Map Locations of contig_137016 (9801 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_137016

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_6065 1 1474 bp MLOC_6065.1 Available Available LOC_Os03g40270.1, FRAME:-3, EVALUE:0.0, 13103.m04360 protein alpha-1,4-glucan-protein synthase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_6065






Contig Sequence (9801 bp)

>contig_137016 9801 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAGCTTGCGAGGCCAATTGTCGATATTGTACTCAAAGAAGGAATGTCGCGGGCTTGAAGG
GATTTAGTGCATATCAAAAAATCTCGGCAGGTATGCGGGTAATTTCATACGGCAATCGGG
TTGACTATACCGATGAGTACCTTCGCATTGGGGAAGAAAGTACAATTGAGTGAGTGCGTA
GATTTCCAAAGTGATCATCCGTGTCTTTGGTCCTGAATATTTTGTGGCACCGAACGAGGA
AGACACAAAAAATTGATGNNATTTAACGAAAGAAGAGGTTGGCCTCGCATGGTAAGAAGC
ATAGATTGTATGCATTGGACTTGGAAAAGTTGCCGAAAAGCATGGTGGGGAATGTATTGT
GGCAAGTCTCGTGATGCAACAGTTGTGCTAGAGGTCTTAGCTTCACATGATTTATGGATT
TGGCATTGTTTTTTTTTGTACGCCGGGTACACTAAATGATATCAATGTGTTGCAACGGTC
TCATTTGCTTGTTAAGCTTGCTAGTAGTGATGCTCCAGCTTGCAACTACACTATTAATGG
GCATGAATACACAAAAAAATACTATCTTGCAGATGATATATACTTTTTTGGTGCACATTT
ATCGAGAGCATCAAAGACCCTCGAAACAGGAAATAGTCTGAATTCGCAAGGGCACAAGAG
ACGGTCTGAAAAGACATTGAGAGAGCATTTAGGATTCTGCAATCTAGGTTTGCTATTGTT
CGTGGTTTTGCTCGATTTCGGAACAAGCGTTCAGGAGATTGAAAATGCAAACACCCACTA
TCAACATCAAAAGAATCGACATGCAAACATCCACTATCAACTTCAAAAAAATCTTATTGA
GCACCATTGGCAACAAACTGGACCATTAACACATTTCAATTTTTTCATTTCATTCATGTG
TGATTTGTATCATTTCATTCATGTGTGATTTGTATACGGGACAAGTTTTGTATTAAATTA
TTTAATTTGCTACGACAATTAAATGATTATTGTACTTTGAATGATTACTGTATTTGTAAT
ATTGAAATTTATTTATATAACACATTAGTAATATTTGTAATATTGAAATTCTTTTTATAT
AGCACATTAGTAATACTGATATACGGAGTCTTTTGTTTGCTTGGTGCTTGGTCGAGGTGG
TGCCGCCCGAACAGCTCTTAGTGCACGATTAAAAATCAGGTCTTTTTTTCATAATGGTAA
ATTAAGCCAAAGAACAAATGAGTGATGCTCAACTACAAAGATTTCACTGTAACAACAAAC
GGTGCTTGATTTCTCAAAATTACATGATAAATATTATTGTCTTGAATTATGTAAATGATA
ACAAATCCTTATCCAGCTACAAAAGAACCACCAGCATAACATGAAAGAATTATAAAAGCT
GCTTCAGTAATCTCTTCCTCGAAAAGAGCTATATCCAGGCCGTAACCATACACTCTTGAC
TTCCCAAGCTAGCTACTTGGCTGCTGCCTTGCCGTTCCCAGCAGCAGCAACGGCATCAGG
AGTAGCAGATGGGTTCAGCTCGTCCCAGGCCTCGATCCAGGTGACCATGGCATCAGCAAG
CTTCAGGAAGTAAGGGTCAATCTTGCCAAGCTTCTCCCTTACCTGCTCCGAGAGTGAGAT
GTAGCACTTCTGGACTGTGTCACACTCCTTGGAAAGGGTGGCGTTCTGGAAAAAGGGAAT
GATGTCCTCCTGCCAGAAGATGCCCTTGTACTCCTTCTTCAAGTTGACAAATGGGTTGCT
AGCCTTGCTGTGCCACAGGTATGGCAGGCCAGTCTTCACTCCAAGGCTCAAGTGGTCGCA
GATGACCTGAAGTTTACACAGTTGTATCAGGTTCATTTCTTCAGTTTATTTTAGAAGATT
TCATTTCTTCAGTCAAGTGAAGTGGAAATACAAGTGAGTTCAGTTATATGCATACCTTGA
CGCACCATCCAGCCCACATGTCATCGTAGCGACCAATAGGCTGGCCATCACCCATGAGGC
CAAAGTACATTGCAGGGCCGATGAGCTGACGGTCAAAAGCAAGGTTCATGCCACACATGG
GGAACAATGTTCCCTTGGGAATAGTCAGGACGGCATCAACATACCTAAACAAAATATAGG
AGATCAACAGCAATTCTGGATGCAATACAATGATTGCTAATTAGCAGCAGAGCAGTATTT
TGCTAACAAAATGCAGTACCTGCTGTTCCTCTCACGAGGTTTGACCATCTGTGTGGGTGC
ATCATAGTCAGGGATGTTCAGCCAAAGGCCATGAGAGACAGCAGTGGGTGCACCCTCCCT
AAGGCTGAAGGGGTATCCACGAACAAAGTCCGCGCCTTCACGGTAGGGGTCATACAAGGT
ATTGAAGAAAAACGGGGTTGACGGGCTGAGGAGGTTCTTGATGTGCTGCTCAAGAGCATT
GATGTCTTTGCCAGATGGGTCCTTGGCCACCTATTTCCAAAGAGGACCAATAAATTTCAG
TTGAAGCAACACACTAAGACACTGTCAGAAAAATACAACAGTTCACCCCCACTTGATTGC
TTCATCAGGAAAGGCAAGATCTAGTGGAGACCACATGGTGTGGATCTCACAAGGTAGAAA
CATAGTTCTTTTACAATCGGATTACGTACAGAGAGTATAATGAAATTGACATACAACGGT
GCTTACTAAATATCATGGACCAAGTGACACTAAATACTCTCAATGCTTTGTTTCGTTACT
AATTGAATCGGCCAACCCGTGTTCCACAACCGCACATAAACTAGAACCTCTAACCAAATG
AAAAAAGAAGATAAACTAGAACCTCTACCCAAATGAAAAAAGACTGTTCACCTCTTAAGG
ACAAACTGCTAACGAACAACGAACAGATGGGCTGCTTGACACATGCATCAGTTGGAGAAA
ATTAATTATACACGATCACAGAGACCACTTCAGTGGATTCTCTACCGGCCAATACAAGCA
AGGCCGAGGGCTGCTTGTCCGTGTCCCGGGAGCAGCTCCTGCTCAAACCTGATACGGCTC
AGGATCTGACAGGATACTCTTTATTGTTGAAGTGACTGATTGCGGGTCCCTAGATCCAGA
TCTGATCAAGCCAGATCTGGAGAAATTAGAACAAGGCTACCCAGATCCAGGACAAAAAAT
CAATTTTCCCATAGATCCGCAGAATTCGAACAATCACCAGCAAGAGCGACTATGAAACGC
GAGTAATTTGGAGTTGTGCACAGAGCGAAAGTTAGAAAGAACTTACGAAGCAGTCGTCGT
CGATGGTGAAGACGTACTTCTTTTTGGAGACCATGTAGCCGAAGCAGCGGCACGCGGAGT
CCTTGAAGGAGATGCATGAGGCCTTTGGGCCGAGAATGCGGTTGATGTCGTTGCGGTTGT
AAAGGTCGTAGTCGAAGCCCTCGGGAACCTTGATGGCCTTACTGGGGTCGCCGTCCTGGA
CGATGATGAGGTGGTACGGCTGGAAGAAGGGGCGCCACATCTCGAGGAAGTCGAGGTTGC
GGATCGTCGGGATCACGATGTCCAGCTCGTCCTTGAGCAGCGGCGTCGATGGCACCGACG
ATCCGGGCACAGTCACCGTCCCTGCCATTGCTTCCTGGCCGGGGATCTCGATCTCGAGCC
CTGGATCTAGCTGTTCCAGCAGGCGGTGATAGGGGTGGGGGAGTAGAGAGAGGTGTGGGT
TTGGGCTTGGAAAATTAGGGGGTTATATAGCGCTCCACGATGAAGAAGACTTTCTTGTCC
ACCGATGCCTGCCTTTCTATGTGCGTCTCTCTTTTCTTTCTCCATACCAATAGTCTTTAT
GTTCAATGTTCATATAAATGTCCACGTGAGTAAACAAAAACCCATCATACAAGCTTTTTA
AAAGCATCTTTAAAAGTATGTATGTTTAATCGTTGATATAAATGTCCACATTAACACACA
ACAACACATGTTGAAAAAATGTTCATGTTTGTCTCGGATCTTGTGTGTGAACCATTGCTT
CAAGTTCATACGATTTCATTATTTATCTTCTTTTATTACGTGTCATGTCGTCAAAACTTT
CTATGTGACTGTTTTACCAACGGTGGTCATACGACTGTTGGGTTGTCCATAGTGGTGGTA
TATTAGCTCGTAACACGCACTCGGAAATAGCAAACATGCTGATGTGGCATAAAATTAAAG
AAGAAAGAGAAGGTTGGAGTAACATAGGTAGATATTGTATCATGTTAAATGTTATGCTAC
TTTGTATCATGCATGATAATAAATAAGAGTATATATGATACTACTCTATGATACTATGCA
CTATGAAAATAATATCATACACTAGTATTATATGTGTGATACTAGTATATAATACTTTCC
ACTATGAGTAGCCTTGGAGATGCCCTAATGAAGCATATGTTAATTGTACGTAAAACAACT
AAGCGGGTCCACTAAATGTTGAAGAAAATGATCATGCTTGCCTTAGAGCTTGTGCCTGAA
CTGTTGCTTCAAGATCATACGATTTCATTATCTCTCTTCTTTTATTATGTGTCATGTCAT
CAAAACTGTTTATATGACAATTTTACCAAGGATGATCATACGACTATTGAAGATGCCCTT
AGATGTGTTCTGCTCCCTGCATTCCTAAATATAAGTTTTTTAAAATATTTTAATATAGAC
TACATATGCATGAGAATGAGTTAATTTGGACCCTAAAATACGTCTATATACAACCCTATG
CGGTCTTTATTGAAATCACTAAAAAGACTTATATTTAGAAATAAAGGGGGTATTTATTTA
TTTTCTTAAGTCCTAGCTAATCATATTATACATCTATGGAAAATGTTGGAGGGCGTCCGT
GTTTGGAAGTGCCCTTCACGTCGTCACTTTTGCGCGTGAGGCGAGTGTTCGTACCTACAT
GAATTTGTGGGAGGTTCATGATGCGTGGGAAGCTCGCACGTTGGATCGCACCACGTATGT
GACCTTGCTCGTTCGCGAAGCGTCTGGCCGGACACTGTGCCCACCTTGTTGTTTGATTCC
GCCGTCTGGACTTATTTCTGGCTGCCAGATAGGCTGCCAGATGTCATGCCGCCCTCGCCT
CTTGTGTGTCGCCTCATCTAGTGGAAAGGCGATTGCCCTGGCTTTTCAATCACCTATCAT
TTGGTTATCCTGGCCAGTTCTAGCTACTTGGTTATTTGGGTGTACGCGGTTTATGTGTTA
CTTGGTTGTTGTCTTCGGTTGTGTCAGGGACGCCCATGCGTCCGATCACCCTCATGTTTG
GTCCATACAGACGGGCACCCCATGTATGCTCGTGTGACAGTGTCCTTGAGGGTGCTAGCC
GGGTCGGCCTGTCAGTCATGCATCGGCCATAACCGAATAATGTGCGATGTCAACCATGGT
CCTCGGTGTACTCAAGATGGAATCCTCCAAAGACTTGGTGCACACTTCAAGACATGTTCC
AAATAATTGGCAAGCTTATCGCTAGATGTAACTGACATACATGTAACCCTAAATGACCCC
GGTCGCTATATTAACTGAGGGGTTTAGTCTTCAGGATTAGGTTAAGTTAGATTTCATACA
TACGAACTCGAGGTAGATCATGATGTACTTTGTACTCCAACACAATAAGTATAACGAGAG
AAAGACGTAGGTTTTTACCTCTTCAAGAGGGCCTGGACCTGGGTAAACATACATATCTCG
TGTTCGTCATGTTATCACCAAGCTAAGGTCACGAGCTCGGGACCCCCTACTCGAGATTTC
CAGATTGAACCCCGACATTGGTGGCCTATGCAGTTCCAATTGTTTGGTAAAAATAATTTG
GTGGCATCATCGTTCGATGGTCAGATTTGCTGTGGTGTATCTTCTATGATAGAGCATCCA
AACCTCGGCTCAACGAAATGCTGGGGAAAACTAAAGCTCCGAACCCTCGACGGGGCATCG
ATCCCGAAGACCTAAATCCTATAGGCCTTTCCTCTGTCATGGCACTAGATTCGTCCGAGG
AGACACAAGTTATCATCGCCCGAGCATCGGTTTTGTACCAGCTATAGGGCAAAGACTATG
GATCATCAGACCAAGTGTGGAGCTCGAATCCAGTGACCTACAACAACGGCCAGAACAGTC
AGGTCATACAAGTTATCCTGAGGATTATGCGTGATCAACCTCCGGAGACCTCATTAGGGA
GGCCGATGTCAGATCGGTCTAGAATATAATTTTCTCTCCCACCCACCCCCATGTCACCTA
TTGCCCCACTAATTTTGGGGCAACTAACATTTGGGATTTAGATATAGTTGTGCAAAAAAA
CAAATGAAATAGTTTGGTTATTATGCACACGGTTCTTGTTTGTCAAGAACAAAATCACAA
ATTGCACGGACGGGGAGGGCCTAGTGGCATTCCGCCATAGTCGTTGCAATGAAGGAGTCA
ATGGGACAATGGCATAAAAACACCTTAGAATGTTTGTCAAACTATCAGACATAGTGACGA
GACACTGCATTACGAAAAATATCTGGTTAGACGAATAGCAGCGCCAACACCTGGATAAAG
ACCCGCCCAAGTCAATTGAAATGGGAAGATACTCACGTGACACCCGATGACCAAGGCTAT
ACAGTGTTGATTCACTAAATGATCAAGCGATACAGAAATAACCAGATCCATATCTACACT
AGAAGCAATATTGGATCAACCTTGCGCAATTCACTCACTACAAAATACTCATTGACAAAA
CTCATGGTGACAAAACATGAAACGTGGCCTAAAATCATTTTTTTGTGCCGATACACCATC
ATCACGTGTTTCCCTCCCCGGGAAGCACCCCCGACATTTTGGTAACATTCCGGAAAGATT
TGTGATGACGTGTTCGGTCGTCACTAGGCATGTCTATTTCTGTGACAAGTCTCGCTATCA
TAGTAAATGTTGGTAGGTCCTTTTTGTAAACATTAATAGAAAATAACAAGTACTTGTTGT
TGAGCTGGCTCATTTAGCGAGATCTCTTTCCATAATAGCGGGAACTTGGAATTGGGATCG
TGTCGTTTCCTCCTAACAAAAGGAATTGGGATCGTCGTCTTGGGTGTGAATCAACATGGA
TTGTGGATGGATTACTCATGAAACAAAGCTGACGCCATGATACATGGATGGCATGAATCA
GTTTAAATCTCCCAAATTAAAAATAAAACCATTTATTTTTTGGCTTCATTTTGATCCTAT
TTTGCTGCCAAACAAAATAATGTAACACAGTTGGTGCAATTAGTAGCTTTCATTCAAGTT
CTACCACATGGTGCAAATGTATAACGTATTTAATTAACAACACACATGGTAGTCATACCA
TAGGAGGATTTTTCTGTCATGACATCCCGCATGAGCCAACAAAGACCTGCTTTTATATCG
CAACATGGTGCCATGGGAGCTTTTATGATCCAAAAGTTTAATTATGCTTCCATGACACCA
TTTCAGGCCAGCAAAATATAGCAGAGCATTATATACAATGAGTTAAACACACATAACTAA
GATTCATACTAAATACCAAGGTTCTCAAAGTTGCACTCTCGAAACACCTATTGGTCGGAT
GACCGGTGCTGGTTGGGGATTCTATACATCATCGACGGTGGTGGGTGGGGCGTTCTTGGT
GGCACTAGCCCCAACATACATCCCCATCACGCTCTTTGAACTCAAATCGGAGATTTCATC
TTGTTTTGTACCCATCTCATGAGCACTTCTGGTTTGCTCTGAACTAACATTCGTGCACGC
TCTTCGTATTTGGCCTCCAATCTCACAATATATGTTGCATTTCTCAATTCAGTAATCATG
CGATTTTTTCAAACTTGCAAGTCTGCCATGTCCACGCTCTCATGTGTGAGAACCTCCAAC
TTCTACTACTCCTTCCAGCAGTCCCACCATTTGTCTACTGCATCCATTATCCCTACTGCT
CATGCCATGACCCGTTGAAGAGGCCCTCGTGGATCCTCTCACGGAGGACTGGAGTATGAT
GGCGCGGTATGAGAGGCCCAACGGGTACGACAAGCCATGGAGTCGATGGTGGACACCTAA
AATCTTTAGCAAAGGGTAGTAACTATAGTACTAGCATGATGCAATCAAATCAATTAGATT
CTTAACAAACATAGAACAATAGTAGAGCGAGAAGGAGCATGATCTGTGATACGGGGCAGA
ACCCCTAGGTGTCGATCTTTCACTAATTGGAGGGGGGAACCTCAAGAACACGAAGAACAC
CGAGAAGAACGAGGAAATATCACAAGAGAAAACACTCAAGAAAACAAGTCCAATCACACG
TCCACTAGACTCACCACACACAAGATCCACAAAGGTACATGAACAATATGGGGAAAATAA
GACATAGTAAATTTCATCCCAAATCAAATAGGGAGATGAGGTCTTTAATCCACTAGGGAT
CTTCCCCCGCAAGGGACCTTGACATCCACTTGGGGATTGATAAGTCTCCAGCGTATCTAT
AATTTTTGATTGTTCCATGTTGTTATATTCTCATCTTAAGATGCATTTTTGGGTAATAAT
GCACCCATTTATATTATTTTTGAGCACNNNNNNNNNNACCCAGTGCCCAGTGCAAGTTGT
TGTTTTTCCCGTGTTTTCTGTTTTTCACATTTTCAGTACTAAACGAAGTCCAATTGCCAC
GAAACTTTTTGGTGTTGTTTTCTGGACCAAAAGAAGACCTAGAAGCTTAGGGAGGATACT
TGAAGCTGCACGAGGAGATCACAAGGCAACATGGCGTGCCTAGGGGAGGTCGGCGCGCCC
TCATGCCTTCTCGACTCCCTGTGGTCCCTCTTACCCCGTTCTATTGGCCTATAAATTCTC
TAATATTCCAAAACCCTAGAGGCATACACAAAACACTTTTCACGTCGCACAAGTCTGTGT
TCCATGACGATCCCATTTGGAGCTCCATTTCGGCACACTACCGGAGGGGGGGTCGGTCAC
GGAGAGCCTCTTCATCAACCTCGATGCCTTAATGATGATGTGTGAGTAGTTCATCTCAGG
CCTATGGGTCTGTAGTCAGTACCTAGATTGCAATCTCTCTCTCTTGATCTTCAATACAAT
GCTCATCGCATCTTCGCTTTGATATGTGTGATGTAATTATGTTGTATGGTGCGTTTGTTG
GGATATGATGAANNNNNNGTTTATGTTCAGATTATGCATGAAAAGTATTTGAGTCTTCTC
TATATTATTATTGCTCTTATTGGCATGATCATGATAACGTCATAAATCTATTTGATCTAT
TGAAATGCTTTGGCCAAGTAGTTTGATCTTTCTTTGATGGTAGATGTGCATTGTAGTGGG
TTCAACCTGGCAAATTTCCATCCCCCAGTGACAGAAGGGGACCAGTCATGTATTTGTATT
GCTGCCACTAAGGATAAACGATGGGCTTTATTCATATTGATTGAGTTTACTTCGTCTACA
TCATGTCATCGTTCTCCAAGCATTACTTCGTTTGTCATGNNNNNNNNNNNNNNAGAGGCA
AGCATAGAAGCGCTCTTGGAGTAAAGTAATAGTAGTAGGTGCAGGCGGGAGTCGTACAAT
TTGCTGATGGATGTGATGCCTATGTAAACATGATCATTGCCATGAAAATCGCATAACTAT
GTGTTGTTCTATTAATTTCCCAACAGTAANNTGTTTACCCATCATATGTTGCTTTCACGA
GAGATGCCAGTAGAGAACACTACGGCCCCCGGGTCTNNNNNNNNNNNTATTCAGAAAACT
TATATTTTCCTCGCTGCCTTCTTTTATCTTTTTTTAGTTACTATTCTCAACAATTATCTA
CACAATTCACTTGCTTGCAAAAAACAAGAACAAGGGGATTGACAACCCTCTTGCACGCGT
TGGGTGCAAGCTGTTTGTTCT