Map Locations of contig_135665 (11028 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_135665

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_4921 2 3584 bp AK362285 Available Available None





CDS Structure of MLOC_4921






Contig Sequence (11028 bp)

>contig_135665 11028 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATGTAGTTCACTAGTGAAATCTCTACAANNNNNNNNNTTTAGGAACGGAGGGAGTACTCC
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TGTCTTCCTTTCGAAGAAAATAGATCATCAAAGGTTGGGGTAAGGTTTGATGAACAAATC
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TTTAGCCATGATCTGCATCATTGTTATTTTTGCTTTCCTTATTAACAGTGTGTGTTCCAC
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ATACAATAGTTGGTTTTGCTTTGAGTCATCAACTAAAGCACTCAACAGCTACAAACCCTG
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CTTAAGGAATTTTACTGTTTTAAGCATGTTCATGAAGGACGGGTCTGGCGCAGTGGTGAA
GTATTCCCCACTTGTGCCAAGAGGTCCTGGGTTCAACACAACCTATCTGCATGCACTGTA
CAGGGTCAGACTTGCCTCGTATAATCCTTCCCCAGACTCCACCTGGTGTGGGAGCTTCTA
GCACTGGGCCTGTCCCTTTTTTTAAGCATACTGTTCGTCCAGTTCACTTGTATAGTTATG
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TGTTATCCCTCCTAATGAAATCGGAGTTACATTTGAGGACATCGGAGCATTGGAAAGTGT
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TCTGTCCTTGTTTCTGCTTTTTGGGTGTTTGTGTCATCTAAATCACCTGTTGTTGCAGTG
GTTTGGTGAAGGAGAGAAGTATGTGAAAGCTGTGTTTTCACTGGCAAGCAAAATTGCTCC
AAGTGTCATCTTCGTAGATGAGGTAAGCTAATGCAACTGTGACTATTCAATATTGATAAT
TTTCTTGCACTGTATGGGTACATACTCGCTAAGTTTGCTGTTAGTCCTGAAGGGTGCTGC
TTATTTTCTTGCCGTTTTTGCATCTTTTAGGTTGATGGCATGTTGGGTAGACGTGAGAAC
CCTGGAGAGCATGAAGCCATGCGCAAGATGAAAAACGAGTTTATGGTGAACTGGGATGGG
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TAGACGAATCTCCTGACCTTGTATGTCACTTGCTTGTAGGTTTGTGCAAGTGTATCTTCT
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AGGAAAAAGACAATGCTAAGCTACTTTATGTAGCTATGTTGAAAGCATGTACATACATGA
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GCTTGTGGTAGGTCAACAACAGCACAGCTGACATGGCCTGCTCCAAGCACATCACCATCC
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TGTTTCATTCCGTCCCTGCCTGCGTGTGTAATCGCGCTACCAGGAGAATTGTATGAACCA
GAACTCTGCAGGTGATATTGGATTTTTTTTTATTTTTTACCTTTTGAAAATTTCTGATAT
CTGATGGTAGATCTTCAACTCGAAGCTTTCCTTGAAAACTTTAATCCAAGAGAGTTCTTC
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AATTCACTATGGATCGTGGGCATGAAATAAATTTTCATTTTTTCATTTTGTCAAAAGAAA
ATCATACAAAAATCATACATTTAACATTTAAGTTCGGCTGTTTCATTCAAATCGGCATGC
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TTTCTCCGTCCTCTGATTTTTTGAGTCTTTGCAAATGAAAAAAAAAAATCTTAAAAATGA
GAATTATTTTTTCTAACATGCTGAGATTTATGTATTCCTTGGTTCCTAAGTATAAGTTTT
TTTAGAATGTAGGACTACATACGAATGTATATAGACATACTTAATGTAGATTCATTCATT
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TTACAAACGGAGGGAGTAGATGATAAGTGTATGAGATCATTCAAGTGAATGGATCTGCAC
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TCCTATAAACATCTATTGTAAAGTTGGAGTAGCAATACCAATACCAAGTCGTCAATTTGT
AAGCTATAAAGATAAAGATGATGGGCAATGACGAGGACACTCATTGGTAACAAGTCGTCG
GACCTGTATACTGTCATGTTCGGTGATGATAGTCTTATGTGCGTGTTTGTAACACCTTTT
TTTTTTTTTTTTTGCGAATTAAGAGCAACTCCAACTTACCGATCCAAACAAACGACGTTT
TTGTTTGCGTTTTGTTCGTTTGGTCGGTTCAGCGGACATCCGTGTTCGTTTTTGTAATTA
GGTCAGCGTTTGCGTCCAACGCAACCAACGACCCATTTTTAGGCGGCGCGAAAATATATA
TTAAAAAAACATAAACCATTAATTAAATATTTAAGTCGGCCTTTGATTTGATCATATACG
CCAATCATACACGTAAATGCGTACGACCAAGCTCAATGACTCACAGAAAGATATCACAAC
ACAACTTTAGACACAAATAAAAGCATACAAGCTTCATATTAGAAGCCACGGGCCCCGAGG
GCTAGAATAAAGAAACTTGACGAACACACGAGTCAGCGAAAGCAACANNNATCTGAGTAC
AAACATGAAACATGACAACGCCTTAGAGAAGGCTAGCACAAAAGAATTAACGATCGAACG
AGGCGAGGCCTCCTGCCTCGGAACCCTCTAAGCTACTCCTGGTTGTGAACGGCCTCCACG
TAGTAGTAGGCACTGTCGGGGTAGCAGTCATCATCAAACTGGGTTCCATCATATGGTCGC
AGCAATAGTATCAAGGGGAAAAAGGGGAGCAAAGCANCGGTGAGTACTCATCCAAATTAC
TCTTAAGACTGACATCAAAACTATGCTAANNATGCATCAGTATCAAAGGAAGGGGTCATA
TGTGGACAAACTCCAGCAATGCGAGAATAGAGAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGACTA
GCATCTTCAGCGTCTTGCAACAATAGACGAGAGTAGAGCAAACAACACAAATATATAGTC
ATATTGTNNNNNNAATATTAATTAAGGTCACGCCCAGAGATTCTTCCT