Map Locations of contig_136393 (11600 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_136393

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_5572 1 654 bp None Available Available None
MLOC_5569 6 3148 bp MLOC_5569.6 Available Available LOC_Os07g23110.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13107.m02269 protein poly synthetase 1, putative, expressed
MLOC_5571 1 1141 bp None Available Available None
MLOC_5570 1 628 bp MLOC_5570.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_5572






CDS Structure of MLOC_5569






CDS Structure of MLOC_5571






CDS Structure of MLOC_5570






Contig Sequence (11600 bp)

>contig_136393 11600 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACGTAAAATATGGATGTTTGAGGGGGTCAAATGCTAAAATACGGCACCTGCAGGACTGCA
CATAGCTCACAACAGAGCCTTACTACATTGTATCAGAGAATCAGTTCATACATACATTGC
ATGTTTGTTTTGAAGTAACTGAAAACTTGGAAAGTACCACCTCTGATCCAGAATGTAAAC
TCTTTGAACATTTTTACCGGTCAAACATCTCTAGATTTGACCATCTAGAGGAAAAGAACT
AGTATCCAAAACATCAGATCTGTTTTACTAGATTTATCATGAAATAAACTTTTATAGTTC
ATGATTGTTTTTTATGTGAGACACAAATTTGCACAGAAATTGATCATCAATGTATCATTG
AAGAACATCCCAGTGTCCTAAAAGACTTACATTTTGGATTGGAGAAAGTACTCATTACTC
AACTGACCTCTAGTATTTGGAAGTAGTTTTCTGATAGTTTTTGAGCTGTTAGTTCTCTTG
AATGCACCAATGTCTTAAAAGACACAGGTAGCTGTGTGTCAATTGTTTCCTTATTTTTCG
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ATCTCTAGTCCTGCATCGATTCAAAGCAAAAAAGTGCAAGGCTTTTTCTCCTATAATGTA
TAGCCTTGATGGCTGGGGACCCACACCCACCTTATAATAAAGAGAAGGAATAAATTGATG
CCTGCTTTGTTCTCCCTTGGATTGACTGCAACCTCAAGCATTAGGCCCTTTGAATCTCTT
TCTGCAGTGTATTGATCCAGCTCTATACTGCCTTTGAATCACTTTTCTGCAACACTGGCC
TTAGAATGTAACATGAGGAAAAGGAGCAAGGTGTTGAATTCATGTAAAATCATTTCTTGT
CAGATTCTAGGGTCGAAGTCGAATTGCCTCATGTGATGTGGCTCCTTTTTTTCGTATCAG
ATGGGTACTGTTTTATATCTAGTTGCATGTGACACCAATTTTTTTTCTCTGCTTTCATTT
TTTTAATTTTGCTGTAGTTAGGTAATTAATGCTTGTTTCGAATGCTCTTTACAAATTTTA
TATTTATTTAATGAGCTGAACTCGTGTAGGATGAGTGGAAGCAGAAGCTTAAACTTGCTG
GTGCCCACTTCAGTCCCAGGGTTACCAAAGGTTTTTCTTTGCATATATGAACTTCTTTTA
TTACAATTGGATTTGTATAGCATTGGAACCTATATTTCCTTGTGCAACATATATGGGTAA
CTGAGGTAATTGTTTTATGGAGTAGGGATAAAGGGAAAGAGGCTATCTTATTGCTATTCT
TACGTCAATATGCATTGGTGCCCCCTTGGCTATACCACCCTTAGATCCAACTATCCAACG
TCACTTCATGCTTTGAAATTCTTATATTTTCACCATCTTCACTGTAGCACACCCTCATGT
CACACCATAATAAAGACAATTCTACAGTGAGGCCCCAGTTTGACCACCACTCAATTGTTA
GTTCATATTCAGTCCCTAGCATGCACATATTAGTTTGAAATATGCGACCCTCAGCACAAG
TTCATGGTCTGGGTTTGGCTACCACTTAATCTTCAGATTATTTTCAATATCTGGTAGTGC
ATAATACGAGTTAAGTACAGATTGGTTCATCATGTAGGGTACAATGCTGTATTTTGTATT
TTGTATAGACATAAAATACAGGAACCTCAAAGCACGATATTATCGCACTATGCTTATGTG
TTTACCTGCATTGCAGATATTAACTGTGTAGTTTCATGCGGTGGGCTTGATAATGAGAGC
GCTGAAGTCAGGAAAGCTAGGTCTCACATTTTACTCTATCCTTTGTTTTTCAATCATAAT
TTGGCACGTTCTTTTTTCTCTAATGCTGATGTTGGAATATCATGTTATATATATAAATTT
GTTTGCAGGAGGCAGAAGATACCAATCGTTAAAGAAGATTACCTAGGAGAATGCATTAGA
AAAAACAGGGTGCTTCCATTTGATTTATATAAAGTTGCGACTACCTTGGAGGAATCATCA
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CTGCAAGATACGGGCCATATTCTGGAAGATGGCAAAAGCATTTACAATACAACCCTAAAC
ATTTCTGACATGACACAAGGTGTTAACAGGCAAGGTTTTTGCCCATGATATTTCTTTGAG
GGTTTGCTCATAATATTTTGTTGCAAATTCGTGACATACATTTTGGGTTAGGTGATTGGG
AATAGTGCCTACTTGTTAAGGCACTTTTAGACTTCTAATAAATCATGCAACAAGTTTTTT
TTCTACATTTACCCCCCTACAAGTTTTCCATTCCAATTATCCTCTTTCGGCCGCATTATC
TGTCAATTTTAATGAATTCCACCTGAACTTTAGTGGTCAGGAGAAATATACAATAACCGT
GAAGCAACTATCTAATTTGTGTATGTATCCAGGCTATAGGAATTGGAGGTAGTTAATCTA
CAATTGGGTAATAATTTTGAGTTACTATACACATTTTATTTTTGTTGTGGTTCCTTGAAT
TCAATCTGTGTTTATCTAAAACTTAGAAGGATGGTTTAATACTCTGTACTCCATACTTTC
TTCTCATCCACACAAGGTTTATCATACAGGGGCATTTTAGGATTACCGACTAACTAGCCT
GAACAAGCTCAAAATCAGACCAAAGGGTGTTGAGGATAATTTCGTCGATGCCTCACAGTG
GTACGACTGTTGCACGTGATTTGTAGTCAAGGGAATTGCTGTTCAAGTCCTGGCTTTCGC
AGTTTATCTGAAAAATTGCTGTGGCCCCTCTTTGTCCGCGTATAGGCCTCTTGAGTCTAT
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TCTGGCCCTTTCCATCAGTTCGGACTTTTGGTTGCGTTAGCTAGTGCATGAAGCTTAATG
CCTTACATGGGCTTTGAGTGGAGGGGTTACTTGATCAACGTTCCCCATCTTTGTCCTGCT
TTTTCTAAAACTTTAATACAAAAAGGATATTTGGCTGCTCTATCTGTGTAGAAATTCCCC
ATTCGAATCTACTAAACTAAGTACATGATTGTAATCATGTGCTCCCTCCGCCCCGAATTA
CTTGTTGCAGAAATGGATAACAATGGATGTATCTAAAGCTAAAATTCTATCAATTTCTGA
GACAAGTAATTTGGGACTGAGGGAGTGTATTAATAGTTTCCAGAGTCATAAAACATATGC
GCAAGTTTACCTTGTTTATGGTTCCTGTTCCTGTCGGAGATTGATTTTCAGGAACATAAA
CACTATTTACATTGGGAAAATAAGTAATTCTGCTGTTGCTTCGTTACAAAGGTTATTGCT
TGCCTTACTTCATCTCTTACAAATTGCTTTTTGTTTCTGAAGCTACTATATACTTCAGAT
CATCGAAGAGGATGATGGGAGTGAATGCTATGTATTTCGAAAGTGGGGGCGAGTTGGCAG
TGAAAAGATTGGTGGAAAGAAACTGGAGGAGATGTCAAAAACTGACGCAATACATGAATT
TAAAAGATTATTTCTGGAAAAGACTGGAAACCCCTGGGAAGCATGGGAACAAAAAACAAA
TTTTCAGAAGCAGCCTGGGAGATTTTATCCACTTGACATTGTATGTTGTTGGAAGGAAAA
GTTTGTTCACATAGTTATATTTGTCGTGTGGATTTGAACTGATGATGTGATGTACATTAT
TGTAGGATTACGGAGTTAAGCAAGCACCGAAACGGAAAGACATCAGCAAAATGAAAAGTT
CACTTGCTCCTCAGGTGCTGGAACTCATGATGATGCTTTTCAATGTTGAAACATATAGGT
GTGTCTCAGCTCTCTTGTTCAAGGAATCACTTCCATCCATGTCTTCTTATTATTGAAGTC
ATTATTCACGTTACTATGTTCCAGGGCTGCTATGATGGAATTTGAAATCAATATGGCAGA
AATGCCCCTTGGGAAATTAAGCAAGGAAAATATCCAGAAAGGTCTATCTTGATCCCTAAG
GAAGCCATTTATTTTTGTTATTATATAAAGTTATTATGATTCGAAGATTCTTAGCTGCAT
TGCGTGCAGGATTTGAAGCATTAACTGAGATACAAAATCTACTGGATGACACTGGCAATC
AAGAACTGGCTCTTAGAGAGAGCTTGATTGTTGCTGCAAGCAATCGTTTCTTCACTCTTA
TTCCTTCTGTTCATCCACATATTATACATGATAAGGATGACCTGACAATGAAAGTATGTG
CCTGTTGCCTTGCATTGTATTCCTGTCAGTTGGCAAAAGTACCCTATCCCTATTTCCCCC
CTTGCCAGCATTCCCATGACGAATCCTTTGTCTACCTGGATCTTCAAAGAGCCCAAGTCC
CAGTGTTGGGCAGAGTCCATTGTCAAAAGATCGTTTTGAATCTAGCTACTACCAAAAAAG
ACATTTTATTCACACTTTCTAATTCATGCAAAGAATTTTCCTATGGTAGTGACGTGCAAC
TAGGAGTTCATTGCTATGTAGCTGGAGTGTGACATTTGCCATAACGCTTAGATGAAATCA
AAAGAAGAAAGTATGTTCTTGTTAAATCTTATTCTAACGGAGTCACAAATGAAATTAACT
CTTATAGGTGAAACCAGAACTGATCATGGTGCTGCTAGTCATGGTGCAAATTCTCAATGC
CTCTCACATTTTGCAAGGATTTTATAAGACGTTATAATACAATATAGCCAATTTTTTATT
CTTCACATGTTTCTTGTCATTTGATTATCTTGATTCTTGAGTTTCTTCTCATGTGCCTGA
TTTTGTTGATTATATGACCTGAGTTATGTTATATACCTAGCTGATTTGTAGCTTCTGCAC
AGGCGAAAATGCTTGAAGCTCTTCAGGATATTGAAATTGCTTCTAAACTAGTTGGTTTTG
ATGGTGACAATGATGAATCTCTTGATGATAAGTACAAAAAACTTCATTGTAACATCACCC
CGCTAGCTCATGACAGTGAAGATTACAAGTTGGTCGAGAAATATCTCCTCAATACACATG
CTCCTACTCACAAGGTATGCAAATTCTTGTGTCTAAATGATACTTTGTTTCTGTGTAGGT
AAAATACAGAAGACTACTGTCTCTTGTCATCTGTATACATGTTGACATGTGCTTTATTGT
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GGCAACAAGTACTCAAGATATAAAAATAATCTCCATAACAAGATGCTATTATGGCATGGT
AAGTAATTATTTTGAACTACACAAAGCATATAATTTGTGGCAATATTTCGGAGGTATTTA
AGTTGGAAGCTTCTGCCCTTGCTGCTTTTCTGTGTTGGATGGCTAAATCTGGGCGTTACT
AAATTGATTAACAAATAGTTTCCAAGCAATCAGTGGTTCTAAATGCTTTACCTTATTATT
TTAAGCACTTGTATGATTGCATTATGTTAGGTTACAGGTGTTTAATTTCTTTGCTTGTCT
TTCCAGAATTACTTTTTTCTATCCTCCAGCTCATGACCGTAAAACTGAATTTTGTGTAGG
TTCAAGGTTGACAAATTTTATTGGAATTCTTAGTCAAGGACTAAGGATAGCACCTCCTGA
GGCACCCGTGACCGGCTATATGGTTTGCTCTTTATTCACTTTATACATTTTGTATGATGT
AACTCTCTGCTTAACTATATATTGAATTTAATAACATGATGTTTCTTTCACTTGTTAAAA
GTTTGGCAAAGGCCTCTACTTTGCAGATTTAGTAAGCAAGAGTGCACAGTATTGTTATGT
GGATAGAAAAAATCCGACTGGCTTGATGCTTCTTTCTGAGGTTGCTCTAGGAGACATGCA
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TTGCTAGTGCCAACTTTTGTCCTTTCATTTTATGCATCAGAAATAACCATTTGTTATTTG
ATGCCGTGTCAGCTATTTTTCTAGATTCTTGTAATCAAACTTTCTGAATATGTGTTTGTT
ACGATGTTCATTGCTTTATCACAATTTCAGAAAAAAGAAAGAAAGAAACTCAATGAGATA
GCAGATAGGTCGACATTGTTCCCCAATACGTTGCACTATTGTCCTTGCTGCTCAACATAA
AAGCTTTCAGTTTTTCTTTCATGTTTCCTCTGATTTAGCATCTCTACCTGGTACTTGTTG
TGCAGCCAATGGACAAACCTCCAAGAGGGAAGCATTCGACCAAGGGCTTAGGCAAAACTG
TGCCACTAGAGTCGGAGTTTGTTAAATGGAGGGATGATGTCGTCGTGCCTTGTGGCAAGC
CAGTGCCAGCATCTATCAGGGCATCTGAGCTTCTGTACAACGAGTATATAGTGTACAACA
CAGCTCAGGTTTGCCAGGCCTACTTGCCCTTATGCTACCGCAGTAACGCGAATTTGCTGT
TCATCTTGCATGAAACCTTTTTCTCTTTTGGCAGGTGAAGATGCAGTTCTTGTTGAAGGT
CAAATTCCGTCACAAGCGTTGATTGGGAACCTAGGAGAGTAGAGTTGGACTGTTAGTTGA
AGAATCTTCTTTGTTGTCAGTACTCAGTAGCTAGTCTGCACTGTTGGATATGCAATGTCA
TCGGTGAATTATTCCGCAGCTTAAGGTAGGTTGTGCCGCTCTAGCATTTGATCCGTTTTG
GGAATATGGCATGGGCGTCGGGTGTGAGTGGCGCGAGTAACCCCCCGCATTGTTGTCCCC
CCATTGATGATGGATGCTCAATCTTTAGGAACTGCTGCTTTTCCTGATGTTTGCTTTGGA
CAGGTCAACTGTTGCTGTTTTGCATTATGCTTTGCACGTACTTATATTTGAATTTGAGTC
GATGCTTTACTATGAGAGGTAGAGCAGCCAGCTGTGTGAAACACACACACACACACACNC
ACACACACACACACACACACCTCCTGTTGCCCACTCTCTTCACAACGTTCTCTGTCGCGG
CTTCAGGCTTCAGACCCCCTGGACCACCGGCACGGTTTGGTCTTGCATCCATCCATGTTG
CTTTCTTCTTCTCGTCTCTTATCTCCGGTTCAACCATGAGGTCGGATAAGACTCTGAGTA
ATTGTTTATGTATGTTAGCGCGTTGCTGCCCGGTAGAGATTGTCCTCCCATCTTCCCTGA
TCCTGGGTCTTCTCACTCTCTTGGTGGTGATGGTCTTCCATATTTTGTACTCATTGGGTT
TTTTCGATGAGATTGGGGTTCAATCTACTGTACTTGGAGAGTAGATGTCAGTCATTTTGT
GGTAACCTTATGATTTGCGGGCCATCCCAACAGAAGCAGATCATCTCTACTTGTAAGAAC
CATGTTTCATCATTGCCATACAGGTTTGTAAGATGCACATATTTTGGGATCTTGCTAGTG
ATTTGTCCCTTGAGCATGCTTTTGAATAAAAATAAAGTAAATTCAAGGAAGAACTATCCA
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AGTACAAAGCGAAGGTTGTCTAGGGGAAGGAAAGAGGAGGAGCAAATGACTGTTTTTTGC
TTTTCCCGGAAGAAGGCGATGGTCGGACTGAGAGAAAATAAAGGTCACGCGATACATGAT
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TGCAAGCACATATTGTACGGCTTGGATGTGGACAACAGTCTGAATACAGATTTTAGAGGG
AAAAACATCGCCACCACATTGATGTTGCAGTTCGTCGAGGAGAATCTCTGTTTGTTATCT
CCAAGTCAACCCCTCACTTGTCCGATTTGGTAAAGCTTTGCTTGCTTGTTGTGAAGAGGA
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ATCACCACAATTTGAATTTCCAATGTATCCCATTTCTAACAAATGTCACCGTTTAGTTGT
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CTATTGTCACGCATGTACCGTAGTTTTGAGCATTGCTTATGCTACATGAGGACCTAGTTA
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TTATTTTCTTCCTTAAAGCGTAACCATAGTTGTTGAGGAATTAATATGTCTAAGGCTCAT
CCGATATATGCATCTTTGACTTCCCACAAGTTGGGATGCATCTTGGTTATAAAAATAGGG
TCCATGAGACTACACACAAAACTATGTTGTCCCCAATCTCTTTTGTCTCCACAAATCTTT
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TTAAATTTGTACATATCAGCAACCTAGGCTGAATGGTGTTTGCTAAAAGGAAAATAAATA
AATAATTTTGTGATTCCACCAAATGTCACTTACTTCTTGAGGTTTATTAGTTTTCTCCTC
AGAACGGCCACAAACAAATAGATGTTGCACCAAAGCATGTGCATGTAAATCAACAACATA
TTTGAATCTAAACGATTGTGTAAATTCAATTTATTATTGATAGTAATCATCATAGACACA
AAAATGGCCTTTTGATTTGATTATGAATCTTTGCATATTCTATTTAATCATTCACCGGAT
GTGTCTATGCAAGAATTGTGAGATGCACCCCACTATACTATGATGTGGGAGTGGATAATG
ACGTTCTTGCTTTCTAATCACGTTTATTCTTATCCTCCAACCTTATTGAAAACAAGAGCT
TAGCCCTACATTTTTCAATCCAAGTTCTTGCTTGAAATAGAGAAACAGAACACCTACAAC
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AATAATAGGATCTTCTCTTCATAGATTACAGAGAGGAAGAACACATGTTGCATTGTTTTA
TCAACCAGATGCCTTTTTCCTCGAGCAAGTTAGAAGTCCTTCCTCGCAACCCAATCAGAT
AGCTTTGTCCCACACTTGAATATACTTATTTCGCCTTCTTTATGTATAATATCCTAGGAT
GTAGTGTAATGACCCCTAGACTAATATCAGTGACGGTGTGCTTGAATTAAATAGAAAAAA
GTACCATAGACATGTATTTGGCAGCGTTCAGAGGCTGAAATAACGGACTCCCAAAAACTA
CCTTGAAGGTTAGAATGTCGTGAGGCCCTCCCCTCTTTAGCCTACACAAGCACATAAGCT
ATCGTATTGATGTCCCACCTAGGAGCAGAAGTGTAATTATACATAGATATGGCACTCACC
ATTCTCAACCTCCTAAAATCTCGTTGAATGTAAAATCCAATTGGTTAAGGCCTAAAACAT
GTTAGAATTATTGGGACAAGCTCATTCATTATTTTCCAATAATTCTAAGGATAAATCGTA
AATGGCCACATGGTTCATTCATGGACAAAAAGGGTGTGTGTAAGTTTAGTCTCCTCCACC
CTACGGTGGCTGGTGGCGGCGGAGGAGGAGGACACCCATTTACTCATGCTCTTAGTGGTG
TGTGAAAGACCAACACCCTCTCAAAAAACTTGTGATGATAAAATTTCAGCAGTCCAAGTC
CATGAGTGGCCCCAGACCCGGTACCTGGCTTGGTCGGGGCATCCAACTTTAGATGTTAGA
CTTTGGTGCAATGTCTGTTTGGTATTTGGCTCGGACGTTCGGAACACCTTCATCATTGGA
TAGAAGTAGCGACATATGTTGTCAAGATGACGGCTTCAAACATACTGATGTATTACTTTG
TAAGATCTTTATGAATAATTAATAAAGTGGTTGCATGCATCTACCAAATGCAGAGCCGGG
GGTCATCCTCCTTTTCTAAACAAAAGCCCATGAGTGGCATGCTCACCTCCAATGTATATT
GTTAAAAACTTAGACACATACGACCTACACAATTTGACAACACAATGTTCAGTCCATTTG
GATGATTGTCCAATAATAGTTAGGTTATATATCATCCTATTATCGATCAACTATTGTTAG
GTTATATATCATCCTATTATCGATCAACTATTGTTAGGTCTTGTCATCACTTTGTAAAAC
ATTTCAAACATTTGTTATGATACTTTAATGAAAATGGTTACGTGCGTCGAGTGATGCATA
TGACCACCGGGGGAAGGGCAGTTCAACCTCATTTCCAAAAAAGAAATTTCACAACAAGAG
AGAAAATATAACTATCGCTACTTTAGAGGGCTGTTATAGTGGGTTTAGACGCGTGGACCA
CTCAAGCGAGAAATCCCAATAAATAAGTAAAGATGACTTCGGCCAATTGAATCATTCATG
TCAAGGCCAGGATGAATACACTATGCCATCATGGTATAATAGTGTCGGACTACCTACCAA
ATAAAGAAACAAGATCCTTCGTGTCAATCGAGTCTGAATCCCAGGATTGGTCTATGGCTC
CTGGACGTCAGCCATGTTTCTCTTAACATATATCCTTGGCATATGCTCACTTTTTCATGT
CTTAGAGAGGCGCCTACTTTCACACATAGAAGTGTTTGCAGCACAATGTTGTTATAATTA
AGTCATGTTGCAATTCGGAATTCAGTTGATTTTTTTTTTTTTGAGGAACCGACAGGAGCA
CTGCCTTTTCAATATAGAAGGAAAGCGGAAAACGCGATGTGCAGAGGGGCACACGTTTTT
AGGGAACGCGGCAAAAAACCCAAACATGGCACTACCACAAAAAAACTAAATTAGCCAATC
CCCTCGGTTGGCATGGACCCAACAAATGCTAGCTCGCGTTGTTTAATTGCCTCGAAAGCC
AGCATAGCAACCTTCGTGTGCGTCATACGAATACCGGTGAAAACACGCCTGTTTCTCTCC
TTCCATACTGACCATAGGGTGTAGATGATCCTCCCGCTACGCCGCCGGCGCACCTGCTTT
GATTGGTTTGCAAGCAAGGCATCCCACCAATCCGACACGCTTCCGGGCTCAGGTAAGAAA
CCTGAAATCGGCAAGCCCTCGTCCGTCCATGTGTGCACTTGGTTCCATACCACGACTGTA
AAGGGACATTCCTTGTAGAGGTGGCTTGCAGTTTCTGGCTCCCGAAGGTAGAGCAGGCAT
CTGGGGTCAAGCGGCCAGCCCCGCAATGCCAGCCTGTCCGCCGTCAAAATCTTCCCGTGA
AGGGCCAGCAAGGTGAAGAATTTGCACTGGGCTCAGCATGAGCAGACCAGACCTTGATGG
GGGTAAACCTAGGATGAGAGCCATAGAATTGCGCCCCATACGCTGACGCGGAGTAGTAGG
CCCCGTTGGCAGTCAGGTTC