Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_135881 (5006 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_135881

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_5098 1 1221 bp MLOC_5098.1 Available Available LOC_Os09g26170.1, FRAME:-2, EVALUE:2e-73, 13109.m02514 protein MYB family transcription factor, putative, expressed
MLOC_5097 1 1490 bp AK369503 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_5098






CDS Structure of MLOC_5097






Contig Sequence (5006 bp)

>contig_135881 5006 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CATATTGTTGTGCTGCTTTGTAAGGTCCTCGAGAATAANNNATAAAATGACCGCATGCAT
CTCCCAGATGCAGAGGCCGTGGGTCATCCTCCTTTTCTAAAAAAAAATTAAAAAATTAAA
AAAAATATCAGTGTACCATGCCAAATTTACTGCTATCACATCGCATTGGGTCAGATTCCT
TCTTTTGTACACTTATGTTACATGAGAGTTAAAAGCATTCGCCTCCTGTTCTAGGGAGCA
TATTGGCATAAATGCGTACATTTGAAACAGATATGCATCATTATGCTTGGTGGTTTTATT
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TCCATATTTATTGTCGCTGATTTAGTACAAAGTTGTAGTTAATCAGCGACCGTTTAGAAT
GAATCCGAGGGAGTACTAATTTTTTAGTTACAAGCTCCAATCAGAAAAAGCATATATTTC
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ATTCTTGCCTGGGCTTTTGAAAAGTTTGAAAATTAATGAATCAAAGATGATTCCGCTCAA
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GATACCATACCTTAAGTTGTTCCTTTCAAAATATTGCCACAACTACACTATGACTGGACC
GATCTACAGGTTCGATGGATTTGGTTATGTGAGTACCAACTTTCCAGCTCTTGTATAGTA
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TAGGATCGTCCCAGTAGCTCAAATTTGTATATTTATAATTTCACATACCATCAAAATATC
TCTCAAACAAACAAAAAATCAGAGTAATCTTTTATTAAGATTATAGTTTCAGCCAATATC
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TGGAAATATTTATTGGTTTTCTGTTGAGAAATAGAATGCTTTCTTAAATAACATGATAAA
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TCATTTGTGCAGGCATTTCCTCGGGGCTCTCCACTCACGCCTGATATCACGAGGGGAATA
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TCATGCCCCGACAAAGATGACTCCCAAACTTCAAGCAACCTTACATTGCACAGCTTTCAG
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AATACACCCCAAATAGTGATGAGACCAGTGGCAAATGTTGGTAGTACAGGAAGCCCGCCA
GAAGGACAAGGATCACGAGTGTGAAGTGCAAAACCACCTTTCTTTGTAGTTGTACGCATG
CAGCCTGACGACTACTGATAAGCGTGCAGTGAACTACACGGTGAGCGTATAACTACTGAT
GGCCGTAATTCTTTATTCGTTTGTCTGTTGATTTGTATTTATGTTTAGGCCTTTTAACGC
ATAGATTGATGCAAGAACATTTAATCTGGCGTCCAAATCTGTATTATAAGGTGCCACCTG
ATGCTGTTTTCCAGATCTGTCACATATCACATATGGAATGCAATGTGCACTTAGACATGT
ATGCAAGCTATGTATATGCAAGAATACTGCTGCTTAGTTGTTGGCTCTTGAACATTTTGT
CGATCTTTCTACCATTGGCAGTGCACGCATGCTTGCTGATGGTAACTGATGAGGTACTTC
AGTACTTAACTACCCTTTATATGCTGTTCAATGGACAATCAGATTAACCAGAGAAGCACT
GGCTTTAAACTGATATCCCATATGTATACTGAATATTGGTTCTACATTTACGATACACTC
ATATCAATCCAGATCTTCAGAGAAAAAGCTGCTGAACTAGTACACATATTTACGTACCTA
TAGACTAATAGTATTAGGGCCATATTCAGGTCTGAAATGCATATAATTCTACTGCCCTTG
CCCTTGTACATAGCCCTGGAACACCGAGTCCACTCCTGGAGTGGAACAGGAGCTCCAAGA
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CAAGCACCCTATCTGCTGGAGCAGCATCTCGATCTCGTCCTCCATGTCGCCGTCGAAAGT
CACGGAGCTCGCTGCCGGTGTGGAGCTCGAGCTCCCTACGCCCACCGCTGTCTCGCCCGT
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GAGGTTGCCGTACAAGGGGAGCCCCGGGGTGTCTTGGAGGCCGACGTGGCGTCGCTGCAC
GCTCAGCTGCATCCTCTCCAGCGCCGTCGATGCGCCGCCGCCGGTGGGGCTCGCGAGGAG
GAGGCGCGGCTGTGGCTGCAGGTGCGGCAGCGCGTACCTGATGGGGCGGCGGCCGCCACC
GAGCAGGCGCCGCTTGAGCTTGGTGTTCCAGTAGTTCTTGACGTCGTTGTCCGTCCTCCC
CGGCAGCTGCGCGGCGATGGTCGACCACCTGCTCCCGACGCTGACGTAGAGGCTGCATAT
CAGCCGGTCCTCCTCGTCGGTGAAGCCGCCGTGCCGGATGTTGGGCCGGAGGTAGTTGAG
CCACCGCAGCCGGCAGCTCTTGCCGCACCTGTTGAGCCCTGCACACAGCGTCGACGTGTT
AGTATCTAATCTAACCCTTGATCGCTCCGGTGCCGGAGAGGCATGGTCCGCGACTCCGCG
GCCTGGCACGTCGTAGCAGCGGCGGCGGCGGCAGGGCATGCAGTACGTACCGATCTTGCG
GGGGAGCGCGATCCAGTTGCCGGGGGTGCCGTGGTCGGCGACGTAGGCCCTGAGCACGTC
GTCCTCCTCCGCCGCCCACGGGCCCTTCTTCACGCTCGCCTTGTCGCAGCACGGCGCCCT
GCCCATCTCGACGCCGAGCTCGAGCTCGAGCTCTCGATCGGTCTCTTAATTTCTCTTCCA
CTCTGGGCGCCGGCTGCTTCGGTTCAGCTCCAGCTATAGCTAGCTAGCTGGATCGCGTCG
CATGCGGCATGCACGACGGTGGTCGATGCAGCAGCTGAGTGGCCGAGTCGACGGCGATGG
ATGGCTGTGGCTGGTGTCTGGTGAGGTTGTGCCGCGAGGACCGGGCATTTTATAGTGAGG
GGCTAGGATCTAGCTAGCCCTCACGACGTGGGAGTGGGAGGAGAAAGTACCGTGCTCTTG
ACTTGTGTACTTCTGGCCGCTCCCTCTCAGTCTAAGTGCTTCATTTCTTTTCATACACAT
GTTTTCTTAGGGAATATAGTGGTATTCTAGTATTTTTACGGTCTTGTGCTAACAAAACTG
TATAATTAGAAAAAAAAGCTACTCCCTCGTATCCATATTGTTTGTCGCTCAAACGGATGT
ATCTGCAGCCGTTTGAACGACGAGTAATATGGATCCGAGGGATTAAAAGATCTATGTATG
TGTTATATTAAAAAAAATCGGTTTACCTATACATATACTTTCTTTGTACGAAAATATTTA
TCGTACAAATAAATAAAAATATATGTATCTAAAATTAAAATACATCATTTTTGTGACAAG
TATTTTCGAACGGAGGGATATTTTCTTAGAGAAAAAGTCTATACTCTTTCAGCTATCAGC
AAAGTTGCTCTCCGAACCCGGCAGAGGCGATCTCTGCCATACCACACCACCACTGCTCTA
CCGGCCGTTTGGTCGTAGCCCTTCTATTCGTTCCCGACTGATGCGGGGAGGCCCCGATCT
ACCAATGAAGATGTATTTTTTCTTGTTTTGGGACTTTTAGCTATGTTTCAACAGTTGATA
GTTTTGGTTCTTTCAACCATGGTGGC