Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_136204 (5118 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_136204

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_5373 1 460 bp AK359210 Available Available None





CDS Structure of MLOC_5373






Contig Sequence (5118 bp)

>contig_136204 5118 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCAAGGTCCATAGTTTGGGACCCCTTACCCGAGGTCCGTCGGTTTGGACACCGACACCTC
TCTTACCGGATCAAGAAGGAGGATATGTCACCGAGCCAGATGTGTGTTAAACTCGGAGGT
GCCACACGTGCGGTGGATCGGATTGGATCGCGACGCGAGTACGACTACGCCAACCACGAT
CTCTAGGCCCTTAACACTTTCGGTCTAAAAGGGTATGCAGACACCTTCCCCTCTTGTTGC
TAGCATCTCCATAGAATAGATCTTGGGTGTTCAGTAGGAATTTTTTTGTTTCCCATGCAA
CGTTTCCCAACAATTTTATGGCCTTCTTCATTGTCAGGATGTCCGCACCTGAGTCGAGCT
ATGGTCGACCAGAGGAGGAGCGAAGGAAAGGCGACCGAGGGCGATGTCGTGGATATTGAA
CGAGGTGGATCCGCGGCGACGACATCTGCCACACAACCGCACCATCTGCACCTCCCTGCT
CTTGAGTTGGTCATTTGTTTCTTATAAAGTTTGCTTCTTTTATCAAGGGCACATCGATCA
CATCCTTGGAAAAAGGGCACATCGATCATTTTGTTTTCTGGTCTTTGCTGTTGTTACTTT
ATAACCTATTTTATCATATGATTTTGGATATTTGTGTTGTAACATACCTTAGTTTGGGTT
TTATTATGCACACACCTTATCTTGGGCCCTACAAGAAGGAAGCACGACATGTGTGGCTCT
CATTTGAGTTAACCGGATTGTTTCTTGAAAATATTCGTGATTACGGTTGTGCTCTCAAGG
AATGGTTAGGTTTAGTAACTTTTTTCTTGTATAATATTTGGGTGGTGCTCAAAATGCAAA
GGTGAAAACTAAGAAGCATAAAACCACCTCTCAAGAAAAGTTCATGAAGCCTCCTAGAGT
GTTATCCGCTTAGTTGAACTGAAGTTTAATGCATATGTAGGTTGAGTGCATTACAAAGGT
TGTTAGCTTACTGAATCTTAAAGAAACTACTTTTTCAACATGCATTCTTCTTTGCTTGAG
TTGTGCTCTTGTTACTTTATTTGTAGGTAAGCAACACTAAATGTTCCGTACTAACACGAA
TCAGGGTAGTATGGTGTTGTGACACAAAACTGGGACCCCCAGGAGTACAAAATAAAAAAG
GTCCAACTCTCTTATCAATGCGTATCTTAAACACTTGACTTGTATTTTGTCATACCTTTA
TGAGTCCATGGGTACTTTTCCAAACATGTTTTACCTACTGCAATGGTATAAACCCTCACA
TGGGTCACCACCAAATGCTCCATTTTTCAATCCTTGCTCTTAGGTGCAGAGAGAGACATT
ACGATTGCTATGGTTTGAGGTGTACTTTCAAGTATGCCACTTAGGTTTAAGGTTGCAGCT
TACTAGCTTTTCTATTTTTGTGTACAATTTCTATTTGGTTCAACTCATTTAGCTCGACCG
TAACTAAACATCAGTTTGCCAAAATACTCATTGGTTACTTACAAATGATTATTGCTACTA
GAAGAGCATAATCATTTTGAATGAAGCAACCTTATATTTCATCTTTGGGTAGCCAAGTTC
AGCGCCTTGAAAACATTTCTTATAACTTAAAAGTGGCAATGGATGCACCATTATATTTTT
GCTTAATCACTAATATACACGAAAAAATGTTACTTTGTAGGTTGGTGATTCTGATCTTAT
AAGCAACAACTAGAAACATGGGATGTACACATTATTTGACCAATGTTTCTCATACGGAAT
GAGCATTAGAATTCTTTCTTATTACAAGGATAATAATTCTGTGTGGCTTTGTTTTATTGC
AGATAGTGATCAGTCTATTGGAAACTATGGTGCATCATGGTATACATGCAACTTTCTTGC
CGAGTAAAGAACGATGGGAGTACCAATTCATATTTTGAATGAAAATAACATTTAAATTTG
CATTATTTCATGCCGGTTTAATTTCTAAATGCTAATCACATATATTGCTTTGGATCTTTT
TATAGCACCTAAATTAATGTCCTTTTTGTCCACTTGAATACCTAATTTTAGTAAATGTTC
ATAGATTGTAATATATTTCGTTGCCAGTAGCAACTCACATGCCTGCTAACTAAGGGTTTG
CCACAGTTTAAGACAACATTCCTCGCTCTATATGAAAATACTTTAAACACATCGAGTAGA
TCTTAGTTTGTAATAGATAATTATTTAGATCATTGCTCTCTATGTACACATCATTATATT
GGATATTTTTTATCAACTTACATACCAAGTGAAGTGGATTCCAATTACTCCTCCATTGTC
ATGGACTATCCTTTCTATGCATGCAAAATTTGACATATATTGTCCATATTTATATATGCG
ACCGACAAGAAAATTATTCATGGTCCATGTCTACACACATGCATTTAACTAGATTTAGCT
TACTTGGATTAGAAATAGATTAGGAAGAAGGTGGCGTGGTCGTGTTGTTTTTGTACTGTT
TTGAGACAACAAAACAACGACATAAAAGCTACATGCAAAATCAAAAAGACAATAGATTGA
GAGGATGAATGATGTATGAAGAGAAAAGATGATGATCAACAAGTTCAACGAAAACGAGGA
GCTAGAGGGATGTGTGGTGTTTGTAAAATAATAAGATGCTTGCATTTATGTCGTGGATGA
ATACTTCATGCAATGTGCTCGTTTGTGAAAAATAAAAATAAACATTATTTTTATAAATTC
TATAAAATACAAATTTATTTATTGACACGTGGCAAAGCACGAACAGTAGTAACAGAGAAG
GACACTGAATTCGCCGCAGAGCCCGGGCACGAGCATACAGAGCGTTTTTGGAGAAGCCCG
GACACGACGAGTCCAACAGAAAAAAGCCCACCACATAGCAGCAGTGCCCCATTCGTCGGG
CTCACCAGGCCCACACCTTAGCCCAAAAGCCCAAACGAGCCATGAAAACCCTAAACACCC
TCTCCACGCCTCTCCCTCCGCCCCTATATAGCGCCCCATCCACGCGCCGCCACTCTCCTT
CCCGAGCCGGAGGCGGACGAGGTAAGAAGCAGCAGCCGCAGCGCGACCCCGCGAGGAAAC
CCTACCGCCGCCGCCGCAGAAGCAGCCATGGTGAGCCTCCCAGCCCCCGCTCCCCCCCTT
CGAGATCCTTCCGGTTTCCCTCTAGTCCGCGCGCGCTAACTCTGCTGTGCTGCCAAGGGT
ATCGACCTCGTCGCTGGCGGGAGGAACAAGAGGACCAAGCGCGTCGCGCCCAAGTCCGAC
GATGTGTACCTCAAGCTCCTCGTCAAGGTATTCACGCGCGTACCCCACGCTTTCGCCATC
CGATGATCCAGTTTCCGTTTAATATGCCACGGTTACGGAATTTTCGTGATTCGATTAGCT
GTAGCCGCATCTGTGATGGCTAGTTTAGCTGTATTTCCATCTGGCTATGTAGGCGGCCAT
TTCTCGTTGTGTGCAGCGCTGTAGAGTCTAGTGTTGGATAGGCAGATCGTTTTTTTGTAT
GTGTGGTGTGCTTCTGGATTGTGATTGTTGTGTTGCTTTCTGTTTGCAGCTCTACCGTTT
CCTGGTGAGGAGGACCAAGAGCAAGTTCAACGCCGTCATCCTCAAGAGGCTCTTCATGAG
CAAGACCAACCGCCCGCCGCTCTCCATGCGCCGTCTCTCCAACTTCATGAAGGGAAAGGT
ATGCACATCCCTTACCGAGAGACTTTACCATCTGTTTGTTCGTAATCTAATTGTAAGGTT
CCCAGTGATGTATTAACCATGCTAATGCTGATTCCATCTGACGAGCAATTCATTATTACT
GAGGGAACCATTTACCTAGTTATGCCTTTTCGACATCCAAAAACATTGATTTCTTTATTT
TGTTCCAATTTGTGTATGTGCATCTTGTTCTGAAATTGTGCATTTCCTCTCCAATTTCAT
GTGCCAAATGTAGTTTGTCACTGGTGGTTATGATGCAAATCATCTATTCTAAAATTTACT
TAAATGTCCACAAGTCTATGTCTCAGTCTTCTTGTTTTGGTAACCCAGCTTATCGATTGT
CATATTTAAATTGTATCTCAACAGGAGGAGAAGAACATTGCTGTGGTTGTTGGCACAATC
ACAGATGACATGCGGATCCAAGAGATCCCAGCAATGAAGGTTACCGCTCTGAGGTTCACA
GAGACAGCGAGGGCAAGGATTGTCAATGCTGGTGGGGAGTGCCTCACTTTTGACCAGCTT
GCTCTCCGTGCTCCAACTGGGGAGAACACGGTAAGCTTTTCTTATCTCTGAAGTTGTGAT
TATCTTCGTGCCATTGCTTGGATTTGTTATGAGTAAAGCACTGTTCCGTAGGTTTTGCAA
GTGTGTAGGAAGTGGTGCCTTTATACTATGTTTAGGATTTGCTATGGCTGTATTGATCAG
GTGTTTTTGTATAGTATGGAAGTGTAAGATTTATAACCCACCCATCAGTTATCAGTTTTA
TTCCGAAAGGCCACATTGTCAAACTGATGTTTACAATGGAGTGTGATCATGGTAGCCAGT
TAGACTGTCTAGATCTTTCTAAGTTATCATCTGTATTTGAACACTTCCTTCGGTTCTGAT
CCTATTTTAAGGTTCCCAGTGATGCATTAACCATGCTAATGCTGATACCATTTGACGAGC
AATATAATATTACTGAGGGAACCATTTACCTAGTTCTTAATTTTGACTTCCAGAAACATT
GATTTCTTTTTTTCCCTGTTGAAATTTGTGCATTTGCACCCTTTTCTTAATTTTGCAATG
ATCTTAGTTTTGCGATGATGATACACTTTACCCAGCTCATTATGAGACTTCCCTCTGTGG
GTTGTTGTGATATGTACTTCTTTCCATTGTATCTGAGCTCTTGATAATGATTTGTTTTGC
TTTTTTGAGTTTTGACATGTTGGCATATAGTTGTATTCTTCTTTGTAAATGTTTTTGTGT
GACTTTCAATGGTGATACCCTATAATCCCAGTTCTATGAATACTCCCTCTTTGGGTTTTC
TGATCTCAACTAAATGTTATAGTTCTAACTTATTATACTATGTGTCTTCTTTGTAAATGT
TTTGTGTGACTTTCAATGGTGATACCCTACAATCCCAGTTCTATGAATACTCCCCTCTTT
GGGTTTTCTGATCTCAAC