| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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Predicted Genes from contig_136693
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_5785 |
1 |
1349 bp |
MLOC_5785.1 |
Available |
Available |
LOC_Os07g34570.1, FRAME:-3, EVALUE:1e-163, 13107.m03521 protein FAD dependent oxidoreductase domain containing protein, expressed |
CDS Structure of MLOC_5785
Contig Sequence (12415 bp)
>contig_136693 12415 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGAATGCCGCGAGGTTGGCCTCAAAAGATTCTGGAGAGGGA
TGCGCGAGCAGGCACAGTGCAGAGACTTGGGGCATACAACCCGCAGCCGCGCCAGCATAG
GCGTCGTGATGCTGGTTCAATTGGTGACCATATGGAGAACCAGCAGCCAACGACTACAGG
GGAGGGGCCCGGTGCAGGGGCACGATCCGAGCACGCCTGGTCGGAGCACGATCGTGATCG
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CTGGAAAAATATACTAGTGGCTACATTAACAAGTTGGAACCATTGTTCTATCATCCATTC
ATTAAAGATTCTTCTAAAAGCTAACATTAGCTGATTACCATCCCAAGCATGCTTGGCAGT
TTTATAGGGATCTTTACATATGGTGTAAAGGTCCAAAAACTAAACAACTAAAGGGCAAGT
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TCAAACGATTTATTTTAATGCCTTATATGTCTCAATTTTATTGCTCTCCTTCACATGTTC
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GTTCTTGATCATATATCAGTCACTCAAGCATGCATTGCAAATAATTCATTGGTAAACACA
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GTTGTTTTATACTTATGATCTATTATCATCCTCTAGGCTTGCCAATGCGCTGGTTTTATC
TTTTAATCCAGGACCCCAAGAGGCAAATGTTGACTTCTTGAAACTAGATTATACCCTGCA
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GATTCCAGAGATAATTAACCATTTGAGTGTTTATGATCTCTATAGCCCATTTAGAAAATT
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TCAAACCATCTTATTGGTTGTTGCCCCAAACCAGATACTAGCAGACGCTTTGGAGTCACC
TCTGTCGTTCAGGCGTCCACGGTGTCACATTGCTCGTCGACACTAGGACAGTCGCCGGGT
GTAGCGCCTCGACTCCCTTGAGTATCGTTGTTCGTCGATGTCGTTCGGCCGGCCGAGCGC
CTTGAGTGCCAGGTGCGCTGCCTTCTGGCCGGAGATGATCGTGGCACCGAACGTTGGAAG
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GGGTGGAGGTGAAGAGCGCAGCATGCTTGATGACGACATAGTCCTCCTGCTCGTCGTACT
CGATGTTTATCTCATCGAGCAAGAGGTGTGCCGGCTTGCGCACGACCATGGCGGAGAAGA
GCTGGCTGCCGAGCCAGCCGCTTCCGCCGGGGGAAACGGACCGTTCAACGATGGCGATGT
TGACAGACGGGTCCTTCGAGAGCTCGTACGCGCAGGACAGCCCCGCGGAGCCAGTTCCGA
TGATGATGACATCTGTGTTGACGTCGGCGATCATGTCGGTCATGTACCGACGGGTCATCT
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GGGTAGAGGAGGAGATGGAGTTGCAGATGGCCGCGACGCGCCGGGTGGAGGCGCGGGAGG
GGGAATGAGTGGCTGTCGGAAGGCAAACGACAGGGAATGAGGTCTTGAGGAAGCTGGAGG
CGGTGATTGTCATGGCTGCCATGTGTTGATGGGTCTTTGCTAGGAAATGGATGGAGCTTG
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TGCCTTTCCTTCGTAAGCATATATCTCTTTTCCTTTGCTAAACTAACAAACATTGGATTG
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ATTTATTTTCATTTTCTTCTTTGGATGTGTGCATTCTAGATGTCTCGGCGACATCTTCCA
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TTCGGCCGTCTTCTGTCACAGCGAGCAGGGCACTGAACGAGCAACGACTTGTTTGGGCTT
ATTTATGAAGGTGCCCTGCTCCTACAAAGGTGCATGTTTTTGCATGGCATCTTGCGACAA
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GACGAGTACCATTGAAGTGGGGGCTAGCCTTGAACTTTGTTCATGTCCATGGAAACTTTG
TGAATCTTGATTACATAAACTTTTCAACAAAAATAATTACCACCTTGTACAAATCCATTG
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GTGTTGTGCAAAAAAAAACTTTGGTTGTAGTGTTTAATTTTTCCAATTTTACTAGAACGT
CAAAAAGTTCTAATTTTTTTACACATTACTGCTATGCAAAGTTTTTCCACGTCCTTATTT
TTCACAAATTTCTGAGATAGAGAAGTATATATTTCATCTGCATCTTTAGAGACTGTCCTG
TTTTTCACAGATTGTTGTTCTAGTTGCTTTGTCTACTTATGTTTGAGTTCTTGTTAAGTC
CGTTGACTTGGGAGCTATAGAATTGTGATATCATACAGTAGGGAATGTTGTATAATAACT
ACAGAATAATGTTATGGCAGGACAAGATGAGATATTATATTATATGCACTAACCTTTCTA
ATAAAAGTTTTGTCAAGTTTTGTGTGGATGAAGTGTTCGAAGATCGAGGAGGTATCGACA
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CTTGGAGCGTTGACACTTGTGATCAGTGTTTGGTTTTCCGTGAAGAGGAACGGGTTATCG
CAGCACAAAGTGGCTAAGTATTTCCCTCATTTATGAAACCNNNNNNNNNNNNNCCAATAG
GAATATCAACCACATCCGTCTTCAACGGCTGCACACAAAAGAACAAATAAATTGC
