Map Locations of contig_135241 (10649 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_135241

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_4544 3 1921 bp MLOC_4544.3 Available Available LOC_Os08g36320.3, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13108.m03813 protein decarboxylase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_4544






Contig Sequence (10649 bp)

>contig_135241 10649 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCGGGACTCCGGCCTTTCCCCTCGTGCCTCCATCAAACTGGCTTATAGGGCTACTTGATT
AATGGCATCTGCTCCTAATTGTATTATATTTCTATATATCTGAAATTAAATGGCCATAGC
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ATTGACATAATTTTCACTATTTCAGTGTTTTGAAATAGTGATGTTAGAAAAAACATCATT
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TTTCTTCTTTTGCTCCTTTATCGACGATAATTTGTTATTAATTACTAGCCTTCAATTGAG
AGAAAAATAAATCATGTTATTTAGCTCAATACTAGCTCAAGATCGACTCAAGCAAACTAA
GCTCGCTTAAATTTTACTATAGGTTGAGTCGAGCCTAGTCCAACTCGCTCGAATTCTGAC
TCATTTGCTGCCCGAGATGCAATATAGCCAAGACAATGGAATACTTTTGTATTGGTTGGG
TGACCAGATGAACCTTGGCAACCTTGGACAATGAAATCATTCAACATTACCTACCGCCCC
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CCCAACTGTTCTAAAATAATTGAAACCACATTTATAGCAGAAAATGCTTTCATGAGTGCA
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CTGTTTTTTTCTGTCATATTTTTACCTAGCAATCATGTGAAAGTAAAATGTAAACTTGTC
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GGGTAGGGTAGGGTACACTCTACTACTGTTTCTGTTTAAAGTAATGGTTCCAATTGTTTC
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TCTTAACTTTAATATAATTTTGTACTAGAGCAAGTTGAGACACTTAGTGCCTGTTCGGCA
GGTCTCTGCTCCGTAGCTCCGCTCCTGGAGGGGCTGGAGGAGCTGCGGAGCGGCGCCGAA
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GAAGTGGAGGCCTACCGAACAGGCTTTTTATTTTGAAACGGAGGAAGTATGGAGTTGATA
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CCTGTGGGAATGTTTTGATGCGGTTGGTAGTGTAGTGTAGACCATACCTTTGGAACAGCT
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TGACTGGCAGCGACCGGCTGGCCGAGCAGCAACTGCACCTTCTCCGTTGTTCGCCACCCG
CTACACCTTACACGTATGCACACATGCCGGTGATACTCCGGCGGGATAAGCCGGCCCTCT
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ACACACACACATCCGACTACAAGCCAGGCAGCTAGGGGAGGGGAGAGCAGTGAGCGGCGG
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ATCCCTCAAGAAATAGTTGACGGTATCCCTCGAGAGAGGTAGGTTTCTACCGGACAAGAT
TCCACCGTTGATCTTCGTTTGGGAAGTGTGCCCTTTTAGTTGATATACCATGTATTGCTT
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ATCTTTCTCTACATGGTATTTTGATATGAAAACTTGTAGGAACCTACAAAGTTTGATCAT
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GCTGGCAAAAACTATTTTTTAGCCGTGGTCAGGCCGGTCCGACCGGGCTTTGTCGGGATC
GGGCCCGATTTATTACGCTCGATAGCCGGGCCTGGCTCGGGCTTGAGTTTTTCAGTTTGG
GTTTTCTTAAGCCAGGTTCGGGGTATGTCCAGGTTTACTTATACCTTCTTTACCTTATCG
TGTGACATGTGGGATATTTAGCCTCAAGTAAACAAATGTTAGCCCGAGATGGGTTTGGTA
TTGGCTTTAAAATACCAAACCCTAGCCTACAAGTTCAAGCTAGGCCCAAAAGTATTATTT
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AGAGCTTGGCTACCCATGACCAGGTTTAGCCTAGAGGTCCAACAACAAGTGGTTAGCGGG
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TGGCATACATGGTGTTTACATATTCAAAAACCTCTAGTTCAATTATGATTTTGCAATTTG
ATTTTGTTTTTCTAAACTAATCTCATTTTAAAGATGTAACTGTCATGAATAATAAAATTT
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AAACGAGAGAATACGTGTATGGCTCCCGGTTGAAAGTGAAACAATAGGATAACAATAGAA
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GGACAAACAACAACAAAAAATAAGGGAATGAATCAAATACTTGGTATGGTATAAAGATAC
GTTGTAGGTGGCCGTCCCCGATTGGCTGAGCGGACTCCGTTAGAAACCAGTTTCACTAGA
AAATCGTTTTGTAGTATCCCTCTCTCTGAAAAACAATTAAGCTAGCTTCTTCACTCCGAC
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GTGTTGCAGCAGTTGTTGTTGTTGTATTCCAGCAGTTGTGTTGTTGTTTTTGTTGCTACC
GCTGCTGCAGTTAGATACCGATATTCCTATGTATGTATGCATGTTACATTGATATGCATC
ATTGGAATGAACGGACAAGTTATTAACAGTCAGCATTACATGCATTTTCTAATTCTGTGT
TTGCAATTCGCAGAACCGTTGTGTCAATATGATTGCTCACTTATTCAATGCACCAATAAA
TGAGGATGAGAAAGCTATTGGAGTTTCAACAGTGGGATCCTCGGAGGCAATAATGCTTGC
CGGCCTGGCGTTTAAGAGGAAGTGGGCAAACAAAAGGAAGGAGCAGGGGAAGCCATATGA
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ATCCTTTGATTTTTGTCACTTTATGTACCTGAAAGATACCTCCTGTAACCTCTCATGTTC
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GTTTAGTCAGCAGGATCTAATGACTAAATTGTTTTGGTGAAGTATAGCAATGAAACACGG
CTGTCATATGTCTTAACTTCATACACATAACGCAGGTGGAATGTGCCGATCCATGTTGAT
GCTGCTAGTGGAGGATTTATTGCTCCTTTTCTTCATCCTGAGCTTGAGTGGGACTTCAGG
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GTTGGATGGGTCGTTTGGCGGAGCAAAGGCGATTTGCCCGAAGAACTCATCTTCCATATA
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CTGAAGGACATGGTCAGACGCACGCTTCAAGGTCGTTACATCTGTGTATCTATAATTATT
TTGTACTACGTGGATTCCACTCCCTTTCAGCATGGTCTGTGGTTGTGTACATGACACCTC
TCGATGCAGGTTAGTATTTGTTGTTTGCTTTAGTTTTGTTTCGAGATGTTGCGTGTTTGC
TGTGCATCCTTTACTTCTGTACTGAGATGATTGTACATGTGGTTTGTTGGGCTTTGCACC
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CAAGATGCGCGCGTTGTCTGTGGTCAATTCAAGAATAACATTTCAGGATACATGGGGTGA
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GATGTTTTTAATTTGGTAGGAGAAGTGGAGTTGCTAGGTGCATACTGAAAAGAGTCAAAT
CAGATGACATAACCACATTAATTAAAAGCCAAAAGCTAATTTAACATGTCAAAATTATTT
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GCTCCCTACCCCGTGCGACCCATTTGGTCAAGCGGTACATCACCCTTGAGCATGTACGAG
AGGCGATTGGGATCCCTTATCCGGCAATTGTCATATGACAATGGTGCTTGGAGCCCATGA
TCCTGGCGAGTGTCGGGGTGGTTCCATGGCATCATTCTCAGCTATCACGTCGTGTCTTTG
GTAGATACCTATTTCTATTTCTACGTCCATTGTGTCTATGGGCATCGGACGATTGTCTTT
TGTCTCTTCTTGTGGTGAGGTGACCGTCCTTGATGTTGCAAGCCATCGGTAGATTGTCTC
ATGTCCATGCGTGTCCTCGAGGAGCTTCTTTTCCTTGCTGAGGTGCTGCACACTCGGATC
CAAGGCGAGAAGGTTGTGATCTTCTTCGATGATGGAGGCGATGGCACGGTGACACCGTCT
GGTCATGTGGATGCGAAAGATGGGTGGACCTTCCTTCGGTGGCTTGATTTCCCCAAGACT
TTGCCTCTCCCTCTGGTACGAACGTGCCAACGGGCAAGACTTCGATGATGTTGCTTGTGC
TTCTACTTTTGTAGTTGTTAGCTTTCCTTCTTCACCTTGTATATATGCCTTGTAGGGTTG
CATCCCCGATTTCGTTTTATATTTCCTGGTGTTTCTAAGGTGGTGTTGGATGTAATCCTA
ATCTGCTAATGGCTTTGTCAACTGGAAGTCAAACTCAACTCGAGCCTTATCTCGGGCTCG
GGAGTCTTTTCTTTAAAAATAAATTACTGGTCCTCTATCAATCGGCTCCAATACGTAAAC
TGATATGTGGTACCTGATATGTTCTTATCTGTCATGATGTGTACGGGGGTGTTTGGTTGG
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CAAGGCCGAAAGCCACAGCTGCAGCCCGAAACCCCTAAATAGGAGCTTTTGGCTTAGAAG
CCAGTAGACGGAAGCTGGCTGGAAGCCCAACCAAACAACCTCCAAGGAATTGGCAGCCTC
CGGAGGCTGGCTTCCGATGCACACGGCAC