Map Locations of contig_137236 (10897 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_137236

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_6226 4 1645 bp MLOC_6226.2 Available Available LOC_Os04g43650.2, FRAME:-2, EVALUE:0.0, 13104.m04339 protein L-allo-threonine aldolase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_6226






Contig Sequence (10897 bp)

>contig_137236 10897 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAACACTTAGCAGTAACGCTGGATTTGGGGCAACGCTGCTACTACAGCTACCGTCGGTGG
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TCCAACCCTACTACTAAGGTCCTGCCTATAAGGTTTTTCCTACTAGTGTGTTGGTTCGTC
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TGCACTACACTATAAAATAGAATAGGGGGTACAATGTACATCGGTCAACTTTAGTTCCCA
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GGTAGACGTGAATGCATTATTCATACATCAACTTTTCACTGATGCTCACTTTGATACACC
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ATGTACGCGGATTTGGGAAGTTCAAAAGTTTTAAGAATTTATAAATTGAAATATAGTTTA
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TTTTCGCCTCCTTTGTATAATGAGTGACTCTAGTGCTCGAAAAGAAGATTTTGAAGTGTT
TCTTAATTTCATGCGAATGAATATTTCCGTGTCCTTCGTACAATAAGAAACTCTAGTGCT
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CCCATGGCCCAACGCCCCTCCTGCCCGTCAGCCACTACCACCGCCATCGTCTTCCCCGTC
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CCACCACCAGCCCTTGCCGTCAGATCCTCCACAACTGCTCCCCACCGGCGCCACCTCATT
GGCGCCCAAAGCCCATACGACCTTCCATGTGAGCTCTCTCCCTTTTCTTCCTTACCCCTC
CTCTCCGTCGAGCCCCCGGCAGCCCCTTCACAAGGCCCCGTTGCACCGTCCGTTCTCCCC
GCTGCCACCCCGCAGGTGCCGCGTCCCCGACCGCGCCCCGGCTCATCCGGCCACCGCGCC
CGCACCCTACGTGTGCCCCGCTGCAGCGCTCCGTCCCCGCTCGCCCGATGGTCGTCGTCC
TGCTCCCGTGTGCAGTCCCTCGCGCCCGCGCCACGTCGCTGGCCGCGGCGGCCGCCGGCT
CTCGTCACCTTTGGCCTTGCCCCCGGTTGGCCTCGGCCCTGGTCGTCAGCCCCCCTCCTT
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TACTAAAGGACAACAGGGCCCCATGCACCTGCTAATTAGATAGAAAATTTAATATAGAAT
AAAAATAAATAGATAAAATTATTATAATACTAATAATTAAAATATTAATTAGTTAATTAG
TTAATTAAGTACTTAATTAACTCTGGATTAAACTGCTTACTTAATTAGATTAATTATGAA
TTTATGACATGTGGGACCCCTTTGCTTTTTTAATCTAATTGAATTAAATTTAACTGATTT
AAATCTGTTTATTAATTATTAAACATGAATTAAAAATGTGTCTATGACAGATGGGGCCGA
GTGATTAATTTGACTAGTCAACTAAGACTGTTGACTCTGATGTGAGCATGACATCATTTT
GATGTCATAAATGTTTATTGAATTAAAATAAATCAATTTAATTTTAATTATTAAGAAATT
TTTATCAATTAATATAAAATAATCCGTAATCCGGATGGAAATATTTTGTACATGAAATTG
ATCGCAAAAACGAGATGAATCCGGATACGCTGTCCATTCGTATGTCATGGCTTCCTAGCA
TAGGGAACATGAAACTTTTCCATTGTTTTTGCATGTGCGGTAGTAGCGAGAGACCCGAGA
AATATCGTCACATATTTTTCCGATCCATCTATGACGAATAATACTGCGTTAGCTCATGCA
TATCGCTACTTATTGACATTTCATGCATGGTGATGCATTTGCCTGCATTGTGTTAATTAT
TTCTTCCCCCTCTTCTCTCCGGTAGACTCTGATGCTAATGTTGCTCCCGGGTACGGCTAC
CCACCTGACGACCAAACTTTTGTCGCACAGCAACAAGGCAAGCAAACTTTGATCATTCAT
ATATGGCCTATTTTTTCTTCCTCATGCTTGCATTAGATTTTGCTACTGTTGTGGATAGCT
CCTATTATGATGCATAGCCTGTTTTGTATGAACTAATACTTTACTCTACCGTACTTTAAA
CTCCTTAGTATAGGTGGAGCAGTGATCCCCTTTGACCATTACTCCAGTTGCCCCTCCTTT
TTCATCAAGTCTCGATCATCTGATCGACGAGCCAGGACCGTCACATCACTCACACTTCCT
TCGTTGTACGACGTTGTAGAGCTACTATCGAGTACCGAGGGTTACACCTCGCTATGTACT
CCGATGTTAGTGTTGTAGTATAGTTAACCGGCGGTGG