Map Locations of contig_136523 (12157 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_136523

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_5660 1 571 bp MLOC_5660.1 Available Available None
MLOC_5661 2 1874 bp AK360731 Available Available None





CDS Structure of MLOC_5660






CDS Structure of MLOC_5661






Contig Sequence (12157 bp)

>contig_136523 12157 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CATGCGACGTTCCCCAACAATTTCGACACCGTTATTTTTTCACCTAAAAAACCAAAAACA
AAATAAAGCAGGAATTTGCCTTTGGCACTTGGTTATAATGTCAATCCAAATAGAACTAAT
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TGGATAGCGGTCGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGGCAGGAGTCGGTCTACTTG
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AAAAAATACCTTCGTGCAATTTATTTACTATTTTTACTTTTTATATTTATATTATCTGTC
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GTGTGAGTCTCCTATTGGTTAGATAACCTTGGTTCTCACTGATGTAAATACTGATCTCTA
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GCTTAATAGTGAAGTATATGAAAACTCTCTATATGAAGTACATGGTGCTACTTTGAAGCA
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TCATTTTTATGGGATCTTTTTTAATGGTCTCCTTTTGGCCTCCTTTTTATCCTTATAGGT
AGGGAAACACTATAATAATGCATCACATTTTATTTTACATACAACTCAAAGATATGAACA
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TCATGCAAAGCAATATGACAATGAATGTTCAAGTCATATGAATGGTAATAATGGAAGTTG
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TGGGAGGAGGTTGTGTTGAGTTAACCATCGTGCGCCCCCGATCCGAATACACAAAGATTT
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ATGCATATGGATTCATGAACATTAACACCAATATTAATACTTAGCTTTAATTTTCTACAA
ACAAACTCACATATTACAACCTAACTATCACAAAAATATCACAAGAAATAAAACTTCTCA
TGTTCAATGATAATGTTTTATGCAAGTTTTTATATATGCCATATGTACATACCTACGACT
AACCATGCAGATAACCAATTTCTTTCGACTCTCCGAAAATATATAAGTGAAGCAAAAGAG
TTAATCCTTTCTACAAAAGACTTGGCCAAACTCTAACAAATATAAGTGCAGCAAAAGATC
ATTCTAAAAATAACAGTATTTCGAATGTAGAAAAACGAGCATCCAAACTTCAAAATATAT
GCATGAAGCACACGAAGCATTCTATGATGCCATACTCAAAACATATGCATGAAGTGCAAA
GACCATTCTATAAACAACCATGGACTATCTCATACCATCATGATGCATAACTAAAATAAA
AATAGAATTAAACATACCTCCACCCAAGGAGGGTTGTTTATTGGACCACGTGTACATACC
TCCAACCATATGAATTTCTCTCAAATTATAAGAATGAATAATAGAATTAAACATATAAGA
AAGATGTGACATGCTAATATGTTTATTCTTCTCATCACAAGTTATCAAAATGCTAAATTC
TCCCCTAAAACATAACGACAATAAATCTTACTACACACATAAGCAAATTGAGTAAGAAAA
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AACAACTTATGTAACAAATTAACCCAAATAATTTTTTTGCCATACTCAACAGAAAAAATC
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AGGCAAGAATATTGTATTGTTATATTTCCGTATTCATAATTAAGAGTTTATACTCTATGC
TATAACTGCTATGATTTTGAAATATGTGATTCGATGGAAAACTCATATGCACGTGTGGAA
TGATAAACTATAAAATAAGGTTCCTAGTCTTGCCTCTAAGACTCGCTCAAGAGTTTTCGA
TGATCACATTTTTTGGATCTTAGGATATTGTTAAGTGTAACGACGGTCCTAAAACAACAT
TCAGAGTGTGATGTTAGAAGAACAATCATATTGAATCGATCCAGACATGTTTGTTATACT
TTGTGATAATATCGTTTGTAATCAATTGTTATAATACGAAGTGTTAACAAGTAATTTATG
TTCTTTAGACCATGAGAGTATCGTGATCACTTCTTATCGTATGATTAGCTTTGGGGTTGC
TCAAACTTCATCTGTAACTAGGTGACCAAAACGATAACTTACACGTTCATCTAAAAGTTT
GACAAGGTATTAAATAGCTCAATTGTGGATTTGCTCCTCCAACGATGGAGAGATATACTT
AGGACCCTCTCGGTGTGACGACATCCATCATCGTCAAGACAGGCACATATGACTATGTCA
CGGGGATGGCGGAACACATCAATGAGAAAGAAGAACAAAAGTGGTAACGAGTACAACGGT
ATAGTGAGCATGTGAATGACTCGGGAGGATACCAATGCATCTCGGGTTTTGTAAAGTACC
GCGAAGAAAAATAAATATCACATGATAACGAAAGGTTACTCAAATATCATGCGTGTGCTC
ATAGGGATCAATATGGATGTCCACGGTTTTGCTATCAATCATTGAGAGAACAAGTTTCGT
TCGTGTCTATGAGTTACCGAACCTATGGGGTCACAATCTTAAGGTAATCACGATCTCCTA
AGTGTCAGTAGTATGGGAGTAATAAGAACATATTTTTTTTAAATCCATTAATATTTGAAA
TAGTTTCGAGAGGATCCGAAATCGTTTCACGGTCAGGAGAAGGGTTTCATAGACTATCTC
GCAACACCGGGTTTTACCGATAAATAATATATACATAGATGGAAAATATTTCGAAAGATG
TTAAATTAATAATAAAAGTATGCTAAAATAGTTAGGAGGATTTTATATTTAATTTAATAT
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GACACGCCCCCTCTCCTCATGAAAGGGAGGGAGAAAGGCCGAATTGGAGGGGGAATCCCC
CTTCTTAGTGAACTAAAGGGGAAGGGAAACCTCCCCTCTTTGTAGCGCCCCTCCTCTCTG
CTCCCTCCTATTTATACTAGAGGATCTGGCCCCTTTGATACACAAGTTTTGGAGCCTCCT
CTAGTTCATATAGTTCTAGTTCTAGTTGGTCCTAGTTGACTAATGACAACTAGATCTGGT
TCCTCTAATTCTCATAGTTAGAATCCCTGTGTGGTTCTAATCTCCTCCCTCTAATTCTCT
AGTGACGATTAGCTCTGGATGGAGAAGTGTTGCCAGATCATGAAGACTGTATGCTTGCAA
CCAAGTAGAGAGCTCGTGCTTCCAATCTTCCAAATGGTTGCACTTACAGTCCAAAAGCTT
CAAACTTCAGCACACCAATGTAAAGATCACGTGGTGATTAAACGTGGGCATGAACAGTCC
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GGGCTCGGGCCTTAGAAATTTTTCTTATGCAAATTATACACAGGCCCGACTCGTCCCAAC
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GTCGGACAGGGCTCGGGCTTTGCAAGTCGGGCTTTGACAGACCTGCCCCGAAACCCGGCC
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GGTTGACACGCGGACTTGAGTCGTGTGTTTCCCATTCACCCAAAACATATTAAATGATGT
TAGTCGGCGTGGAAAGTTTAAAAAGCTACATTGACTATTGTCTACAACAAGCGTGCGAAA
GGACATTGTTTGTATCTTTATCAACAAACAACACCTTTGTCCACCATTTCAATCGGGCTT
TCGCTAAGTTATTTTTGTCAAAACCACTTCTCTATGTATCCGCCCATATCCCTCCGTCGA
CATCACCACCGAACTACGGTATATATTATCTATTTCCTTTTTGTTCATTTTTGTTCGTGG
GCTTGGCCTTGGTGGCCGATCCATGATGCCTACTGCTACTACCAGAAACCACCACAACAT
CATAACAATTAAAGATTGCCGGTTACAGGCTTTAGTGTTTAGTACCCACTCCAAACTAAA
ATAAGTGTCGTGGTTTTAGTTTAAATTATCACAAACACTTTGAATCGGAAGTACTAGCAC
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GTGCATAAAAACACTGCGATAGGGATAGGATGACCTCGTCCCTGTGCGAGCCTACGTGTG
GTCTCTGTTTGCATTCACTTATTTGTCCAGCTCCGACGAACTGTAGAATGGAACCGGACA
GCTCCATAATGCAGTCCAGCCTATCATGTTAGGTTAGCTTTGCAATTCCTGTCATAACTC
AGCATCTCCGGTGCTATGCGTATCCATGCCTAGACAAAGATGGAAGCTAGTGATAAGATT
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ACATTTAGTAACAAGGATAAGAGTAGCATTCCGCAAGATATCTAACACTACCCTTTCTTT
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CTCTTGGCGTACTCTTGAAAAAAAAGAGTAAACCCTAGAGCAACCATCAACTCGCTATAA
GCTCATTCCGGGTATCGTAAAGAAGTTGATCACCCATACCACACACAGACCCTTTTCTAA
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ACACACTAGTTTCTGTTCTGTATTGTTCTATAAAGTTCTTGAAACAATGGTACAACATGA
GGATTTTGCTTATGCTCCATACACTCGGCTTATTAAGAAATCCACTTACGTAACAGGCAT
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ATGTGTGTCATGTGTCATGTGTGTAACTGCAAAAATCACCATGTTCTTGGTTCCTTGATT
TCACTTTGTGTACTGTCATACAACATAGCGATATGTGACGTATCTGCCGGCTGTCTCGCT
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CCTGTTCATATTTCTAGCAAAGTACTGTAAAATGGAGAGGGTGTCATGCAGCAAGAAGTG
ATAGAAGCATGGATGTGTTGGCAAACAAGAAAAATTTAGTAGCTATTGTTGTATATCTCC
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TGTAGAGAATCCAGAATGGGCATCTAAAAGATTGTCATTATTTCTCTGCCCTATATTTGT
TTGTGCCTAAAATGGGTCTGATACATAACTACATAACGTAGTTAATAGAACTGAAAGTAA
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TGACAGCCTTTTATGTTACTAACTACTCCCTCTGTTCCTAAATACTTGTTGTTGGGGAGA
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AAGTGCTAATCAAGATTTAGTAATACCTGAGTTTCCTTTAAAGTGTACCGCGCCAATAAC
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TGGATCTTTGGCTCCAGTTCTTGGAGGAACGATTTCGCAAATGGGGTGAGGTTCTGTTGC
ACAACCAATATAGCCCTTGAGACTTTCTCGGCGTTCATCATTTCAACGTACTTCTTGATG
TGCTTCATCCCCACCTTCTCGTCGTTGGGGAAGAACACGTAAATCTGATTCGAAAGAGAG
AGAAAATGACAAATATGTGTCTGGAGAAGTGCAGAGGGAGTGCCAAAGGTAGAATTTCAC
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TAGTTCGTAGTCATATATGTAGAATTGTAGGGGTAGGGGCTAGCTAGGTATAGTAGCAGA
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GTGCTGAGTGCTGAGTGCCTCCCAAGCTAAGCAGCCGACGCCATGAGCACCACGAACTAA
GCTTGCATCGAGCACTCGATGGCAGAACAAACACCGGTGGATCCAACAGAAGAGAACAGA
TCGAGCAAGAGCAAGATGACGGAGCCAGGGGTTCGAATCTGACGAAGTTATCGACCGAGA
GACGGATCGCGGATGACCGTCGGGCAAACAGAGAGCTGGATCCGTGGCGGACGACTAACT
ACTGAAGCTGAGCGGGAAGAGGAAAGCAAAAAAATGGCAGGGCTGAGCCGAGCTGACCTG
GTCGTTGGGGTCGTTCTTCTTGCACTTGTTGATGAGCATGTCCTCGCGGTGGAAGGTCTC
GCCGTACTTGCGCTGGAAGTCGCGGCGGGTCATGGACAGCTCGTGCTCCACCACCAGGTA
CCCCCGGTCGCGCAGCATGTGCATCACCGTGCGCCGGATCCGGACCAGCCGCCCCACCGT
CACGTCCTCCGTCACCAGGCCCGACGCCATCACCCTCCTCCTCCTCCCCCGCTGCCGGCG
GCGGCTTCGGTTTCGAGGCGGAGCTGCAGCTGCCGAGCTTGACCTGCGGAGGGCGACGAC
GTCGGCCCACTCTGCTTTTCTCCAAATCCAGCAAGTGGGTTGGCTGCGCGGATAGAATAT
TGTCACGCGCGCCTCCAAGTTGCTTCCGCGGATGACCGGTGGGGCCCCGGTAACAGCAGT
GAGCAGTGCCCAATACGGGCCGACTTTACAGCGTGTGTTCTGACTGGTCGGCTCTGTAAC
GTTGCTAAATGGAGTATCTCCCATGAAGCAATCACTTTTTCTACTACCTTCTACCGCGAT
GTCACTCCCACCGTCTGCATCTACACCCCGATCTTGGCTCGCAAGCAAGAATGTTCTAAG
GTCAACTTCAACGCGCGATCCCATACGGACGTCTGTTTTGTTCGAATTCTGTTTGTTTGG
AACGGGTAATGGGATCGTGTCCATGTCTGTCGTGTGATGCGGTGGCCGTGTGCTCAACGC
ACGGATGCATCCTTCGGCCGCATCCTGTCCGTCACGGTCAATATGCCCATATATTCATAT
TTATCAATGTTTTAAACAGGTTTGCATGTTCATATATCAATTGTCTCTAATAAAAATAGT
TTTACAACCCAATCGAAATTGTCTTGAATAAAATAGGTTTACAACCAAATCAAAATTGTC
TTGAATAAAGGTAATTAACCAACACAGCTATTGGTTTTCAATGTGATCCCACACGTGCTC
AACTAAGTTATTTTGAAGCTGCAAATGAGTGTGTCAATCACGGATTTCACGATGGAATTG
GATAAACTGCTCAAACGTTGTCGGTTCTTTGGTGGAGGGGCTCAACATTGTTACCTTGAA
AATCAAATCCTTGGTCGAAAATGAAGTCATCACGCTCGTCCTCAACGACCATGTTGTGCA
TGATCACACAAGCAGTCATCACCTCCCAAAGTTTTCCTTCATCCCATGTCAATGCAGGGT
TTCGAACGATACCCCATCGGGATTGAAGCACACCAAAAGCAGGCTCCACATCCTTTCTAG
CACTCTCTTGCATTTGGGAAAATCTCTTTCTCTTCTCTCCTTGGGGTTTGAGATTGTCTT
CACAAAAGTTAACCACTGAGGATATATACCATCAGCCAGGTAGTATCCCTTGTTCTAGTG
GTGGCCATTGATCTTAAAGTTGACACGTGGGGAGTGGCCTTCTGCAAGCCTAGCGAACAC
CGGGGAACGCTGCAGCACGTTGATATCATTGTGAGAACCGGCCATGCCGAAGAAAGAGTG
ACATATCCAAAGATCGTGCGAAGCCACCGCTTCTAATATGACAGTGCATGCTTTCACATG
CCCCTTATACTAGCCCTGCCAAGCAAGTGGGCAGTTCTTCCACTCCCAGTGCATACAATC
TATGCTGCAAGCATGCCTGGAAAGCCTCTATCGGCGTTGATCGCCAACAGCTTTTCTGTG
TCAGCGATATTTGGCTGCCTCAAGTACTCGAGGCCAAACACCACTACCACGGCCTTGCAG
AAGTTGTACATTGACAGCGGACATGTGGACTCACTCATGCGCACGTACTCATCCACAAGA
TCGCCTGGAATCCCATATGCAAGCATGTGAATGACGATGGTGCATTGCTGATAAGAGGAG
AATCCAAGCTTGCCAAGGGCATCCATTTTGCACTCAAAGAATGTGTCATGCTGAACAACT
CCCTCACGGATCCGATTGAACACATGCCTTGACATACGAAAACGACGATGGAATTTCTTC
GGTTTGAAGAGTGCGGTATTCTCAAAATAATAAGCATAGAGCAAGGCGTGGCCTCTCTCT
CGCGCGCGCGGTTCAGGTTGGGCGCGCGGCCAGGCACTCACCCTGTACCGAGGCCGCCGC
CTTTGAATGTGGTCATGAACGACCAGTGCAGCCACCACAAATTCTTCGTCATCCGAGGAC
GAATCATCCGATGAACAAATGAAGTGGTTGAACAAAAAATGCATCTCCATTGTCCATACC
TTTGTGGGCAAAGTGTCAAACACCTTACGGATGTGATGGTGAAGAGGCCGTGAATCACCT
CGACACGGCGGGGGCGGATGGCGGCCGACTACAGGTCGCTCTGTAGCACCCCCGACGGAA
GATGGTGTTGCCGGTGGGCGTCGTCGGCGGTCGTATAATAGTGACGACGCCGATGGCGGG
GTTAGGTGGGGATGGGCCGGTTGAGGCTTGGGGGGAATGAATCACTAGAGTCCCTGACGG
GCGGGCCAGGGGAGGACAAGGGCGTGCGTCCCGCCCGTCCGCGCGCTGTCCTTTTCTCTC
TAAAAGCCACGCAAGTTTGGGTTTGGGATGGGTCGAAAACAGACGAAAAACAGACATTTG
TCCGTTTGGGGCCACGCGTTCGGCCGCCCTATTCGTCCGTTTTATCTCAAACGAATGCAC
CCGGACCGAATGGGGTCGCGCGCTGGAGTTGGCCCAATAGTTGCAGTACCATTCATTTTT
TCGTCGTCCACGTGCACGAGAGCTGTGTACAGCCATGTCCAAAGTTTGGAGGCTCATGGA
TACTGACATCGCTCTGAAAACTGGGAAAGAATGGTTGTGTCACGCTCTTTTTACCATGGG
TGGTATTTGGCGTTGCATGTTGCTCGTGAGGTTATGGAGGAGCTGGCATGTTCGTAATGA
GTTGGTGCATCGCAAACCAGTTCCTCCTATGGGGCGTCTCTTGCAGGTTTTTCAGAGTTG
CCCTCATTCCCATTAAACTAAACTATATAGAGGGTGCTTGGATCCAAGGGACTAAAACTA
GTCCGACTAAAAATAGTCTCTTTAAGAGGCTAAAGTTCCAAGCACCCCTGACTAGAGAGA
GGCTAAAACTAGTCTTGAGGCTAAAATCTTTTAGTCA