAGTTCTTCAA
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GAGTATTGACAAATGTCTCTTCATCGGATACAACATCTTTCGTTATCTTTGGAGGACTTG
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GTTGAGACATACATAATAAAGTATAAATTACCGAGTCAAGTGCTGGATATACAAATAAGG
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TCTAGACAAAAGCAAGGGTGACCTATTCTTTTGTAGTCAGTGAGTCGGGAAGTTTAAAGT
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TCTTACAATAAAACCAAGTTTTTCCCCAGCCATTGGGATGACTTGGCAAGGTGACAACAG
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CGGCACATTCCGTCTGGCGGTTCAAATAGAAGAATTCCCTAAACAAGGGAACAGTGGGCT
CTATTTCCAAGTATGTTTCGCAGAAGACTTGAAATTGGCATAAATTTCTGATTGAGTTGG
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TCCTACGTTTACGTATTGCTGAAGGGAGATGTGAGAAATTTCTGACGCCAGCCAATCACA
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GCGGGTTATCTCGATGAACATGACTTGTCTTGAAAAAAACAAGCGACTTGACAAAGAAGG
TAGCCTAAAATGTTCAAGTCGCCCTAACGTAAAGACGTTTTCTTGAGATGGCGAGTTACA
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TTTCTGCTAAGTGCGGGACAAACAAGTTTCTACCAAAGGGCATAAAAATATGGATCTACC
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TAATGGCGATGAGCACGAATGAACTTCGAACGAACCCTACTAAGCTTTGGTGGATTCACG
AATGAATCTAGGGAAGGAGAGAGCTTACCTGACAGCGTTGACGACGGCAGGGTAGACCCG
CGACTCGAAGGAGGAGACATACGGCGAAAGGCTCCTGAACCAGATCAACTGGCGATGGGG
GTTCTCCAGCGGCGGCGGTGTGAAAGTACATGCTCGAGCAGGAAGAAGAAGATGGGGGCG
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GCGCGGGAATCCAGGAGGAGCAATAAATTTCGAAACTCATGGCGCCTTGATTTTCGGGCT
AAGAAGATAAGCCCAAAAGATCTGTTGGAATGATGTCACTAAGATTCCTAAAATCTTGGG
GCGGGTGACATCACTAACAAAGCGAGCAAGAGCTTCACGGAATATTTGAAGCTCACATTT
CTGCCTTGGAAGGCAAAATCCGGGTTGAATATGAGCCGCCCAGATTAAGAGTAAAATCTA
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TGACCCGCCCTAAGAGGCCGGGTCAAGATGGTGGCGGCTCTTCGTTCATACTCAAGATGG
GCCCTGACCTAGAAAGTGGGAGGTGCAAGGCGGTTTACCAATGGGAGCCGGCAGCGGCCC
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TTGTAAACCTAAGGGTCTTGACCTGATATAAAGGCGAGTCTCTAGGGCTAGTAGACTTAA
GTTACAACAATCGAGAGCTAGGTCATGCGAAACCGCACCCTTTTAATCAATCTCATCATC
AATACACATAAAAGCATGACGTAGGCTATTACCTCCATCGGAGGGGCCGAACCTGGGTAA
ATGCGTCTCTCGTTCCCGATCAACCCCTTTGAGTCACCACATAGTTGCGATGGTTTCACC
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AGTGCCACTTCCAGATGCCGGAGGAGATTCGGGCAAGGTGTGCCACCCGCATCGTAGCCG
AACTACCTCCAGACTCGGTGGAGCTAGAGTATGAGGAGGAGGAAGAGGAAGGGAGTGATA
GTCGGTTCCCACGGAGGTGGCAGATCCGGAGGAGGAGGACATGGGGAATCCGAAGGAGAA
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GGGCGCCCAACACGCCTTTCGTTGAACTGGAGGCGAAACCGAAGGAGACACAGGAGCCGG
AGTAGCGGCTGCCGTCGATCAATGTATTCAGAGCCGGGGACGTAGATCGTGAACATCTCC
GTTGAAGACTAAGGTAATGTAGGTTATTGTTGATCTACATATTATGTAGGTTTTCTGTTA
TGGATGTTTTTTTCAAAATTTAAAAGTTAAGTTACAAGTTATTCGGATGCCAATGAGCAA
ATTTAAGATGTGATGAGTCGTGTTGGACGTGTCCGGATATGTCAACGGACATATGAGGAT
CCAAATTTACTGTCACGGCTGTAGATGCTCTTACTTATGCGGCATTTCCAAGCACGAGAG
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AAAAAAACGGCGACGGCCAATGGCGCTCCAACGGTGGCTCCTGGGCGGGTCCCCTGATTG
ATTTTTCCCAGGATGGGAAATTCCTCGCGCAGTCGCCTTCTTTATTTGGCCGGGTCGCTT
CCTTTTGTTACCCCTTCGATCCATACCTTGCCCTTCCTCCGGCCGCCTCCCCACCCCGTC
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AGGGAAGCCGCGGCCGCGCCGTCCCTCCCCACCCCTCTCCTCTCCCTAGGCATTTCTGGT
GAGCTCCCTGCCCTCTCAGATCTGCCCGCTTTTGTCGCAGTTCGATCTCCGCCGGCTAGA
ATTTTACTCACATAATCGGTCTGTTTCTAACCGCGCTGTGCAGCTGGTGATTGGCCCGTT
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GGTGCGGGGGAAGACGGAGATGAAGCGGATAGAGAACGCCACGAGCCGGCAGGTGACCTT
CTCCAAGCGCAGGAACGGGCTGCTCAAGAAGGCCTTCGAGCTATCGGTGCTCTGCGACGC
CGAGGTCGGGCTCGTCGTCTTCTCCCCTCGCGGCAGGCTCTACGAGTTCGCCAGCGCCGA
CAGGTACGCCCACGCAAACGGCAAATCTTGAATCTAGTCTCCCTGCTTCCGCTGCTGCTG
TTTGATATCGGCTCACTGCTTGTGCTTGGGTACTTGGTTTGGTTAATTCATGGGGCCTTT
GCAATGGCTGCGGTTGCCATTATTGGAGGCCGGGAACTCTTGTAGCTGCTGCCATTCTTC
CCCAAAGCGTCCGTACGGACTCTCGGTGCACACAGCTAATCAAAAAAGCACACATCACAT
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CTTTCGCTTTTCTTTTCCCCTAGATTTCTCCAGTTCCTTCTCACTCCCCGGCAGTATCTC
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GATGTCCGGACTCGGGACTGCGAGCATCACCTATAGCAGCAAAGTAATAATTAATTTATC
GCAGCACCACCGCTGATTTGACCTGATTTCTCCTCCGCTCTCCAGTCGCGTCAGTTCCGT
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ATACTGTAGTTTCGGGGAGCTCTTTCTGATCCGGGTGTCCTTCTCATTTGACGAGCTTTA
GTTTAATCCTGAGCAGAAAACCGCATGTTTCGCCTGGGCCTGGACGGTTTCATGCGTTGA
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GCAGGCTAATCAAACCTTAAACTTGTGTATGGAATCATATAGTAGTATGTTTCAATCATT
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CTAGCCATAATTTGGTAGTTTTTCTATCTCCATATTGGTAGAATTTCCCTGCTAATTAAC
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TGTCATATATAGTTATATATGCACGCATGTTAGGAAATTAGCTAGCAATGCATGTCCAGA
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ATCTGAAAGGTTCCATGCATGGAGAACACAAAGCTCCTTTTTCTTTTAATCCAATTACTA
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TGAGAGCAGGCAACCATGCATGATAAAAATACTAAACGAAATAAGTTGTACATTGTTAGA
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TGATTTCTATATTGTATGCTTACCAAAAAGTTAATGATAGGTCTCTAACAATTACATAAT
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AGAGTCAGCTTTGAGCCAAACAGGGCCTTATTTATCCCTGGGACGAGTTACTTCAGCCAT
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ATCCATTGTAATTTAAATAGTGAGCATACCAATACCAATGTGTTTGGCTACCGAGTGAAC
TTCTCTGTACTCGAGTGGGCAGGATTTGCGGTAACCATGTTTAGAGAATATCTCCAAATA
AGCTTGCTACCTGTTTTATAGATAAAGCAAATACCAAAGTAGATGACTTAACGATACATA
GGGTAAGGTAGCCCTCTTACAAAGCAGATATGAGAATAACCAGACCACTTAGAACGCATG
CGATTACGCTATCAAAAGATAAAAACAAGAAGGTCTCGAAACAACGGCATGCTATGCCCT
AGTACACCTAAACTCCACGACAACACCCTCATGAGGGAGAATGGCACTAGGTGTCGCCGT
TGCCGAGTCCGACATGGAAAAGGGTCTTCACCAGGAACCTTTAGATAGAGAGGAGAACCA
CAACGACGTCTTCAAGAAGAAAGGTGATGCCCGCAGGCACCGCGCCGTCGGCGTAAAAGC
GCGAAGCTTTGCCTTGGCAACTCACCTATGCCGCCAAGAGGTCTTCAGGATAACCATGAC
TAGTTCAGAACCCTAACCTGGATCTGGGCATCGCCACTACCAATGCCCATGCTACCCGAC
GCCATACCCCTTGCCGTCCACACGACCGAGAGGCAAAGCCACCACCGCCACCATGGTGCC
TCCCGGAGAGCAAACCATGTGAATCACCTACCGGGGCTGCTGTCATGACATCCATGTTCC
GTGACACCGTCGACCATCCTCGTCATGGTTATAAAATATGAATATGCTGAAAGCTGCATC
AATTTTCTAAATAATTGACATTCTTGTAACTTCTTCGTAACCACTCAATTATAAGAAAAT
CCGTACTGATTAACTAGGTATGCCTAAAACAAAAAGTAATTCATCTTTATCTCCATAAGC
CCACAATGAGGGGATGGAAATGCACTTACTTGGCGAAAATCAAAAATACGAGCCAGCCTC
GTACTACTATCACATGGCGTGCAAGCATCGTCGTCACCAGCACTAAGTCTTGGGACCAGC
TGGATCATCTCTAATAGATAAATCCCCATATTAGTGTTTCATGGTTTTCATGTCGTGTTA
GTTTGGTCACTTTGGATTGATTTGGGGTTGTTCCTTTCTATTTGGGTAGTCATCCCTAGT
TGCAAGATATGTTATAAACCAAGGCAATTGTTATGTAATTCTAGCATCAAAGAAATGGAT
AGAAATTGGAGGGTTTAACTCCACACTGATCTACCCTCCCCCCTCCCCTAGCACCACAAT
GCAAAGTCCAAACACACCCTGATCCTCCAACATCCCACGATCATCCCTCCATAATATAGG
TAGTCGCTCTTGACGTACCTCTTCGGTCAATGCTTATCCACCATCCCTCAACACCACTGG
GCTGACAAGCTCCTCGGTTAGTATTTGTTCATTGAATTCCGCATGGGCAAGTTAAACATT
GTGGTTGATGCCTTGTCCTCTTGGAAGGAACACCAATGATTGTTGACAACACTGTCTAGC
CCATGCTTCATCCTCTTATCACCTTACGCGCATCTATGGCCACATTACCGACACTTGTGG
AGTTGCAACAACAACAAGAGGCAGGTAACCCCGAGGCTCATCCTTAGGGTTGCATTTATG
GCATTCTAAGATATGAGTAGTCTATCAATCATATTAACCCAAGTGTTCTTTGGAGATAGC
TTCTAGAAAAGAAGGTACACCTTACTGATATGAGTAGTCTATCAATCATATTTACCGAGA
TGTTTGTATGATATCATGTGTGTAGAGGTGTGGATCTTACCTTAATCTGGAACGGTGTCT
TGTATGTGGTACCAACGTGTCTGCATCATTTGGGTAGCGGGGGGGGGGGGGGGC