Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_134701 (4180 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_134701

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_4112 1 1661 bp AK249870.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_4112






Contig Sequence (4180 bp)

>contig_134701 4180 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATATATATGGCCTTAGACCTTTCCCAAAAAAATAGTAAAATTCTTCGATGCATGAAGTGA
ACCAGAAACTGTAGTGCTAGAGATTTTTATCATGCTACTACACCATATTAAAAACAGACA
GCTTTGGGTTTTCAATTTGGGCACTGTGGAGCTACATTACCCAGGCGGGCCTGAATATCT
TTGCTATGACGCAGTCTAGAGTCTACACAAGAGCAACGCACAATATGCCGACTGATGATA
GTTATCTGATGAGGTCATATTATTATCCTGAAGAACTGACAAGCACAAGTGGGCCAAGAA
TTCAACACAAAACTTCCCTGACAGATTCCATCAGATGGGCATTGACCCCACCATGCTTTG
GCCGGTACCAATGATGAGTCAGGAAGCCCCAAGAAGTATCCAGGAGCCGAGCCCGCGCAT
AACCAAAATCACTATTTTAACCTTGCCAGGAAATTTTACCATAAAATGAACTTACTGAAA
TTTTATTACCCTGTTCAGCAACGTCACAAGCCGTGGCATTTCTACTACACAGACGCAGGC
AAGGTTGACATTTCTACTTGACTACGACTAAGCCAAGCGTCCATGACGTTTTACCCAAAG
GAGCGCCATGCCCCTTCGCGTTTTCAGTAAGCGCATGCACACACTCGGTTATCTACTCAG
GGAAGAAACACTCAGTTATCAAAAAGTCAGATCATGAAATAAAATCTAAAAGAGTTCAAT
CCTGCTAAATGTATCGAAAATGGTCAAAATAGTGAAAAAAGTCTCTCCCCAGCCCCATCC
GCTCCATGTGCAAACAAGGGGATGTTTGGTTCCTAGCCTAAGGTTGCCACGCCTAACCTT
AGTCATGTGTTTGGTTCATTGTCATACTTGTGGCTTGCCACACTTTTCTAGTTATATGGT
CCACATGTCTTACACTCAATTTTTTGTCAAATCTTGCCACACTTGTGGTGTCCATTTTGT
TAGCCACACTTTTTGTGACAGCCACACTTTGCCTAAGGTTAGTTGTGGCAAAGTTAGTCA
TGAACCAAACAGGCCCTAAATTCGGTTACAATGGTCATAAATTCAAAAAAACATGCTTTT
TTTTACACTGAAGATGAGGAATTAGCTAGAAATTTGCAGAAGTTCGTGCCGAGATGACAC
TAGAAAGTACAAAAATCAGAGCTCCAACAAAGTCGTCTCGACCCGAAAACTTGAAAGCTA
CTAGAAATTTCCATCGTATTGTAGTAAAAAAAGTCAGTTTTAATTTGTTTTTACTGTTTC
TTTAAGATTTACTGTTCTAATGAGCTGCAGAAATGCTGCTGTCCCATCCAACTTCTCAAA
CTTACCCCAAAAAAGAACTTCTCATCTGTAAGAACTCATCTGATAGTTGCAAATGAACTC
AAATACAGAAGAAGAAAAAAAGAGTAGAAGTTTTCTAAAGAGAACGAATTAATTGAATAG
AGAAGGCAAGCCTTCTTTAGGAGAATTGTTATTACACGAAGTGTTGATGCAAGATATACA
ATTCACATTCTTTTGACATAATTTCTGTAGGTGACAAAACAATTTACCAGATGCCTCTCA
TGTCACCTGGAGCCCAAATGCCCAATATTCACTCGTCTGCTACATCTGGCACCTCCTATC
CCCCAACATTTTGCTTACAATCTCTTCAAGCTCTTCTTCCTCGCGTCCATCTTCTTCTTA
GCAACAGGTCCTTCCTTCTTGGGCAATGCCGTAGATGATCCAACAGTGGGCTCAGCGGGA
GCATTCTGATCCAGCGAGTTTGAGCCCGGCACTTTGGTAGCAGCAGTAGCACATAAAGCC
ACGGGCGTTGATGGTGCAGTTTCACATAGATTTGTGCTTGACTGATCCACGTTTACAGAA
GTTGACTCAGAGATAGTGCCACTCTTGGGCTTACTCTTAGGTTTGAGGGCATGAATGCTC
GTGTATAACCTGCATATAGTGCAGTGTAGACGATTAAGAAGTGTTTAAGATTTTTATAAA
GCAGTGGTATCAGATGGGCTCAAACTCGCTAGATGTAATAGTCACCTAGACGCGCATAAT
ACTCTAATTTTGACCAAGGAGAAAGAGAAGGGACTCCCCATTTAGTGAAGGCAGATAGAG
ATGTCTGCTAGGTGTGAAGGTGTCCCTAGACAATGATACACTGATGCTCAATAAAAGTCA
AAAGGTTACCTTGCATGCCGTGCATAGTCCGCATAGTTCTCAAGTAACATCTTTCCAGCC
TGCTCATTGAGCGCAGATTCTGGGAATGGTTCAATCAGCAGGCATCTCACCACCTTTAAG
AACGTAAAAAAGTCACTATCAGTTATTAATCGATAATTACAGTTCACGTATTACCAGTAG
CAAATAGGGCCAACCATTGTAGTATGCACTTACCAGTAGAACATGCCTTAATCCATGAGT
AGGATTCCAATCCTTTTTCAACGTGTTAACACAGATCTCACCATTGCTTGATATGTTTGG
ATGGAATATTTTAGTCACAAAAAATCCTAAAAAGTGAAGGACAGGTTAAATATTTGTCAA
GAAATAATCAGGTAAAGAACATAACAAAACTGCTCAGGCTTTAAGTTCATGAGCACTTGT
GCAGAAAAAAAGTGGCGCGCAAAAGACAGACCTTTCGGTGGGGATTGAGGGAAGTCACGG
GACAAGACTAGCTTCATCCGGAAAACCCCATTCTCGTACGGAGTCCCACCTGCATCATTT
TCAATATCCGTTTTCCATTAAACAGTATAGTGATAAGCAGTGCCGTACCTAGGGGGTGTG
CCGGGTGTGCCATGGCACACCCAAAATTTTAGAAAACATTATTTTACTATGTATACAAAT
TAGCAGATTTTAAGGGGCTATCCAAACCAGTTAAAATAGACCTCACATTTTAAGGTGTGC
ACACCTATTATTTCATTTTTAGGTCCGCCACTGGTGATAAGTAAAGATTTTTACAAATTC
AGGTTATGACATTATTCTTTACAAAATGAACATATTTTTTAGTATTCAGTTATGAACACA
ACACGATCAGCATATGAAAAACACATGGAAAAATTATAGCAAATGCTATTACAGGGAAAC
ATCTCGATTTTTTTAGTGTTTATAAACTATCAAAACCTCCTAATTGTAACCTTACCAGGG
CCATCTATATCTGCACAAATACTTGTGAAGTCATCGTCATTCACAATCACTCTTATCCCT
TCTGGAGGTGACTGGTCAAGATTCTTCAATTCTTTAGCCAATTGCCTAATGACATTTGGT
GGGAGGTTTTCGTTGGTTGCCTTCATAAACATGAACACTCCACATTAAAATCATGAACAT
CAAAACATTTGCCATGAAAAATGAACCGTAATAATCACCATGCAAGCAAGACAGCAAATA
GCTTTGTTCTGGCTTCTGAAGCAACTCTGTGAGCAGATGTCCTTCCACAATAGTGATAAA
TTTCTGATAACAGATGCAGCCTACAGGAAACAGCAGTTAATGTCATGGTTGGGCAAACAA
CGCCAAGAGAGCAAAAGCAAGCATATTAGAATGGTTAATTTATAATATGTTTGGAGTCCA
AGAGACATTATGAGCATCAATTCTTATGCTTAATTTCACACATGGCTTCTGCAAACATTT
CTCAAATTCTAAGGCATATAAATAAATGCTGAAAGACTGAAAGTTACGAGTTGGAGGGAT
CTACATTCGAACAAGAGGGGTACTATTTTTTCCAAGATTTTTGGGAGATTTTTTTAATAG
CTCTCTTTGTACATAGCCTCTTGTTTGTTACTTTTGTTAGATGTGGTGACTAGCACAGTT
AATATTTCCAACCTACAAGTATTGGGTTTGACCACACAGACACCGTTTTCCACTTTCCAC
AAAACATGGCTAGTTTGAATTAAGCATCCATACGGTAATATCCATTCCTAAATGAACACT
GTTTTTCACCACGCATGCTTCTATCTTTATAAAACTACCACATGTGCCCTCTTTGATTTT
AATGACTTCCTAACTAACATCGTGTCTGACTGGCGATGCACATCATGCCATTAGCAGTTT
ACCACTGTCTAATCCCACATAGGACCCAAACACTAAGGCCTTGTTTGGCACTAGTGTATT
TTAGGAAATTAGTGGGGATTATCCGCGGAATCAAGGGGGATGTTCAAAGTTGTACTAATT
ACCGCGGAATCAAGCTGATGAGCCATACTATGAAGCTATG