Map Locations of contig_134591 (10175 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_134591

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_4026 6 3583 bp AK250031.1 Available Available None
MLOC_4027 1 1348 bp MLOC_4027.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_4026






CDS Structure of MLOC_4027






Contig Sequence (10175 bp)

>contig_134591 10175 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTACGACTCAACATTGTACTAACCTAGAGCTAGTACAAAGTTGAGTCGCTTATTTTGGGA
CGGAGGGAGTATTTTATAACACCCCTTCAAAATATAACAATTTGATGCCAGTGGCTAACG
GTTGGTGTATCACAACAGATAATTGTCCTTTTTAATGGACTCTTCCATATAAGCATAACA
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AAGAAGACATGAAGTTGCTTCACCGTTTACGTATGAATATAATGCAGCTGATTACCTTAA
GCCCTTTTGAAGTAAGTCAATTTCTTGCCTTAAGAGTAGCACCTCTTGCTGTATTACCTG
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CAGTATTTCATACAAATAATGTATTTCCACTGCGTAGCTTTGCAATGCTATTTGACATTA
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GAGGCCCATTCGCCGCTTGCAGAAGGTGACCTGCCTGTGCACCGGGTTTTCTATCCTTCT
CATCTGAACCTTACCACGAGCCATTACTATTCTTCAGTCTATCTTCTTGTTTGTACACAC
AACCTCCCACTAGTTTGGACTAGCTTCTGAGGTTGTTGCAACTGGACACTGGATCCTCCT
CTCGCCCTTGAGGCAAATGGTGATTTGGACCTGTCGTGGAGGTGAGCATTTTATTGTGGC
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TGTAACTTGTTCAAAGTGTATTAAATTCCTTGTAATATATAAAATCCATGTTGCTTGTAC
TGGCCCATGCCAGATAACCAAGTGGCCCATGATTACAATGAATATTAGTGAGGAATATGT
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TCCCAGTTAGAGTTTCAAAAGAAATTGTGCATCCTACAATTAAAAGTGTGAAGCCGCCAC
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CAAGTTTACTCAGAACAATTAAAAATAATGTCCAATAAAAAAAAGTGCCTGCTGATACAC
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ATCTTTAATTGACCAAAGTTATGATGACTAGCTCATATGAGCCAATCATGATGGCAGTTC
ACCAGGACCACCCCTTTCATGAACACTTTCAAATGGCTTTAGATCCAGATTCCAGACCAA
TTGTCCTCAAGTATTGTCAAAGTCAAGCTGGTCAGTAACATTACGGAGCCATAACAGTAC
AATAATATTGTTATCTCTATCATTCATCAGATCTCGGGAAGTCCAATGAAATCAAGAACT
TTAGTTAATAACCTAGAAATGCATTATTGAGCATTTCAAAATATGAGCACTTGCGGAGGT
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TTGTTTTTATTTGATATTGTGAATGTTAAGTATCAGGATTCCCTGACCAAAATAGGTACA
TCTTATGTATACATGTTTTGCTTAGCAAGGAAGGTGCCCTTTGGGGTATATGTTAAGACA
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TCTACCCGATGGGAGACGGTAGCGCGGGATATNTTCAACCGGTTTGGATGGCGGTCCAGC
AATAGGATAGATGGCTAGGCATCTAGGCCTGCTTTGCCGGTTGTGGCACTTTTTGATTTA
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TAATAAAGAGGCCGTATGCATCGTGCTGATGCAGAGGCCGGAGGTAAAACTCCTTTTCTA
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AATATTTTTTATGCCATGGAAGTTCATAGAATACTCAAATTAATAAACAGATAATATACA
AGGTAGAGGGGTGACTCTGCCATTATCCAAAATAATTCATCAGGTAGTGCCATAGATATA
GACCAGAGAGAAAATTTAACATCATATAAAAACAAAAGAAGCGTAGAGAATATTTACTCC
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AGCAAATGTTCTTTAGGTTATACCATTCACTGAAGAGGTACAAGCCGATGTGGCTATGTT
GATAGATATCAGGTAGGAAAGTGTCAACTAGCCGCTTCCTTTCTATTGAAGTGTTGAGAA
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ACCGACGGTCCTCTGTTGTGTCCTACTGACAGACTGTAACTTTGCACAGTATCGACCTTC
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TCTACCATGATTGCTACATATTTTAATAAAAAGAAAGCGAACAGTTGCTAAATTTTCAAC
TCTTTGTCATTACCAATATCATTCTGGAACTCCTATCACTGGTTTGATCGGATTTTGAAA
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AAAGGACGATGTAAAAGGTATAGCCAAAATTCGTGTTGATCTAGCAATCTCTTTGAAACT
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ATAGCAGGCCTCTGAAGAGAATAACTAAGATTTGTTCACGAATAAACAAACCACCAATAT
GATAGTGTGCTTTAGTGCATCTGAACCTTACTTTTGATACAGAAGGGTATTGAAAGCTCT
TCCTTGAACATGATACATCGTCCACAAATTGAATTATAGCTGTGAACACATGAGATAAAG
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GGAACACAACAAAACCAAAGTTCTACTGATTATGCTGGATTCACAAGTACATTCACAAGG
TAACCTAATAGCATTTTTTTCAGTTCCGCATAATCAGGAATTTCTGTTGCACCAATTTAA
GTATTGAGTGTGTGGGATTGGCAAGAAATCAAACTTCTTAATTTGCTTTTCAGTTTTTTT
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GAAAGTATCTCTTATGTACTTGTTGAGAGGAGCACCTATTTCAAACCTCCGAGGCAAGTC
AGGATTGGATAAAAACAAGCGCCCATATGCTACCAAGTCAGCATAGCCATCGGCGATTGC
TTTATTTCCATCATCCCTGTCGTATCCCCCAGCTACAATAAATGTTCCCTTAAAAGCATC
CCTTATGGGGCGAAGACTATGGGGAGTTTCAAACTTTTCACCAATATTCACCATCCGTGG
TTCCACCATGTGGCAATAGAGAATTCCAAATTTGTTCAGTGCATGTGCCATGTATAGGCC
TAGAGCTTCTGGGTTTGAGTCGGATGCCTCTGAATAGCTCGCAAACGGTGAGAGCCTTAT
CCCAACCTTATCAGCTCCAACTTCATCAACTACGGCTTGAACTACTTCTAGTGCAAAACG
GCAACGATTCTCTAAGCTCCCACCATATTTGTCAGTGCGATCATTTACTTGGTCCTTTAA
GAACTGATCAATCAAATAACCATGAGCTCCATGGATTTCAACACCGTCAAATCCTACAGA
CCATACAAGGCATTGCAGTTAGAAACCCCTCTTCTTCAAGAGTCAGGGTGATGTCGAAGA
ATTCAGTAGGTGTTTGTTAGGCACTAGACAGAACATTAATGAGAACATGTGTATGCTAAT
TTTCTCCTGATACTAATTTGTTTGAATGAGAAGTCTGTACTTTGTATGATATAATTTTAG
CATAACATTTGAAGCACAAATGTGAGAGATAACGATTACCAAATAGGGTTCACTACCAAC
CAAAATGTACTTACCGGCTTCAATCGCATTTCTAGCAGCAACCCTAAAATCATTGATTAC
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GTTGGCTCTAACTACAGGTTTGAGTGGCTTATCAGTGCTCGAAATTGGAGCCTGCCCATT
AGGCTGAAAAGCTGCATACAGATAACGGACATGTGTCAGTGAAATAAAAGCAGGACTACA
AGGATGACTATGGGGTGGACAATGTATTTTTAGTTACAAAAAAACATGAGGTAATTCATG
GCGCCATAAAAGGGTGAAATAATCATGCAGAATGTTCATACAAAGCCAATAATCTAAAAT
CCATTTGAGGTATTCTTGCTTGAAACTTTTTTTTTTTAAAGAATGCTCGCGACATAATTG
TGCTTACATTTGGTTTGATGACATGTCAGACAGCCTTATATTAGAGTTAGTAAACTTACT
GTGATTAGAGACTCTTCCTACATGCCAAATCTGACAGAAAAATATTCCTCCTTTTGCATG
AACCCCATTGACGATCGGTTTCCATGCTTCTACTTGCTCCTTTGTCCAAATGCCAGGAGT
ATCTTTGTACCTAGCATTCATACAGTGTAACAGGAAACATATCACCTTTAAAAGTCATGC
TAAACTGAAAATATGACTACTGAGATATCAAAAAGCCACAGCCTAAGGATATGTTATACA
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GTTCTCTGTTGATAATACAGTACGGCATGAGGCTGAGGAACATTTCCGAAGGATCGCTCC
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CCATAGGCACAGTCGAAGAAATTTCAGGGACACACTCCTTCACATAGTCCACAGCAATTC
GTCAGACGAAAATTGATTGTTGAGCACACGTACTGGTGTGCACTCATTGGTATTAACTCA
AGTTAGGGTCTATCGATGGAATAATTATTCAGTAATGTCAGATGATTTCAGTTTGACAAT
ATCATCTCACATGTTCATTCAGAAACATCAAAACTTTCAGGATGACGCTTCTCTTGTAAA
TAAATACAAAATGCGTGCTAACTTTCGTTGTTTGCAGTTTGCAACAACCCTAATAAACGA
TTTCAGCATAGGACCTGATCATGATGCTGCCATTCCTCAAGAATCTTGGGGGTTAAAACA
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TCCAAACAAGAGCAGCCTCTGATAAAAAGCAGGAGCGCATAACGTCCACATGACAATAAA
GATCCTCCGTGAGTCATGTCCGGGATTAGAAAAACCCTCCTTGCTGAAAAAAAAAAAAAA
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CAGAAGACCTAAAGAATCGATTCTTGGGCGATTGCTAACAGACATCAGCGGTTGGTTGGG
GTTTCCCGTACCATGGAAAGGGGGATCGAGTGGGATTGGAAGAAGAAAAGACGGACTACC
TGTGGGAAAGATCAAACCTTCCCATCTTGTAGGGGGTGAGGAGTGCAGTGTTGCTCATCT
TCTTCCTTGGTCTGCTCCTTGTCCTTGCCCCCCTTCCTCTCTTCCTCCGCCCGTTGGTGG
GGGTGGGCCTTGGCACCCCCCACCCTTTATGCTGATGAAATGAAAGCTGTGGCGGCCGGC
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AGAGAGGAAGAGCTGGCCACACATTTCTTGGAGGTTTTCTTTAAAACAAAACTAGCACGC
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CATATTTTTTTTCATAAATCCGAGACAATTTAGGGGGTTTGACGGACTTTGAATAACAGT
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CCTCCCATTCTCTCTCCTTCCTTTTTTTCTCTTACCTTCGTCGCTGCTCCACCATCCCGG
CTGTCCTGCCACACCCTTGTCGAAACTCGACGATTCTGTCACATCTGAATGGTACATCCC
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AGGGCATCGTGTGAAGGATTGTGTTCTTTGGTTACCAGAAGTGCACGGCAACACTGTGAA
TGCTTGCACGTGGCATGGCTGCTGATTTGTGGGACAAGTACCTATGGATGTCTGAGACCA
CATGCAGAGATGAGATGGTCAAGTTTGCAACTATCGTGGTCGAGGTTTTTGGTACCTCAG
TACCTGAGAGAACCAACTGTGGCAAATACCGAGAGGATCTTGGCAATCTCTGGAATAAGA
GGGTGTCCAGGTTTGCTCGGATCTCTTGACTATATGCATTAAAAATGGAAGAACTGCTCA
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GTTGCGTCACATGATTCTTCGATTTGGCACGCTTTCTTTGGCATGCTCGGGTATCAACAA
TGACGTCAATGTGTCGTAACGATCACCATTGTTTGCTAGGATGGCTGAAGGAAAAGCGCC
TCTGTGCCACTATACTGTCATTGGACATGACTACAACATGGGCTACTATCTGGTTGATTG
TGTCTATCCTTGGTGAGCTACCTTTGGCAACACCATTTCTAACTCAGATGACCAGAAAAG
GTCTCATTTTGCTTAAAAATAAGAAGCACCCAGAAAGGATGTTGAGAGAGCATTTGGAGT
TCTATACACACATTTTACAGTTGTTCGTGAACCTGCTAAACAATGGGATACAGAGACCTT
GTGGGAGGTGATGACATGTTGTGTTATCATGCACAACATAACCGTGGAGGATGAGGGTGA
GGGTGTTGCCGTAGCTCTTGAATTTGAGAACATGGTGATCCTATCAAACTTCCAGACCAG
AATGCAGCCACATTTTAAGAGTTTGTTCAATGCACCAACAAATTCAGTATCGAGCAAATC
ACGAGCAACTGGAAAAATATCTGATCGAACATTTGTGGGTGGTTGAAAGGGACAACAATG
TTGGAGTGTAAATATTTGAACTTTTTAAAATTAGAACTACTACTACATTTGAACTTTTGA
ACTATTCTAGACCATATATGTGGTTGTTTGAGCATGCAGACTTCAAAAAAATTTGGGTCA
CATGTATGCGGACAGCGTTGGATGACGGCATTCGCATCCGTGATCATGGACTGTTGCCCT
ATCCGCCAATGGATGCGGGAACAAACTTGTGGGTGAGCGTTGGATATGCCCTTAGGTACT
CCCTATGTTACATAATGTAGTGTTCATTTCTTGAAAGTCAAACTACCAAGTTTATAAAGA
AAATTATTTATATCTACAATACTAAATATATAGAATGTGAAATAAATCTAATGTTATATC
CTTGGCACTCGAGATGTAAATTTTTTTCTCCAAAAACTTGCTCAAATTTTGTGAGGTTTG
ATGTCCCACTAGCGTATGGGATCGCAACAGTTTTC