| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_136792
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_5857 |
5 |
2933 bp |
MLOC_5857.3 |
Available |
Available |
LOC_Os12g05600.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13112.m00564 protein hydrolase, alpha/beta fold family protein, putative, expressed |
| MLOC_5856 |
6 |
8032 bp |
MLOC_5856.1 |
Available |
Available |
LOC_Os12g05640.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13112.m00568 protein pentatricopeptide containing protein, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_5857
CDS Structure of MLOC_5856
Contig Sequence (14281 bp)
>contig_136792 14281 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGGGTAGGACAAAATATATCATGCAAGTTCTTTTCCATAANNNNNTATGACTATTTACGA
AATACATCTACTAGACGTATGCCCCCCCCCCCGACCGCCACACCGTTGTAGAGGGTTTAC
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TGCAGCCAGATTTGATTACTTACAATTCCTTGATAAATGGACATTGCAAGGCATGTAATT
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TGCTTGGTGAAAAACTCTGTAAGAATTATCCCTATATGCATATTCTCTTTATCAGTAGTT
TTTTTAACGATTGTAATTTCTTCCAGCATATTTTGATTTCTGCTTGAATCAGCAGATGAC
AGATGGAATTTGGGGTGACACTCTGGATAAAGGAGCTATGTGATTTCCAGACAGATAGCA
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TGGTCATGGAGAAACAACCCCCATTGTTTTTTCTTTTCTTTCGATAAGGCGTAATGGAAA
TCTTTTGACCATGCCTCCCCAATATCTACCATCTCAAAAGTGAATGGCTATGGACCTTTT
GGGCTGAGCTTCAATAATAACATATAGGCTTTCTCTTGGTAAGATACTACCAAGAATTTT
GTAAAACGAATAATCCTTGTACCACCGATTCACGGTCAATTTTGCCATAGTCATCTGGCA
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TTTTCTATACTGCTGCTAGATTGTGGAGCGGCTTGGCAGGAGGGGACTGCCGAACTACGG
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GAATTGCTGCCCTGGAGAGGTCTACAAGCCTGCACTCCAAGGCCAGGGTGTGAATTCGGT
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GAAGGCTGCTTGTTCGTGGTGGTTTGGCAGAAATTATTTAGCCTTCCCTAGCTAGGCATG
CTTCTGTACGGTCAGTTTTTTCTTTTTCTTTTACCCTTTCTTCCTTTGGCTTGGTTCAAT
CCAAATTCGGCAGTTTGTTGCTCAGTTTGGGGGCAAAGTTGTAAGTGTTATTTCCTATCC
TAATATGATGTCATGCAGGCCTACTGCATGTTCTCTAAAAAAGAAAGATTAGATTTCCAG
TGCAAACCTGTTTAATTCACCTACAGTATGTCTTTCGGCGACTCTTCGAATGGTCAAATT
CCATCCAACTTCTCCTCCTAGAAACATTCCACAAGATTAGGATGATAATCATGTGCACAA
GCCTGGGGTCATCTGTGTTGATTAGTAAGCTGATCCAGTGAATTCTGATATCTGGATCAC
CTGATTTATTTTCATCCTGTTCTGTTTCTTCCGAAGTAATTCTGAAAATATGGTTTATTT
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AGATATTATCGAACCTATGCATGTTTGAATTTGATGTCCAGTACCTTCCATTTGTGAAGT
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TACTCTCTCCGGTTGGGTTTATAAGTCGGGCATGGATTCTTAGGTCATGAGTTTGCCTAT
GAAAACATGTTACTCCCTCCGATCCACATTACTTGTCGCTCAAGCGGAGTACATCCGTTT
GAGCGATAAGTATATGGATCGGAGGGAGTATTACATTGTATAAAAAATATATCTTTAGAT
GAGTGTCAAATGTAGTTTCTAACCATATAATTTGTGTGGCATATTATAAATGTTTTCTTA
GTCAAATCGAAGACCTAAAAACCTGTGCCCGACTTGTAAACCCAACCGGAGGGAGTATTT
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TAGGGTACTGGAACTCGGGCCTATACACTAACTCTAACATTGCTTATATTTGATATACGA
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TAGTACATTTGCGAGTGTGCCTCATGGGCAAACTAGGGCAGTAGAACTCATGGGCTTATA
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TTCACGTAATAAAAACAATGTGGCAGTGTATGCAAGTGACATGACGGAATTCAGAGTCAT
GGAGCCTTTAACATTCATATGAACATTTAGTACTAAATATATCTCCACTCATGCCACACT
AATTCACTAGTAGTGCATACTGCACATAGTTCACTCAAGTTTCTAATCCACTCAGGTTGC
TGTAATCTTCCTCGCTTGATATTTTGTTTCTCAAGGAAACACAAAAGTTATGCGTCTCGG
TGCATTGATGGAACAAGAGAGTTTATCTATATTCCTTGGATTAGGCCACAACACACGCAC
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TGTTTGCACCTTCGAAGATCATACCTAGGATATGACCTCATACCAGCTTTGGCTAGCAAA
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ATTGCATCTCTAAGCCTTCATTAAATCATTTGTTTGAAACACTGTGTATGCCTATTTGTG
CTCCCTAGAGAATACACTTAAGTATTGAATACATGAATGTTGTTTATTCTATTGTGAATT
TAGTTTCTGTCATTTGATTTATCAAATTCAGTTAACTTCTTTATTGGGATTATGGTTTTA
TTATGTTGGCTTTCGATATATGTATGTAAACGATTTCAGGCTACTTTATTTGAGTTTGGT
ATTTCATATGGCACATGAGTCTTGTAGCCTAGTGCATGGCAGTAACAAATTTTTGGGTGT
GCACATGGAAATACTATGGACTAATTTTCCAGGGTGAATCACTAATGCCAAATTTATCCC
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GGTAATCTTCTACCATGCAACTACTATTTTATGGTGTTATTTAAAAAAAACATTAATGGT
TTATTAAACTATCTTTGTTTATTCTCATAATTTCTCATTGACTTGAGTTGAAGCACATGC
ATGCTTATTGTTGAATAAGCATTATGAGCATACATGCTGCTTTTTTAATACATGACTTGA
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AGATACTTTAGGCAGACAAATATTGAAATAATTTACTCTGCTATTTGGTTAACATGGTGA
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TTTATGGGGGAAATAACTAGTAAGAGGAGTTCAGATTTTGTTGCTCAGGATGACCATGAA
TATTATTGTAAGGTTGTGTTTCTGATGAATGTTAATCATGATGTTAGAACACTAGATGCT
GCATTTTTTGTTCCTTACAGTGATATGAAATCACATGTTTGTTGGTTGCAATGAAAACTG
GAATCCATCTATGCAATTACTAAATCCTGATGTGCCTTAATGGTTTCTCATATGGTATGT
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TTAGATTCAGTTTTTTTTAAGACTCGTGGTTCATAAAAACATCCAGAGTATTGAAGTGAG
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CAATGTACTGGAGAACAATAGTTTTTTTCGAGAAAACGCAAAAAGCCTTTGCGTTTCATT
GCATTGAAAAGGGAGGGGAGAACATCCTCCTAAGAGGCCAGTGAGCAAGTGAAGTATGAT
CTATCATCTTTTGAACTGGACAAATTTGGTGTCCCACGGGATAAAACTTGGGGGAAAGAA
GTTCGTAGCATCTGCACTGCCCAGTAACAGCTCAAAGATGAATCTTTAGTCACATCGGTG
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TTAGTGTAAATCGCAGAAAGGAGTTTACTGTTGCACTTGTATATCTGTATTTCAAGTGTT
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TCATGTTTGCTAAATATTTCAGGATGATGCATGGCTGCCGCAGAAGAAGGGAGCCATTTC
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TCTGGTACAATGAGCTTCTTGAAAGCCTGCCTGGACACCTCTGGTGGGAAAGAAGGCCAC
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TTAGCTTTTCAACTCTGAAGAGTTTCATATTTCATGAAGATACATATGGCTGGAGTTTCT
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CGCTTTCTTTGTGTGCCTCCACTACTCCGGCTTGTTGCTGAATGCTGACTGTGTAAACAA
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GGTTTAATATGACGAAGGTCACTTTTACCATCTCAAACGCTGACAAGCTACACACTTCAT
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TGATCAATACAACAAATGTCTACAAAAATTTAACACTAGAAACAACATACTCCAATATCA
TCTACAAAAATGAAGTTTAGCAATATATACCTCGCAAGCGTTTTGTCAAACACCTTGTGG
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GCGGCGCGCGCAATGGGGGAACGACAGGTGGAAGCGCCGACGGGTCGTCGGAGAGGATGG
GGAAGTCGCGCACGCGAGTGGATGTTTCAGATCCGGCGGTTGGTGGACATTCGTGCGGGC
GAGTCGTTGTTCAGAGTAGCGGACGTTCAAAAAAAGCAGCACACAATGTAGTTCTATTCG
GCGCGCAGAGTGGTTTTTAACGCGTGATTTTACGCATGTGCTAGAGCTATCGATTCGGTC
ACGCGCGCTAAAAACTGTTTTTAGGCGCGGCTTATTTAACGTCTCTGTTGGAGATGCTCT
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AAAAAAACTGGATGAAAGCCAAAAAAAATCAAAAAACTCATCTAAAACCCGAAAACATGT
ATATAAAAGTAAAAAGTATGTAATCTAGAGAGTATGTCGAGTACGTGACATGTGATGACG
GTTGGATGCACTACTTAACCGGCTCTCAAAGCATCAAAAGTGACCCTCAAGGTTTACCGT
AAGGGGTAACCTCGAATTAGTTAGCTCTCCTAATATGGGTCGACAAGCGACTGCGACGGC
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ATGTTTGCGAAGGAACTTACCCCTGAAGGCGGATTAAAGGGGGAAGATTTGAAGCAGCGG
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AGTCGGAAGAAATGGAAATTACCTCGACTTCTTCATCTTGGCTCTCCATGTCACCATCCT
ATAAACAAAAACGGCAAAGCTTAAGTATGGACCGAGGTAGAATTAAAGGACAAAAAGCAT
TTACCTCTGAGTGCTCCTCTACCGCACGAGACTCGCCCACAACAAAGGACTCTTTGGTGT
CGGCTTTGCCCTTAGCTTTCTTTTTCTTTGGGGCGGTTTTCGTTGTCGTCTTCTTGGCGA
CGATTTTTAGATCTTCGCTTTCAGAAAGGCGAGTTCTTCTGGTCAACATGATTGGAGACC
GGGTCAAAAAACAAGCTCAAAATTATAAAGAGAACAAGACAGGCGAGTCAAGTTATTTTA
CTTGTGGTGCAGGGTTGGAGACACAGAATGGTTTTAAGCCAATCTTGGCGCAATTCTCAA
TTGGCTCACCACATTGTTTCTTCACGATATTGACAATATCCTCCTCTGCAATCATGACGT
TGTAGAAGCATTGCGGATGGGTTAAGCTGCCATCGTATTCGCACATTAAGCCGCCCCGGC
GGCTCAGAGGCATGATCCGCCATTCCACCCAACAACGGATCAGATCAACTCCAGTGAGGC
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