Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_134620 (4522 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_134620

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_4051 2 1225 bp AK357441 Not available Available None
MLOC_4050 1 888 bp None Available Available LOC_Os01g58680.1, FRAME:+1, EVALUE:3e-33, 13101.m06230 protein apurinic endonuclease-redox protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_4051






CDS Structure of MLOC_4050






Contig Sequence (4522 bp)

>contig_134620 4522 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACTTTATACTAGCTCTAATACAAAGTTGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTGGGACGGA
GGGAGTATTAGACAAGGAGATCCATTATATTGCTGTGCTGGTTTGCACTTTTTTGTATTG
CTTCAGTTGACCATGTGGTCATATTAAAAAGTTAGGAACATTTATTATCGAATACAGTTA
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GCAACCATTTAGGCATTTCACATTTGTACCCATCTATCTTGTTCAGTTGACAAATTGTGC
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TTACTTTCTCGTGTCGGAGTCCATCGCAGAAAGAATCCACGATTCATACATCCTCCCAGA
CGTTTCTGCCAGTGACCACAGCCCGCTTGGCCTCATACTGAAGCTCTAGGTGAAAGGCTG
AACCCCCGGCCCATGCGAACTTGCAATCTAACTTCTGGGGTTGTTGGTCTGCAGCGTTGC
TTGTTCCGCTTTGCGCAGATGATTTTGCGTCAGTGAAGCAATAGGTATAGTACTCTAATG
GATGTTGGCTGGTGGTCATTGTACCAATCCAGGTTTGTGGCGTTATGGTCCAGCATGAGC
GTTTTGGGGAAATCCTTGTCCCGTCTATGTGTTCTGACTGTTCCTTCAGACTTAGCATGA
AACTGTTCCTCCGATAGTCTGGGTCAGATATGCTGTGTTGTGTTGTTCGAAGCAATTTTC
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GGAACATGTGCTAAAACAAGAGTATTCTGGAACGAGAAATCTACGGTTATGGGCTACGGT
AGCGGAGTTGGCCATCCAACCCGGTGCATCAAATGTCCATTCTGGGTCGGACTCCTCCAT
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TCTACCATGCTCAGGCACAACATTCTCATCCTGAAACTGAAACCCTTGATCGTACAGACG
TTTCAGATGCTCGTCTTCTATGATCATATTATGCATGATCGCAAAGCAGTCATCATCTCC
CATAGTTTCTGCGTGCTCCAGGTATTAGTAGAATACCGAATGATGCCCCATCAAGATTGC
AAAACACCAAAGGCACGNNNGACATCCTTCCTAGCACTCTCTTGTTTTTGGGCAAATATT
TTCCTCTTCTCTCGATAGGGTTGGGTATTTGTCTTGTCAATAATGGTCCACTAAGGATAG
ACACCGTCACCCAGGTAGTATCCTTTGTCGTAGTTGTGGCCGTTGACAGTAAAGTTCACC
GGTGGGTTGTTGCCTTCGGCAAGCCTAGCAAACACCAGCGAACGCTGAAGCACGTTAATA
TCATTGTGTGATCCGGCCATGTCAAAGAATGAGTGCCAGATCTAGAGATCTTCAGACGTC
ACGGCCTCTAATATGACAGTGCAAGCCTTGACATGGCCCTTGTACTGCCCGTGCCAAGCA
GAAGGGCAGTTCTTGGAAGTGCATGCAGTCTATGCTACCAAGCATCCCTGGGAAGCCTCT
GCCCGCATTCATCGTCAACAAACGGGTTGTATCTTCAACAGCCGGCTCTCTCAAGTACTC
AGGGCCAAACACAGCAATAACAGTCTTGCAGAACTTATACAGGGACTTTAGGCAAGTAGA
CTCGCTCATATGGATGTATTCGTCAATGAGATCACCGGGCACTCCATATGCAAGCATTCG
AATGGCGACAGTGCATTTTTGATAAGAGGAAATACCTATCTTGCCAACGATATCCTCTTT
GCACTCGAAATAGTCATCATAGCCGACCACCCCCTCTCTAATATGGTTGAAAAGATGCCT
ACTCATACGGAAATTACGGAGGAATTTTTGATGTTTGAACAACGGGTTTGTTGTATCAAA
GTAGTCCTTTCAAAGAAGGAAATGCCCGCTCTCTCTGTTGCGATTCAACGTTGGAAGGTG
GCCCGGAATGGAGCCACGGAAC