Map Locations of contig_137389 (7195 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_137389

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_6329 1 698 bp MLOC_6329.1 Available Available None
MLOC_6332 1 512 bp MLOC_6332.1 Available Available None
MLOC_6331 1 556 bp None Available Available None
MLOC_6330 1 1647 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_6329






CDS Structure of MLOC_6332






CDS Structure of MLOC_6331






CDS Structure of MLOC_6330






Contig Sequence (7195 bp)

>contig_137389 7195 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGGGGGGTGGGGCGGGAGTGGGGGGGGGGGGGGNNNNNNNNNNNGGGGGGGGGGGG
GGGGGAGCGGAGCCATCTTCTCTTCGTCGCCTAGGCCTCCCCTTCTCTTCATTTGTGTAT
TCCGCTGCCCCTGAGTATGTCCGCATCGTTGCGGCATGCTACCTTTGTCGTTCATTACCA
TGCCGAGCTTGTTGCCGACCCTCAAAAAGCACCCAGAAACTCTCTTACCCTGCATATATT
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ACTCCGTCCAGAATGGTCGCTCCCACACCAAGCAATATGGTGTTGTCATCGCCGCCCTTT
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GGGTGGTGGAACTCCGGCGAGCTCAGGGAAGCCCTCAGCTGCCTCCCAGGTCTTTTGGTG
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AGATGAGCAAAGCTCTCTAGGTTTGATTTCAATATGCTTTTGCTAACCCTAATTCGTCAA
GTGAAGGTGTACTTATAGTCTTGGGGGGAGGGATACAAGGGCCTAAACCCGAAACTTGCG
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TGCTCGCTTCGCTTCGGCACCATCTTGTCCATTGCTCCTAGCTTCTCCATGGCCATCTTC
TTGGTACCTAATCACACATAGCGTCTCCGTCTTAGGTAGTAACCATGTCTCGCATATAGG
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AATTCTTTTTTCTTTTGCTGGGACTAAAGGCTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTAATGTAAAT
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TGCCTTTAAAGCCTTTTCCCACATTGAAAATAAGCTACCACCCTTGTTCTTCATCTACAT
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ACCGCTGGACTTGCTGTGCCGCGGCCGCCTGCAGGTGTTGCCGTGCTGCCGTGCTGGTGG
CTGATGCGGTGGTCCCCATGGCGCCGCCGCCGGTTGCCCCTGTCAGCTGCAACAGCTAGG
TCAGGATAGAAGTAGAACATGGGAGAAGAAAAGCAAGTCATACCGGAGGAGTGAGGAGTC
CGAGTTGAGGGCTGCGTGCCACGTGCGTGGGCTGGATATGTATACCTATATATTTTTGGC
GCCAAATCATTGGTATTCCATGGAATACCCCTGGCTCTGCCCATGTGCCCCACCCAAGTC
GTACATGGCACTCCACATAGACGGTCAAAAGAAGTCAATGAAAGCCAACACAAGTCAAGG
AGGTCAATAAAATTCCAAACAAGCTACCTTTCTCAACAAAGGTTCAAGCAAGTCTTCATT
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AAAGCCCAACTGAAGGGAGAAAGCCTTTATATGGGGGAGAAAATCTCCCCTTCATGAGCC
ACAACTCCCCTCCTAACCCTACTAGAGGCACATGGGCTAAATGACTAAGGATTACATAGT
TCTACCCTCCCATCTCTTTTCAAGGGTAGTCTTGGTTGTTTGTCAAGGACCCCTACAGCG
TGTTTGGCATCTTGAGGGATTGGGCATGGGAGTTTATGAGGGGGGAGTTTGTGAAGAAAT
TAGACTTGGGAAGTAGATTATTAGTCCCAATCCCACGTTTGGTATGTGGTAGTATTTATC
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TAAGAATTGTTGACGATACAGGAGTATGGATAAGAAAAATGAATGCTTCATCAGCCGTTA
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ATTACCTGGTCCTTGCAGGGACAAGATCGAAGGGAGTTGGACCTCTTAATTCCCCTTCCT
CTTCCCATCTCAACTCCCATGTCCCTGAGACAATCGAAGGAATTTAACTCCCATATACCT
TAAACTCCCATTCCCCATCTGCAACCCCCCCCAAACAAACACGCTGCTAGTTTATATAAG
GCCCCTAATAGGCATGTAAAACATTCACTCCCTACTTGAATAAACTCCAGAGGAGAGTCA
GTCCCCCCTTTCCTAAGAGTTGAGGCTCGACTGAAGGCCGACAGACGTAGTAAGTCTCAG
ACCAGTCTAGAGTCGTGGGACTTCGGAAGTGGTAACACTCAAGTGTTCCGTACGCAGAGC
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TTTTTTTAAATCGTTGTGTCACATTGACGGTGTACTACGACCTTTGCTCTATGTTTGTCA
TACACACCCTTGCCTACTGTACTAACCACATTGCTAAGGGCACCCCCCAGGTTGAAAGTT
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TTTTAAGAGATTTCACTACGGGCTCATATAGATGTATATAGACATAATTTAGATTGTAGA
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GAACGGAGGGAGCAGCATCCTATTAGAATTCATTTCAAAACACAAAATATGTCAGGAGAA
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GCAACAAAATTTTGTCTTTATTGTACCTCAGTTTGTACGAAAAATAAAAAAAATATTACA
TTCAGAGTATTAAGTAGTAGTTTCAAACACATAATTGTTACTGCACCAAGGAATGCAAGA
AGCAGTCTAAACTTGCTATTGGTTTTACTGTTTATGTATGTGGTATGCTATCAGAAACTT
CTGTGACTGAATGCTCCTTACTGATTGGTAATTACAACATGTCTCTTGTGTTGCAGGTAA
CCTGTTCGGGCGTAACAAGGATATTGTTGGTCTCGAGTAGATCGGCAAACAGTTTTATTG
CACAAAAGTGTGCATTGATTTGTTTTTTCAGCCATGTAGATTCGATCTGTATGTTCACTA
TGATGATTGAGAGTTAGCATTGGTAATCTTGTACTTCGTACATGCTCACTTTCCATTTTG
TGCATAGAAGAACATGCATGGAAATTGGCTTGGCTCAGCTATTCTCTTGTACGTTTTTTT
TAATTTAAATTACCGAATCTGTCTATCCAGAGCTGGTAGTTGCATGCCAGTAGTTGCACT
CATGGCTGCATACCGCTCTTTATAGTTTGTGCCAAAGTACAACAATCTATGGGATAGGCA
AAAGGCCCTTTTACGGTTCTGACTGCGGGGATCAACGTGAATAAAGAGTAGAATGAACTT
CCAACAATGAGGGTTTAGATGGGTTCGGTCACCGCGAGGTGTAATACTCTATGTCTTGTA
TTTTGGTGGATTATTCGTGTTGTCTAGATGTCATGTCTAAGATGCGGCACTTTCCTTATT
TGGGGCAATGCCTCAAAAGGGAAAAGAGTCGCATCTAAGTGTTTCGCAAGCAGGATAAAC
ATTGCATTACATAATAGATGAAAGAGTAATAAGATTTAGTTTATACTCATCACAAGCTAA
ATTATAGTTCCACACAATTATTCATTATTCAAATAGAAAACATGGTTCGTCTACGGACAA
GATAAACGACAAAAGCTAACGCTATCCCGTCTTGCTAGGCCCACGATCACGACCA