Map Locations of contig_136280 (8783 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_136280

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_5444 5 5105 bp MLOC_5444.3 Available Available LOC_Os12g37860.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13112.m03898 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_5444






Contig Sequence (8783 bp)

>contig_136280 8783 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTCGCGGGCCCGCGGGGCCCGGCCGCGAGGGTTCCCGCGGATTCCCCGCGCACGCCCCCC
GCCTCCGCCGCCGCCGATCCGGGCCGATCGCGGCGTCCGTCCGTCCCTAGGGTTTCGCCC
CCCTCGGCCCCTCCGAGGCCGTCAGAAAGATCTCGATCTCCCTGGCCTGGACGCGCCAGG
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GGGGAGGGGCCATGGCCTCGAGCCTGCTCACCACAGACAAGAGGTGCGAGATTCCCGCCC
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CCCTTGTTTTACGGGTTAATTAGATAAATGCCACTCGAATTCTAGCGATTCGGAGAAACA
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AATGGCCGCCCCTCTTCTGGTGGCGGTTCAAGGCCCTCAACAGCTGGAAGTGAATCTCTT
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TCATGAAGGCAGATCAGCCGGCACATGATGGAAGTGCTCCCTTTCCTGCCACAGGTCCTC
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TGTATTTGGTTACAGAGGATGTATAAAACAACAAAAAATGTTGTACCATATGCTGCTGTG
CATGCCACGTGACTTGTTCTTGTAGTCCCATCCTTTTATAGCCTTGCATTCTTTAATGCC
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GTTAGTATTCTTCAGCCACCAAATGAACCCAAGGATACTGCCGTTCCTGCACAGCTCACG
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TCACATGATGCCAGTGTTCGAAAGCCTAGGCAAGGCTACAAAAAAAGGCATACTGTTTCA
GAGGATAAAATTCCTGGTGAGAAGTCAAGTGTGGCAGCTAACACAGAAAATGTGAAGAAA
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GAGCGCCTGAAATTACCAGAGGAAGCTCAGAGCACTGCAAATAGCCGGCCAAAACCTCAG
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AATGAGAGTGTTGTCTGGGCACCGGTTAAGCCATCAGGGTGGAATGAACCATCTGAGGAA
GCTGATGCAGCAGTAGCAGCCAGGCCTAAACCAATTGGAAAGTGCACCACCGATGGGGAG
AATGTCACACGAACTAAGAGAGCTGAAATGGAAAGATATGTGCCTAAGCCACTGTCCAAA
GAGCTTCAACAGCAGAATTTAGAACAAAATTTACCTGTAGAAAAATCCTCTGTGGAGAAC
AAGAGTAATGATAATGAGAAGTTAACCGCTGCTAAAGAGCCCAAGAAATGGGAGGACAAA
AAAACTAATAGAGGGCATGGGAAGTCTCATCCTTCTTGGCGCAGAAGGAATACAGATGAC
TCAGCTTCGGTGGTACCAATACCTTCTGAGCGAGCAGACAGCTATCAAGAATCACATGAA
GTTCAGAGGCCTTCTGACAAGCATCAGCACCTTGAACCTGACAAGCAAGCAGATTATGCT
GTCGGGAATAGTTTGGCTCCAGCTGAAGCTGCTGAGTTACCTGCCAGTGCCACAAAAGAA
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AACTACCCAAATGAGAACAGAGATGACAGGAAAGATGTGAATCACATGTCAACACGTGGA
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GCTGGTACACACTCTAGATCACACTGGAAACCAAAATCTTCACATTCCCAGAATAACTCA
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CGTAATAGTAATCAAGGTAAAGGTGACATGACACATGTGGAAGAGAACCAGAAGAGCGAG
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GGGCCTCCAGCTCCAGGACCAGTGTACAGGGAGCGCGGCCACCGCCCCCCTGGTGGTCAC
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TGATCTTGCTTTGCCCCCATGATTGTTGAGATTTAGGAACTCGCTGATGTCGAGTCATTC
ACAACAGGTAGGCAAATGAAATATTTCAGCATTCTAGTTTACTGCCTGTACATGGAGCTT
GTGTGATCTCATTCTCCTCATGGCTAACATGTTCAGAGGCTGGCAGGTTGAATGTTTCTC
GGCAGTGGCGAGGCCGTCGTCGGCCGGGGTCACCAGTAGGCTGTAATGTTTTTTGTTCCC
AGGGCTGTTGGGCCTTAACATGCGATTGTTAATTTTTCTGAAGAACATCCTTGACTCGGC
GAGATGTGATGCTTTTAATTGTACTAACGAAGTTGATTAAGTACTGGGACGCGAAAATGT
TAGTAGTGTTTGCTAATGGGAACGCGTTGTTTTCTTTTACTTATGGTAAACCTTTATATA
AGGCGCGCCGGCGCAACTTTCGGCCGGGCACACTCTCTCCCACGTACAATACTCGTATCA
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CCAGCTAAGGAAAATGCTGCAACCGATGAAATAAAAAGTTGGTATCTTTGTCCTTTTTCT
ATCTACCTCTTGCCTTATTTGTTACATCCAGTGATCAATTTCTAGATTACTCTTGTACCC
CTTGACTGACTCATGGCAAGGGACACATCATGTGCGGTACACGGCATGTCATACTATAGA
GCCTATGGCTCAGGCATAGGGGA