Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_135846 (4668 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_135846

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_5075 12 1140 bp AK372252 Available Available None





CDS Structure of MLOC_5075






Contig Sequence (4668 bp)

>contig_135846 4668 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGACTAGGACTAGGTATCCTAATACTAGTAGGACTCGGTTTGGCTTTCTTTCCTAATCCT
ATGTGTACAGGGCAACGTGATTAACTCACAGGTACTCTTTCTATTTGTGTAGGAATATTG
GGATTGGTTAGCACTTGATACCATCCAACAAGCATGTGGTATGTGATTTATGTTCAACAG
ATATTATAGCCTTTTATCATTATCTGCTTCACTGCTACTGCTTCCCCAAAAAAGAATGCG
TTTTAATTGTGTGCATTTAAACCTCTTTAGATCCTACTGCAAGTGCTGATCTAGCAGTTA
TTCTTATGCAAGAAGGACTTGCCCACTTATTCCTTATTGGGAGAAGGTATGCAAAAACGT
TTTTCACTTGCTGAACAACATAATATTTGATTGTTTTCTTTTGAATTGCTTTAAATAATT
AGATCCCATGCAAGTCATGCTAAATATATTTATTTCACAGAATAACCTTACAATAAGCCT
ATCTGATTCTCTCATGATAGCACTCATCAATGTTACATCGACCTTTGCACCCCTTTGATG
AGCTTCTGCTATCCAATCGACCATTTACCTTAAAAATTGACTCCTTCCCCTTGTGTGTGT
GTGTTGTGGTGGGGGTAGTATTTCCAGGAACAAATCCAACAACAACAACAAAGCCTTTCA
GTCCCAAAACAAATTGGTGTAGGCTATAGTTGAAACCCATATGATCTCGAAACCTAGTCA
TGGTTCTGGCACATGGATAGCTAACTTCCACGCAGCCCTGTCCATGGCCAGTTCTTTCTT
GATTTTCCAGTCCTTCAGAACTCTCTTCACGTTCTTCTCCCATGTCTAGTTTGGTCTACC
CCGACCTCTATTGACATTATCAACATGCTTTATCCTTCAGCTGTGCACAGACGCTTCTGG
ATGCCTGCGTTGTATATGCCCAAACCATCTCAGACGATGTTGGCCAAGTGTCCATAACTA
TTAAATATGCAACGAAAAGAATAATTGCTTGTGATGGTACCGGTTTCGAACTAGAATGTC
AAATGGTACTAACACCAAACTGAAGTTTCATGAGTATTTTCATTCAATATTCATGCATCC
TGTGCAGTTACACAGGAACAATAGATTTGTCTATGGTCTCCCATAAATATGAACACCCAG
TGGTCATATAGATTCTGGCATGTGTTCTTATTATTGCTTCTCTAGTCCTTGATTGGCTGG
AGTTCTTTCTCCCCTTTCATTCAACTTACTAGCCATGACTATTTTAAACAGCATAACAGC
AACAAGGTCACGTATTGAAACATCGATCCCTAGGAAACATGGACCTGCCATTGCTGGTTA
CGAATCGGTACGTTAACTATTTTAAGATAATGTGGATTTTCTTTGTCTCATCTATTTGCT
ACTGAGTTGGCAGCCTTTTGTTCCTATGCAGGCTCTCAAGAAGTTCTTTGAGCATGTTTT
ACAAGTAAGCACATAATAATCTGTACAAAGTTCACAATAAATGAGAACATTTATAAATGA
TCTTTTTTGTAACACACTACATTACCTGTCTGCAGGCTTTGCTGAAGCACATTGATTTCG
AAGTGGTCCAATGTGTTGTAATTGCAAGCCCAGGTTTTACTAAGGTAATCACATACCGAG
AGGAGAAATATATATTATTATAACACTTTCTTTTTAAGGGTCATCAGTTTGTGAAAACAT
CTTAAACAATGTTTTTTGAAGAACGATAAATGTACCTGTCATGTGATGTTAAATCAGTTT
CTAAGTCGATCTTGATAGGCATATTAGAAACCAGTCAGTTAATGTTAATATAACCTATCA
AATAGTAAAATAAATCCCATGCTTCATGAAAAAGGTCTTGGGCTTATATGTTGCTCTGGT
CGTATCATATATCAGCACCGGTTCATTGTTTATAAGGTGGTAACGCGACCTAAGGCGTGC
ACCAACCGCCCTGACGCCTAAGTGTCCAAGGCGGGATCCTTATAAACAATATGTTCTGCA
GCTATGTTCCATGTCTCAAGGGACTACCCAAATCCTGATGTTTCAGTCCCTAATTTTACC
AACTTGAGTGTGTAGTACTGCCCACCATCCACATATGGTTTACCAGCTATGTTCTGTTTT
AATGGTTTACATTAAATTTTATGTACCAGTGTAATATGGTCAAATTATCATGGTTTCGGC
TGCACCTGGCAATATAGTGAATTGCATCATTGCATGTTACTTTTGCCATTTACACTTGTT
TCCAACTTGAAACATGTGCTACCGTGTACTTACATTTTGGTCCATCTATTGCTACTTGCA
TAGGTTAACCCTCCATATCTTCATGAAGATAATATCAATTCCTATTCTTTTTTCTTTTCC
TTTTATCTTAATTACAGGATCAGTTTCGTGATTACATGCATCTTGAAGCTGCACGGCGAG
ACTTGAGAGTAATAATTGAGAATAAATCACGCATTATTCTTGCACATGCACCTTCAGGCT
ACAAGTAAGTTCTATATTTTCTCATTCAATTGATTCTGTGTACTCATCGACCTGTTTTAG
CCGTCCATCTTTCCTCTTTTATTTAAGCTACTAGCACAGGGTAATACTTGGAGATTTAGG
TCCTCTTCTAAAATTCTGAACAATCGGTTGGAGACTTGCCTGATGTGATACTACTAACAT
GTCTATCCGGCTGATACTTGCGGTTCATTTGCCTGTGACTAGATATATATTTGCTAAATG
AGTGGTTGGTTTATGTATTTCCTGGTCCTCTATTTTCTCGTTGCTCTCTGTTTGATCCTA
ACGTTGCTGTTGATTATTCTGTTGTATATTGTTATTTGGTATAGGCATAGTTTGAAGGAA
GTTTTGGACACCCCAGGTGTGATGTCACTGATAAAAGATACAAAAGCGGCACAGGAGGTA
AGTCTGATTTAGAACTCCCCGTTGTCAATATATACCGTAACTTACACGTATGATTCCTTC
TGAAGAAGTTCCATATCTTCATTAACTACATATGACAGACACTTTCAAAACAGATTCTAA
GTGCAGCTGCTCAGATCTCGTCTTGTATTTCTGTTGTAATTTGCAGGTGCAAGCTTTGAA
AGAGTTCTTCGCTATGCTTACTAATGTAAGCCTCTTGAAACATGCGAGTTTATAACTAAT
GGCTTTTGTCATGTTCAGTACATTTAACTCATCTGATATGTTGCTATTGCTTAGATGTTG
ACCATACCCCCCCCCCCCACACACACACTCGTATTTCAGATAAGAAGAACAATTACAGTA
CTGATTTTATATGTTTATGATTCTGCTTAGTTCAAGCATATCTGATTAGACTTAAATGTT
TGTTGCTTAATTGCAGGACTCAGCCCGAGCGTGTTATGGACCTAAGCATGTTGAGGTCGC
ACATGAGCGCCTTGCAATACAAACTCTTCTGATGACAGATACTTTGTTTCGGTAAGTCAT
ATTTACGAAATTGACTATATTCAGTTTGGAAAATGTGATTGGTTTGGTATTAGAACAAGT
GGCAAACTACAGCCACAAAACTCGACAAAGAAGTCTTAATGTAACAAAACTGTGCAATGT
GGCCATTGCTGTAGGTTAATTAAGCTTGCTTGCCTAACCTGCTATGGATGAATGGTGTGG
CTCCCAGGAAACATTAGATTAATAATTGAGATAGCTTGGTGTAGCCTGCTTTGTTCAGTT
GAAATACGTTTGCTACACGAGCTGATTGCTGATCGCTACTCTTGATGTTGAAGATGCTAT
TGACTGTGAATCCATATTAGGCTATTTACATATAGGATTGGAAGGAATCACATCTTGTGG
TAGTCACTATTTTTTGCATTTTCAAATTAAAAAAAATGCAAGAAAAAATAGCAGGCTTCT
CTTTCAATAGTCCATTTTGTTAGCCTGGGCATATCAATAGTCCATATTTGTTAGTCTGGG
CATTGCAAGGGAGGTTCCCCATATTTGATGCGTGGCTTCAAGCCAAATGTCTGTATGTAC
ATGTGCTTCCTATGCATCCAATATGACCTGAAAATTGAAACAGAAGTTCATGAGTTGCAA
TTTGCCTGTACAGTCTTGTTACTTATTTATTTGTTCTCCTTCTGTTTCCCCTTGTAGGAA
CACGAACATCGCTAGCAGTCACCAACCACTCATTGTTCCCAACTAGATATGCTTCAATCG
TCATTCCCGCCTCACGTTTCATGAAGCAAGGAGATGTTTTCTGCCTCTCATTTTTTGTAT
ATAGAAAAGAATACCATTTTGTTATGCTACTGGCCTTTGTTATAACATTCTGGAAATGTT
TTGGTTCATGGGATAACCAAGTCGGTATCATCATACTTATACGACTGCTTGGCAATTTTC
ATGTTTGCAGATATATCATTCTAGCGACCAGTACATTAAAAGGACAGTTCTTCTACAAAT
ACAGGTCGCATTCCTTAACTGCCTGATTGTCTGATATTGATTAATCTTGTTTTCATGCTA
CATACTCCCTTCATGCCTAAATATTTGTCTTTTTAGAGATTCAACTATGAACTACATACA
AAACAAAATGAATGAATTTACATTCTAAATTATATCTATATACATCCGTATGCAATTCAT
AGTGAAATCTCTAAAAAGATAAATATTTAGAAACGGAGATAGTAGAATGATCCGTGGCTT
TTAAGGCACCATAATTGTTCTTCTCCAGCAAATGAATTTCTCACATGC