Map Locations of contig_136354 (4648 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_136354

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_5523 2 1951 bp AK368553 Available Available None





CDS Structure of MLOC_5523






Contig Sequence (4648 bp)

>contig_136354 4648 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCCGGAGGCCCGGTAGGAACCCTAGTCCTACCAGTTGTCTTCTTGTATAAACTGCAAGAT
ATGACATGTCCAAAAATGTAAAATCAGAAGAATTATAATTGGTTATATTGAAAAAGTTTC
TTTCGGGGTGAGGCTGCCTGTCATTTACAATTTAATAGCATCAGCATTGCTTGGACAGAT
GTCAGCAAACTGTTTAGTCCATTTCGTGTTGGGCATGTGACCAACTGCTTATTACTCGAA
GCCTTTTGTTGCTACTGTCAATGTCGTCCTTGCTTCTTATCTTTCTTGTTTGTCAATTTC
AGGCCGTGGTCGTTGTTATGGGGTATTACCTGTTGTAAGTGCTTTAGTTCCTGTACTGAA
GGTTACTGATAAGGGAACTGGGGTTGAATGTGATATTTCAGTCGAAAACAAAGATGGCAT
GTCAAGATCGATGATATTTAAACTTGTTTCTTCAATTGATGAAAGATTTCAGATACTTTG
TTATCTGGTATTTCAATCCTCTGTCTTGATGTTTATTTTTGGAAAATCTTACTACCATCA
TGGTCCCCTTGAGGTTATCTATCTAAAAGATATGACAATCATTTTCTGTTTATTCTGTAG
ATGAAGTTCTGGGCTAAGACACATGATGTTAATTGTCCCAAAGATCGAACGATGAGCTCG
ATGGTAATTATCTCCTTAGTTGCTTTCCATTTACAGGTAAAGTGAGATTGTTACCTTTAT
TTGATTTTCTGTTCAAACTTCACGATTGGAGTACATTGGATATAGCTTGGCTGTTGTATA
CAATTTTCCATTAGAGGGGCCCAGGCTGAGACTTGAGGCTTAAATATTTTTCTTTTTGAA
AATAAATAAATTAGTGCACTTATGAATTGTAAAATATTGAGTGCAGACCCGGCATCCTCC
AATATTACCTGCATTTTCTGGCTTACTGAAAGGTACCTCCTCTATTGAAGTACATGTATT
TTTTTTAGCTCTTTGCAACTACATTTGCTGTTGTCATATTTTTATCATCTGATTATTGAT
TAAGAACTAACAGTCAGATATTTTATGCCCTTTTATAGATGGTGCAGACTTTGCAAGTGT
TCAGAGAAACGTTGTGCTATTCAAGGGGTTTGGGAGCACTAATAAAGAATCTGTTGCTGA
ACTTTTTGTATCACTAATGAGTAAAGTGAGTTCTTTATAGTTTTCTTCAATTTTTGATAG
GAAGATATCAGGTGCAAAGCACAATTTGGTGCACCTATGCTTTTTTGTCGATGAATGTAT
TTTGACAATGTTCCTATTGTACTTCCAGTTTTAAGTGTAGCCTTGGCCCCCTGCAGCAAA
CCTCTCCACTTGATCTTAACTCCAGCATGTGTTCAGCCTTTAAACTCACCTGACCCTGCT
GGAATGGGATGACACTGTTCAGTTGAGCTATGACATTGTTGTCATTAGCCATTCAGAACA
TTTTCCTGTGAAATATAGTGATCAAGTAACCTGATTATTCAATATAGTGACCCTCCTCAG
AGAACATGATTAAACCACCTGATTCCATCCTGCAGTGTATAGCTTTGTCCTAGTTCAACT
CACAGCTGTTTGTAGCTCCTTTTTTTCTGGCTATGTGCACGTGGCTACGTATGGGCACCT
TGCAGAAAATAAATAAAAATGCAATTGTTCATTCATGCAACATAGCTCGCGTCCTAGTTT
CATTGTGGCCTCATCTTGACTTTTCAATGGTTAACATGCTCAAAATATACTCTTGTCTTG
TGCAGCTAGTAGCAGTAAAGGATTTATGGGAGCAAGGGCTTTGTGCCAGCAATTTTGATG
GATTCTGGATCTCGAAGACCTGGAAGAGAGGAATTGGTAACTTGAGTGTAAGTCTCATGT
GAATCCGGATTGTGACTTTTCAACAAATCCTGCAGAGCATTTTTTATTTGATTTGATACG
TTCCTTTTTGCAGGTGGAAGACTTCTTGGACAGATCTCAGAATTTTGCCAGATCAGTAGG
GAAGATGGAGATGCAGAACATCTGTGAATGCCTAAAGGATACTGTTTCCAAATTGACTGA
TTTCTTTAGGGGTAACATTGATGCACCAACACTGAAGATCCTCATTTTCGGGGCGTTAAA
TCAGGATGTGCCAGTCAGCCACCCCAGTCCAAAACATGTGAAGAGTAAGAGGAAGAGGGA
CTTGCGAGATGACCCTGGAAACAGTGAGAAGCAGCAAAAGAAAGGGAAGCACGCCGCACA
ACGTGGCCATGCTGCTAACAGCACTGCTGCTATTTTACCAACTCCCACTGTATTTATGCC
TCCACATGTGCATCAAGTAGGTTCTACCCAACCATTTAGTCAGGTTGTGCATCCGTCTCA
GCTTCCAATTCCTCCTCAGCTTGCCTACGGGTTGCCACAAGCACACTTTCATCCAACTCC
TCATATACTAGGACAACCTTATGGTAGTTTCATCTACTCGACGGATCCTGGGATTCGACT
GCAGCAGCAAGCCCAGCATATGTTTGTTCCTTTGCCGGTCCACCAGCCAGTGATTAATAG
GTCGTTTCACCCCCATGGTTTCAACAGGGCGCATCAGACCCAGTATGATGACAATAGCTG
GTTACCTTACGGAACCAATCCAAATTACAGGAGGGTATGACAAGTGCAGCAGCTTGAGTT
GGGCGGCGTAGCTAGCTTATCGGTGGGAAATTGTGGTGTTGATCTGTTGTAGAATGAAAT
GTGCATTAGCATTCATGTAACAAGTAGTAGTTTCGTCCAAAGTGACAGCGAAAAGGAAAC
CGAAAGCATTTCTATGTTGGTCTGCAGTGAGCAGATAGTAAGGTTATTCTAGACTTGGTA
ATTGCTCAGTGTTGAAATATTTTTGGTTAGGAGCCTGGGTGAAGATTTAAGATGGCCAGG
TAGATAGCACTGCAGCAAAGAACAAACTAGAGTAGCCACTGCTAATTGTTTGCCCATGAA
TGTTTTGTAATGAATTAATCTATGAGTTCATATGAAGCAACTATTGTAATGAAGCTGCAT
CAGCTTGATTGATTCTATGCTATCACCATCCTCACTATTGTCATTGCATCACCCTCATTA
TTGTCATCGCAGACAAAACTAATGCAGTTACAGCATTAGCTAATTTAGTGTTTTTTTCAA
TCTAAGTAATTTAGTGTTAATCCATCTGCAATCTGGGAGAAGGACAAGACTGGTCGAATA
TGCGTGCAATTTGCGGCTAGCTAGCTAGCTCGTTGGTTATCAACAAGACAACAAGTCCAT
TACCTTTTTCTTTTCTTTGAGAACAAATCCATTCCGCCCGTTGTATGCATAATCCGGCGG
CCCACCATAATTGATAGTCCGATCCAGACGAAGACGACGATAATTGATAGTCCGATCAAG
ACGACGAGAAAACTTCACGAGGGGTTAGATAGATTCATCCAATGTAGCCGAAACATGGTG
CTTTCCAACGAAAGGGACACATACTTAGTGCCCGTGTCGTGTTAAGTCAATAGACATATG
AAAGTCTTGCCTTTCAGTAGCTCTCTTGTTTTTGGTCCTGAAGATACAAAACACGTGTTA
TTTCTGTTAGTAACAAAAGAAATGATGTAACTGTCCCTCTCTTTCATTGATAGTGATGTT
TATATACAAGTTTGAGAGACGCGATCAAAGGACGCGTCCGTTACAGACATATGTGATGGT
TAGCATTAGTGCTAACCGCCTGACAGATAACAAGGGGAGATTTACCCCATAATTAACACA
GTTAATTAATTTTAACACTCCCCCTAATCTATACTTGTTCATATAGCATCATCATCTTGA
AAAGCTCCTCAAAAACCCTGTGGAAAAAAATGTGAGGAGATATGTGTATGATATGTTGCC
AAAACTCCTTCAAAACCCAGTAGGGAAAAATAAGGAGAAAATGATGCAACATATAATCAT
TATTGCCTCTTTTAACTCAATATGAGAAAACTCATAGAACTAAGAGGACAATAAATATGT
CATGTATGCTTCCCTAAAAACCCCGGTGTGGAAAACTGAAAGTATGACATATGATCTCAT
GTTGATATTACCTCATTAAAGACCTTTATGAGAACCTGTATAGTAAATTCATGAAGGGAA
AAAGAGTATAATACGATGCATTGAACATGAACAATTCAGAAAGATACTCCCTGTGATTCT
TGCAAATTTCAAAGCCGTCATATACCAATTCCGTGAACATAGTTCTGGAATGTAAAAGTT
GGTAGAGACTTTGCAAGCAAATCAGTCACATGATTTGATTTGCAAGATATGCAATATAGT
GTTATTGCTTATTGTGAAACATGTTTGCATCCGGACAACACAAGAAACATTATCGTTGAG
ATTATAGTTGGTGGATGTAGCCATGAGGACTATTTCACAGACTCTTCATGAGAGGGCTAC
CACACCTAGTAGGAACACCAAGCTTGTCTACGATCCGACATAGTTGGGATCTAATCGATG
TATCCAATGATATCGGTGTTCACATTTGTGTGAAACTGAAAAACTAGGACAAGATGTTTA
ATGCTTTGGAGATATCGAAAGATATTCTTGAGTACCAATCAATTGTGTTTGGTGGATCCA
ATGACATTATGGAACATTGAGTCCCAATATCTCATTTCCATCATCTCTTGGTCTATATAG
ATCTTTCTCTACGTCTAGAGAATGAACT