Map Locations of contig_136998 (13126 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_136998

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_6041 1 1680 bp MLOC_6041.1 Available Available LOC_Os03g38210.1, FRAME:-1, EVALUE:4e-156, 13103.m04150 protein MYB family transcription factor, putative, expressed
MLOC_6040 2 2154 bp AK366355 Available Available None





CDS Structure of MLOC_6041






CDS Structure of MLOC_6040






Contig Sequence (13126 bp)

>contig_136998 13126 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGCCTAACTAGGTGCCGCCGCTTGGGATTGAGTCCGAGTTGTTGCCTTTGCTAGGTTCTG
TGTTTGGGCCGCGTGAGAGGGTTGATTTGCTTGGCGACGCATGAGTTCTTGGAACCCTTT
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GATCCATTGGATGCCTGCTCGCCTCCTGCATGTTGTCTGGTACTATGTCCGGATCCAACT
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GCAATAGTTGCATAGATAGGTCTGTTTCTTATGAACTGTATGTCCGTGATCCTACCAAGG
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ATATCTTTCCAAAATCCAACATTGGAGGGGCATCTTTCTGTTCATATGTGATGGGTTTGA
CTCTGAAAGATTTTCTGAGCCTGCTATTGTTGACATTGGTACTGTAAGTGTTATGTACTT
GGATGAGCTAAGGTTATTAATGCTAATGGCTCATAATTGCAATGTTATTTATTTTCTACC
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TGACAAAGCGTGGCACCAGGTGCAGTGGCGGAGCCAGCCATCAGATAATGGGTGTACATA
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ATTATACATGGATAATCAACATTTTTGGCAAAATAATGGGTGTACATATGTACACCTAAA
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ACACCTTGGTCTTTATTCCACAGATCACATACCATATGTTGAATTTGGCGAGTGTGTCGC
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AACTTGGCTTGCTGATGCTTTGCAATATGAACTCTGGGTGGCAAATGATGGGGCTCATTG
GAGCATTGCACGAGACATCTACTTTTCTGATCTCCCCTGGCCTATTGGAAAGGTACTCTA
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TACTGCTGCTTATGATGCTTTATCTACGAAATTAGGAGATCAATCCTTTCTTTTCGACGA
TAGGTATACTATTGTTTTCTTATGTTTTTGTTTATATGAAATGTATTTCATTGTATTAAG
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AAAAGAAAATGGATTCCATTGAAGTAGTAAAGCTATTCTAATTCGAATAGTAGTTTAGAA
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AAAGATGTCTGGATCACTAAACGATTGGGCATTTTGATTCTTTGTGGCTTATTGATGTAA
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AGTGCACTTATCAAATGCTTTATATGTTAATAATAAGGTTCTTTGTATGCTATATAGTTT
TCTTTGCACTACGTTCTAGCTGTAAAACACATTCCCCAACCCATGGCTTGAGTTGTGTTT
TGACTAACTTCCTGGCATGTCCTGCTTCTTAGGCTACATCTATGCTGCGAAGCTATTTGC
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TAGTAATTTTTCTGTTCATGGATATATTTGTTTTTGTTAGTTTCACATCCGGAGATTCTG
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TCTCACATTCTGTGAGAGCTCCACCAGTGATGATGCATAAATGCTATTTGTGTCACGTCA
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TTATGGACCTGATCTTTTCTAGGTTACAAGCCGAAACCCAAAGCTAAGAAGGAGCGGACA
GAGGAGGAGAAGAAATTCCGGCGAAGAACAAAGTACTTCCTTGCGGCCCAACTCATCTCG
GTTCTCGTCTTCCTGTCCATCATGGGTGGGGTCGATAGTTCCGAGCTAGACGATGACTAC
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CATGATTGCGGATGTGAAGCATCCATTGCTTCCAAGTTTTGTATGGCTTCATGGAGAGCT
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GCTTGGTTGGAAGTAAACGTCATTTTGTTGTTTTTGAATCTATTGTTGCCGGTAAGAAAA
TTAAATTGCCTTTGCCATGTCATTTCCCTCTGTGTTAAGAGAGTAGGAAATCCGGGTGCG
GCATTAGGGATATGATCAGAAGAATTGCCTTGATCAACTATTTTTGACATTATTTTACTT
GGTCGCTCGAATTGCCATGCAATTTGAACTGAAGTTGCCATGGGCCATGGCCAACTTTGT
AAGACTTGCCATGACCAGACTTGAAAATTGTCATGTAGCATAAAAAATGCCAATGATTCT
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CTTTACTTCATGTGATGCATATTCTGGTAAAATCGTGTTTGACAGGTTAATCCTGGATAG
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TGTACAAAAAAGAAAACAAAATCGAGGGTCAAAAAGACGCATTTTAGAGCACAAATTTTG
TTATTTTTGCACGCCTCTACAGATGTCTTTTCATGGCAAAATTTTGCATTATGTTGGGAA
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TATGCAAGGATGTAAAGTATATGTGTGAAAACTTTCAGGATGAAATACCTTAAATTGCAA
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ACATTATGTATCTAGGTATATGTGTATTTATTTTCAGATTTTTTTGAAACTAAAAATTTG
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GAATAGAGGTCTCCCATCAAAATGATTACTTATATTTCTTTTATTGTATTCGCCTCCTGA
TGTGAAAAATGTTAGCCTCGTAACTTAACGTCCATTTAAATTTTTTTAGGGTGCGCTCTC
AGCCCTGAACTGAAACAACCATTAGCATGCAAGCTGACGCGTCTGTGCCCGTCTGCATTG
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AATGAGCTCGGATGAACAGTAAAATCGTAAAAAAATCAAAAAATTCTGAATTTTGTGTGT
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AAAATTGTGGAAAAGAAAAACGATGCTCCAAAATGCGTTTGAAAATAACATTTTGGAGCA
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GCTAACAAACATTTTGACAATGTTTCATACAAAAAAAATCATAATTTTTTGAATTTACTT
TTCAAATTTTACTATTCACCCGAGCTCACTTGAGATCGGGATTAGAACGGCCGCTTCCCA
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CGCTCATGCGTTCCAACTGCTCCTTGTTCCTCTCGATCACCACCGCATTGCTTCAGGGGA
GGACACCGGAGGCTGCAAGCCACCATCCTTGCACGCCCGCACGGTATGCGGAAATTTCAC
GACGGATTTGTGACCACCAAACCCTGCAGTTTTCTTCTTCTTTGCGATGAACTAACGAAC
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TATGAGTTAATAAAAACGACATTTTTCAAGAAAAAAAATAACTCAGAGACACTAAAACTC
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GATGAGATGATCGGAATATGATCAACACTGAGGTCGACGTTGTGGTGGTCATGGTCGTTG
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TAAAGTACTCTACTTGGCAAAATATATAAAGCAAACATAACAAAGATTAAAAGTAGTCAC
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TGCCCAACTCCTAACACACATGATTGCATAAGGTGAAAATGCTTTGTTTACCTTACCATA
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TGGGCGAGGAACTGCACCGGCCGGTTGGCCATAGCGAGCTGCCCGGCGAGGTCGAGCGGC
GGAGGGCGGGCGCTGGTGTACCTTGCATCGGTGGCGTCCAGGACATTGCCGCCCGCTGAT
TGCTGCGGGGGCGTGAAGTCGTCGTACCGGCAGCGCTTGGTGATCGCGAGCTGGAACTGC
ACCTCCGGCGGGTACATGGGCAGACCGGCGCGCTGCCTCCGCTTGGCCCTCGTGTTCCAG
TAGTTCTTGATCTCGTTGTCCGTCCTCCCCGGCAGCTGTGGACGTACGAGCACAAGCATC
ATCAAGAGCCAAATTCGAGAAATCTGCCATTAATGGAGACTGAAAGGAGTGGGATGGAGA
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TGCGCGATGAGGAGCTCCTCGTCCGGCGAGAAGGCGCCCTTCTTGAGGTTGGGGCGGAGG
TGGTTGGTCCAGCGCAGGCGGCAGCTCTTGCCGCAGCGCAGGAGACCGGTGATGCGCTGC
ACGGCGTTCCAGTTGCCCTCGCCGTGCTGCCGCACGTGGTTCACCAGCAGGGCGTCTTCG
GCCGCCGTCCAAGGCCCCTTCTTCAGCACCACCGGCATGGCTTCCTCCTCCCCCTCTCCC
CCCTGCTCCGCCTCCTCATCAAGATTGTCTGCTGCTGCCGCCGCCGCCGCCATCTTCTCC
TCCTCCAGTGATGCCGCGTCCATAGGCGGCGCCAGGGAAGGACGGAGGAGGTAGAAAGAC
ACGGTTGTTTGGGGTGGCAGGGAGGAAGGAGGGTGCAGAGGGTAGATTTAAGCCAAAGTG
TGCTAAAAATGGAGGGGCAGGGGTTTTCGGTTTGTGTGGTTTGCAAGTGGTTTTTATACA
GGTAAAAAGAACGGTGACACTGTAATGGCTATCTATGCTCACCGTGTTTCTGTTTGGGGC
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ATCTGTTACGCATCCGACAACAGATATAATATTTAAGCATTTACGACTCAAGATTTGAGC
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GGGGCAAGGGTTTTCGGTTTGTGTGGTCTGCAAGTGGATTTTATACGGGTGAAAAGGACG
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GCAACCCGACAAAATAGTTTTAGAAACGAGAGAGGTGGCCGACCGGTGATGCTATCGGTT
CAAGTTTTCACCGCTTCAACCGTTTCTTTTTCTTCAATCACGTTTACCATGGAATCCACT
CGAGAGAGATGTTTGTAGCCAAGGAATGTTCCGGCCCCATAAGATACATATCAAATACAT
AAGATAACATAAAAATACTTTGAGTGTATTTTGATGGAAGACCCTTATTAATCGAACTAC
GACTGACACTACTACAAAAATGTCTATCCATGATAGCTCATCGAAGACAATTTTGCCAAA
ATATGAATCAAATTTAAGCCAAAGTTTGCTAAAATGTAGGGAGGAGGGTTTTTGGTTTGT
GTAGTTTGCAAGTGGTTTTTACATGCGAGCGGTATTTCTGTTTGGGGTTCTCCTTTTAGG
AATGGATTTTTCGCACCCAGCCGGACGTTCAAGAGTTATTTTGGTCATCTTTTATGCACC
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GCCACCCTATTAGTACTTCATACATCTCCAAAATATCTGTAATTTTTAGTTGTTTCATGC
TATTATATTATCAATCTTGTATGCTTTATATGTCATTTTATATTGTTTTTATAGACTAAC
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ATCCATACCAAATCGTGTCCAAATGCAACGACACTTTTTGTCAGATTTTTCTGGACAAAA
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AAAACCAGCGCTATAAGTTCCCATATATCCAGAAACTCTCAGAGCGATACCCGAAACAAT
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TTAGAACATATTATTTTATCTTACTTTGTCTACATTATGCCATCATGCTTGAAGCGTTAC
TCTGTTTGTCATGAACTTAATACATTTAGATGCATGCCAGATAGCGGTCTTGGGGTGGAG
TAATAGTAGTACATGCACTTGGTGTTGTGGAACATTGCATGGGAAA