Map Locations of contig_135971 (9832 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_135971

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_5179 2 1184 bp MLOC_5179.2 Available Available LOC_Os04g43170.1, FRAME:+3, EVALUE:1e-141, 13104.m04280 protein caleosin related protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_5179






Contig Sequence (9832 bp)

>contig_135971 9832 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATTTCCTATGTGTTTATGAATAAAGATAGTTCTTGAACATTATCAATGATATGTATCAAT
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AAATCCAAAGTCGCCACGTACTTTGCTATTATAAAGGGATTATACTGATGCCTCTTTAAC
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TCATATGTGAGGTATTGAGTCAATCCTCAATAAAAATGACACATATATGGTTATGGCGCA
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AGCACGTCGCCTTCTTCGACCGCGACAACAACGGCATCATCTATCCCTGGGAAACTTACG
ATGGTACCACGCTTGTTACTTTATGTGTATATATATACAGTCGCACCGCTCTTCGTCTTG
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AGACCTAGAGAGGAATTAACTTCAGAAATCACACCGTGCTTCATTCAATCTTTGTATGTA
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GGCCGGTATGTTATACTATATACTTATGACCACTGTTAATCTTGTACTCACGGCGGGGTG
GGAGTTAATTGCAAAAAACCATCACATTGAAGCGAACTTCTGCGGAGAACACCCTTTTAC
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GCATGATTATGACATGTGGGTTCCATTTTCGATGACGTGGCGCATGGATCCGTCATTAAC
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GGACCTCGCCGTACCGAACTACTTGGAGGCAGGATTCCTTCAATATTTTCGAATGGGCCG
CATCACATTCGATATGGTATGCAACGAGCTCGTCCCCAAGAACACGGGGCCCGTCCAGCT
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GACAGAGAGCGATCGATAGATAGCGGCGGGATGGAATCGGTTTTGATGGAGCCAAACAAA
TCTAGCATCGGCATTAGTGACGGATCCATACGTCGCGTAATCGAATCCACATGTCATAGT
GGAGCGCCAATTTAAAACGCTCCAATCGACTGGTTTGTGTTTTTTGCAAAAGTTTAGGCG
ATTTCTTGTGTTTCCGCAACGAATGCGTAAAATGTGTTTTTCGCAAACGTTCGCTTCAAT
GCGATGGTTTTCTGCAATGTGGCGGCCAATGTGAAATGCGTGTGGTGTTGTGCAGGTTCA
TGCCGGTGAACTTCGAGAACATCTTCAGCAAGTACGCCCGCACGTACCCGGACAGGCTGA
GCTACAGGGAGATGTGGCGGATGACGGAGGGGTGCCGGGAGGTGTTCGACTTCTTCGGCT
GGTAACTGCCTAGGCACTCGACGATCAGCATGAATTGACCTTCGATCTCAGTCGGCTATG
ATGTTGTATAACTAACTGGTGTGAGATGGATGGATGCAGGGTGGCGATGAAGCTGGAGTG
GTCGATCCTGTACGCGCTGGCGCGGGACGACGAAGGGTACCTGTCGAGGGAGGCCATCCG
GCGCATGTACGACGGCAGCCTCTTCGAGTACATGGAGAGGCAGCGCATGGAGCACGTCAA
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CAGTTGGTGTAGCGTATGTAGAACAGACCACAGATCAACGTGGGGGTGCCGCCACTGGTT
GTGGTGAAACATAAATAACGTGATATGCCGTGCTTGTATGTTTAGCCCCGTCTTTCCCTG
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CAATAGTAGAGCCGGTTGCCGGCTGTAAGCTCATGCCATGTCATATATAGCCCATCTTAT
AGCTAACATGTACAATAGTTGGTTAGAAGAGTGTACTACTTATTTATTATAT