Map Locations of contig_137166 (9161 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_137166

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_6173 2 1715 bp MLOC_6173.2 Available Available LOC_Os01g27880.1, FRAME:-2, EVALUE:0.0, 13101.m02893 protein sucrose-phosphatase, putative, expressed
MLOC_6172 4 2436 bp AK250968.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_6173






CDS Structure of MLOC_6172






Contig Sequence (9161 bp)

>contig_137166 9161 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGTATAGACATATTTTAGAGTGTAGATNNNNNNATTTTGCTTCGTATGTAGACCCCTAGT
AAAATCGCTTAAAAGACTTGTATTTAGGAACGGAGGGAGTAGATACACATGCATGGTGAA
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GGACGGGCCGTCGACGGGTCGTTGTCATCGTTCCTCTATCGGAGCCGGCTAGAGCTTGTC
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ATTTTGTTCGACGGTCTCGTTCGATTACATATCTCTCTAAACACGTTATCAGCACGCTCA
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CTTTTAGGAAAGTATATACGGCATATTTATTGTCCTCTGTTTTCTCATATTGAGTTAAAA
GAGACAATAGCCATTATATGTTGCATCTTTTTCTCCTTATTTTTCTAATGGGTTTGAAAG
AGTTTTAACAACATATCAAACACATATATCCTCACAATTTTTTCCAAAGGGTTTTGGAGA
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CTACTGATCTCTAGCATATTATCAGACCAGTGAACGACCGTAAGATTAAAGCTGTGATTA
CTGTTAGATTTGATAGAAAGGCCAGCGCTGAGTTGTTTCTTTCCTATTTTAATTGCGTCC
TTAACTGCTCCGCTCAGCACGCCTCTTTAGAAATGTTTTTTTGCTTCTGTAACGGCTCTG
CATGCTTCTATTCGGCCCGTCTCGGTGCATTAGCCATCTTACGAAAATCAAATAATTCCA
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ACTAAAGGATCAATGCTTGCATTTTATGCGGCATGCTTTTTGGATTTAAAATGGTCTCCT
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CCTAACCAAGGAGATTAAGGCATGACGTTCTTGTACAGTTCACTTCCTTAGCAAAAAATT
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