Map Locations of contig_135919 (11580 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_135919

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_5144 1 186 bp MLOC_5144.1 Available Available None
MLOC_5145 3 795 bp AK368448 Not available Available None
MLOC_5142 2 1042 bp MLOC_5142.1 Available Available LOC_Os03g21370.1, FRAME:+3, EVALUE:9e-107, 13103.m02560 protein expressed protein
MLOC_5143 1 265 bp MLOC_5143.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_5144






CDS Structure of MLOC_5145






CDS Structure of MLOC_5142






CDS Structure of MLOC_5143






Contig Sequence (11580 bp)

>contig_135919 11580 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGATACGTTGGAGACGTATTAATGACCGGAGCAAATGCTCAAAGATGTCGATCCTCGGAC
AATGGAGCGGTTCGTGAGGGCCTACCGTGGTTTCTTCTCATAGAGGTCGTGTTTCCAGAC
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AGCTTGACGACGCAACCGAGAGGATAGAAGAAACATCCGTTATGCGTGGATGTGTTTGGG
TCCTCTCCATTTGGATGTGGGAGCGAATCCTAATTGGTCGTCCAGAGAAACTGGCCCGAC
GTCCCTGGACTGACGATGTCGAAGATGACGACAAAACTCGATACCTGACCGTCGCGTACG
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GAGAGTGGGGGTTCGAGCTGAACGTGATGTGTAGGCATGACAGGCTTCTCTAGCGGTGCA
TTGTGCCCATGATTTGTGTTTATGCCACCGAGTACCACTTGCCACATCGCGTTGCCGCAC
AATTTGGTTGGGCGCAACGTACCCCACCGGGTGGTCAACTCGACGCCGGTGGCTCTGACC
TACACTCGTGAGAGCATTGTTCTCTATTTCCATGTTTTTGTTTTGATGTTTTACAATCTT
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GGTACGACGGTGGAATCAAGCATCGTCTGCGCCTAAGGCCCTAGTGGACTACAACAGATG
CTGAAGCACTATACGACGACTACTCCGGGAATGAAGCCTACCATGACAACATCAGAGAGC
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TGTTTTGAATCGACGGTTGGATGAAATCTACTTTAGTGGGTGTGACTCATTTATTCTTTT
GCAGCCTTCGGAGGTGAACAAAAGCATTTTTGAAGGCTCGGATTCACTAAGTTCTATCCC
TGGGACTCGAGTTAGTGAAAAGAAGTTGAGGGAAGTTGTGAAGGTAACATCGAGGTTCCT
ACACTCACATTCTTTCTTATGTTCATGTTCATTTGTAATCATAAACTTGATCCATATCAT
GTTCTTGTTTCATTATTATTGCACAAATACGTCAACAAATGTCGCAAGCTGGTGGGCCTG
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TCATCGAGCTATGCTGCCTCGTCGTCTAGGGTGGTTGAGGAGGACGATGAGGAATAAGGT
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AAGACCTCCTACTGCCATGGCCCTTAGCGGTAGGCTGTGACAACCTACCGCTGAGTCCTT
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TGGCTTAGTTACATGCAGGCATGCGACTGTGTACTACTCCAGCGTGCAAGGGAAGTTTAC
ATGCAGGCATCCTTAGAGCATCGGCAAAGCCAAATACGGTGATACCCAGCGTTGTCCCGA
AGTAACTAATGAGGCTGGAAACCCAACCGATAACGCACCCACTCGAGTCACATTTTGTGT
GTGCGGTGTGTGTGTCAGCTTGTGCACGCTATTTACCGAGAACATAACATTGGTACATGG
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TGAAAATAACATTCGTGAAAGTCATGGTAAAAAAAGTTACACTCCAAAAATGCTATTTGC
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TGAAACATATTAAATTTGCATAAACACAACCATGCATTAGTCATTAAGTGAGGAACATCT
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GAAGGTATTTCTCTCACATATGATTAAACTATCCATTGATGTGGGATTAGAATGTTTGGG
GGATGTTGTGATGATCTATGGAGGGACTGAAAACAAGTCAAAATATGCTTTTATTGTTAG
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TAATATGATTATTTATGCCTTGGCTAATTTTTAGGTTGCAACGCCGAACTATGATTTTGC
TAGGCTCTTGTCCAAATGGTTGTAATATTTGATTTTGAGTAATGCAAGATTTATTTCGCA
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AAGGACTGCCATGTTTGGAAACAAAGAAAAGTAGCCGAGCCTGATGCACCTAGCCATTTT
TTGTGGAGTGCATCACATTCATGGGACAAGAGTGTGTAATTAGTCAGGAAACATAATAAA
GATATACTACCTACCACCATAGAAACAAGTGCGGGGATGTACATCAATCGGCCATTTTAA
TTTTGTTTGTTTTGTTAAAGACCAGACTGTTTTTTAATCCCTTTTCTCATTTCATTTTTC
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AAAAATGTTCGCGGATTTGAAACTATATTCGTGAATTCAAAAATATTAAGTAAAATTCAG
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AAAAAGTTTGCGAATTCATATTTTTCATCAATCCAATACATGTGTACAAATTGAAAAATT
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TCTTGAAGATCCAAGGTCCCCCTAGCTCTCAGTGCCAAAATGGCAGTCAGAGGCGTGGGG
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TTGAGATCCGGAACTCGGCCAGGAAAAGAAGTAGTCCATGGGCCGATGATCCCAGTCCTC
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GCCCCTGCGCGACCCTCGCGCCGTCCAGGGCCGCGCACGCCCACGCCGGGTTCGCCCACA
CTAGCCGTCCAGCCCTCTCCGTCTCCTGCCCGCCGACGCGCTTCGAGACCCTCCGCCGCG
CCGCTACCGCCGTGTCCGACCGGCAAGGCTCCGCAGAGCCTTCCGAGAAAGTAAGCATCG
GCACACGCTTCCCGTGCCTCGCATTTCGCACCGGGCACCTGCTCAGTTCTGAGACGATGT
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TTCTAGACAGGTTCCCCAACGTCGCCAAGCGGCTCAAGCGCCCCGCCGTCGCGCTCGTCT
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GTGGGGAAATTCTCCCTCCCGCTCAACATTGCAACAAACAACGGCGACGACGACAACAAC
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CTGAACATTACAATAACTAAATCATGGTAATACTTGTTTGTTGTTACTAGTAGGCGCTCC
CTTCATTCTAGTTGCCTGCCTTGCCCATATGTCATTGACATCATGTCATGCACTGGAAGC
CGGTATGCTTCCTGTTGCAAATGGCAAAACCATGCAGCGGTGCAGTCTTGTATCTGCAAT
TTGCACTGGATGCCTACTTGATGGCCTCCCATAATAATGTGCTTGCCATCAGCAAAGGCG
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AGAAACTTATTGACCATTGAATTCTTAAACATGATGGCACTGGTGTATGCTGACTGTGTC
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TTTTGTTTCTATACATATAAATATGCTTAGCCAAGTATCAGCTTGGATTCGATCTTAAAG
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TTCTCAATAATCTCATGTTATCTCCTTTATTGCTCTCAGATTCATGAAACTAAGGCTGGA
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TGCAGAGTTGAAATTCGATAAGCCTGACAAATGGACAGCTCCATACCCCAAATACGAGTC
TGGATGGTGGGAGGCCTTCTTACCTCCAAAGTCCAGCAACGGCACGGCTTAGAGATAAGC
TTCAGTCGCCCCCGTGTAAGATTTCTTCCATGTAAGTGATGATTGTAAGTTTTGGTTTAT
GCTATGTGTATGTAGTCCGTAAGTTTATGAGAGTAGAGTTAGCTACATTAGTTGCAGAGG
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TGGTTGTTTTGACATTTCTTCAAGGATACACATTCCTGATTCATGCACGTTGTCATTCTA
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AGACCTCAAATATATTACTCCCTTCGTCCGGAATTACTTGTCGCACAAATGAATAAAAAT
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GACGTTATAACAAACTGGAAATGTAGTCTACATTTAGCAAATTTAGAAATAGCCATGGAA
TGCTGGGCTAGCTCGTGATTTGTTTGACATTGATAATCGGGCCTTTCTTTGTAGATCCAT
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AAATTATTGCCAAAAATTGCCATCACAGGAAAATTAACAAATGTGCCAATGTATTAGGAA
AGTCAGATACATTCTACTGTTTTGATAAGAGATTATCGGACTACAAGGCACATACATCAG
ACGCACAGTACCTACATGGTAACATGAAGGAAGGGTAAAATTTAGAACACACTAGCACAA
TTTTCAAAAATAACACTTCCCCGTCCCAAAATTCTTGTCTTGCTTTTGTCTAGATATGAA
TGTATTTAGTCATGTTTTAGTATTTAGATACATTCATTTTTAGACAAAATTTTTTAGGAC
GGAGGGAGTAGAACACATTAGAACACGCTAGAATTGCAGGCCAGGACCTGCATTCTAAGC
TTCTAACCAACACACCAACTCCCTAGCGACTGAAAAAACCAACACAATAATTACACAACT
CTAAAGACTGACATTCACTTTTAGGGCCTGATGGAGCGATCTACGGATCTTGTGGTTGTT
CCTCGTTCCGATCCTCCGATGCTTATAATCTGCACAACCGAAGGAGCACATTGCTTGATG
GCTTGCGACAAAACTTTAACTCAAACCAAAGACGCGTAATGAAGTACTGTAGGTCTATAA
CTCTATTGAAGTGCAGACCATGTGGATACAAGTTGCTTTCAACAACTGGTAGGTCCTCTT
GGAAAGGAAAATCCAGCTGGTTGGTATAACAACCTTCGTGTGCTTAGCACTAGTACCATA
CTATTCTTCTTTTTGACGAGAAACAGTATGCATGTATCTACATTTTTTGTTTTGTTTTTG
TGCTAGTTACATAGTATTCCCCATGTATTAATCCTATATACTCCCTCCGTTCCTAAATAT
AAGTTTTTTTAGAGGTTTCACTAGAGAACTACATACAGATGCATATAGACATATTTTAAT
GTATAGATTCACTCATTTTCCTCCGTATGTAGTTCCTAGTGAAATCTCTAAAAAGACTTA
TACTCCCTCCGTTCCAAAATATAAGACATTTTAGTTATTTCACTAGAAGACTACATACGG
ANNNNNNNNAGTGAATCTATACTCTAAAATATATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATA
GTACAATCTCTAAAATGTCTTATAGTATTTAGGAACGGAGGGAGTATTTAGGAACGGAGG
GAGTATCTCGTGCATGTTGTGTCCCTGGGATTAGTAAGTGGCGAATTTCTTTCCAAAGGA
GAAATAGAGAAAAACATTCATGAACATATTTGCTTGATTGGCCAAATAAATTTTGTATTC
AAATGAGCAAATCATGCTACGTCAACGCGCAAAGGCAGTAACAAGTTAGGCAGGAGCAGG
AAAGCCGCACGGAACTGAATGGAGAAGGGAGAATATTTTTAGCGGAGCCTTGGTCAAGGT
CTTTGATAGTACAGTTTTCCGAATTAACAAGAAGTTGGAAAATAAATGAAGAAACTGATT
ACTGCTTGCATGAAACTAATCAAGCAAGATCCTGAAGACCTAGCACCAGATGGAGTCAAC
GGTAGAAAGCCCGGTCGTGAAAAAATCACCCTAAAATGTCTAGAAATGATACATACATAC
ATACATGAGAAACAGAAGAGGGAGCATGCCGTGCCGCCTTCAAGTTCAAGCTCCCCACAC
GGTGATCCCCTGCATCATGCACTTGAACTCGCCGAAGTCAACTTGGCCGTCGCGGTCGCG
GTCGACGTTGCAGATCATCTCCTGCACCGCCGCCAGGTTGCGCGCCTCCGCCAGGCCCAG
CTTCTTGAGCACGGCCTGCAGCTCGGCCGCCGAGATGAACCCGTCGCCGTTCTCGTCGAA
CACCCGGAACGCCTCCTTCATGTCCTCGTCCTCGGCCTCGCCTTCCTTGCCGGGCTCCTC
CTCGGCGATGGGGCCGAAGAGCGCGTCGCCGAGAGCGCGGTGGAGGCCCTCGAAGTCCTC