| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
| No map location | No map location |  |
Predicted Genes from contig_135119
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_4424 |
8 |
3099 bp |
MLOC_4424.2 |
Available |
Available |
LOC_Os08g37800.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13108.m03989 protein CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like_AMPKh.4 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed |
CDS Structure of MLOC_4424
Contig Sequence (11318 bp)
>contig_135119 11318 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GACTAATGGGCTGGCCAGGGCCAAACGATAGCCCTGTTTTCTACTAGTGCCTATCTCCTG
AATTTATATGGATTTGATATGCAGTGGTGAGGAGCTAATGAAACAACCCATAGATGTGAT
GAAAGCTTTATCTATAGAGATTGATGCTACCTTGTTTAGTGTAATCCCTGATTATCTGAT
CAATATTTTATAACCAGACATGTGATCCGCCTGAATAAATAATATGCCTTGAGGGTCATT
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CTCCAGTTTGTGTGCTCCTCTGCTTGTGGTTGTGGGGATTTCGGTGTGCTACTTCCCCTT
TGTTTCTTTCTTCCCTCCAACGGAGATCTTTGCCGCATCCAGACCTGTCCAACATTCACA
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AATTATTGATCGATCGGCCGGCCCATCCATCACACTTTCCCCAAATTTACCCTATATATT
ATCGAAAAGATCCTACCTGCGGAGCAGCGAGGGATTCTGATTCTGATACTGCCGTGTAAC
TATTGTGTGCACAGCTATTGAGTAGCACATTCATGTTTTTTAGCTCACCTCTTCTGTTCT
CTGTTCTTCATTCAGCTCAGTTGTTGGATGACTGCATTTCCTGCACGTCTCTTCCGTTCC
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GAAAGAAATCCGTGTTAATCCGCTAGGATTCTAGCTACGTGCCACGCACCAGGAGCATCT
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TTCACCCATTTCATTGACATTTGAACCACACTTGCCCTTGCCATTCATGTCCCATAGCAG
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TTCACCTGTTTCGATCAACTTGTGTCTGAACTATAAAACTGTTTACTGAATCACATATAT
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GGACATTCTGACGCATTAAAGAACTACAATCTGGGCAAAACATTAGGTCTAGGCACATTT
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CTTATCAGACTTGTGGGTGTGTTCCTGATTCCCGTTAACAAATTAGTCGAGATAAAGTAC
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TCATTCACTTCATTCATCCTCATATCATCCGGGTTTATGAGGTCATTGAGACACCTAAGG
ATATATTTGTTGTGATGGAATATTGCAACAATGGGGATCTATTGGACTACATTGTTGAGA
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TGGCATGTAGGAACACAATTTTTGGGAATAACAATAGGTTGAGCTTCTTATTTTGACTGT
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CGATCAATTTGCTCGATTTTGCATTCATTGACTAAGTTTTAGCGAAGATATTTTATACCT
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CGCGTGGTGCGCATGGCCGGACGGATCGCTCGTTAACAGCTGAGCCGGCGAGGCGTTCGT
GTGTACGTGCGTATACAGAGACGTGGGCGCTGCGTTACTATGGCACTACAAAGGCACGGC
CTGGAGTGTGTTCTTGGGTCAGCTCTAGCACTGAGAAAGATAAACGGCTGTACGTGCGGC
CGGGGTGTTCGTCGCCGAAACTCTCTGTGTTCTACTCGTTCTTCTACCTTCGTCCAGCTG
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AACCTCTTATTGATGCTTTATTTGGTTTTAGTATCTTTTAATGCCTTGGTTATCTAAGTA
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AGCGAGAGTTTGTGCGCAGGTTATCTCAGGTAAATTGTACCCTGGACCTGAGATTGATGT
TTGGAGCTGCGGGGTGATACTTTATGCTCTTGTCTGTGGTGCTGTTCCATTTGATGATGA
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GATCCGCCAAGTGTATGCCTTTTTTTTTATAATTTTCTGGAAATCAGCAAATTCATGTAT
ATTAGTTGGACTTTATCATTCACTTTTTGTCTGGAGATTTGACTCCCCCTTGTTTGGTGT
TCCAGGGAGGTACCTATATCCTTCCAATTCATTTATCTGATCTTGTAAGGGATTTGATCC
CAAGAATGCTTGTTGTTGATCCGATGAAGAGAATCACAATTCGTGAAATTCGAAAACACC
CATGGTTTCAGAGTCGCCTTCCTCGCTACCTGGCAGTGCCTCCACCAGATATGGCGCAGG
AAGCCAAAATGGTACCCATCTATGTCACAGTTCAAGCGACTGTTATACATTTATACATGC
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AAAACTAACATCTATACTTTTGTCATGGAATGCTATCTTTTATTGCCATAATCTTAAATT
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TTCTTTCTAGAACATACACTTCAATTTTTATAAAGAAGAGAACGCCTAGAGCCCGAGAAG
GCACGACTTCTCGGCTGCACCACAAACGCGAGTGAGCGAGCTAATGGGCATGTGCTCTAG
CCAGCCGAGCACTGCTCCATTCTCAAAACACAAGAGCGTCTGGAGACTTGAACGAGGGCG
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TCATAGCTGCTTGTGTAACCTTTTATTTGGCAAGTAGTCCACATGCTGATGCTGATCGGC
TTGGCATGTAGATAATTTTAAAACAAATTCTACTGCTTAACTGATAGGCGGAGTTCCTGC
TGGACGCTGGTTATTTAAAAAAAAAACTAGCCAAACAACTAAGCTATCACTCAGCAGTGG
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CGTTCCTATGGGAACGATATACGGATTTGCCATCTGTTCATTTCTGAAGATTGATGAAGA
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TCATAACTGACTTTAGATAATTAATGTTTCCAGGCAACTGTTGCATATTACTTGATCCTG
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AGTCTACATTTGCATCATCTATGACTTGCTTAATGCATTAAAGGTTTAAGCACTACTAAC
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GGAGCTCACCCTCGTGCGATAATGATTGAAGTTCTAAAGGCACTTAATGAATTAAATGTC
CGTTGGAAGAACAATGGAGACTACAACATGAAATGCAGGTGGTGCCCTGGGTTTCCTCAG
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AAATGTTTTTCCTGTGTAGAGCTCCTCAAATGTTGTTTTGGCATGAAAACTTGCAAGCAC
CTAGCTAGAAAGTTTGATCATCTTTGATCTTGCAAAGTTTCAATTTTTTTTATTTTTTAA
TTTGTTTTGGTGTTACTGTTCATAGAGTGTGCCTAGGCAGCCGGCTGCTGAAAATCCACT
CTCATTTGCAATTCGCCAGCATGGTACTACTGTCTATTTGGCTCTAAATTTCTTGTATTT
ATTCTCCAGCTTTACAAGACCAAGGATGACAAGTACCTGCTAGATATGCAGAGAGTTACT
GGATCTCAACTCCTCTTCCTGGAATTTTGTGCGGCCTTCCTTACCAACCTTAGGGTTCTA
TAGTGCTTGTTCTAGTTGAGTGGAGAATAGCAAAACTTATGACTGTCCTGTATGTGTGGT
GCCGTTCATTTCCCCAACAGTGAATAAGTGATGGTGTGTAAACATGTAGGCGGTGTGTTT
CATCTTAGTTTTACCGAGTCCCTGACAGCGAACCATGTTGTTTGAGTGACTAGTCCTGTG
TCGAGCACCAAAAGGTTAAGTTGTTGTGAACTTGTAAGATAAATAGGCTGTGGTGAACCT
TTTTTGACTCTGCAGGCTGCACGACTGCTGGTGGTGATGCTGGACCACAAGGTTTTGCGA
TATTATTGCAAGATCTCGCTTCTATTTGCCATGTTGTTGAACACGCTGATGCGTCGTCTA
TCTGCAATTTTCACAACCGCTAAAAAAATCATTTGCTTTCATGAAGAAAGAGGCCATGGT
TATCAAGCCATGAAGAGCCAAATGTGCTGAGCAATTTTCTGCACTAGTAGCCTAGGCTCA
TTTTTCTTCCCTTGTTCTGTACATACTATTTCTCCATGAAACTATGAATACACCATCGGA
AGAAATTCTACGGGCGTAGATCGAAATTATGAGCATATACTATGCATGTGTATGTTAGCA
ACGGCTATCCAGGGCGAAGCAACGTCATATGTTGCTCCCCTTCCGTGCTTGCATGCGCAA
CTCTGTTAATATGTAGAATATGAATATGACGTTATTTTACATGTTAATTGTTTAAAAAAA
TGTTATTTAGGGTGCAATCTTAATTAATAACGCATGATCTGTTTTGTTTTCATACGGGTG
TTGATCCGAATTGAAAATGAAGACCTAAGCAAAAGATTGGATACAAAGGAAACCAACTAT
ATAATCTTGCATGCACACCTCATCAAAACCTCGCGAAAAAAGTAAATTGCTCATCTTATA
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TACAAGAAACCAAAAGCCAGTATATATATACATGTACATGTGTAGAATATGTAGGAAACC
CCCTATACAATGCGGTAAATACAAAATTTTACATGGCTATATATATATATAACTCTAACA
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CTGGGTCTTCGTCAGAAAATCCGCCAACTGTAACTCGGAATGCACATACTGAAGAGCAAT
AACCTGATCCTACACACACCAGCGGGCACATAGAAAGCATCAACACCAATANNNNNGGTG
AGCTCATGCTTCACAGGATCACGCGCAATGTTAATAGCACCTGTATTGTCAGATAATAGC
AAAGTAGGTGTAGTGACAGAAACACCAAAATCCTGAAG