| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
 |
 |
No map location |
Predicted Genes from contig_134577
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_4012 |
4 |
1918 bp |
MLOC_4012.3 |
Available |
Available |
LOC_Os03g11410.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13103.m01288 protein mitochondrial-processing peptidase subunit, mitochondrial precursor, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_4012
Contig Sequence (5489 bp)
>contig_134577 5489 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTCCACGGCCGTCGCCGCGGCCCCCGGCGCCATCGCCCCCGACGCGCCCGCCGTCCGCGC
CCCCATGATGCCGTACGACCGGATCGCCGAGGCCGTCAACGCGCGCGTCCGCCGCCTCGA
GCACCCGGACCCCCGCTTCCTCCGCTACGCCAGCCCCGTGCCCGCGCACGTCGACCACAC
GGCCATCCTCGACGCGCCGGAGACCAAGGTCACCACGCTCGACAACGGCCTGCGCGTCGC
CACCGAGTCCTCGCTCTCCTCCCGCACCGCCACCGTCGGCGTCTGGATCGACGCCGGGAG
CAGGTACGAGACGGAGGAGGCGGCCGGGGTCGCCCATTTCGTCGAGCACATGCTCTTCAA
GGGCACGGGGACGCGCAGCGCCGCGCAGCTCGAGCAGGAGATCGAGGACATGGGCGGCCA
CCTCAACGCCTACACCTCGCGGGAGCAGACCACCTACTACGCCAAGGTGCTCGACAAGGA
CGTGCCACGCGCGATGAATGTCCTCGCCGACATTTTGCAGCACTCCAAGCTCCAAGACGA
CCGCATTGAACGTGAGCGGGGCGTAATTCTCCGAGAGATGGAGGAGGTTAGTTCCCTGAT
GTGTATATGTTTGCCTGAGTTAATCACTCCTTTCCACTGCAATACGGATCTGTTTAGATG
ACTTGCTGCTCATTTGATTAACCTGCCTTGGATTTATTGCATCATGTGCTCTCTAGTGTT
TCATGAATATGTACTTCTTGTTTATTGTCATGTTAACTAATCTATTGAGTTCTCTGAGAT
AGTAAGAACTAATTTACATAGACTTGATTTCTTAGTGTTAGGAATTGTTATGAACTGCTA
TATGTAAGAAGAAGACATCTGGAAAATGGGCATTTGCTATCAAACTGATTAAAACCATTA
TGGATATTGATTTAAGAAAAAAACATGTATTGGGTGCTTGTGTTTTTTGAACTTAATTAC
TTAAATTTGCAAAATAGGTCCTCACAGAAAATAAGAACCGATCAAAGGCCTAATTTCTCA
GTACGAGGCCTTGTTCTAGTTGTACCAATGCCGCTGCAGACTTAGATCTTAGCAGGGAAG
CCAAAATTGGCATTTTATATCAAACCGTCCCAATCAAGCTGGTTAAGAGTTTGGAGCATA
AGTGAATATTGTATGCCTGTGAAAAAATATTTTGAATTTGCTGAGAAGACTATTCAAGTA
GAATAGAATGTTGCACGGCCATAGTGTGTTTAAATGGACCACCCTGCAAGGTTCATCATG
CATCCAAGTATCCAACAGATGCTTTTCTCTGAAAAAAGTACCTTATATGGATGCAAATAA
CTTAATTCAATCCTTGAGTTTTATGAGCATACAAGTTTGATGTTCTGCTGTATCATTTAC
AGATTTCATTTTGGATTCAGTAAGTTGTTGTTAGGCATGTCAAGCTGCAACCCGGGCGTG
CAACATTTCTGAGATGCTATTAATATTTGTCTTGCTGTGCTTCTTGAGCCCACATTTATT
TTCTGACTCTCCTATGATGTAGGTTCAGGGACAGTCTGAGGAAGTTATATTCGATCATCT
CCATGCAACTGCATTCCAGTATACTTCTCTTGGCAGGCCAATCTTGGGTTCTGCTGATAA
CGTCAAGTCTATCACCAAAAAGGATCTCGTAGACTACATTCAAAATCATTACACGGCTTC
TAGAATGGTACTTTAGATTAAAAATCTGTGTCTGTGATACATTCGGATATCTGTCATTTT
GTTGTATTGCTATTAACGTAGTAGGATGGAGTAACTCCTATTCGTAATTAACATTTGTTT
TTGTTGTTTTCAGGTTATTACTGCCGCCGGTGCTGTTAAGCATGATGATATTGTACAACA
GGCAAAAGAGCTGTTCAAAACGCTGCCAACTGACCCTACAACAACCAACATGTTGGTTGC
TAAGCAGCCAGCCATTTTTACTGGTTCTGAGGTATGTATTTTACTGTAAATTTATTGGTG
CTGTTCAAATCATTGATTATTTTATGCTACTCAATAGGTACGAATCATTGATGATGACAT
GCCCCTTGCTCAATTTGCTGTTGCCTTCAATGGAGCATCCTGGACAGATCCCGATTCTAT
TGCATTAATGGTTATGCAAACCATGCTTGGTTCCTGGAACAAGAGTGCTGGAGGAGGGAA
GCACATGGGGTGGGTTCCTTCCCTATTATGCATCATTTCATCTTGTCAGTTTCCTTGCGT
ATAACCAAGTCCCTTTGTCAAACATCACTTCAACAGCAATCCACTGATCATATTTTACTT
TGTTATCCTGATTTATTGATACAGTTCGGAGCTTGTACAGAGAGTAGCAATCAATGACAT
AGCTGAGAGTATAATGGCATTCAACACAAACTATAAGGACACTGGCCTGTTTGGTGTGTA
TGCTGTCGCTAAGGTCAGTCTTATATTTTCTTCTTTTGTATTGAGGGTTAATGAAAGCAC
TTCTTTCTGTATGTTTTTTGTAGTGACACATTGCTTGAAATGTAAGTCATTAGTGATGCA
AACATCTACACATGACTCTAATAATTTCACAATATCACAAAATGGGTGAGAGCATGCCTA
AGTTCTAGCACTGGATTCCTGTGGAAATGGTCATGCACCATGTTGCTGTTCTGTGTCAGT
TGCTATTCTGGCATCTGCTTGTTTGTGACTTTCTAGCACAGTGCATCTTTTGGCAATTTG
GTCTTGTGTTGTTACAGTATGAAGGAAATAATGAAATTTGACAGTTGTAGTTTCTCATAT
GGAAAGTAATGAAATTCATTTCTGCTGATTTTGCCTTGAAGCAGCAGTTGAAACAAAACT
ACAAAGGGGATTTTGCCCCCACTGAAAATATTGTAGCCCTTCTTTGGAAATGTAAACTCT
GAAGGCTCAAATATCTGGACGAGAAACGAATAAGCCTGCCAACTCAAATGTCTGGATGAG
GAACGAATAAGCCTGCCAATGTCAGTTCAATGCGAGCAAATAGATGTGCCTTCATTGAAT
TTATTGTAAATTAAAAATTGAATGCTGATCATTATTTGTGAACATGTTCCGGTGGTATAT
AATGATGTGTTCTGCATTTGTTTTTGCCTGATGATGTTCTTTGACCTTGTTTTGTAGCCT
GATTGCTTGGATGATTTGGCTTTTGCAATTATGCAAGAGATGAGCAAATTATCATACAGG
GTTACCGAAGAGGATGTTATTCGTGCACGTAATCAGGTATTTCTTTCAACGAGGCTGAAT
AATATGTACTAGCATATTTTGCCTTTTGTGTACTAGTTAGGAATCATAGGTGTATTCAGA
TATTCTGTTTCTCGATTATTGTTGAATTGGGACATATGTATCTTCCATTGAACTTCACTG
TCTATTTTTCTGAGTTGACATTGCTTTGATTTGATGCTTTCAGCTGAAATCGTCCATCCA
ACTACACCTTGATGGCTCCACTGCTGTTGTTGAGGATATTGGACGTCAGGTATTTTGATG
TAATTATGTAATGTGACATGATATTCTCGACGCGCATCCTCTGGAACTTGATCTTTGTTC
TCTGTTTTGTCAGCAACTCATCTATGGCCGTAGAATTCCTATTCCCGAGCTTTTTGCGAG
AATAGATGCAGTTGATCCCAGCACTATCAGGCGTGTTGCAAACCGCTTCATCTTTGACCA
GGTAATTGTTGTTTTGCCAACTTGCCTTGTTTTATGTACTCCCTCCGTTCCTAAANNNNN
NNNNNNNNNNAGGTTTCATTAGTGGACTACATACGAATGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNCACTTATTTTGCTCCGTATGTAGACTACTAGTGAAATATCTTAAAAGACTNNN
NNTTAGGAACGGAGGGAGTAGAATTTTGGATATTCCATTGCGTTGATAATGCCGGAAAGT
GCTGTGGAAACCTAAAAGTTCACTTGCTTTAGATTACATCCTGCTTATGAGGAGGCTGTC
AATTGCTACTGATAGACCTCTAATGATAAGAGTATATTTTTTCCTTTTATTGGAATATTG
ATATCTGGGTGATATGCTTTTGTTTTGTTGTGAATAATGCTTGCTGTACTAAATTATGAA
GTACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGACATTTTAGTTTGCATTTACTTCTTAATTGTGGC
ATTGATATCTTGAGGAATATTTAGTTGGAACAGTAACCTAACTTGATAATATGATAGACT
GCATTCTGTATATTTTTTTGGTGCCTGAAAATATATGTGCTATATGGGAAATATTACTGT
TATATTCTGTATATGTCGCATGAAGTTCAGAAGCCGTTGAAATACATTAAACTCACGTCT
TACTGCTGTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCAGGATATTGCCATCGCTGCCATGGGA
CCAATTAAGACTCTTCCAGACTACAACTGGTTCAGACGCAGGACCTACATGCTCCGTTAC
TAGATTCAACCAGCAGTGTACCATGTTTACAGTCTGCAAAGGCAAGATGATTGCTTGTTT
TGGCATCAGTATATTATAAGGCCACATCCACGCACATATTATGTGCCGAAGTGGAGGAAT
TTTTTGAGTCTTCGTTTTCCTTGCCCCTGTCTTCCTTTTGCAAACCCACAAAGCTGTCAA
TAATGGTAGGCAAATTCGACTGACGTGTTTTATGATGATGATGAATTGTCACGATACTTT
TCCATCTTTGTGTTCGGATATTGTTGTCTTTCGGCCAATAATTTTAATGAAGCTTATGTA
AAGATGGTGGCTGTTAGCTTCAATATGATCTTCTGGGAACTTTACATCGTTGTAATTGTT
GTGATGAGATGTCTGTTGTAGTCTAGGGACGGCGCCATCTTGTGTTGTGCTTTGTCTGTA
TTGCTCGTCCCTTTTCTGCTATCCTTCTCTCGATAGCTAATACTTCCTCCGTTCCTAAAT
ANNAGTCTTTTAAGATATTTTACTAGAAGCGGAATAAAATGAGTGAATCTGTATATATAC
ATCTGTATGTAGTCCATTAATGAAACCTCTTTAAAGACTTATATTTAGGAACGTAGGAGT
AGGATTTATTCTTACATGCTAGGTTTTCCTCTTCTGAAGAATATACGATGTGAAAAACTA
CATCTAAAACAGCAGCGTTGACCAGCCTCTGACGATTCTTTTGCTGAGAGTGTAGTTGCT
GCTCAGAGCGGCAGCACGAGCGCTAACTTTGGCGCTGGTTACCGCTTCACTTATTTTCTT
TTGAGGGATGGTTACCACTTAGGAGGTGTTTGGTTGTGGTTCCGTTAATGTAAATGGTAA
GGTAATGAGGTTACGCCCCATTGTGGCTGTAATGGAAATTTTGCTGGTTTTGTTTGGATC
ACTCTGGTAACGGTAACACAGAGTACAGAGAAGGTATACAATCAAAGATACGATGGCGGC
GGCGGCGGCCGTGATGGTACAACAGCAACAGTTGTGGTGACGACGTTCGGGCGACAGTGA
TGGAACGACAGCAGCGGTGGTGGCGGGGG