| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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 |
No map location | No map location |
Predicted Genes from contig_136117
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_5314 |
1 |
3180 bp |
MLOC_5314.1 |
Available |
Available |
LOC_Os10g42439.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13110.m03987 protein heat shock protein DnaJ, putative, expressed |
| MLOC_5313 |
1 |
324 bp |
MLOC_5313.1 |
Available |
Available |
LOC_Os10g42439.1, FRAME:+1, EVALUE:7e-42, 13110.m03987 protein heat shock protein DnaJ, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_5314
CDS Structure of MLOC_5313
Contig Sequence (10923 bp)
>contig_136117 10923 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TAAGTCAAATTGACGACCTAGGTACATGTGCATGCCTTATAAACTGTGATGGAGGGAGTA
GATGGGTTAGTTATTATATGGAATTAGGCATGCAATAGATACATAATCCCCTTGAGCCCC
TTCAAAGGCTGCTATAACTGGATTATTTTTAGTACAGAATAATTTTCGAGGAGGATTGCT
AGCAACATAAAATGAGTGTAGTAAATCTCAGGTTATCCTTTCTAAGGAAGACTAAGGTGT
TTTTTTCCCTTAGCTTTAAGTTTTCTCCTGTGGAATACCTCTAAATTATAATTGTGCATG
GAAAATCATTTGCTTGTTGAATTTGATTAAGCTGTTCTCCATGTTTCGCCTTCTCTTTTT
GTTTGTTATTCTGTTATTTGGTCCGTCCTTTCCTTTTATTGGGGTATAACTGTATGAGCA
GATTTCTTCTGTGCATTTCACAAATCATTTTCCACTTTGTAACATTCGCCCTACAAATTG
GAGTAAGGCAAAAGTGTGAGCAAAAATATTTAGTACTGTTAAGACTATTCCCACAGTGTT
GACTATTGACATTGAGTCCTTTTAAAGGTATTTACTGTGAATGTAATATAATATCTATGC
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GTACAAAGTTAGTACAAAGTTGTACTAAATCAGTGACAGTTATTTTGGGATGGAGGCAGT
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CCAGATGTGCATCATCTTCATTAAATGGAGAAGAGCTTATACGAGACAGCGGTATCCCGT
TGTTGGCAACACTGCTTTCACGTTGCATGTGCATCGTTCAGCCCACAACTCCGGCACATG
AACCGGCGGCAAAAATAGTCACCAATATAATGCACACATTTTCAGCGCTCAGCCTGTTTG
GGTCAGGAAGAGTTGAGATTCTTAAGTTTGGTGGCCTTGTTGAGGACATTGTGCACTGCA
CAGAACTTGAATTTGTTCCCTCGGCTGTGGATGCTGCTCTGCAGACAGCTGCTAATGTTT
CAGTTTCATCTGAATTGCAAAATGCTCTGCTTGCCGCTGGCTTTTTATGGTACTGCCCTG
CCATCCTTTTGCTATTTGCTATAAATAATATGATAATTCCCTCCTCTCCTAAAAGAAAAG
AAGCTATAGTAACATGGAGTTAGTACTAAACGAATTCTGTACATATTATATTTGACTGAA
TCAAATTGACATATACATTAGCAAAAAAGTAGTAATGTGAAGCTATAGCAGTGACATATC
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TCATGCAATACATGCAGCTCAGGCTTTGTCAAAGCTTTGTGGTCTTGGTGGTGACGGAAT
ATCAAGTCCATCTAACCCTCCGGCTTTCAATACATTAAGAGCACTTCTTACTCCCAAGCT
TGCTGATATGCTGAGAAACCACTCACCCAAAGATCTATTATCAAATCTGAATTCAAATTT
GGAGTCGCCAGAGGTAATAGGTTCTCTATTCAATCATTATATTAGGCAATTTGCCAAGCT
TACTACTTTACTCCATCTGTAGCAAGCTGAAAGGTATCACAAATCACTATTATTACTGGC
ACATTATCTACTGCATGAGCATACACCTCACTGGACTTGGTGAATTTCATGACAGTGGAT
CTAGCTTCAAAGATGTAGCAAGAGCAGTTTCATAGTCTTACTTAGTCTCTAGTCCTGACT
TGATATTAATTAGCTATGGAAGTGATGTTCTCTACGGGTATAGACAAAAGCACACTCTTA
GTGGTGATGCTGTTCTAATCAATATACACCATGCAATTGTTTCATAGGGAGCAATTATAA
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TGGACGGCTTCCTTGAGTGTATGCAGTTAAACTTCTCTACATTTAACTCGTAATATTTTT
TATAGGAAAAGTATTTCCATAATATCACAATTTGATAATTGTACTGAAATATTTGTATGG
AAGTAATGGCCAAAATTGCATCTTGGAGACTATATGAAAGGTAATCTAATTATGAATGTA
GGGAGTAGTTACTTCCCAACAATCTACTACAGTTTGGTTCTATATGTGATCTTCACTAAT
TTACATATTCTGTTGCTTTAGCAATTGCAAGCTGTTTTTCATGAACACGACTTCAGAGAT
CATGATACGACAATCTACTACTGTTTAGTTGTATGTGTGGAGTTGATTTTTAGCTTAAGA
CTTTTTTCTTGCTGTAGATCATATGGAATTCTTCAACCAGAGGAGAGCTCCTCAAATTTG
TAGATCAGCAGCGAACTAGCCAAGGTCCTGATGGTTCGTACGATTTGACAGAATCACAGT
CTTTCAACTATGAAGCTTTGTCAAAAGAACTGAATGTTGGTGATGTCTACTTGAGGGTTT
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AGTTTATAGCAGGTTTAGTGCAAAAGTGGAATTCCATAAATTCGGAGGAAGATATGATGC
ATGGACATGATTCGGTTATTGATACATCTACTGAAAATGGTGGAGCCAGTGATTCAACTA
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GTGAAGTTATTACGAACCTCAGAAGTGGGTTAACATCGCTTCAGGTACTCTTTTGGATCA
GGTTTCTCAAGTGTTCTGTTTATGCTGCTCATTTTCTGACTTGTGTTTCATTCTTTTTTG
CTACAGAATCTTCTGACAAGTAATCCAGGCTTGGCTGCTGTTTTTGCTTCCAAGGAACGA
TTGACACCTCTATTTGAATGCCTTGCGCTGCCTGTTCCTCCTGAAAGCAATATCCCACAA
ATTTGCTTAAGTGTGCTTTCTCTCTTGACAAAGCATGCTCCTTGTTTGGAGGCCATGGTC
GCAGAAAGGACGAGTCTCATTTTGCTATTTCAGATACTACACTGCAATCCTTCTTGCAGG
GACGGAGCGCTTGCTGTCCTCTATTCTTTGGCCAGCACGCCAGAGTTGGCCTGGGCTGCT
GCCAAGCATGGCGGTGTAGTGTACATTCTCGAACTTATGTTACCCCTTGAAGGTGACAAT
CTCTATTTTGTCATTTTTTTTGCTACATTTAGATATTTATATGAGACTATGGTGTGGCTA
TTTCAGAAACTAAAGTGTATTTCACATGTTTCACATTCTTCATGCTCTTGCTGTTTTGTT
GGCACCAGCTGTTATTTTCAGGCGCAACAGTATGTTTAATTAATTGTTTTTTAAATGTAG
TTGGAACTTCTCACCAGTATCTTGCACTGATCCATCGCCTTTAAGTTTCCTATGTGTTTA
TCAAACTTTGCTCTATTTTTAACTTCTTACCGTTCACATTGGTTTTTTCATGCTTAACTA
CCACTAGTTTTTAGAGATCTAATTATGTACAGCATATTACTCACTTAGTTTATATCATGT
AGAGGAAATCCCTATGCAACAAAGAGCTGCAGCTGCATCCTTATTGGGCAAACTTGCTGG
GCAGCCGATGCATGGTCCCAGGGTGGCCATCACACTTGCTAGATTCTTGCCCGATGGTTT
GGTTTCTGCAATTAGAGATGGACCTGGTGAAGCTGTTGTTTCATCTCTTGAACAAACAAC
AGAAACTCCTGAACTTGTATGGACACCTGCAATGGCAGCTTCTCTTTCTGCTCAGCTGTC
TACCATGGCGGCAGACCTTTACCAAGAGCAGATGAAAGGACGTCTTGTTGATTGGGATGT
GCCGGAACAAGCACCTGGCCAACATGTAATGAAGGATGAACCACAGGTATAGTGCTTGTT
CAACTATTATTCTGGTATCTGCATTTCATAACATTGTCTTAGGTATTATCATGCTCTGCA
AATTTCAGGTTGGTGGAATATATGTGAGACTTTTCCTAAAGGATCCCAAGTTTCCACTGA
GAAACCCTAAAAGATTCCTTGAAGGGCTACTAGATCAATATGTTTCTTCAGTTGCTGCTA
CCCACTATGAAGCAAATGCTGTTGATCCAGAACTCCCTTTGCTGCTTTCTGCCGCACTTG
TTTCCTTGTTGCGTGTTCATCCGGCACTTGCAGACCATGTTGGTTACCTAGGTTATGTTC
CAAAGCTGGTTGCAGCTATGGCTTATGAGGGAAGAAGGGAGACTATGGCATCTGGACAGG
ACACAAGTAGAGCACAAGCAGAACCTGTTGAGCACGATAACTCTGATGGTGTCCCTGAGA
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TGGCGTCTAGCACAACTTGTGCTGAAGCTATGGCGGCAACAAGTGCAGGAACTCCTCAGG
TATTAAATTATAATGAACTTATTTGTGTTTGTTATGACTCTTGAGGGGCACATTGCATAT
TTAACTTTTTTGTAGCATATTTTTTACTGATAAAGCAACGTGGTCACTAATGTGTTTTGA
CTTCATCTGAAGATGTTTGATGACAAAGTTTGATAATACTAAGTTCAGTGTGAACCTTGG
TGTTTAAAGAAATTATGACTGAAAATTCCTTTTCTGGCATCACTTCAACAATAACTGTTT
ACCGCATAAATTACAAGATATGTTTGCCTTTATAGTTTGGAAGTATATTCTGTAGAACTT
ATGGGGGGAGAAGCCAGAAGAGGAAATCCAATATGATTGGTCTAGCACATCTTTTCATAA
ATGGCATCTAAAGCCCTTCGTTATCTATTTCTTGAACTGTCTTGCAGGTTGTTGCATTGC
TTATGAAAGCAATTGGATGGCAAGGTGGAAGTATACTGGCATTAGAGACACTAAAGCGTG
TTGTTGGCGCTGGTAATCGAGCTAGAGACGCGCTTGTTGCACAGGGGCTGAAGTAAGCTG
CTCCAGTTTCCTACCATAACTAGCTATATGTCTTCAAATATAAGTAGAATATTCCATTTT
CCAAATCTCATTGATTTCACAAATTTGAAGTGGCCTTCAACAATTACTATACAATGCTTT
GGTGCTATATACTGTTTAGAGGGCAGACTTGTGTAAATATGCAACTTATGTTGAAAACCT
TTCTGATCAATTTTTTTTGAAACATTTATGGAACATTTGCATGTAGTGGGTCCCATTTAT
GTTGAAAACCTTTCTGATCAAAATTTGTTCAATATAGTTTTTTTTTTCTCATTGGAAAAT
TAGGTATTCTGCAGTATCTCATCATCTGCCTTTACCCCATTCTTTTGACATTACAGAACT
AAAACATATTAACTTGTATTTTTTCTTCTGGTTAAACTTCGGAATACACACCTTTTGTCT
AGAATAACCATCATTTGCAATATATATGGAGGCTTTTTGAATGAAAAGGAATCCTAGCCT
GGACCTACCAGTACCAGTGTCTATTTGCTTCATCTTGTTAGTCACTGCAGTGGAGAGCTA
CTGCTTCTCAGTAAACATGCTCAGCTGTTACAATAAATAATTTTTGCTCTGTATTTACTA
CGAATCAAAATAGGGTTGGTCTTGTTGATGTGCTCCTTGGCATTCTCGACTGGCGAGCTG
GTGGAAGGCAGGGACTCTGTAACCAAATGAAGTGGAATGAATCAGAGGCTTCAATTGGGC
GTGTATTAGCAGTGGAGGTAAGCATCATATTCTGGGTAGCATTTTAGCTAAATCTTGCTA
TTGCACTGAGCAGTTGGATGCAATCAAAAGTGAATTGGTTTGATGATCATAGGCAGTCTC
TAGGGAGCTGATGTCCAAAGTGCATCTTCCATTTTGCTTGTTTCGGGTATTGGGTGGTAT
GAGTTTAAGATTGCCCTGAAATATTTGACCTGAAAATAAATGAAGTGTTTGCCCAAAGAA
TTGGATGAGCAACATTTTGTGTCGTCAAGTCTTCACAGCATTAGTCTGATGACTATTGAG
TAGTTAAAGCATGATATAAGAGGGTGCAAACGTTGGATCATGTTAAGGCCTCGTTATGGT
ATTTATGCATTTTAGGTTTGAGTTGTTTGAAACTTCAATTTCTCCATACTTGAATAGCCT
CTACGGCCTGTGTTCTGTTGATATATTTGATGTATTTTGTTTTGTATCTATAAACAGGTA
CTTCATGCTTTTGCAACGGAAGGCGCTCACTGTGCTAAAGTTCGAGAAATTCTTAATTCT
TCTGATGTGAGTGTACAGAACTCTGCGGTTCATGAAATTGTGCAAGTAGATCATTGATGA
AGCGACTCACTTGGCAGTAAAAAAGAACTCAAGTTAGTTAATTATAAGAAAATAAATCTG
TCTTTTGCAGGTATGGAGCGCCTACAAAGACCAGAAACATGACCTGTTCCTTCCATCCAA
TGCACAAACTTCCGCTGCCGGAGTTGCAGGGCTTATCGAGAGCTCGTCTTCAAGGCTCAC
CTATGCCCTCACGGCGGCGCCCTCGCCTCAACCCGCCCTGGTCCGTCTACCATCATCATC
TCCTCCTCCACCGACTGGTCCTGTAAATCCTGCCAGCGGGCGGCGGCATTCGTAGCGCAC
AAGTTGAAAAACACGCCGATCTCAGCTTCTTGAGGATGTCGTGAACATTTTGGAGTTGGT
GGTGCTCTTCAGAGTGACTGCAGGTGGCTTGCAAGTACATAGCATGTACAGTTTTTTTCC
GTTACACAGAGGTCGGGTGTCGTGTGCGTTTCTTGTACATGTAAAAGCACTCCTTTTTGT
TAGTTTCATCTGTCCATAGAGAATATCCGGGATGGAAATGATTGCATCGATTCGTTTCGG
CTTCATGCCATGCCAATACATTGTCCTTTTCACATAAGAGGAATGAGTTGCATGGTATTT
CTTTCTTACGCCTCCCACATTTTATCCAAAGTTGCATGTAATAATTTCTGTGTAATCATT
TAAATCGCCCGACTGGTCGACTGGATTTGTTGGCCTCCTCGCTCTCTTGCTACGTTGGCT
ATGTGGCCCCGAGGGAGTCACCTCTCTGGCTCTCCCATATCTTTTTCTACCGCATCTCTT
GCCGTGTCTTCCGCATTCACCTTCTCCTCCACCTATGCCGTCGCAGCGACAACTCACCCC
GTCGCTTTCTCCTCCCTTTGCCTCTAGATGGTATGGATGTCCACTGTTGCAAGACGCTTG
TGGCCCATGGGTTGTGGGAGTGATTGAATTTTAAAGATTTATCTTGATTATTACTTTTCT
TGTATTTATAAATTCTTACATAAAGGGTATAATAATAGGGGCTTGTTACGTTGGTCGTCG
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GCGTCTTCTTCTTTACAACAAAGATCTTGTTACAGAAACATTTGTAATATAAGATGCGTT
GCGTAATTTTTCTGCAACATAAGTTGTGTGGCAGGATTTATTTTTGTAACATAGGTTGTA
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CTGTTGCCTGCCTCGAGCGTGTCGTTGCGAACCGCAACAGAGCAGTAGCGCTGCCGCTCC
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TTGAGATGGAGGGTGGCGTTGTAGGAGCATGAGATGGAGGGCGGCGTCGCTATCGGAGTT
GCTGGGACGATGGAGGCACTGCTCGATGTGAAGAAAGACCGATTGGAGGAGAGATAAGAT
AAGAGAAGGGACACGCATCAAGTATTAGGTGGTGGATGCCCACCATTGGATCTGCCGTTG
ATGAGAATCGTTTCTCATAATAATAAGTGAGTGTTTGTTCAAGTAAGAACAACTCCGGTC
CATCCACATAACAACTTATCAAAATAATGAATGTAACTCAATGAACCATAGTGGAAGTAA
CTAGATGATACTCCTGTGTGTCCTCAAGAGCGTTTTAATCCTGCTGCACCTTGCTACTTT
TATTACTTTTTATTTGCTATCAATTATCTTATATCCAACTATCTATCAAAATTATGTTAC
ATCACTTGCAAAGAATAACTTGCTGAAAACTGCTTATCGATTCCTTTTGATCCTCGTTGG
GTTTGAGATTGTTACTTATCTAAAGGACTATGATTCTTCGCTTATACTCATGGGTCATCA
AGACTCTTTTCTGGCACGGCTGCCGAGGAGTGTAGCGCTCTTAGTAAGTGGAATTTGGTA
AGAAAACACTTATTATACGTGTTGAATTTTATCTTCACTTGTTACTATGGAGAACAATCC
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CGGACTCACATTATACCGGTGGCCGTGTTGATAGGAAATATACTTCGGGGATATGTCATT
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TCTTGAACAAAGCATATTAATATCAGGCATCACTTTTTTCACGGTCATGTTCTTCGAGAG
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CTCGATGAGAAAAGATTCTGTTCGTTATGGTGTGAGATAAATATCCTAGATTCCACAAAT
GTGCAGTAGAGAGAACTTTGTGCCCATGCTAACACTTTCATATCTTAGAAGGAATGGGTG
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ATTAACGAAGAACTTGACTCATAGAATTCCACAACAAACTGTGTGATGTTTGGGTCAAAT
AGTTCTTACACGGTTGGTCACATCACCGCCCTTTCATTTGTTTTCGTCTTGGATTTTAGT
TCTTGATAGAATTTGTTTCGACTTGCTAGTTTTGACTTCCCCTTTCTATTTGGATATTGT
CCTCTATACTTTTCACTCATAGTTGTTTTTCATTTCGAGTTGTTTTTCTTCTGAGTTAAA
ATGTTTAAGATGCCACACTTCTATTCTATCTTATCCAGTCTGTGTTATTTTCATTATGAC
TACGCAATTCCATCATGAGTGTCCTTTATCTGGCATCCATGGCTACAAGAACTATGTCAC
TCAGAAAAACATATCAATTTGGCGCAAGCCCTCTGAAATTTGGGTTTCCCCGCTCAAGTC
AGGAGACAATTGTCCTTACAGTTGCCATGTGGTCACGAACAAGTGCCACATAATACTCAC
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ATNNNNNTTTTTAGAGATTCCACTAGTGACTACATACAAAGTAAAATGAGTGAATCTATA
CTNTAAAGTATGTCTATATACATCCGTGTATAGTCCGCTATTGAAACCTCTAAAAGACTT
ATTTAACAATGAAGGGAGTAATCAATAGGACAATTGTTCCTTTTGCATATAAATACCCGT
CATCTCTCTCATTTTGCAATTCCACTCTCTTTCTCCTCCCTTCCCAAAATCCTCAACTCA
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GGTGTTGCCGGAGTTCATCCTCGCCGTCACTGTTCTTCTCCCTCACCGCACCACCGCAAT
TGTTGCACATCACCAAGTTAGGGTATGTGTTGGATCGAACCCGAGCCTCCTCTTGTTCTT
TCTTGTGTTCGCCCACAGTAATATTCTAGGATTTTACCATACTTATCAGATCTTTAAATC
TTTAGGGTAAAATCTTTATGCAGTTTGTAGTGTTTCCTTGCATTAAGTCTCAGATCTAGG
GTTTGTATTTTGCTTGGCACGATTCAGATGAGTAGTTTTCATGTTGGTGGATTTGTTTCA
GATACACTAGCATGAAACCTATGCCTATTGGTAGGCAGGGATGGATCCAGGGGGGGGGGG
GGG
