Map Locations of contig_135490 (5587 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location No map location




Predicted Genes from contig_135490

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_4777 1 528 bp MLOC_4777.1 Available Available None
MLOC_4776 1 632 bp MLOC_4776.1 Available Available None
MLOC_4775 2 936 bp AK364202 Available Available None





CDS Structure of MLOC_4777






CDS Structure of MLOC_4776






CDS Structure of MLOC_4775






Contig Sequence (5587 bp)

>contig_135490 5587 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGACGGAGGGAGTATTAAGTTTATGATTGGGGTCAAAAGTGGGGTATTTTGGCTGATCT
GGTTTTATTTCTTATAGATGCGGAGTCTAAGCTGGATGAAGCACTGAGAATTGATCCCAA
CAAGGCTGATGCACTCTGGTGCTTGGGGAATGCCCTGACCTCTCGTGGATTCTTCACTTC
GGAAACTGTCCAGGCTAATGAATGCTTTGAAAAAGCAACTGGTTGTTTCCAGAGGGCTGT
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TTAAATGTGGATCCTTAAACATCCTTCTCTCTCATTGTTCTGGTCAATTCAACGTGTAGT
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GTTATTTTAACCGTTCGCACATGTATACCCATCCTATTGCTGTCAATTGTTTTAGTTAAG
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AAGTTATGGAGAGGAAATGGTGTTTCCATGTTGCGGTTTTTGTCAATTTTTTCGACATGC
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GTCTACATAATATTGGGTACTGGATCTGCTCTTGAGCGGCATATACTTGCTTTCCGTGAG
CATTCTTTTTGTTTGCCAATAATTGTAAACGACGTTTGACGTGCTAATCTCATACTCTTG
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TTATCTGTTTGTTTCGAAGTTGGTTGGAACCCGACGGGACAGGCAGGCGCCCCTGTTGGC
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CGGGTCGACGGGTCCATCTAACGTGTAGCGACGGGTCGGCCTTGCGCCATCATACGCCTG
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GAAGGGACCGTGTGTGTGCTCCGGAGAGACGGGCTTCAATTGATTGCTGCATGTTACTAC
TAGCATCTAATGATCGACATGTACCTGTACCCTGTTCCTGGCAAATCAAGAAAAGAAAAG
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GGTACCTGTCTCCTCTCCCACGACGGGATGCACAACCGCAAACTGACTCAGCCCCGAAAT
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GGCTAGTAGGACCTAACTCAGGGCATGATCCATTCACAAGATGTTTCATTCGATAACGGG
CATCCATATGATAGGATGTGCTCCCGTAAGATCCAACATGGTGATGCACGTAGGACGGTC
GACAAAAATGGCTTGAAAGGGGATAGGTGCAGCAATAGCTGAAGGTTCTGCCAGCTCCGA
GTTCTTCTAAATGTGCAGAGCTGGCCTAGTGGCATCATGCATCAGTAGTCAACACACTGC
TGGCGCAATAGGGTGCGATGCGTGCGGCTCTCGGGTCAGGTGGATCAAATTCGCACATGC
CGTGTGGTGGCTCCAGAAAGATGAGATCGGATGCGGGCTTGAATAAATTGTTGCATCATA
CACAAGCTTCTAATTATCTCGGCGTGCCACGTTCCTGGCAAATCAAGAAAAGACCTCCCG
TCACCACCGTTCGTCCGTCCATCATGGTCACTCCTTTGAAGATCATGATTCCTTTTTCTA
AAGCCCACCCAATCATGAGCGTTAACAATGGTGGTAGCAACTGCAGGTACCTTGCCTTTT
TCTCCTAGGAAGAGATGCACAACCGCAACCTCACTCGATGCAAACAAAGATAAAAGCTAA
ATGAGCGGAGGGAAATGGAGTTTTCTGATCTTCTCATTGCAGTCATGTTGTGCACTTGTG
TCATCCTCTTGGAGAAGACATTGTATTTGATTGTGTGTCGTTGGTCTAGCTTTGAGTAGT
CAGTATGACCGGGCATAGTGAAATGAAGTGGTTGTGTGTATCACTTGATGCATAGGTCAG
TTTTCCCCCCTTTTCACTAAAATATGAAATGAAAACCACTGTCTTGATCTTCAGAGGATG
GATACCTAGCAACGTCGGCACAATCTCATAGTTTTTCCTTGAAGGTGTTGGTTTATAAGA
TTGGGACTTAGTAGTAGGTGTAATCAACCTAACATTCATAAATGATTTTGTCATTGCAGA
CTACCGTGTACTTTGATTATAAGTGTATGTCATGGATTTGCTAGAGATCTCGTGTTATAA
ATACATGGATGCGGGTTTAAACCTTTCTTGAAAATCTTGTGCCTTGATCCAAGCCGTCCA
AACTGCTCTAGATCGAACAACCAAAGAGGATTAATTTCATATGTAGGGTAAGGCAGTTAA
CTAAACTAGGAAGATGGTAGCAGGCCTATCCTAGTGTTAGAGCATATTTCTCCATGTGTG
GTTTTGGTAATTGATGGCAATCCCTATGGACTAATGGTTGTCTTAAGTTATATTTGAAGG
ATTTATCCATAGGCACTTCTTGAAGTCCATTTGTTGGTTTCAAGGTGTTTATATGGTGAC
CAAGGTGATATTCAAGGTTTTATACAAAGAATGGTCATGGAGAAGATAAGATACAAGGTC
GATCAAGCTAAGTCAAAGAGTGAATCAAGTTGATCAGCACACAAAGCGTACAAGATGTAC
CGAGATGGATCAAGTGATTACGTGGTATGGTAAGCATTGTCCATTATGCTTTATGTACTA
ACACATGGTCTACGTGAGAGTTCTTTGCGGGGTTAGGTATGTTTCCATGGGNNNNNNTCA
AGAGGAAGATCTCATACAATCCAAGGAGGATAACTTCAACTGGTGACCATCATCAAGATT
GCGGTGTGGAAGTTCAAGTGTAGCAACACAAAGAGATCATGTTTGAAGCTTGCCGTCCAT
TGTGGTGAAAATAGACTTGTGAATATGTGCTCAAGAGTGGCTCACCCATAGCGCAATACA
GGGGGCAATCTACTAGTATTCATTGAGCTGGTGCAATCAATAAAGGTGGTCCATCNTGAG
GAGGACAACATCGTCATCATTTAGCTCAAGTGTATTATGCGCAAGGCAAAGGTTTGTCCT
TGATAGGTTTTCTATCTTACCGGTGTCAGTGTGTTAGTTGGGAGACCGGGTTATAGGATC
GATCGCCGTACTATCAAGGGGGGGGGGTCTCAAGTGAGTAGCTTGATCGTATCATTTATT
GAGAGCT