Map Locations of contig_135605 (7831 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_135605

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_4875 6 1866 bp MLOC_4875.1 Available Available LOC_Os03g04550.1, FRAME:+2, EVALUE:2e-83, 13103.m00469 protein expressed protein
MLOC_4874 3 1031 bp AK374209 Available Available None





CDS Structure of MLOC_4875






CDS Structure of MLOC_4874






Contig Sequence (7831 bp)

>contig_135605 7831 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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CGATTCTGCGCCCAACGCCCCAGGTTCGTTTGCTCCCACGGCGAATGCTTCGGCAGATTC
GGTTCGTCCGGTCCTTTCTGCCCCCGAGATTCACCGATTCCCGTCCCTTCACGTCTTTGT
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TGATCTTCTTCCTCTAATTGCTCTGTCATATTTTAAACAATTTGCAGTGATTCAAGCGAC
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CCAGCGTGTCACGCGCCCCAGGGTCCTCGGATCCCATCCGTTCCGTCCGCCCATCCAACG
GTCACATGCCAGCTGGGTCAACACGACCGTTACCGCTCCGGCTTTTGCCCTTTTCCCCCA
ACGGCAGCTTCTCCTCCGCCCCAAATGCCGCGCCTCCTTCACTACTACTCCTAGCCGCTG
GCCTCTCTTCTCCCCCACATCGCCGCCCAATTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCGCCGC
CGACGCGCGCCCGGCCATGGGCTGCTTCCTCGGCTGCTTCGGGGGCGACAAGTCCAAGAA
GGAGCGCCGCCACCGCCGCCGCAAGCAGCGCTCCCCCTCGCACTCCCCCTCCAAGGCCCA
CCGCGACGCCGAGGCCGCCTCCGCCGCCGCCCCGCTCCTCGCCACCCTCCTCGAGCTCAG
GTTCGTTCGTTGCCCCATCGATGACTGCTGCCGGTCTTGCTGGTTGATTGGCCGGACGTG
CCGTTGTTGAATGTTGATCCGCTTCGTGGTTGATTTTGTGTGGTTAATTAGGGATTCGGC
CGATGACTTGTGCCTGGCCGTCGTCGCCAAGAAGAAGGTGACGTTCGACCCCAACGTCAC
GGCCTACGAGGCGCCCCCGATCCCGGAGGGTGAGGAGGAGAAGGAGGAGGCGGAGGGCCG
CGCCGCGGCCAAGGGCGAGGAGGAGGCGTGGACGCTGCTGGGGCCCGAGTGCGCCAAGTC
GGAGGCGTTCCCGCTCAACCACAGGTACGGCAACTGCGCCGGCGCCGACGACGACAGCGA
CTACGAGGACTGCTACGACGACGACGACGACGATGAGTACGAGTACGAGGACGATGAGGA
CGAGGAGGAGGACGGCATCGACGAGTGCGCGGTGGACGACGACGAGGAGCACGGCGGGCT
GCTGGCCATCGCGCGCGGCGAGGAGGAGGCGTGCGAGTCGCTCTTCCTGCTCCCAGCACC
CAAGACCACCGCCAAGGACAGCACCGGCCAGACTGGAGCCGCAGCTGAGGCGCCCGCAGC
CGAGGTGCTCAGCTCGGTGGACAACTTCAGCCAGTGGAAGGACGCCACCAAGCCTCACAC
AGCCGTGACGAAGGATTCAGAGAAAGAGAACTTGGCCTGGCTCTCCGACCCTGCGACGGT
CCCTGCGATGAAGCAAGAGAAGCCGGCGGTGAGCTGGGACTACACCCCCAGGACGCCGAG
CAAGCAGGAGGCGTCGGTGGACGCGAGCCTGTCGACGTGGCTGGGCTCCTCGGGGACGCC
GGAGAGCAACTACTCGGTGCGGTGCTACTCGCCGGTCAGCCGGGAGGACCGGCCCATCCT
CGGCGCCCTGACCGTGGAGGACATCAAGATCTCCTCGGCCAACTCGTCGCCGAGACGGTC
GCGGTCCCCGAGCCCGAGCCCGGACGACATGCCGATCCTGGGCACCGTGGGGGCTTACTG
GAATTGCAGCGACGGCAAGGGAGGCCATGACGGCTCGGTGACGAGAGGCGGGTTCATGAA
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GCATTTCCAGGCTCCAAATGTGCGGTGCTCATGATGTTGGCATGATGAAAATGGCGAATT
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GTAAACATGTCAGCAATTCTACATAGCAGTAGCACTATGGTATTCTTTTTGTGTGGCAAT
GTTAATATGATGTATTATTATTATAAGTCTTTGTAGGTTTAGCATTATTGTATTATTATT
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TAAGAGGGTGTTTGTTTTTTTAGAGACTTATTGATTTAGGGACTTAAAAAAGTTTTTATA
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ACTCTCAGGGAGGAACTTATTGGGACTTATCGATCGGCCCGCACCTAACCCGCATCGCCC
CGCACCTACCTCGCCTCGCTCCTTCCCTGCGTCGCTCCAATCGCCGTCGCCGCCGGCACC
CTCAACCGCCGCCGCCATGGCCGATGATGAGGAGGACCAGATCCCCTTCTTCTCTCAGTT
CCCCTCGCATCAACAGGCAACCCAAGGTTCATCCATTGGAGGAAATCTCGGGAGGGGAAT
GGGTTTCTTGGATCTCAACAGCAACGTCGACGTCTTCTCGGAGTTGGTCTCATACCAGCA
ACTCCTCTTCGACCAGTCGGACGGTCATGACCTTCCTCCGGTTGGACCTGGTCGTGGGAG
GCCCGTGCCCCAGGGCGGAGGAGGCCGCAACCGGTCTCTGAACATCGGAGGCCGAGCCGG
CTCTCATCGGAGGCTGCAACCGTTCGTCTGTTATCTCGGTTGTTATGTACTCTCTCTTAT
TTTGGTTCTTATGAACAAGTATTAATTCGTTTTTATGAACAAGTGTTATTTCGGTTGTCA
CTATTTTGTAATCCGTTTGTATGAACAAGGGTTATGTGAACAAGTGTTTTATTATTAAGG
GTAACATGGACTTATAAGTCCTTGTAAACAAACAGGCAGAGACTCGGGACTTATAAGTCT
ATGTAAACAAACAGGTAAAGACTCGGGACTTAAAAAATCCTATGACTTATGAAACAAACA
GGGCCTAGACCCTGTTTGGAACCACCCAGAT