morexGenes - Barley RNA-seq Database

Contig contig_137288
Source Contig contig_137288
Contig Data
|Contig Location|
|Microarray Probes|
|Predicted Genes|
|CDS Structure|
|DNA Sequence|
morexGenes
Links
Map Locations of contig_137288 (7378 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013	Oregon Wolfe POPSEQ 2013	Morex Genome Release 2012
	No map location
Predicted Genes from contig_137288

Gene ID	# CDS Predicted	Max CDS Length	Probes in Cluster	FPKM by Treatment	FPKM by Replicate	Top Rice Hit
MLOC_6256	3	1812 bp	MLOC_6256.2	Available	Available	LOC_Os06g15400.1, FRAME:+1, EVALUE:2e-45, 13106.m01703 protein expressed protein
MLOC_6255	8	1998 bp	MLOC_6255.7	Available	Available	LOC_Os06g15410.1, FRAME:+2, EVALUE:8e-138, 13106.m01704 protein angel, putative
CDS Structure of MLOC_6256

CDS Structure of MLOC_6255

Contig Sequence (7378 bp)

>contig_137288 7378 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TCGCCGGTGCTGCACTGAAGCTTCGCGTGTGGCGTCGGTGCTCCATTGCAGCTTCGTCTC
GGTGCTGGGGTTGTTATGAAGCTTTTGTCGATGCGATGCTTGATGTTGCCATGGACAGCG
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GGAAAAGTTTAGGATATATGACTTGGAGGACAGGGGCGCTGTACGAACTTCATGGCGGTG
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GGATTCCAGTCCTGCTGCTTCAGGATGCTGATACGGATCAGAATCAGGTGTAGGAAGCTG
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ATTTAACGTGCAGTATGTACATGCCGACTGTAGTGTACTCGTTCGGTCTATGCCTATATA
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GACACTATTGTTTGAAGATCCTGCTTTTAGACTGCTCGCAGTAGGATACTAACCAAACAT
TCCATATATTCTGCAATAAATGAGGAATTGCCGTCATCGAGGAGGTCAGGCAGGCTTTAG
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GGGCGAGCGCGGCCGCACAAGAGCCCCTCCTACACAACAAGCGTCCCAGCTTTTGTTGTT
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CGCCACCAGCAACGCCGCCCCACGCTCCTCCGCCCTCCTCCCGCGGCGCAACCTCCACCC
GCTCCGCCTCCAAGGTGCACATGCATCCTATGCTATCTACGTACTATCAGCCGGGTTTTT
CCGGAGGATTCTTTTGGCTCTGACGGCTTGGCCGAGCTTGCAGATGCGCCGAGGCCGTCC
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GACCTCAAGGGGAAGGTTCGTACGAGCTACCTGTCTGCGTAAACGTATGAGCCGTATTGG
TCAGTCAGTGCGCAACACAATGTGCCCTATCGTCACCCGTTCTCTTCTCCCGTGTGACAG
TGGGAGGCGATTGAGGACAAGCCCACCTTCCTCCTCTACAGCGGCGGCGCTGTCGTCGCG
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TGACCAAATTAACCGACTCTTGCTTTCTCGCTCAGTTATTATTATTAATCCTGCGATGAA
CTGTGGTGGATGATGAATTATGTTGTTTGGTGGTGCGCTTTTTGCAGCTCCCCAAGCTCC
TGGAGCTGGTTGGGCTCGGGTACACCGGGTGGTTCGTGTACCGCTACCTCCTCTTCAAGG
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TTCGCGTAAGATTATTTAATTTACATGGATGGTTTGGTTTTCCTTACTTCTTACAGGAAA
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AAACTCGGTTCTCTGGAACGTTTCGGATGGCTCTTTTGTCTAATTATGTAATGGAAGAAG
ATCTACTTGCTGCTTAGAGTACCATCCACTGCATTTGTGTGTTACATATATGTATGTATG
AAAAGAAATGCGCTTTGGATGGTGTGAGGTGACAATAGTGAAATTGTATCAGTTTTTGGA
ATTCTTCTATTTCTTTCTATATAAATGTGTTCATATGGAAAACTTGATCCGTCGAATTGA
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GGCGCACCTATTTTAGTATATTTACTTAGTATCGATAAATAAATATAGAAAGGTGTATAA
ATCATGATCTCTTAGTCTCCGTATAAGGTTTACATGTGAATACCATATTTTAATTTGATA
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CCCGATGTTCGGAATTTTAGGAAAAAGTTTTCAAAAAAGTAGGGCCAGAAATTTTTGTTT
GTTTTATTTGTTAACAAAAGCTTCAATTATGTTTTTGTAATCTGAAAGTTTTAATTTGAG
TAAATAACAACCTAAATTTTATTTCTGAGTTTTGGTTTTATCATTAGTTGGATTATAT