Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_137212 (5514 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_137212

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_6208 1 652 bp MLOC_6208.1 Available Available LOC_Os07g47450.1, FRAME:+1, EVALUE:1e-51, 13107.m05050 protein flowering promoting factor-like 1, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_6208






Contig Sequence (5514 bp)

>contig_137212 5514 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAAGTTATTACGTTTGCAAGTACTGATGATGATGATATTGTATATCGATTTCAATCATAT
AGGTCTCGTAAAGGGCTTTTACCTCGTCGAAGTGGTAAGTTTTTAGACTTGTATCAATGA
TAATTGTTTCATTGATGCTTATGCCTCTCTTAAGAAACTTTGTTTTGATGTCTTGAAGGT
GTTGGCTCTTCTTCCACCGTTGATGAGGTCATGCGAGGCATTAATGAAGCAAACCATTGA
TTTGGTACTTCTTTTATCACACACTATTCTTTGTAGTTTTAGACATATTTTTATGTACTT
TGTCAAATCGTTAAGCATTGAGGTTGAATTCTAAATTTTTCGTGCAACTGAGCCATATTT
GGTATGGAATATCTTTTGTGGTAGATAAAAAGCCTTTGGGAATTAAGTTTTTTTTTGTGG
CGAAAGAAATAATTTAGGCCCGGGTCTTGCTTCAATCCTGGCTCGGCCACTGGTCACAGT
AGAAGTAACTTAGCTAGCAACGTAGTGCATTCCAAGACAACTTTGTTTATTAGGTCCGTA
GTTAATGAGGAGAGAAAAGTTTAGGGTTAAGATATTATGTTATCGTAACAAAACACATTA
AAAACAAAACGCGTCAACGATCTAGTAGATGCAATGATCTATTATACTAGCACTTTTATG
TTACTTTACACAATAAAAATAGTAACACAGACATAACACTAGTCTAATTTACTGCTCAAT
AGTCTTAGGCCGTGTTTTTTTAAGCTTTTTCTTTTGCTTTTGCAGCTGATAAAAAAAACT
CCTAAATAGGTGCTTTTTTGCTTCGGCTTTTGCCTTATACAACCATATAACAATATTAAT
TCATCGAAGCAAAAATGCCCTATTTATGATTTTTTGTGCTCGTGACTCGAACTCATTACT
GAAACTTATTCTTAACTTTTTGATGTGCTTAAATTTACCCCTAAAAAGCATTTTAGGTCA
CGAGAATACGCCTTTTCAGCTGATCAAAGATGTTTGATCGAAACTTTAAAAAATCATAAC
GAATTTATATGAACCCAAAAGATTGCAAAATAAGATATCAAATATTCATAGAACGTCACC
TATAACGAGAGGGGGTGGTAAAGTTGCAGCTAGCTAGCTAGCGACCACGTGAAGCCCTTC
GACCTCCTGTGCATACGTTGGCCCACGTTACTTACTGCCTTGCATTATTGGTACGTGCAA
CGGCAATGGTGACGAGACGACGATTTTATATTTAGACAGATAGATGTGCCTTACGCACGC
ACGCACGCACTTATCTGCAGGAGCTGCATGCGACGCTAGAGCTAGCCGGGAAGAACGGTA
CCACATCGATCGATGGCGGCGGGCGGCGTGTGGGTGTTCCGGAAGGACGGGGTGATGGAG
CTGGAGCGGGAGGCGTCGAGCAGGAAGGCGCTGGTGTACGTGCCGGCGAACGAGACGATG
CGGTCCCTGCGGGCGCTGGAGCGGCGGCTTGGGTCGCTGGGATGGGAGCGCTACTACGAG
GACCGCGCCGTCGTGCAGCTCCACCGCCGCGACGGCAGCGTCGACCTTATCACGCTCCCG
CGAGACTTTGCGCGGTTCCGCTCGATCCACATGTTCGACGTCGTCGTCAAGAACCGAGGC
CACTTCAGGGTCGTCGACCTCTAAGCATGCGCACCGGCCGGCCAGTCAAGCTTACAAGGT
GTGTGTTAATCGCTGTGCGTTTGATCGATCGTTTGACATTTGCGTTTACCTGTAGAGACC
TCTAGACATCTCCGTACCTACTTTCCCTGGCCAGTCGAGGTTGCAAGATGTGTCTGTGTG
TCGTTTGTTGTGCGTGTGATCGATCGTTGTGTAACAAACTTATATCTTGCACTGTTTGGC
GTTTCCCGTGTTCGTACGCCTCGGCTAATCGTGTGGCTTATGTGTGCGAAAATCCAACGC
GTACTAACAGCCGAATTTCAGGGGGTGGGCCCCTCTCTCCCCTAAAAAACCAATCCTAAT
CCTTGTATAAACTCAGGTTATGATTCAGTTCATCCCACTTTGGTATAAAAAGCGTATAAA
TATGGCAGAGATATGAATAGGCAGGAACATTTCACTCTTGAAAGGCATGATGAGCAAGGG
TATTGTTGTGGGAGGCGCCTACTCATCTATGTTAGTGATTGGTCATGTGTGTGTGCGCCA
TCCCATCCAGTACATGTACTGCTTTCTATAGCAAGTACAATAATAGTCTATAAATTTGCT
TACATGGCAATTTTCTTTATGTGGACGGAATCGACATGAAAAACTAAAAGAAGTGGGCTC
TTATTCAAGATCCTATATTAGTGAAGAAACGGCTAGCCATAATTTATTTTGGTGACACGT
TGTTTTTAAGCAATGCCAACAATATATTTTTCAGATAGTGTTGGCGTTGCACAAATTTAT
ACGACAGTGATCCCACCTTAGTGTTGGCGTTACGGTTATATCTCACGACACACATAATTG
CATATAGTTTTCCCTTTTTTGGTACAGATTATACCGTCATGGCCCATTATCCAACGGCAA
CATTAGTCTATTTTAACAGCCCTCCGACCCAGTCAACGAAAATTAGGTCACATTTCATTA
TCGCCTCTCCCCCCTCTCGGCCCCTCTCTCACGCCTGCCGCCGCCGCCACCACCACCTCC
CAACCCCGTTGCGTGTCGCTGTCGGACCAGCGGGGTCGTCGCCACCTCCCGACCCAGCCG
CATAGCACCAATGCGACATCCGCCACCTCCGGGCCAGCAGGTGAGATCTACCTCTTTGGT
AAGAAAAATAGAGAACTTGCTAGTGGATTTTGAAAGGTTCTAATCTCCTGGATTTAAGGG
TTTGGTAGGAAAATTTTCAGAATTATTTGATCTAGGAAAAATGGGCTTGCAGTGCACTTG
TTCGTTCTTGTTCTAGTTGTTTAACTATGGTGCAGTGCATTTTGATAGGAAAAATTTCTG
ATCTTTGGTGCAGTGCAGTGCATTATTTGATCTAGGAAAATTTTGGTTAGTCAAACACGA
TGCTTAATTATGTTCTACTTTCTTTGTATCTAAATACTTGTAGTTGGGAAGAACTAAATA
ATTGTAACTGGGGAGAACTGGTCTAGTTTAGTTCTCCCGAACTACAAGTATTTGGGTACA
AAGGGAGTAGTGGTTTTATAAACAGAAGCAATCGGAACAAATCTGAAAGCAAGGGATCAA
CCTAACTATTAATTCTTAGGATATGCGTTTCTACAAGAACTATACTAGTTCTCCCCAACA
ACAAGTATTTAGGATATGCATTTCTTGCTAACAAACCTGAAAGCAAGGAATCAACCCAAT
GTTTAATTCTTAGTAAATCTAGAAGCAAGGAACCAAAGAGTTTAAATCATGCATGTTAGG
ATCCACTATGCAATGATTCATACTACACATATGAACTTTCAAGATTGTGCATGTGAATGC
ATGCTATTTTAAAATTCCTCATTCTGAGATGGTGAGCTTTCATTACAAGTTCTTAGCAAT
TCTTAGTAATTCTTCATTGTGCATGTGAAACTGGACATATAGACAATTCATCAAGCAACA
ATGAATCGGTGTACGGCGTGGACAAGCTTAATAAGTGATTCTTAGAGGAGACATATAGTG
GAGCGTCAAAAAACTGGAAGAACACAATATCGCAGTGAAGAATGAAAGAATAGTCTCCTT
ACCGAGGGTGCTACGGTCCTCAATAAGTCAAACGAACTGAGGGAGCTGAGGGATAAGTTG
ACGGAGGAGAGGGATAAGCTGAAACTGGAGAAAAAACAACTCATCACATAGAGGATTAAC
CTACACACAAATGTTGCTCACTTCAAAAAGATGGAGTGAGCAATCACAAAAAGATTTGCT
AGCTGAGGATAATCCTAGATGAAGAGTAGTTTAATTATTTCAGTACCTTTTGTGAAGTAA
TAAACTCTGAAGTTTATGAGTATGTTTAGTTTATCAATACTAAGTTTTAAACTCTTATTA
AGTTTATGAGTATGTTTAATTGATCAATACTTTTTGTGAAGTTTAAGCATGAAGTAGTGT
TTTTTTAATTATTAAAAAAGAACAAATTGTTGGCATTGGACAACAACGCACGACAAAGGT
AGTATAGGTGTATGGATGGCGTTGGCCGCATGGACACCATCAACATGTAATATACTGCTA
GTATGGGACCCAACGCCACCACTATTTTTTAACTCTGATGTCATATTGGTGGCATTAGGT
GTCCATGCCATCAAGGTTATTTTTTCCACGCGATAGCTAGGCTTTTCTGCAGTAGTGCTA
GATATATCTGTATTCCTAGGCAGATGCAATAAATGTGAAGAAAGAGATAGAAAGAACTTG
AGAAAAAATACTAATCTTATAGCCGATCTTATAGCTAATCTTGTGGTACGACTGAATGTA
TGTGTTGGCTATAGATGATATGACAATATCTTATAGCCAGGAGTTGGCTATATTGTTAAC
CATGCTCTTAAAGCATTAGCTAATATCTTAATGCAGCACTTTCTATGCAGAAGAAACAAT
CTTCCACGTAGATTAACTCGTTATAATGAAATGTTGACGTACCACGAGCAGTTATGAAAT
GGTAAAAGGGGTGTGAATCGAATAATCTTTATGTATTTGAGTCACAATATCTAATACTCC
CTCCGTTTCAAAATTCTTATCATAAGTTTGTCTAGAAATGTGTGTATTTAAATACTAAAA
CGTAACTAAATACATACATATCAAGACAAATCTAAGACAATTTTTTGAAACGGAGGGAGT
ATGTTTCTACGGAACATCTATGTTGTACATTAAAGTGTCTACACAATATGGAAGTGATTT
CCCATATCTTAAAGCAATTGATATATCTTCCAATATATAATGCGGACACTAACTTCTCAA
GTCCTCATTCGAATTGTATACCAATGATAGGTGAATTAAGTGACGTCCTCCTGCATAGCT
TTTTTCAATAACAATTTGATAGCGAGGTCCTGAGCCGAAGTGAGGGTTCGAATCCCTCGC
TTTCCTCACCCTTGGATCATTTGGGAGTTTCAAATTGGAAAGAATTCTGACCCCCCGGAT
TTTCTCATAGATAAATGTAGGAAACAAATTTAAATTGTAAGATTTTTTTTAAAAATGAAT
GTTCATCCTCGCGTCTAGGATTCCGTCGTAGGTCACTAGATTAGAATCCAAAGATAAAAG
GTGAAACAAAGAATATCACTACTGTATAAACAAAATGTTTTCTTTTTTTTCATTTCATTT
TGGATTTTAAAACATATANNNNNNNNNCAATCTACTAATATTAATTATTTGATATAAATT
TTGCCTACTAGTATTTATAATACTTCAGGAGCTAATGAAGCTATTTTGGTAAAATTCCTC
AGCAATCGCATAGGAGAAACCAATGTTATCCTTATGAAACCTTTCAAACTAATCTATACA
CGCCCCCACCCTTCCCCGCCCCCCAAATAAATCGGGGGCGGGACCCTCTCTCCCCTAAAC
AAGACTATGATGGATGTTTAAGGGACACAATGTCACCCTTATGAGACATTCCAA