Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_135539 (8989 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_135539

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_4818 4 1733 bp MLOC_4818.1 Available Available LOC_Os01g08850.1, FRAME:-3, EVALUE:4e-179, 13101.m00940 protein expressed protein
MLOC_4817 1 602 bp AK375970 Available Available None





CDS Structure of MLOC_4818






CDS Structure of MLOC_4817






Contig Sequence (8989 bp)

>contig_135539 8989 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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GCCCGGTCCGACCAAAAATTCAAATATTCAGGCCCGAGCCCGGCCCGAATGGACTAAACA
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GAGCCCGCCCCGAAATGACTCGTGGGCCTAGTTTTGAAGCCCGAGCCCCGCCTGGCCCGG
GTTTTTCGGACCAGGCTCAGGTCGGGTCATCGGGTTGGGCTGCCCATGCCTAGATTTAGT
TGCACCCACATATCTCCCTCTCCTCTCCTCTCCCTCNCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTTTA
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GGAATTAGCTTGCGATAGTAGTTGAGTTAGTGGCAACACCTTTGAGCAGTGGCGAAGTTA
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CATTGCATGTAGCTCCATCAGTGTGTGTGAGTGTTTTGTACGAGTAATTGCTCTAGGATG
GGTGGGCCATGGCCCTTTTGAATAAGGGAGGCAACTTATTCTCGTTGCAAATCTATTGTA
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AATCCACAAGTACCGGCCGAGGACCAGAAAACCACCCGACCTTGTGGGTCTGTAACAGTT
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