| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
 |
 |
No map location |
Predicted Genes from contig_135494
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_4782 |
1 |
1018 bp |
MLOC_4782.1 |
Available |
Available |
LOC_Os05g08360.1, FRAME:+2, EVALUE:2e-166, 13105.m00919 protein rRNA 2-O-methyltransferase fibrillarin 2, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_4782
Contig Sequence (4982 bp)
>contig_135494 4982 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGCGGGGGCTGGGGGGGGGGGGGCGACGGGGGGGGCCGGTGCGGTGGTGGGGGTTTCGG
AGGCCGCGGCGGCGGCAGGGGCCGTGGCGGCGGCAGGGGTGGGGGAAGGGGTGGCCCCGG
CATGAAGGGCGGTGCCAAGGTGGTCGTCGTGCCCCACAAGCACGACGGCGTCTTCATCGC
CAAGGCCAAGGAGGACGCGCTCTGCACCAAGAACATGGTCGCCGGCGAGTCCGTCTACGG
CGAGAAGAGGGTCTCCGTCCAGGTCCGTGCTCGCTTGCCTCTCATTCTTATTTACAGTTC
CAGGCTTCTTATAAGTTTTACTGCTACTGTGGGTATTGGCATCGAGATGCTCTTTCACTG
TGGGTAAACCAGCTTTGATTTAGCGGGGTCATCAGCTTAGATTCGGCTGTTCTTAGTTCT
TAGACGAGCAAATGGCGCACTTGGTGCCCTTAGTTTTTAGATGTTCACTTGCTTCATATT
CTGTTCGTAAATTTTTATACTCTGTTATGCTTATGGAGCACGTGAATGGCGTTCATTGCT
GTTTGAAAGATGCACTTTTTTTATTCCTATATGTAAATGATGACATTACTGGCTGAGAGA
TGCAATTTTTTGGTGCTGATGTGAAATGACTTTCATTAGTGTTCTACCGATATGCACATG
TAGGCTGATGTTCATTGTTGCTTTGGTATTATGCAGAATGAGGATTCATCCAAGGTCGAG
TACAGGGTGTGGAACCCCTTCAGGTCCAAGCTGGCTGCTGCCGTGCTAGGTGGTGTGGAC
AACATCTGGATTGTAAGTCCTGTTTTGTTCCTTGGCTCTAATTCTGAATTGTTCGAATCC
TTGCAAGTCCAGATTAGAATCATTGTTGTAGTAACTGACTCCGTGGATGTGTTCCAGGCT
CCTGGAACTCGTGTGCTGTATCTTGGAGCCGCTTCTGGAACTACCGTGTCTCATGTGTCT
GACATTGTTGGACCGGTGAGTTCTCATCGCTCCTTTGTTTACATTCGGAAAATTTCGCTT
CATTTGAATTGTGTCTTAATGAAGTTCATCATACTGCAGACTGGGTTGGTGTATGCTGTT
GAGTTCTCTCACCGGAGTGGCAGGGATCTTGTCAACATGGCCAAGAAGAGGACCAATGTC
ATCCCCATCATCGAGGATGCTAGGCACCCGGCCAAATACCGGATGCTGGTTGGCATGGTT
GATGTTATCTTTTCTGATGTTGCACAGCCTGACCAGGTATGCCTTTTATGAAGAATTTCT
AGACCTCTGTTTCTACAAGTTTGCTTGCTGTCAACATAAGTTGTTATAGTTTACACTTAC
GGTTATTGTTTGTCTGTGTGTGACTCCTTTGTGAGTTACTGACGGCTTAGCAAAAGATGA
GCTTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCAAATGGATGATGCAAAATCGAGTCTCTGATG
CGTTCATGCCTCTCTACTTATTTGGTTTGCAGCAGTTTCTGAATTTTGATTACAGCCATA
CTAAAATCCATGACCATCACATTTGATTATATATGAACTGATCCCATATCAGTGTTTTTA
GTAGCTTTTTGTAATAAATTGCTGTTATTGGTGTACTATGTTTACCTGACCTTCTGAGGA
TTTATTGGGGCTTAGCAAATGATGAGCTAACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCACAATGG
ATGATGCAAAATCGAGTTTCTGATGCACTTATGCCCATTGCCAGATCTTTGCTTTTGCGT
GTTGCTGCGTTTCTATGATTTTCTCCACAATATTGCATTTCACTGGTTGTGTTTATTTGC
TTTTTTATCTATCTTGTTTTGCATAGCATTAAGTTTGGATGGTTGTGTTACAAGTAGCAT
TGCACCCTATCCACTGTGATAAAATAGTGTATATGATTAGTTAGTCCTGTTTTTATTTTT
GTTGGAAGTTCCTTACATCGGGGCCTGTTTTTTACCTGAAGACTCTTCTTTGGCAAGTTC
TCACATCATTCATCAATCCTGAGTTCGCCACTCTTGTGCCATTACATAAATTGATGTCTT
ATTCTACCTTTTCCCTCTTTTTATATTTTTATTAGTTTGACAACTGTGATGAGCCAATTT
TACAGTTACAGACCTGTAATGACTCCTGCGGAAATGATCGCATGGTCAAAGAACATCTAA
GGGACTGAGTTGTCTTAGAAGATTAGATTTGTATCTTTAGCAGATTTGATTGTTTTGTGT
TTTTATCTGCTTCTCTTAACAGTATTCGTGCCTGTGAATTAACCTGTATGGTTCCCGGGC
AATGATGAGGTGGGAAGCAAAGAGGAACGTTCCTCTCGCTATCCAGTGCGGAATTTCTAG
TGTTGCTATTGGACGTCGAGGAACTACACTTTCTTTCTGAATATGAATTCGCTGGTTCTA
TAGCTATTCCAGTTGAAGTTTGGTAACTCATTGATATTGTTGCTTTGCATTCTTTCTTTG
CACACAATATTAAACCCACATTGATACTTGATTTTGATTTTGTTCTCACATGAGGTGATT
TTGTTTCTGTGAGCACCGTTTCAGTACAAAAGAACCTCAGTGTGAATATTGCAGCATGAT
GTGGGTGACTTGTTAATATTGTGGTTGCGCATTTCTAAACCTTGCCATTGCATCTTCTTT
CCCACAGGCTAGAATCTTAGCCCTTAACGCATCATACTTCTTGAAGAATGGCGGCCACTT
TGTCATTTCCATCAAGGTAACACTCAGTTTCATACTTAGGGCATTACTTGGAAAATCTTA
AGTTTCCATTTGAGCTGACATTGCTCTTTCCTGTGGCCAGGCAAACTGTATCGACTCCAC
CCAGGCTGCTGAGGCCGTGTTTGCGAGCGAAGTGGAGAAGCTCAAGGCCGACCAGTTCAA
GCCATCGGAGCAGGTGACCCTGGAGCCCTTCGAGCGCGACCACGCCTGCGTCGTCGGTGG
TTACAGGATGCCCAAGAAGCAAAAGTGAAGTTGAGGAGAAGAAGAATAGAAGTGGCCTTG
TTGTTTCTGCAATCTGCTTTTGCTCAGATGTACTATTAGCAGTAGTGGTAATGTGACCCA
AGTGTATGGGGTTTTGTGGAAACTCTCTGAGACGATTCCTGCTGTTTTACAGCAATTATG
TTAAACTTGATTTGAGCAGAAAATGTTACTTCCTCTGTTCAATATTATTAGATGTTTTTG
ATAGATTTTAATGTGGAATAATTAGTGAAATGAGTGAACACACTAAAAAATCTGAAAGCA
TCTTCTATTTGTTAACATCTTATTATTTTCAAAAAGAAACCTTTGTTCACACTGAGATCT
TTACAGAAACTATATAACTGATGTTAAAAAAATTTATTTTGCTAATTTGTCGTAATAGGA
GTCATCTAACATAAGCTATATATCATTTTTTTCTTGTGGCCAATAAAACCGGCTGGGACA
CCCCCAAACCCCCCCTTTTTTTTTCTAAGCTTAGGGATTGAAATCGAATGAAATTTATTG
AATTTAGGTCTTTGATTTCCAATCCTCGATCAACAATTTGAGGAAGACGAGACAGAAGCC
TTTGGATGAAACCAATGAATCTTCCGATCCGAAAGACTAAGGGGCTAGGCGCTCACTCCA
CACATTTCCTCTTTGGCGTTGGCTCCACCAGTTTTGACTGCTTTAGTTATCTCAAATCTT
TGGCAGGAAGGGGCCAAGCCAAATAGTGCTCTTTAGAAGCGTAATCCGTGCTTGAAACTC
CTTCGCTAGGATCCAAAAACCTGGAGATCATCCTCAACAAGGCCTTGAGGTTGTGGGCTT
CTGTTATGTTTGTTGACGAACTCACAGTCTCCAAATCATCATCAAATGAAAAAAAGAGTC
ATATATAGATGCATATTAGAAGAGTTATTTGAACATTTGATTAGATAATAGCACACGGGT
ATCACTACAGATTAGGAGTAAGATTAGTGATCTGTACTACCTACAATTATGTTAATTTGT
GATCCGCTCTGCTTGTGCTTATGTCTTCATGGCTGAGAGATCATATCTGCAACTCGGTAC
TAATTAACTTGGATGATGAGATGGTGGAATGCTGGGGTTTTGTGTGCTGCCTGTAAGACA
ATTATTTGGTTTATCATGTCAAACTTAATTTGAGCAGAAAATTGTCATCTTTGACAAGTT
TTAACCATGCATAGTAAATCTGTTTGAGCTGTATCTATGCTCTGGGCAAAATTAACTTAC
ACGACGTCCTATCTTTCCTAGTTTCTGCCACTTACGTGCAATCTATCCATTCATCGAAAG
TGTCTCATTTTTGTAGAAAGCTATAGGTACAGGTAGTACTGAACCCAGTGTTTATATTTT
TCCATCCCTGCAACTGGTCCATCCCTAATAGTTCATGTCTGTAATTATTTGGATCGATCT
AACCCAGAATCAAACCAAATTTAGCTGCCCATTGCTGGTAGTACAAAAACCCGTTGGTTT
AGACACGACTTTCCAAATCCAAGCTCTTCAACACTTGCATGATATGTGCAACCAAGATAT
GCATGTTACAACCATCTACAATCTACAAAACTTAAGTCTCATCCATGAAAGATGCCCCTA
TTTATATTTTAAATTTATGTTAGCATGCACCAAGACATTTCGTATTATCTTAATTTGTGT
AGCATCAGAAACAGCGGACAGATAATTCAGACCGATCCAGCCTGAATCCATTCCCAAATG
TACTAACCCAACAAACCTTTGGTTTACATACATGACTGTTTGTTGCGGTCATCGGATTTG
GCTTTTCGGGCCACGGCTCCGCAAAACCATGGATTGATTGGGGAGCACCCCACACAACCC
CGACAAAGCACCCGCGTCACATGCAAGTACTGGTTCATCCTCTAGTCGCCGTCGTCGGTT
TGCCGGCAGAGACTCTTCCGGCCGTCGTCCGGGCTCGGTGGTCGTGCAGCGGCTCGCCGG
CTTGCCGATGCCGCTCATACAGTGTGACGACTGCACAGAGACAGTGCCGCGGCTCACATC
TA