| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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Predicted Genes from contig_136870
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
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| MLOC_5926 |
5 |
2796 bp |
MLOC_5926.3 |
Available |
Available |
LOC_Os02g17780.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13102.m01986 protein ent-kaurene synthase, chloroplast precursor, putative, expressed |
| MLOC_5927 |
7 |
3307 bp |
MLOC_5927.6 |
Available |
Available |
LOC_Os02g17780.1, FRAME:-2, EVALUE:0.0, 13102.m01986 protein ent-kaurene synthase, chloroplast precursor, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_5926
CDS Structure of MLOC_5927
Contig Sequence (15254 bp)
>contig_136870 15254 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCTACTACTATCAACTTAGTAGTAGCGGTGGTTTATACCACGCGCTACTACTATCAACTT
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ATACCACGCGCTACTACTATTGCATGTTCCGGAGGGCATGGTTGAGACCACTTAATAGTA
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TTGGGGGTAATTCATGACCCTGTGTCTATTGTTTATCTTGACTGGCACATTTCAGTTCCC
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GGAATCGCCCGCCACTTCAAGCAAGAAATTAAGCAGTGCTTGGACTATGTCCACAGGTTT
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GATGACACCGCCATGGCCTTCCGGCTGCTGCGGCTGCATGGATACAACGTCTCCCCGAGT
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TGTTGCAGCGTGCAGGGAGATTCTCGTATGAGTTTCTTAGGGAAAGGGAAGCCCAGGGCA
CGGTTCGGGACAAATGGATCATTGCTAAGGATCTACCAGGCGAGGTAAACATGCCAATCA
ATCGGTTTTGATGGATTAGGAAGTAAACATAACTCTCATAATCCTTGGTTCGAGTGCTCA
CAACGCTTGAGGATTATTATTTTTGAAATCCCTAAAGAATTATAGTTGATATTTCCATAT
ACAATATGACTGTTTCAAACACACTCTTGTTAGGATATTTTTTTTAAAGTTAGATAACCT
TATTCGGGTACGAACAAGAATATAAATACCATGATTACAGGTAAAATATACACTGGACTT
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TGACAATGATGTCTGGATTGGAAAGACACTCTACAGGTAAAAAAAAAAAGAATAGTCGAA
TTCCAACATTCCAACAATTGGTTGGTTCCATGCTTTTTGAGGAAAGATCCCAGAGTTGAT
ATGCTGAATGGCTTTGGCAGGATGCCACTTGTGAACAACAACACATATCTTGATTTGGCA
AAGCGTGATTTCAATCGCTGCCAAGTCCAACATCAGCTTGAGTGGCATGGCCTACAAAAG
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TTATTGGCAGAAGAGGCGCTACCTGTTGGTGAAGGACCAATTTACATCAACAATTTGTTA
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AATGTTCTCTTTGGTAAAAATTCTAATATATTTTTTGAACCTCAGTGGATTGAATGGATG
ATGCAACTGATAAATAGAGAAGATGACACGTACGATTCAAGTGTTATTCAAGCAGGGTCA
TGCATGGTTCACGATAAACAAACATGTTTGCTCCTAGTAAAAATTATTGAGATTTGTGGT
GGACGAACCGGTGAAGCATCATCGATGATAAACACCATTGGTGGTGCTTGCTTTATTCAA
CTTGCGTCCTCTATTTGTGACAACCTTCACCACAAGATGTTACTTTCTCAGGTAGCTCTT
TTATGCTGAAATAAATTTATTGCCATGTTTTCTATTGAACTATGTGATACATGGTTGATG
GTGTTTTTCCGATTTCAAGAACTGGACACACTGAGAAATCACTGAACTGTTCTAACTCTT
TCTTGGTTACTCGTGTGCAATGAATGACTAACATGTGTAAACTCAAGCGGGCTCTCAAGC
AAGCTCCAAAACAATAGGGATATCATGCTAGTTTTGGCTTGTAAATTAACTCATAATAAC
TTCTATTAAGTTGGCACTAGAATCCATCATGGCATTCATTAGAAACATGACAGGTATGGT
GCGTCTGTTGAACTAGTTATGCAATTTATTTACAGGACACCGAAAAGGATGAGGCGGCGA
TGAGCCGCATGGAAGAGAAAATCGAGGCGAGCATGCAGGAACTCACCCAGAACTTTCTCC
GGACTCATGATGATGGGACGAGCAGCGAGACGAAGCAGACCTTGATGAGCGTCGTGAGAA
GCAGTTACTTTGCTGCGTACTGCCCTCCCCACATATTCGATAGACATGTCTCGAAGGTTA
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TGTATGTACATAGAAAAGAATGCTGCAAGGAATACTAGTGAAAGGAAGGACCTATAAGTT
GAGTTGGTTGTTAGGTTGTTTGTGTTGCAGTTTGTTGTGTTTGGTTATCTCTTCATGGGG
CGATTTTTTTTAATCAACAAGATGCAACCCCAACTACAGGATGCAACCCTAACTACGGGA
TATGCCGTGTTCACGTTGAGCGCCATACATTTGTTTTTAGGCTATGGGCCAACCCATTAG
TGTGCTCCTTCGTTTGTTTGTTGCTTTGTTGGTCATTCTTTTTTATTTATTCCTTATTTA
CTATTGTCTATATTTTAAAAATATTATATGTATATTACTGTATATACAAACATTACGTCA
CTTGAAAGTTTAAAAACTTTCATCGTGCATTTAAGAAAATGTTAATGCAGGGTAAAAAAA
TGTTCATGCAATTTTTAAAATGTCCACACCATTCAAAAAAACATTGTTTTGACATTTCAA
ATGTTCACATATTTAATAATTTGCTCATGACATTTTTTAGTAAGTTCATGCTACCTAAAA
TAAAATCATGTAATTTGTAAAAATGTTTGCACTATTAAAACACAATTGGTCACAACATTA
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GTAAATATTGTTTGTGTAATTTTTACAATAATGTTCATAATATATATATAGTTCATTAAA
TTTATAAAAATGCTCTCATAAGAAATTTTGACGTGCATTTTAAAAATGATCTGATACTTA
ATTTTCAGTGTGTGTTACAAAAATGTTATGATATTTTCACCTTTTAAAAAAGGTTCATCA
TTTTTTTACAAAATTTTGAACATGTGTTTAAAAAAGTTTTTGTGTGTTTAAAAATATGTA
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AATTATTTTTATATGTATTCAATGTATATTCAGAAAAGGTTGGCATGTATTTGAAAAAAA
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TTACATGCCTGCCACAGCAGCTTCCGCGTAGCTGGCATTGCCGGAATAGCTGTACCGGAC
AGGGCGCTGGGCTTGGGCTTAGCTCCTTCTTGGCCAAAATCCCGGGAACCATGGCGCCTG
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CCCCTGACCAAACAACCAATCCAACTTGACAATTCTTCCACTGTTACTTTTTACAGCATT
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ACATGGAGAGGGCAGTTAGCGGCGTAGTAACAGCTTCTGACAACGCTCAATACGGTCTGC
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TGCATGCCCGCCTCGATTTTCTCATCCATGTGGCACACCATCACCTCGTTCTTCTCAGTG
TCCTATAAATATATTGCATATTTAGTTTGATTGGTGTCAGATGTGTGCCTCGGTTTCTAA
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TTATCTGAAGAACAATTGGTCAAATGGATCCAATTAAGCATGTACATATTTATAATTTGG
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TTTTACCTATAATCATACATAAAGGTATTTATATTCTTGTTCGCATCCAGATAAGGTTAT
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CCCTGCACGCTGCAACAAGTCCTCTCCAGGGAACCTTACCTGAGAGGCCCTGTTCAGGTT
GTACATCCCAGTGACTGCTTGTGTTGATTGCCCCACGAAACAGAAGAACTCCCCGTCCTT
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GACGATTCTGTCGATGTATTCGAAGCATTTCGCGTCACCGGTTTGCATGAGAGCGCAGGC
TGTAGCCGAAGGAGAATAGAGGAAGGACCCATCACTAGACTGGAGCCTGAGGATTTTCTG
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CATCTCCATCGGGATCCTACGGAAGTAATTAATAATTGACTAGGAAAACTGTGAAGTAAT
CTGCATCTCTGGCAGGAAAGAAGATATATGGGGTACCTCTTGAGCTTCACTTCTCTGTTG
GCATATATGCGCTGCAGAGCATGGTGGTCATACGGGAACCCAATGCCCAAGCTCTTGGCC
ACCTCCAGGAGAGAAGGGAACGCAATCTCGAAGCCGATGGGCATCGACTCCAGGTCTTCC
TCTGCTAGCCTCCACATGTTTTCCTCCAGAAAAGATAGCCCTGAAAAGAAAAACAGGATG
CATCATGCATGCATTTAGTTGAAAGACCTTGCTTCTTTTGGTACTTTAGCAGAACAGTTG
TGTGTATCAGTTTGTAGATTTGCAATACCTCTCCTGCATTTATCAGGGCCAAGGGACCAC
TTTGTGAGAGCCACAACACAGGCAAGGGTGTTAATGACCCGATCAAAGGCGGAGAACAAG
GCAGCATCTCCCCAGGAGCCGTCTGGGAGCTGGTTGTCAAGAATCCACCGGAGGGTGGTG
GGAAACTGGGGGCTGTCACCGTCATCAAGACTCGGTACCAGAGCGACCCAGGCGGTGTCG
TATGCCGAGACGTTGATCTCGCCGTCACTCATCGACCCTAGCATCATCCTCACTTTGTCG
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TGTTCTAGAATCCGGATATCATTTCTGACAAGGTTCGTTTGCAATCCTGCAGGTACGTCG
AAACACACGAATGATTAAATGTATCCAGCTTAAGACATCACATTCATTTTGAATTAACTA
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ATTTTATTAGCTGATGAAAGAACGATGGCAGTGACAGTATTATAGTACTGACGGTTATGG
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TCTTTTGTATTGTTCTAAAGTGGACTTCATATAGGTTTGGGTTCCTTCTCTTCGTGAGGC
CAAAAAAATAGTCGTTGACGAACCGTATATTCTTGTTTTGCCTACTAATTAACGTGTTGT
GTGCTCCAAAAAATTGAGTCCTACCCTTATCTCTAGTATACCCTTTTCCTGTGTTTCTGT
GCACTCTATCAGTATCTTTGTGACTCCTCTGAGCGACAAATGGCATGCCGTGTCGTTTTG
TAAAAAAGAACCTAGAGATATTGAAGTATCATTTGTTCTTATCACCTACTAATTAACGTG
TCCTGTGCTCCAAAAATCCGGATCCTACCCCCTCCTGATTCATTGACTGATCATTCGTTC
ATGTCTCACCTGCTAATTACGTGTGCTATAATTGATATAACACGTAGCAACTCACCGGAG
ACCCTTCGGTCCTCCGGTAAACTAGTAGCAGCATGTGTAATTGAGCTCCAAATGGGTTAA
TTATGTGGCGTGCAGTCGCTAAAGAGGAACATGATAAAAATGACTAAAACAATATATGTA
CTCATTAACTGCCTACAGCTTGAAAGTACATAGGCTGGCATACTTGCAGATAACAAAACA
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GATACTTGCCCAGTTCTAGCTAACAGTAGATAGTGACGCTAAAAGCGAGCGATGGAGAGA
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GAAAGTGGTCAGAATCAGCGTCTCGACAAGTGCATCTGTCGGTTTCGTTTCAAATTCAAC
ACAGCATGCCGACATTTGTGCGCGATGGACAGGGCGAAACGAAACGGTCTCGAGGTGCAG
GCATCACAATTCGCGCGTGTGAATGACAGACAAAACCTCCTGCAACCGCACCCGCACCCG
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TCGCGGCACACGCGAAACATCGTACGACAGGCAAACCAGCGCCTCGCACGAAAAGCACGA
CAGAAAGCGACATCGATCGAGCACCTTTGACGGCGAGAGCACGCGTCCGCGGTCCGTGGC
CGTAGCCCGATGGCGCACACGCCAGCGGCAAGAGCAGCAGCATGCTGGCTGCGGCAATGC
ACGTTCCTCAATCCGCAGTGAACACCACTCCTCCAATTGATGCCTCCCAACGACGAGTGT
TAAGGATGATGATGAGCTGTTGATAACGATAACGATGATGATGCAAAAGCGAGGGCGGCG
TAAGGGGTGGCGGCTAACGGACGAGCGAAACAAACGAGGACGGCGCGCGGGGTTGCTCGG
AGCGACATGAATGAATGTGTGCCGTGCAGCGAGATGCATATATAGAAGGATACATACATA
GATAGATAGATAGATAGATAGATAGAAGCAAAGAAAAAGGGGGAGAAGGGAATGATTCCT
GCGCGGCAAAGGCCTCTGGTAGTGGACAAAAAGGCTTGCAAACGTTGGCTTTGTGAACGG
GTGGTGTGAGCGTGCGCGCAAGATTCTCCGCCCCATCACGCCAAGATGCGCGGCAAAGGA
GCCAAGATCCTTTTTTCTTGAGCCGGTAACAAATCCGCTTCGGTTTCCGCAGATCCTGCT
GTCTCTGAGCGGGAATGGGAAAAGGGAACGCGCGTGTATGATCTATCTGCGTAGGGAAAT
TCCTCGTGCTGGTGCCTATGTTCGGTGGCGGCTGGCGGCTGGCGAGACGGGACGAGGGAC
GAACACATGGCATGAGCTATGGCTATGATGCGCGAAGGGGAGGGGGGTAGGGTGTGCGCT
GCCGTACCTTGGGCGTAGCAGGCCGCGGCGGCGCCTGGAGGAAGCCGCGCCGGCGGGGGA
GATCAGCTGCGGCGGAGGGGAGGGGGGCGGCGCCCCCAGGGTCGCCGGCGGAGGGCGGCG
CGGGTGGGCCGGCG
