Map Locations of contig_135472 (11476 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_135472

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_4763 2 2994 bp MLOC_4763.2 Available Available LOC_Os12g16650.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13112.m01765 protein Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_4763






Contig Sequence (11476 bp)

>contig_135472 11476 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCCTCCAGGGCATATTTCCAACACAATTCTCCTGTTATCTTTCAAAAAAATTATGTTTCC
CCTGCATCATAATCATTGACCCATCGGCCTTCTTGCACACAAACCATATTTGTGGTTGTG
GGGGCTTCTTTCCCTCTCCATCCGCTAGACCACTACCACTACCCAGCAGCAAGGAGGTTG
CCATTCCCTGTGGTCGTATGCATATGTGAGGCAATCATTTCTTTCCGATAGGTCCTTGGC
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CTTTTTCGATAAACAAGAAGGTAGATCACCAAACCATATGGTTTATTCGCTAGGCGGCCT
ATATGAATTATCGAAAAGTAACAGTTCGACAGCTGAACGGAGGATAAGTTGGCTTTAGCC
TTTAGCCAAAGGCTGGTCTAGACGACGGTTGCCTGGGCGAGAGAAAACAACCTGCATTTA
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ATATACATTAGAGCATACATACATACGTACCTGGTAATCTCCAAGTGCTCGTGCCTTCAT
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TCTTTTATGAAGTCTGGCTTTCTTCTATATTGCTCATACCGTTCGTCTGGAACTGAGATG
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AGCTTAATTAATCCTCATTCTTGTGCACCAAAATAAGGCATATACTACTAATTGGTTGTT
GTTAGTAATGATTAGTGGAATCCGGCCGTAAGGTTGTTTGGAAATACACTTAGTTGTTAA
TAGTGATATGCACTAACCTGCAAGGCCATTATGCCATCTTCAGCCAAGTAAGACTCGCAG
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CCATAATATAGTAACACTTACATGCTTATGATTGCGTCATACTTGCACGGTGGTATTTTA
CGGTAGTCGCACAACAGAAAAGTTATGTGGTCCTAAAAATTAATAACGACAGACAGTAGA
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TGTGCATGTCTATATTATATGTGTTGTATATATTTCAAGTACATAACAAGCTAGGCAAAA
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GTAGGTGGTTTTGCAAACTGCTTTGTTTAGTTTTTGATTTTATCACTGTACTATGTGGTG
TTAAGCTTCATGTAATAGTCAACGCAACGAAAAATCCGAACTGATGGAAAGGGCTAGGCA
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GGGGGTCGTTGTTTCAAAAATAAAACATAGGCAGCAACAAAAACAAAATCGAGTTATTGG
GAAAACCAGGCCATGCTATCAAATGAGATATTCATTCTCACATCTTCATATCATCAATTA
CAAGAAAGGCTGGAGGTCTAGAGGATAAAAAGGCTAAAATAATCGCACCACACTTTCTCA
ATGAACACATATCGATGGGATGGTAGTTACTGATAAACTATTAAACCGGACACGTATTGT
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CGTATTTAAGCTGCTCCTCTGACAAAGTGACTCCAGTGTATTTGCAGCCAGTTTGCTTCA
CCACTTGTATTGCTAAACTTCCCCAGCCGAAACCAATATCAAGAACATGGTGCCCCCTCT
CGACTTTGGCCTTTGGTTAAATGTGAATTTTGCAAAGTTGAAGTACCATCAGATCATGTC
CACAACGTTGTCTAACTAGTAATCAATCAAATAATACAATCTCTGGAGACATGGTAGTAT
TACCTTCTTGATTAGAAGGCTAAGTTTACGTTCTTGGGCTGCTTCTAAGCTTTCATTGTC
CTTCTATCAATTAGTTTTAGTCCATGAATTAATAAACTACTCCACTATTTACAAGTTGTA
GAACAAATACACAAGATATACAAACCTTGAAAATTGCACAAGAGTAGGTCATCGATTTGT
CCATAAAAAGCGAGAAAAATTCGTTACTCTGCACACATACATGAGAAGACAGAATTATTA
GTATTATTTGGTATGCATAGACGTATGGAGAGTAATGAATGAAGAAAAACAGTATTTATA
AGGTCTGGAACACAAAAATCGCAATCTCAATTAGATCTGTAATAAAACCTAGTATTACAA
ATTGGCCTAAGAGGCTAGTTATATTAACCCTGATGGAAGGTGATAACAAAAGAAGAGACA
TGAGTACTGACAAGATCATAGTGCTGAGAGATGTTTCGACGACTTTGTGCCATAGTGTTC
TTCCTTGAGGCTTGGCCCATAAAGTATTTAGCATGTGCAAACCGAGCTATTACATGCAAG
GGTGTCCACCGACCCCTGCAAACCAAATAATCTTATATGATTAGTCACAAACACATATCC
TCTATTTCTAAATAGCTACAACCCATTACCTAATTTTCCTAGCCATGCAACCATGACACA
TAAGCAAGTATGCATGCAAGACATAAATAACATCTTTTGCATTACTCTAGGCATGCAATG
ATGCCACATCATCAATTCATGCATATTAGTCATAAGTAGTTCTTTGCATTAGAGTTCATC
CTCCATATTTTGTTAGAAATTACATTTGAACTATAATCTTCACTCTCTTTTTATAAGCTT
TCCATTTTACTGTTTTTAAGCTTACATTCACTTTCCATTAGTTTTAGATTTTTTTATAAC
AACTATTTATCCATTTTTAGTAATGTTCCCGCAGCAACACGCGAGGCATCATCTAGTACT
CATAGATACTACTTCATTTTTCTCAAACAATTGATAGTTCTTTTATTTAGTGGTCAATTG
AAGGTTTCAGAACCTATTTCCAGCAATCCTGGAGCTCCTACGCGCATCTCTGTTTGCAAT
GAGAATCTGCAAAAGAAATGTAGCATGGCTTTATCTGAAATGAAGAAGAAATAGCTCTAC
CAATAAAATGATGGACTATGATATAATTTTACCAAGAGAAAATTGAGAAGGCCTTCTCTC
TTGTCAAGAAAGGAGAAACAACCATTAATATAGGCTTCTGCCAAGCCAAGGTTTCCTTCT
GTTGCAACCTGAAAGCCATGAGAGAACGAGGATAAACACATGCAGTTCAAATGAGATAGC
TACATAAAGCAATTGAAGTGGAGTATGTCAGAAATTAAGAATCATGCATGGACAAACCAC
CAATCGGAAAAAATGAAAAGTGCATGTGTAGGCAGAAAAAGGGATTAAGAAATAACCTTC
CAATAGAACAAGGGGTCATGAACTCGCATGACAGATTTTACATGGCATTTGTCACAAGCT
TTACCAAAGCTGAACACACTTCCTCCCTCTTCGACAAATCTGCACGAAAACTATCAAGGT
GAAAAACAATCATAATTAGACGTCGCATAGTATACCAACTCATACAAGGACTCACGTCAA
GTTACCAATGGATACATATTGGTTGAAAAATCTTGCAACTAGAAGGCGGGCCCCAGCCTC
AGTCCATGATGGAATCATCTGCTTTGGGTTTAGCAGAAGCTCACACTTCTTTCCAAGCAA
ACCTTGGGCTACTACTTTTCCAGCCTGCATCCATTCAATATGTCCAATACAAATAGACCT
CACATGTCCATTTCAGGAATAGTCATTTGAATTATGTGACTGAAACTTATTTAAGCATTG
CTAGACCATTGCTAATTTTAGCACATAACCGTATGGTTCACTGTGCGAGACAGGTCCAAA
GAAGAAAATGGAGAGGTTGCATGCACATACCTTCAATCCGTCTTCATGGAAGCCATGACC
TATTACCCAAGGCAGAAGAGACATTTGAGACCTAGTGTTCTTTCGATCATTTCAGACCCA
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GTTACTTTGATATGCCCCGCAGAACCATATTCCTCTCTTTCCCTGGATCTGATCAAGCTG
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ATTCTGTTGGAGGTTTTTTTTGGCGGGGGTTGGAGGGGTTAGGTTGAAGCTTCCATTTTG
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TACCTGAATATGATTTAGCCAGTAAGTAATAGAAAAACCACTCGTAGTTGTCCCCAGGAA
ATTCCAGGCGCTCCATGCCGAAGAATTTCGGGGCATCAAATTTTGATCGCGGTGGAGGTA
TGTATCCCTGCAGCATAAACGTGTCAGACAATTGGTACATCAGCTCAATTATGTGTTCAT
TGAGCAATTGTAGGTAGCCTTTACCTGTGGACATACTGACAAGCACCTAGAATTTTTAGT
TCGTAATCTGTAGCTTCAGCTCCTAGTACTTTGAGAGCATTAGGTGCATGAATGCCAAGG
ATGACATTGTCGTATGTTTCCTCTGAACCATCATTCTCCAAGACTTTGTAGCCAGCTGCC
AGTGCCAAGATATTATTTCAGTTAGTGCCAAGATAATGGAATGACAGACACATTATTTGT
ACTCACAGGCAATCAAGAAAGAGCTTGGCATTAGCAATAACGCATGTATATACCTCCACC
AAAACTTGCAACAGATTTGACATGACAACTGGTTTTAATTCGACATCCCATGCTTTCCAA
AGCTCCTTTTACCTGTGTGTGTGCAATAGTTGCACTGTTAATTCTCTGCATTTGGCTGCA
GCTAAAGCCTAGAGACGTAATAAACAGAGATCATGTTCGACCGTGTTACCGCTCATATGG
GTTGCAATACATACCTTGTCTACAAAGGACTGAGAACGAGCCTTGATAGTGGGCAACTGG
GGGTAGCGAAACAGCTGAGAGTGCAACGACTTAATCAGCTTCCAAATGCACAAAGACGAA
TTAAGCATGCAAATGCAATGGGAATGGAACATGTTTACAAAGTAGTTAGGCACCTGGAGA
AGGTCATGGTTACGAAAAAATGATAGCACGAAGAAGGCAGACAAGCTCAAAACATCTTGT
GATGAAGATGACCACATGCCTGCGCAGACTGGAAACTGCACCAAATATATATTTTCGTGT
CACCAACTCAAAACTGCATAATAACCAGCCTTAATTAACGCCCCCTACACTCTGAGATGG
TGGCAAAACGTACTAGACATTAAGGAGTCAGCCCCGATTTTAGTTAGAATTTGAATATTT
CATCTAAATTTTCCATATTTTATTGAAATTTTCACAATTTTACCTCACTCTTCAAAAACT
GTAGTTTCTCTTCCCGCAAAAAAGGGAAAAGAAAATTGTAGTTTCTCGTTCACAGTTTTA
CATGACTCTTCAAACAAAATGAAAATCAAAAATAGAATACAAAATTCTAATGTGATATTT
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GTACAAGATAAGCCTCTTGAAATAGTACGGAATATCCATGTGACTGAATGAACTGCCCCA
ACGTCTCATTACAATCCAGATCACGGTTATGTTCTTGGTACTCCAGGTACCTTCATTCCA
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GCTACGAATGGAAGTAGTATATATGCACACGAGAAGTGAGGAACTGGACTGCTTACGTCA
ACGCATCGTTCTTGAACTTGAATATGTCACGGACCATGCGCCAAAAACTGATTTTCAGTA
TGTTGGCCTTTTGTGCCAAGAGGCTAGAGATACCGTTGCTATTTCCCCACTCACACCCTC
CTCCAGCACCGTCTGATTGTGTACTCACTGATAAAGACATGTCTGTTCTCTCCATCTCCA
CCCCGAGCCCTACTAACCATTCCATCATGTGGGAATATGTTACCTACATTTGATGCATAT
GGCACAACAAAAGTTTTAGTGAGAAACAAAAAAAAAACTTATGATATAGGCTTACAAAGA
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TTTTGTGCTTAGAAGCAATCCACTGAGCACCTTTTGTGCGGTGAGAAAAGCAGGTGGGCA
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CCTACTGGATAATGACGGCGATATCACGGTCGGGGTCCCCTGTTGTCTCGGCGGGCCTGC
TTGAAACGACGGTGGCAGGGCGCGCGCTGCAGTTGGCAAAGGCAGAGGGCTACAAGGGGT
AGGCCTCGGCGTCGCCGCCGAAGTTGCGTAGGAGGAAGCCGAAGGTGGCATGGTGCGGGT
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GGCTTGAGGATCATACGATTTTATTTTCTCTTTTCTTTTATTACGTGCCATGTCATCAAA
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GAAATGAATTAAGTAACATAACTAATCAAGATGGGAATGGGCCGTCCTGGACTTGGACCT
GGCTCTATGGCTTCATAGCCAATTTCAAGGGCCGTGAATCGATCCATTCTAGCAAAATCA
TGTGGCCTCGTTGGCCCATTGGATACCCAGGGCCGACCCAAAAGTCTCGTCGAGTTTAAA
AACAAACCAAAGACAAAGAAACCTACGAAAGAAAGGACGGCTCGCTTGTTGCTTTTTTGG
AGTCTAGAGGGGAAAGATACACGATGATTTTTCGGATCTAGAATTTCATAGTTTCTCACA
CTATAACTAAAATCACACATATCAAACAAGATGAGTCTATAAGTTAATAAATAAAGTGTT
GCATGACATCACACATATATTATTTTTTATTATAGAAGTAGTAACATAGACTAATAACAT
ATGCATGTTACTAGTTGAATTTACTCCCCACTAGAATTTGTCAACTTTGTATGCAAGGCT
AAGCCATTGGTTAATTTTCAGGGGTCCACACATGCATGCTATTGGCAGAGATTGCATATC
CGCAATTCCCACCTCCTAAAGCTGTTTCATTTCACTTAAAAAATGTAATCCTATTAAATC
TTTTAAACCAAAGGTTAAATTTGTGGCTTACCAAAATGTCTCTATATTTTAGCACGGGGG
TAGTATTTCATTTGTACATTCATGTTCTTTGCGACAAGGGTCTTGAAACAAAACCACTCT
TGAATCATTTTGAAAACTTTGAACTCTTGTCTAAGTTTTGAAACTTGATAGTCATACTAT
TAAGTGTTTCCCAACTTTTATCATGTTTCACACAAATCAACTTAATTTATAATATTAAGT
TTGTATTTAGGGCTTAAGGTTTTAAGGTTCACAGTTTACAGTTTTTAGTATTTAAAACTT
GATGATGTTATCTTTGTGGTATCAAGTTTTAAGAGAAGACATTTTTGTGAAGTTTTTAAA
ACTTGTCAAAACGTATTCAATAGTAGTCTTGTTTGAGAACCCCAATCACAAGGAACATAA
ATATGAAAACCAAACATAAATTGAATTCTGATTCAAAAGATACAACAAATTCACTTTTAA
AAGCTAAAAAAATAATGAAGTTCAATGTGGTGGAGCATACACTCTATCAAAAGTTGCATC
CAAAGATCCATCCAAAGTAATCAAGGATCTAATCCATACATGGGACCTACTGTGCACGGT
AGAAAATCCACTATGGACGGCAAAGAGAGTCTCTCAGCATTGGTTAATGCTCTGCTCTCC
ATGCAGAGTCCAACGGAGACCAAGACGGTTGTTAAGGGATTTTGATAATGCAGAAGAAAC
TTACAAGCCTGGATTTAATTTTTATTTTTTGATTTTTTTTTACATGTTAATGAATAGATC
GAAAGTTTTGTAGGTAAAAAATGAAAAAGAAGAAAATCTCACCCCTAAGTAAAACACGTG
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TCGTAATACTTGTTATTAAAAAGAACTAGTCTTTGGTATTTAGAAATAGAGGGAGTAGAT
CATGACCGGCGAAGCCTTTTCTGGAGCTAGTAACGGGATCATGACCGGCGTAGCCTTTTC
TGCACGCCTATAACTACGAGCGGCGAGCTAGCAGCAGAATAGATGCATGGTACCATGTCC
ATGCGTGAGGCAAGCATGACTGATGTACCACACCGACCTGGTTGAAGCTCGTGAAGCCGA
GGTCGAGGTTGACGCAGCCGCCGGCGCCGTCGTCGTCGTCGACGGCCACCGTCCTGGCAT
GCCCTCCGAGGCTCTCCTCCTGCTCGTACAGGGTGACACGCACGTCGCCTCCGCCGCTGG
CGCCGAGCAGCTCGTG