Map Locations of contig_136445 (10601 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_136445

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_5606 2 2920 bp MLOC_5606.2 Available Available LOC_Os02g04970.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13102.m00530 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_5606






Contig Sequence (10601 bp)

>contig_136445 10601 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTACACTATAGACTACATACGGAGCAAAATGAGTGAATCTATACTCTAAACTATGTCTAT
ATACATCCGTATATAGTCTATAATGTAATCTCTAAAAGGTCTTANNNTTAGGAACGGAGG
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GGACAATGGAAGTGAAGTCGAGGATCTCCCAGAGACTACAGCGATGATTAAAGGACGACT
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TTTCAACTTTTCATCTAATCGGCATGTATGACTAGATTATAGTAACTGCTGTATACTAAG
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CTGCCTTCTTCCGAGGATGATGGATGGGATGGCAATAGCAAGACTATTGCTGTGGCCCAT
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GTATCCCTGTCAGAGTGGACATGATAATTGGGAGGAAGAAATATAAGTCTGTTAGGTGTC
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TCCATCCACTTGGATTCATTGGTGTCACATTCCTCATTTAAAAGTAACATAAAATTAACG
TCCCAGAGAACCCTACCTCCGCTAGGCTGCTTTCTGTGGCCTGTTCATCGACCAGGTTAA
CCTGGTATCCTGGTAACAATGATCACAGCAGCAAAATGAAAAGTACTCCATCTGAAATAC
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AGCCCTGATGAACCACCTGCAACAAGTTAGTGCATCTAGAGTAAGGCACCTCCAGTTCTG
GCCATGTTCGGTTCTGACTTTATTTTGTTTACATGACATTTATTAGGTGGTCGTGGATTC
AGAAGACGTACTGTCATCAGTTGGAGGAGGTCAAGGAGTGGAGAGCCAAAGCAGCTGAGA
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TGATTAGTTTTGCTAGAACAATTTTGCATTGTGGTTTGGTAATACATTTGCTTGATTTTG
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GTTTGGATTTTTTTGCTAGGAATAGTTGCTTTGGATCTTGCTAGAACAGTTGTGTGGATT
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GGTGTGGTGCACATCGGTTGCTCCTTCCATATTTGAAAAAGTGCTTCATCCCATCAACGG
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GACGAGCTTGTGTGTATTTTCTCCACTTGCCTTCATAGACAAGTATATCGATGTGTCTCA
ATGGGAATCAATGGTAACAATGTTGTCGCCTCCAACATCCTCTTATTCGAGTCTTTCTAA
GCAAGGACATTGCCTTGGTTTGTCGATGCTGACGGGGCTGCCTGTCTAGATCGGGGTGGT
GCCCGTTGATATGCATGATCACCAATCTTGACCATACGTGTGTCGGTCTACTATTGTGTT
AATTCAACGAGTTTTGGTCATTTTTGCAAGTACTTCGGCACATGAATTTCTTGATGTTGT
CCATCGTCGGGTTGGCAACTGCTTTGGCACTTTTTGTGAGGTGAAAAATACGTTTTTGGC
CCTCAAGTTTCCCAAAAGTATAGACTTGGACCCTCAAGATTTTTCGACATATATTTGCTC
CTTTAAGTCTCAAAACCAGATAATTTTGGTCCAAAACCAGATTTTGAACAAGTTGATCGG
GGTTTGACCAGGTTTGATGAATGAATAGTAAATTTTAAAAAAACAAAACAAATTCATAAA
AATCTTAAATTTTGTGACAATCAACATTCTAGGATGTGCTAGGTGCGTGTAAAGTTTTGT
GGTGAAATAACATCTCAGGAGCTCTCGCAAAAATATGTCTTTTTTGTGAGCCATTTTTTA
CGAGCTCCTCAAATGTCAAAACACCACACAATTTTCCACGCACCTAGCGCACCAAAGCAT
CTTGGTGGCCACAAAATTTCAGTTTTTTTGGAATCATTTGCTATTTTTTAAATTTACCAT
TCATCGGTTAAACCTGGTCAACATGGTCAAACCTGGTCAAACCCAGTCAAATGCTTAAAA
TATGGTTTCGGACCAAACTTGTTGTTGGGGAACGTCGCATG