Map Locations of contig_134618 (3497 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_134618

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_4049 1 704 bp AK375395 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_4049






Contig Sequence (3497 bp)

>contig_134618 3497 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATTTATTGTCCATCTAACCCTCCCATCCAAACACCTTTAGAGTTAGAGTTAGTTCAGGTT
AGTTCAAGGGTTAGAATCTAACTCTANNNNNAACCAGGTTAGAGTATCCAAACAGGGCCG
TAGTCACAAACTGATTGTTGCCTGGACCCACACTGGTCATTGGACTTGTGGCAAAAGGGC
TCTATAGTGCTGATCGTTATGAGAAAAAAACATTGTTCTTCCTTTTCATCAATATATGAA
CCTTCTCCCACATTATTTATTATCCTAAAAAGAACTTGATGTTTCCCATGGTCTTAAAGG
CGTCGCTGTAATTTGAACTACTTTTGACCAATTGTTATGTGTCTTAAGGCGTTGCCTAGC
ACCATACCTTAAGCCCTTGAAAGGTGAAAAGGGGTGGGCTGACTCGCATTCCCGCTAAGG
TGTTGGCTTTTATAGGTTTATCAGTTCATTTGGAAGAACTAAAATAGAGTATTTAAAAAA
AACATATGGACATTTGAATCGCCTTGACTTACCGCCTGAAACATCATGTTGTTAGCTTTT
GCATTTTGCATTTGTAAGGCGAAACAGATTTGATCTGTGTACTACTAACACTGACCTTTG
TCTGTTGCATGCCACTACAATCGCTCTGTTGTATCATCTGTCGCAGTGCATTACTAATTA
ATATGTAAATAGCCTCATAACTACTAAAACTGACCTTTGTCGTATCATCTGTCGCATTAA
TAATATCTAAAAGGTCACATAGTCACCCTCTTTTACATATTCTTAGCAGTAGTCACTATG
TCTTGCCATCACTGAATGCTACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGATTGTTTTGCAAGCTA
AAACAGCTTACAAAACAATCTTATATTATGGGATGGAGGGAGTATTTGATAAGGTCCATG
TTTTGCTGATATTTTTGGATACCCAGAACTTCAGAATGGGGAAATTTGGATTAGTTAACT
TACAGTGAAGACGTGCTTGTTTGGCTGATTGCTTTGTTTCTATAGGGCCCTCTTTATATG
TTTCAGCACTACATTGGACAATCACAAGTGGATTGTGTGCAATTCATGTGTTTTACAATT
TTGCAATGTAGGTACAAATTCGACGATGAACGAGTGACAAAAGAAGACATGAAACGGGCG
TTGGAGGAGCAGTACGGTGGCGAGGAAGAGGTAATATCCATTCGGAAATATTAAAACGTC
TCATGTTGGCCATTGCTAAATTTTCTTATTTGCAATGCTATCTGTTTCTTGGTTACAGCT
CCCCCATACTAATCCTGGACTGAATACGAACCCACTTAAATTTACCAAGTATTCAAATGC
TTACATGCTTGTGTACATACGTGAAAGTGACAAAGAGAAAATTGTATGTGATTTGGAAGA
GACAGACGTATCTGAACACCTTAAGGTAGTATTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTGCCTTTCG
ATATCATAGAGTTAATTTCAAAATTGTGTAAATTCTTCCCAGACTAGGCTAAGAAAGGAA
GACGAAGACAAGGAGAACAAGAAAAAAGAGAAAGCCGAGGCTCACATGTTCACCACATTC
AAGGTTTGTCTTTATCTCTTTATCTGACTGGGATTGTCATTTTGGTTGCTGTTCTCACTT
GGCTCTTCATTTAAACAATTACCCAGGTGGCCAGAGATCATGATTTGGCAGCACAGATTG
GACGAGACATGTTTTTTGATCTCGTGGATTATGAAAAAATTCATCCTATCCGTGTACTTA
AAGACATGCCATTCAACCAGGTTAAGGTAATTATTCTCACCGAATAGCCATGTTGCTCTG
GATATGAAGATATTTTGTAAATTAAATATGTGTGCTCTTTGCATATGATAGTGTTGGTAT
AGTCAGGAATTCCCAACTGTAGAATTTCTGATGCCCTTTTAAGTTGTACTTGGCCGCAGT
TTTTTCCTTCTTTTCTTCTGTTTCAAGCATTTGTAATAGTTAGACTGGCGTTATTGAATA
TAATTCTTCAGTTTTGGCATTATAGGCATGGTACAGTAATTTCTGCTACTTTGTGATTGG
GTAACTAAAACAGTTATCTATTTGATTTGGTTAACTAAATAAAATTTTATCCACTACGCT
TGTTACCATAGTAAATGCTTTCTATGAACGTGTGTTTATTTATGCAGCAAGTTTACTAAA
ATGAAAATTTGTGCGTGCATATTACTCCTTCTGACCGGTCTACAAGCCCCCCTCCCCCCC
TATTTTGAGCTTAACTTTGACCATCGGTTTAGAAAAAATATAATTTGTTTGCCAGAAAAA
GTATACAGTTGGAATTTTTTTTTGACTGTGAATCCAGTGGTATAGTTTTTCTAGTGTTTC
TTCTCTGTATATGTATAGTTGAAATTTGTGCTTCTGTTTGCTTTCTGTGTGTGGGATTGG
AATAAAGCTGTAATATATTGAACAATGCTTATTGGGAATCAAACAAAATGGTTTAGTTGA
CTTTGGTTGCAACATTCATATTGATGGGAATCCACTTTTTGATTGTTCTTAGTTTTTTCG
TTTGCATTTAACTACAATGCCAAAGGATATGCGTTTTGATTTAATGAATTCTACTTGACA
GGAGGAGTTCTCGAAAGAACTTGGTATCCCCGTCCACTCCCAGAGATTTTGGTGGTGGTC
TAAGCGTCAGAACAACACCTACAGGCCCACTCGTCCATTAACTCAACAGGAGGAATCATA
TACCGTAAGTGAATATTGACATAGATTAATTGTTTGCTTTAACTTTGCTTGAATTAGTAC
AACTTTGTACTAAATCAGCGACAATTAATGAATTAATCAGGATCGGAGGGAGTAACTATT
TTATGCTTTCACTACCTGTCCAAATTATAAAAGCTGGACATCTCGTTTTCTCCTGTTGTC
TTATCTTTTCCTTCTTTTCTTCTGAATATCTTATCTCAGCCACTTAGACCAAATCATCTT
CTTCATGCACATTCCTTTTGTTCTCTCGTTGGCCAAATCATCTTCATGCACATTCCTTTT
GTTCTCTCGTTGGTTCCGTTGCAATAAAGCATGTAGGCAGCAGGCGGTGACATATATCAG
ATCTCAGGAGGGGCCAACATGCAACTCTCTGATCTGTTGTTTAAAAAATGGCTGCTGAAT
CTCCTCCATCTCTCTTATCAATTTCACAGTGCCAATTGGGTAACCATACCAATATACAGT
TACATTGGGGTGTAGCCTTTTTTATTTTCCTGTAAATAAAAAAGTTATTCCTGCACTCCC
AAGTACGTGCTGGAGCCTCACTGGTACGAATTGTCCTATGTGTTCAAGAAAAAATACAAG
CACATCAGAGGTGCCATGTAATTGTCCTTGTTAGCCTTGGGCAATCACTCGTTCTTAAAA
CCAGCATTCTTAAGTTTAAGATCAAAGAGTCGGGCGGAAAAAGGGGAGAGCTCCCCGTTC
CTGGTTCTCCTGTAACTGGATTCCCCGGAACCACAAGAATCCTTAGAATGGGATTCCAAC
TCAGCACCTTTTGTTTT