Map Locations of contig_136316 (10452 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_136316

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_5484 11 3576 bp MLOC_5484.1 Available Available LOC_Os03g24220.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13103.m02863 protein villin protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_5484






Contig Sequence (10452 bp)

>contig_136316 10452 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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TTATTGAGTTTATTGAATGACAGATTAACCCATCACTCGTCCATCTTACAGCTACAAGTT
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TGGTTTTTGCCAAAATTTACTAGGTAAAAACTCAACCTAATCTCTTTGGATGGAAAATTT
ATTAGATACATGCCACCGTGTGTTCATTTTATTGATATGCTACTAAGAGGACCCCTCTTT
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AGCATGCGATGTCGATTGAAGATCTTTCCCCGTATGTACCACTTTACAAAGTTTCTGAAG
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GCTGTCGGATATCTTATACTGCTATATCTTTGTGTGCTGTTGTCTATTATTAACTTATAG
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ACATGATACAGATTTCATGAATTCATTGGAGATGCAAAATATCGAGAATATAATAGTAGC
ATGATATTGATGCCATTACTTTACAGGGTGCATCTAGGAGCTCTGGTAATGGTGGACCCA
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GCCTCTGCACTGGCTGCTTTGTCCAATGCAGCATTCAATCCATCTCCGCAGCAGAAGCAG
GTAAATGCTCAATATTTTATGTACCAATATATTATGAGTGATGAACTAACTAGACAATCC
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TGCACTGGCTGCCTTGTCCAATGCGTTTAATCCATCCTCAAAACCAAAAACTCCACCTCC
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GATCCATAAATGAAGTGAGCCCTTATGGACTTGCTGCTATTGTATTCTTTCAAAGCTTAA
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GCTCTGAAGCTGGAGAATCCTCTGAATTTCAGTCAGAGAAAGATGCTCCAGTGGATGAGG
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GCTTGTTTTTACCCCTCTCATCATGATTGGTTGGCACGATCCATTGCTGGTCATCTTTGT
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GGCAGTCCCCCTGGGTATGTTTTGGAAGGTTGTTTACACTGTCATTCTGATGTAACACGG
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CCAGTCGCCCGCCGATCCAGTGCCGTTCCCGCCCGCCCCGATCCAGTCTCCTCGATTTGC
CCCGGCGCATCGCGGGACATGGGTCGTGTCGTGCTGTACGATCCAGTCCCCTCGATCTGC
CCCGGCGCATCGCGGGACAGGGGTCGTGCCGTGCTGTATCGAGGGACTAGCCTCCCCGAC
TGCTGCCTACGTGGATCGCTCCACCTACCACCTACGGGATCTCTCCAACCGCGTGGACCA
GGTACCGCCTATGGGATCTCTCCAACCGCTTGGACCAGCTACTGCCTACGGGATCTCTCC
AACCGCCTGGACCAGGTACCACCTACGGGATCTCACGGTTCCCACCCAGCCGGCGTGGTT
TCTGCCCTCGAGAACGATCGGCTTGTTCTCTCTGCCGTCGACGTGGTTTCTCATCCCGTT
GACTAATTTTCTTTCCTAAAAAAAATTGTCTACTGCATCTGGCTATGTTGATGTCCCTCA
CTGTTCGGTGATCTTCGATGGTACTAACTACACCGAGTTCACTGGCTTCATGCNNATTCA
CATGCGTGGCATCCGTCTCTGGGGAGTTCTCTCTGGCGAGGTCTATTGTCCGCCACGTCC
GGTTCCTCTTGTGGCTCCCACTCCTTCGACTCCACGGTTTCTTCCCGGGGATGCTTCTCA
GGCTGCGAAGGATGCGGCTAAGGTTGTTGATGAGGCTGCTATTTGCGCTTATGATGAGAA
GGTTTTGACTTATGAGGAGGCTCTTCAGGTGTATCATGATGCTCTCTCTGTTTACACCCA
GTGGCTTGATGA