Map Locations of contig_136104 (9802 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_136104

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_5291 9 3891 bp MLOC_5291.3 Available Available LOC_Os07g31540.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13107.m03195 protein ubiquitin family protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_5291






Contig Sequence (9802 bp)

>contig_136104 9802 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TAGATATAGTGGTCGGGGCGTGCGTTTTGCGGGCCTCGGCAAATTTTTTTACGGGCCGGG
TGAGTATGCGGGCTCTGTTCTGGCCGAAAAATGGGCCGAACCCGCATACTCGCCGGAATT
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GTGTCCGGTTGTGAGAAGGCAGATTTGAGGCTTAACAGACGAGTGTCCACAGATGTGCCT
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GTGCTGTCGGGGGTTCTACGGCGAGGGACGGCTCCGATGGCCCGGAACCCGCCACCATCG
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TGAGTTGTTTCCCTGCCACATTTATACATGGATTGTATTGATTGCTCTGGTCACAACTCT
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GTGGCTCGACGCACAGCTGAGGGCCAACAATCCTCTGAGACTTCTGAAGCAAGCCCTAAT
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TTATGCAGTGCTATGATGCAGTTTTGTGTCTGTTAAATTATTCTTTACTCTCAAACAATT
TATTAGATGACGGAAGAGATGTAAACTTTTGTGTGAACTATTTTTTGACTGACCTACATT
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TGCATCTGTGCGAAGCCAGATACAGAATGAGTCGGCACAGTTGGGGGTAGCGATACAGCA
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TGCAACAAGTGGTCCATCTGTTGGTTCAACCACTGCTTCTGCAACCGCTGCCAATGGGGA
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TCCTGTTCAAATGAGAAGCCAAGTGGCAACACCTAACCAGTCAACTGGTCCTCAAGGTTC
TCAGACTGCAGTGGGCAATGGATCTCAACCAATTTCAACCTATGTTGTTCCACAAGCTTC
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TCTAGGAAAATCGTACCGAATCGTTCACCTGTTTCTGTTGTTATTGTTCTATGTAGGTAC
TGTGCCTTCAAATACATCTGATCCCAGCTTGACACCACAAGACATCAGTACTGTGAGTGC
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CTTGGGCATGCCAGCAGAAAATACTGAACTGAAGAGCAAGCCCTCAGATGGAGAAGCTGG
AGAGTCTACTAAACCTACTGCCAGTGGTGGGTCTGGACCACTTGGTCTTGGTGGTGGCCT
GCAGCCCAAGGTAATACTAATAAGTTCCTGGTTCTTAGTCCTACAGCCTCACAAACTTAA
CTGCTCAGTTTGCATTTTGTTTCTGTCAATGATTTCCTGCATATTGTCCTAGTGCTTGTA
ATTTGTTGTTGTCAGCTGCAATGCCATTGATTTTTATTTGAAGAACAATGTCATTGATTA
TGTTAACTACGCTTGCAGAGACGTAGTAAAGTAGCAAAGCCATCTGGGACTAGCAGCAAT
TCTGGTGAAGCTGTTAACACATCTTCTGCCCCCAGAAGCCAGGAAGCTGTTCTGATGGGA
CAGCAGGCTCTGCAAGCTCTTGTTTCAAGAGGTGCTAATGCAAGCAGCGGCAGTGTTACG
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GGTGGTGAAGGGCAAGTTGACATCGGCAGTATGATATCAAGTGTCCTCAACAGCCCGGTG
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TCTCAGGTATGCCATCCTGTTTAACAAAAGACTTTTTTAATGATTATGATTAAAGTTGGC
AGGTCAGTTATAGTATTTACCTGAATCTGCCATGTTTGGACTGCAGCCATCAATTTAGGG
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TTTTTTTATCAGCGTGAAATACTGGAATCCTTAATCTTGTAAATACAACACCACTCATGT
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GCCCCTGAGGATATCTTTGGTGCCGTCCTTGAGACTGCTGCTCAGGCTTATGGCAACGAC
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TCCCTACAACCTCTAGTTTCTAAAATAAGCCCAATTATAGTTTATTACATATAGTTTAGT
TGAATGCTAGACTGGAGATTGTATTACATACTACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTGTGTC
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AGGGAGTACATAATATGTAGTCCGCTGGGTACATGAGTTTGTTATGAGGGGGATTATTCC
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GTACATGAAGCTTCTGCTGGCGCAAGTCGGCGAGAGGGTGGAGTCCGAATCCGAGGCCAA
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GCGGCGTGGTTGAAAATGTGGTGAAAATATATACCTAACTCGTGACTTTTGGATGTAATT
GTTTCTCCCTGACTTTTGGATGTAGTTGTCTGTTGTTACTACCAAATTTTGCTAGTGACA
TGCACATAGCTAGCTAGCTTTGGGGAACCTTATTCCTGGATTTTGACGGCGACCAGATTC
ACGCATGTCGAAAGCACCCCTCGAGGAAGATTGTGTGCTTGTCTTGTCGCATCCCGTGGC
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TCTTTATTTCGAACTGAGGACGGTCCTCCATCATAGATGGTTCATTTCTACGATGCATCT
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AACAAAAAAGACAAACCGGGTTTGTAAAAATGTTAACTGTTCTGATGCGATTTATCTTTT
TTGCCAAGAGCTGTTCAAATAAGTTGAAATTTAAAGCGGATCTCACGCAATTAAAAAATC
TATCACAACAAAAAAAAATTGGATTTTTCTGATTTTTTTTGAGTATTTCTTTTTATTTTT
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TCTGATGCAGCTCAATTAGTACTAGTGTGTTCTTCCCTCAGGCGCCATCCAAAGTGATTT
TTCTATCAATTAATAAAATAATTGAACATAAGATATATTTTTATTTGGTGCAAGACAAGC
GTATAGGACATTTTTTTTGATTTTCATCAGGGAGGAGGGGAAAGCCCCTCGACCATCAGA
ATTGTATTTATTTTGTACTAGCAAAAGGACCTATGCGTTGCAATGGAAGAAAAACAATTA
TAATCTCCAACGATGCTGATCATATTATGTCTTTAAATTTTTAGTACATTTCTTAAAATG
CATGAACATTTTTTGAATTAGC