Map Locations of contig_135776 (7582 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_135776

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_5006 1 615 bp MLOC_5006.1 Available Available None
MLOC_5007 1 886 bp MLOC_5007.1 Available Available None
MLOC_5008 1 733 bp MLOC_5008.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_5006






CDS Structure of MLOC_5007






CDS Structure of MLOC_5008






Contig Sequence (7582 bp)

>contig_135776 7582 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGTGGGCTTGAAACTGAACAAAGACATCAAATACATCNNNNTTGCGCTTAATAAGATATA
GCCAAGTAAAGCAACTGTAAGCATCAATAAAACTGACATAATAATTGTGACCACTCACGG
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TGACGTGGCCACATGCTTGCTTCGAGGTAGTTAAAAGGTGAGACCGCATGGCCAAAGAGT
TATTTTTGATCGATTTCTTAGGTGCACCATAAGCATGAACAAAGTTTCAAAAGGTGACCA
CGCCACATACTTAGTTCCACGTAGTTAGAAGCTGTGATACCATGTGGCCAAAGAGTTCTT
GCTGATCGATGTCTCGAATGCGCCACATGCAACCATGCATGAACAAAATTTCACAAAGTG
ACATATCGATTATAGTTAGTGTACTTTGTGCCCGATGGAATAAGTGCGATGATCAGTAAG
TTACACATACAGTTTACTGTTACTGCTCAAAACTGGGGGGTCTCGGTCGTCCACCCGAGC
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GATTGACAAAAATATTTTATGTTTTTTGAGAATAAATTCTATATTGATTTACCCGCATCC
ATCACTCTTTTCTACTTACTACTTTTCTACATGAGGAGTCGTTATGGATTAACCAATCAC
ATTTGACATCACTTTGCGGTGTGCACTGCAAGATGGAGTACCCGTCTCTGCCTTGTATCT
CTCTACTAGCTAACATTTTTATTGTTGAAGCTGCTTTTCTGCACACCGCTAAGAAATGGA
ACATCATCGTGCGGAGCCTAGAGCTGCTGCTCGCACACGGCATGCCCAGATCCAGTAGAA
AATGTTGGCGTCCAGGGAATTGCTGGTCTGAATTCTGAAGAAAACCTAGGCAGAGGAGAG
ATTAGACGGCGTGATGGTGCTGGGCCTCCTGGCCCGTGAGCAGGTCAGCGGGCATGGAGG
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ACCGCTGCTCCGTCGACGCTGCTCCATCAAAACTACCTCCGACAGAACGGCGAGCTTCTC
GGATGACTGGATCTAAGAGGCGAGGAACTGGGAGAAAGAGCTTCTCAGGCGATTAGATCT
GAGAGGGGCTGTTTTCTTAGAAAAGAATGGAGAGCAGGAGTGGGGTTAAAATATTGGGGT
GGCAGGTTACAGGTTGTAGGTACTGTAGTAGTATTGGGGAGGCAGTGGAGTTAGATACAA
GTTGACTATAATCACTCTATGTATTTTAGGAAAATGAGGAATAATTGTGGGGTCCGGTGT
GGACCAGCAGGCTCGAATCTATATGCATGTGCACGACTGTGATACGCGCTGTGAATGCCC
TTTACCGCAAGACGCCCTCGCACTCATTCCCCTCCCTCTGCTCGCTCTCCCCTCTTATCT
GCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCCCGGAACCGAGAACGCCCTATCGACGCCATTCGC
CACCACCACGGCCACTGGCCTCGCCGAGCCCCGTGGTGTGCCATATAGCTCCGCCATCAA
GTGAAACTTCTCCAAGACAAAGGAATCGCGCCTAGGAGCCCTCCATTGCCATCACTATCA
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CAGACCTTGCCGTCAACACCATACGCACCGCTGTGAGGCTACCTTCATTTCCTATTTGCT
TTCTTCGCTGTTCGCACCATGTAGTCGTTGTCCCATGAGCCCCGAGCTCCAGTGATCCCC
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CCTGGTGATCTGAGTGAGGCGTCGACCCCGTCTACTTGACTCGCCATGCACCATAGCCTC
GGCTATGCTGATCCTAGCCCAGTCGTGCTCCGTCCGCCGCCACGGGCTTGCTCCGTCGAT
CTCTAGTGCCCCCTCAGCCTCTCGCTAGCCCTGTTCAATGCGCGCGGGCACGAGCTCCCC
CTCGACACCTTTGGCACATCCAACCAATGCCCGAGGGCCATTCCTGCATGCCTCCGCCGC
ATTAGATGGTCACCGGGGGCATATGTCCGACCGGCTAACGTGCTCGGGCTTAATCAGCCA
CTAACCTCGGTCGTGTGTGCATGACACATGGGCCCGGACCCCTTAATAACCCCCGGTTAT
TTCTAAATAAAGACTGTTAAGCAGTGTGTCATTGACATGCGGTTCCCATTGTCACGTTTG
AACTTGACCAGCCCGGGTTGACATGATGACGTCCTGGTGACGCCACGCTAACATAATTAA
TCATTTTCTGTAATAAAAATAATCGAGGAAATTCCAGAAAATCCTTTCAACATTAAAAAT
CATAGAAAATAATATGTAACTTGAATTGAAATAATCTATAAATGAAAAATGATCAAAAAA
ATTCAATATTTCTATCCGTATCATTTTCATGCATGTGTGAACAACTTATATACAATGTTT
AGGTCAATTTCATTAAAAGGCTTTTAAATGCTTATAAATGAAGTTGGAATTGATCTATAT
TGATCAAGTGACCTCCATTTAAATTGTGACTAGTTGCATTAGGTACATCCAGCAGCATGT
TAACATGCCGTGATTATGCATCATTGTGAAGAATTTCTCGTGTTTCAATTGTTCCTTGTT
TGCCTTGTTGATATACTTGTGAGATGAAGTTATCACCGACATCAAAGAATAGCTGAGTTC
TTGTAATCAACAGGCAAGAAACCCCCCTTGAACATTTCGATACAATCCCACCCTCTTGCT
CTTGCTCTCATTTCAATGCATT