Map Locations of contig_135031 (13341 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_135031

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_4342 10 6665 bp AK355657 Available Available None





CDS Structure of MLOC_4342






Contig Sequence (13341 bp)

>contig_135031 13341 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AACCCATAAGATCTCGCGACCAACTTATGGTTTTGGCACATGGATAGCAAGCTTCCACGC
ACCCCTGTCCATGGCTAGTTCTCTGGTGATATTCTAGTCCTTCAAATATCTCTTTACGGA
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ACCTTCTTTTTTCACTTCCAACGTAAGACAAAATTTACAGGACATAAAAAGTTACTCTTC
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GATCCCAAATAGTTGACCATTTGCAAATAGAGTTACCGCCTCGAGCTACAATCAAGTAGC
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GTTCTTCCCTGGTGCAACTTCTATTCAACCTAACATTCAAGCCCACAATTTGTTGTCCTA
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TGGTCAGGAATATCAAAATCGAGAACGCGAGAGGCAATTTGAGTACCTCACACCTAATCT
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ATTCTGCTGTGCAGAAACTATGCTTGATATTGGGCTTCCTTAAAGAACTCCTCACAACGG
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TGGACAATATGCAGCTTTTACAATTGAAGGCGATTGGTGTTATTTGCATGGTAGCTCTTT
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CCAGAGACTGGGCTAAGAAAATTTGCTTGGCACTTGGCCAGAAGAACTCGTTCTCTCGGG
GTTTTGACAAAATTCTTTCCCTCCTTTTGGTAGGTCATTGCTTCTCGATGTTTGATTTTA
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TGATGTATATCATTCTCATTTGGACATTGGACATCACTAGTTAGCCTTAATTCTGTGTAG
GTCAGCAGTATAGTTGAAGCTGATCCTGAGGTATTGGGTGACAAACGTGTCCAATCCGCT
GTTGAAGGAAGGTTTTGTGATTCAGCTATTTCTGTTCGTGAAGCTGCACTTGAGCTTGTT
GGAAGGCATATTGCCTCACACCCTGATGTGGGTCTTAAGGTTGGTGGACTTATGAACTTA
TCTTATGAGTTATGACCTGTTCTTGGGTGCTGTTATTGTTTCTCTGCAACTAACCTTTTA
TCTTTCCATCACAGTATATTGAAAAAGTCGCTGAACGGATAAAGGACACTGGAGTAAGTG
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CAGACTTGATATTGTACTAGAGATGTTCCATTTATTGTTGTTTTTCTACTTCAGTGCGGT
GTATGTTGGTGCATGAGCTGAAACAACCAGTCTTCTGTATGCCTAAAGAAAGTAGTGGCA
GTTAGCTAGTACCTCTTACATGTGAAATTCCCTTACATTTGCAAAATCGAAATTATCCTT
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CTTTTATGGATGTTAACCTCTAACAGTTCATCTCTAATAAGAATGGAGGAATCTGATCTA
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ATGATTTGCGTCTTCTGATCCGCTTGTATCTGCTTATTATTTGCCCTTTGATGGACTATA
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CCGTAGCTTTGGACCTGAAAACCATGATCCCAGTTTAACAATGGTAGTTCATCTTTTTTG
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ATGCTTGTTCTTTCTGATGGCCAGGGTTCACCCATGCTCTGTTGCTGCACAAGTGCACAT
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GTCAAGTTTGGTCTATCCCGACCTCTCTTCACATTATCAGCATGCTTTGGCCGTCCGCTA
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ACAAGCTTCTCTTCAATCGGTGCCATCCCAACTCTGTCCCATATATCATCATTCCGGACC
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TTGCCTTTTAGTCGGCCAACACTAAGCGCCATACAACATGGTAGAGCCTGTGGTTTGATT
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TATGTGTGATGAAACTCTGAGATATATTTTTCCTGGAAGTGAATGTAAAGGTGTTCATGG
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ATCAACTGCCCAGTTACTTGAAAGTATAATTTTTGTGATTGATGCTGTTATTCCACTCAT
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CTTTTAATTTTTTTATCAGCTCATCTTGCAATTGCCACATCATTACTCCAAAAATTCATC
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ATTGGGTCCTGCGGAGCAAGTCAGTTGTCCTAAATATGAAGGTCTACTGTGTAGTTCTTT
GATCAGGCAATGGCAATTTTAGAAATTAAACTAAGCCTCAGAGCCTGTCTTCCGTGGGCA
AGCCTTGTTTGGCCCGTCGCCTCTCTCCCGTCTTCAGACCCTTAACCTATTCAAGTTACA
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TCATAAAATGCAGTAATCTATACCCTTTTCAAGCATGAATAATTACACCCATAACATCTA
CTCTCTCTGTTCCAAAATAAATGTCTCAAATTTGTACTAACTTTAGTACAAAGCTGTACT
TGAGTTGAGACACTTATTTTGGGACGGAGGGAGTAGAAGTGAAGTAATCCATACCTTTTC
CATGCATGCATCATCACAATCTGCATCTTGGGTATTATCTAATGCAAATCTGACATTAGA
TGCAATACTGCAAATCTCATTTGATTCTTGCATGAATGGTTGAGCTTGCTTGCTTTTCTG
TGGAACATGTTGTTTACCTATTGCTGATTTTCACGGACAGGTGTCTTTCTGCCCTTAGCA
ATGCAGCAGGCAGAGGTCCGAGCTTGTTGGAGTCCCTCGTTAGCCTTTTCTACAGGCTTC
TGTCTGGTCCTAATTCTGATGGTCAGGTATTGTACGATTACCTGATTGATTGAGTGAACT
GCAATCTGAAATGTATGATGCATGCTACATTTGAATATTATGTTGTTCTCTTCATTTACA
TCCTTTCTAGTCTCCTTTAAGTCAAAACAGATTCACATCATAACATGTAACACCTTATAA
GCTTCTCTTTATGAGAACTCTATTTTTTTTTTAATTTCCATTGTTGGTGAATTGCATAAA
ATATTTTATTCAAGCATAGTTTAGGATGGGTTCGACTCAATGGTGAAGTGGTGAAATACT
CACTTGTGCCAAGAGGTCCTGGGTTCGGCCCAGCCTCTCTGCACTGCACTGTGTAGGGGT
AAGGCTTTGCCTCGTATAATCCTCCCCAGACCCCACCTGGTGTGGGAGCTTCTAGAAATA
TAGTTTAGGACATTCTTTTGGAAGTACTAGTTTAGACTTTAGAGCAATTGGCATAGTTGT
ATGGTGTTATGTGGCAGTAATTTGATGAACATGTGATACATTGAGTACATTTGCATATGT
GCATCATTGGTTGTTTTTACCTACTTTCTTTTACTTGCAATATCATGTAGGTTAGTGCTT
TCTTAGAATTACGATAATGTTATCTGGCAAACGTCAGCTGGGAGGGGGATGGCGAACGCT
TTTTCCTGGCAGTTTTAGTTGCTTCACGAGATCAAACGGTGGCAGCTTTAAAAAAATGCC
TTCTTCCGAAGAAACCACCATGTTTTGAAGAAGTTGCCATTCCCTCACAACTAAAACTGC
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TAGAATTACCATGTAGCTTAGTTATGATGAACTGACCGTTTGCCTTGTTGAAACTCAGGT
GTTGGGTCGATCATTATTCTGTCTCGGCCTGCTCCTTAGATATGGTTATAAACTGTTGGC
GGCATCGGAAAACCAACTTGATTTTCCAAAGATTCTTGATTTGCTCAAGAAAAGGTATCT
CCTCAAGGAGGATTTCAGCTTGAAGATTCGAGCTATGCAGGTGTGTGTGCTCAGCATTAT
TACACTCAATATTTAACATAATGATACTGGTAGCTAGCTGCAATGACTCAAGTAACTTAA
CATGCATATGACACATTCAAACCACCTGTCTATTTGACTGTTGCTTTAGTTGTTTAGGGT
GCTTGGATATTTTTTATATGATATTTTCCTTATTAAATGAAAATTTTCATGTGTGCGTGC
AGGCTTTGGGATACATACTTATTGCAAAGCCGGATTTTATGCTGCAGAAAGATATTTTGA
ATCTGATAGAGGCATCACTATCTTCTCATGTCGATTATAGGTTAAAGGTATAGACATTCT
TCCTATAATGGGTTCTGCTCCGCATAGCTTTTTCTATATATAATTGGACCTATCTGTCCA
GATTCAAGGATTGCAAAACCTTTATGAGTATCTCCGTGATGCGGAAAGCCAACTCACGGC
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TGCTGCTGGAGCGGGGGACACCAATATATGTGGTGGTATTATCCAGTTGTATTGGAATTC
TATTCTTGAAAGGTCCTTGGATATGAACGATCAAGTTCGCCATGCTGCACTAAAGGTGAA
TTAGTTCAACTGATTTCTACACTTCTCTCTTTTCATTTTAGAGTAGCAAGTAGTGATTGT
TTTTTTGTTTTTGTTTTGCAGATTGTTGAAATTGTTCTTCGCCAGGGTTTAGTTCACCCA
ATTACTTGTGTTCCACACCTTATAGCACTTGAAACTGACCCTGTGGAGGGGAACTCAAAG
TTGGCTCATCATTTGCTGATGAATATGAATGAAAAGTATGATGATTCAACTTCTCATTTC
TTCATTTCTTCATTTCTTTATTGGATAAAATGATCTGACCTATTGGCGTTCTTTTGCAGG
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CAAGATGTGGTGGGTCAGCAAGATGTGGTGGTTCAGCAAGATATGGTGGGTCAGCAAGAT
GTGGTGGTTCAGCAAGATGTGGTGGTTCAGCAAGATGTGGTGGTTCAGCAAGATATGGTG
GTTCAGCAAGATGTGGTGGGT