| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
 |
No map location |  |
Predicted Genes from contig_135772
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_5002 |
2 |
1131 bp |
AK249835.1 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_5002
Contig Sequence (10229 bp)
>contig_135772 10229 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TCTGTTCCTAAAGATAAGTCTTTTTAGAGATTTCACTAGGGAACTACATACTTCAGAGTG
TAGATTCACTCATTTTGCTTCATATGTAGTCCCCTAGTGAAATTTCTAGAAAGACTCATA
TTTAGGAACGGAGAGAGTAGTTTTGAAGATCTTGACACGAGGAATCGAACGGTGAAAACT
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TTTTTAACTTCAGCTCTGCCAGCTCCAGTAGCTGAGTTGCGGAGCAGAGGAAGGCCGAAC
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AGACAATGATTATCTCTTGGGGTTGGGGAAGGGAGGGCACCCGCAAGGGTCACTATTGTG
GTGTGGGAACACACCAAATGGTGCATTCAGCTAGCGTCATGTGTCGCTTGTTGGGCGCTT
AGTTGTTGTTGTTTTTTTTACTTTTTCATATGCATTTTGGGAAGATTCAATGGGTTTTTT
ATAGGCGGAGGTGGGGGGCGGCTTTCGATTTTTGCCTAGTTTTTCCAAGGCTTCATAGCA
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CCGCCAAAAATGTTTTAATGTGTTTATTTACTTTAACTTGTTTGATGTCAGAAATTGATA
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TGGATTGCTTACTACATGTGTCACGTGATACCTTCAACATGCTATCATTATCATTATTTG
TGTTAAAGGTAGTCTTCTCAACCTTGATCATTACAATATGATGGCCACAATTATTTCTTC
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GAAGCATTTGATTGGAATGTACTGCATTACTAATTCAGTTGCTCTATAGGCCAAGACTTA
AATTAGTGCTGAAAATGTCATTGACGAATCAACTATCATTTGTGTCAAAGTCATGAATAT
AGTGCGCAAAGCTTCACAAGCTCTGAAGGCACACAGACCATCTTGGATTCTCTGGTAGCT
AACTAGTTTGTGCAGTAAACTGTTTGAATTCTGCTTCAGCTTACAGGCTGTCCTGGCTTG
TCCAATTGAGTCAATGCTTGTTGCTACATTAAGGTGGGTGATCATGGTTTCTGATGCAAT
GCTTGTTGTTCCTGTAACTTGTTTGATCTCTCTGGTTCAGCCCTGACAACAGCTGGCTCG
TCTATGGCCATCGAACTTGCATCAATAGGCTACAGATGACAATCACCAGACAAAAGCAGT
TGTGGTTAGAGTGTGACCTAGGAAAGTGCAGTCTAGGACAGTAAAATGTGCAATGTGCAT
GTATTCTTCCAATACTAAGTTCACATAACAAAAGAAAACTTACAGGGTTTTGTTTTGAGG
AACCAACTCCATCAGCCACAGGTTCTGTAGCCCTCGCTTGTTCCGAAGCTCCTCCGTTAC
CATCCTGCAGCATACCAATAAAAGAGTTACAAACAAATTAAATTATACAGTATCTACAAG
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ACATGCTTACACAGAAATACACGATCTACATGACCATGTGAGAATTGCTTAACCACCCAC
ATACATGGCAGTCACATATTTGCCATTTTTCATAGGGGAAAATGATCCTTCCTTGGTCCA
CAAATATGTCCTTTTAGTTATAGCCACAAGAAATAAGGAATGGTTGGAAATTACAACCAT
GCCCTTCTCCTGCTCCTAGGTTCTCTAATTATTATCTCAACTTTGAGTTAGAAGGCCTAC
TTTATTCGTCCTTTTAAAGCCTACTTATTCGTCTAGCTAATTCCCATGTTCTCTCTTAAG
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ATGGAAAGAAACGTGCCTAAAAATTGTAAAAGCAGCCGATATTTGTGGACAAATAAGATG
GTTGAAACACCCTACATTCTAGACAGAGAGTACTTGTCATACAGCATTACCATTGCAACT
AATTCCATTATAAGGTGCAAGACCATGCATGAGAACATTTGAGAAAATTAACTTGCCACA
AACATTAGTCACCTAAAGCATCACACCAGAATTACTGCCTCTATATAGCCATATAACAAC
AGTAAGGGATCCACATATCGCCGTAGGCCCAAGCACAAGTCTACACGAAATGCAGTATCA
GCAGGTAGTGAGTGGCTAAGGCTTAGAGGCAAGCCTCTACCTCTTTATGTTAGGATTTGA
TTTGTTTCCTTCGAACTCTAAGGATGGACTTGATACCACAATCTTTTTTGCGCGTTTCTT
AGTTTGCTTAGGTCTCATGCTAATGCTTTCTATCAAGAACCATGTACAATGGCTATATGC
CTACCTCCTAGTTAACTATCATCAAGCAGAAACTACATGCCGGCCTCCTAATTCACTATC
AATAATGTAGAAACTACAAACTCCCCTCCCTCCTATTTTCTTTATCTCCTACACCAAAAC
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GTAAGGTTGTGCCTTTGACAGTCTAGGAATACAACAATCATCACAAACACTGCAAGAGAA
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TGTTTCCAAGCACCGGGAGCAGCCCGATGTGGCAATAACCAGGTGGCGGCAGGGGTGGAC
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GGTGGCTAGCTGGAGCAGGTTTTCGTGCACGCAGTCCACCCACCTGCGTTTGAGGCTCAG
CCTCCGATATTGCTGGGTAATCACCTTTCTTCTTTAAAAAGTGCCATAAGGACTAGTCTT
AGTTGTTCGGGGGAAAAATTGGCACTCTAATCAGCCTTACAAATATGGATCTGCATTAGT
AATGATTTTCCATAGAACGCTAACATAACTAAACACCGTAAGCAATATACAGTCACAACA
TTATTCTAGTTACTAATTTTAATTTGACATATTAGACACAGAACTTCCTAAGATTCAGAA
ATACCCAGGTAACCAAGATTAAAATTCCAAATGCTGGACACTTGGACAATGCATCAACTC
TCCTTGGATGTCTTTTATAGTCGCCAACTATAAACATGTTTCTGGAAAAGGGCACAATGT
GCTTGTTTAAAAAATGCCACCAAGGGATGGTCCTGGTCGTCGAGTTCTTTTTCCACTCTA
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CAAATTACTAATGCTTAGTTTGATATATTGGACAATAGCTTCTTAAAATTCAGAAGTGCC
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ATCAGTAAACATGCAGCATCTATATCCTATTCATACGGTGGTTCTTTTCATCTCCCCCTT
CATTAACGAATCTCCACCAAGGTCTTCTCGGTTCTTCTTCAGTTCTTCTCCACTATATAT
CTGTGCCACTCCCCAGTCTCCATACTGCACCACCACGTGGCCAAGCCTCCGTCAGTTGTC
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AGGATCCCAATCGAAGTAGCGTCTCCGTCCGCAAGGTAGGAGCAGGAAGATGAGGTCATT
CCTGTCAGGGGTTTTTTTCACCCTCAAGGCATGGACATTGCATTATGTGGTGGAGAGATA
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TGAGAACATTCTATATATTATTTCTTTTAGCGATTGACATCGGCTGGAGGCCATCTATTA
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GGACTCGTGCATATTTTGTGCTTTCGCTTTTGAGTTTTGAATGGTGTGTTTTTACTATAA
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CTCAGAATCATCGTGGTTCACACCATACTTGGGCATGTTCATGTTTTTAGGGGAATTCTC
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GCGATGCATTCTAATTACGTAAATTTGGAGATACCCTACAATATACTTATTTTTTGACTT
TTCGTACCATACCGTCGAAATTGAAATAGACATGTATTTATTTATTATTTAGTATTTTTC
AGTCCACAATCCTCCTTCTATACAATGCTACAAATTCCCGCAGCAACGCGCGGGTTATCA
TCTAGTGTTGAACAATGCATCAACTCTCCATGGATGTCTTTTACAGACACCGACTATATA
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ACTCTGAATGCTGCTTCTCCTACAGGAGAAAATGGCATGCATCAGAACCCATGGTATTGC
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CAGAGGCTTGGCATCATCCATTTCCACATCAGAGTCAGCATGATGCCTTTCATCGGGATT
CTCTTGATCTTCATCTTGCTGTACCGAACACAAATGCAACTTAGCCAATATATGATGACT
GCTAGCCATGTTGCTTCCAAAACTACAACTATAGTCAATGAGCATTAATGATCACATCTA
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TGGTCCCATGGTAGCAAGACAAATACAATAGCCCCTAGAAATGAACCCATTGGTCCTAGC
CCAACCCAACAAATGAACAGAAGAAAACAGTCATAAATATCTGACAAGATATATCCAACT
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GCATTACCCAACAAAACAGGAAACAAACAGGGGAGGGGGGGCGTGGGAGATAAAAAACAG
GTGGCAGGTGGAGGTGACGCAACCAACTCCCCTTTAATAGTAGAGATAAATTAATCAAAT
GGGCACAAACTTATTATTTCCAGAAAAAATGGATCAGAGACATAATATGCACAGCAAGAT
GAAGAAAAACAAGTAAAGTAGACAAGGACGATCTGCAAATCCCTACTTTCAGTATTCATG
CAGGGCAGACTGCAAATGCATTTGAGGGCAAGGATTGGCGTCAAAATGGTAATTTGACCA
TTTTTGAACCCAAAAAGGCCATCTAGTAGCTTTTGTTAATCCCTATACTTATATTTAGAA
TAAGAAGTCCACTTTACCCCCTCAAATTAAAGCAGCTCGAGAAGATTCAGCGTGGGTTCC
TCTGGGCCGGGCGCCAGGCCGCCCACGGAGGGCACTGTCACGTGAAATGGCGCCGGGTAT
GCCGGCCGATCGAGTACGGTGGCCTGGGAGTCCGCGACCTTGAGCGCACGGGGCTCGCTC
TTTGGCTCAGATGGTTATGGCTCTCGCGG
