Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_134447 (4945 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_134447

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_3939 1 1245 bp None Available Available None
MLOC_3938 1 1601 bp MLOC_3938.1 Available Available LOC_Os07g37750.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13107.m03888 protein ATMIN7, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_3939






CDS Structure of MLOC_3938






Contig Sequence (4945 bp)

>contig_134447 4945 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCGGCCGGCGAGAGGAGGGGAGGGCCGAGCGCGGCGGCCGCAGGAGGAGGGGTGGGGCG
AGCATCGGGCGACGGGGCGAGAGTGCGAGACGAGCGTGAGAGAGCTGGGCCTTGGTCAAA
GTCTAATTTTTAATACAAAATAAAAAAAATTCCAGATTCTGGGTGGGCCAGGGCCCACCG
TGCCTATACGCTGGATCCGCCAGTGGAGTGAGCACATCTGAATGGTTTGCGTGGGGGCAT
GGCGCCATGAATAAGTGGGGGAGAAACAGTAAACTTAATAGAAAATTTGTGGGGGAAGTT
TGGGGGCCTTCCTCAGATATATGTTTGGCAGTGTTAGAAAATGCCATAGCTTCTGCTTGC
AGTGTACTAGAGCTATTCTGACGTTCTGGGTGGCAAAATCCCAGTTGCACACATTAGCAG
TAGTAGATATGTCATTTCTGAGAAAAAGATGGGGAAAGGTGCATGTTGGTGCCAAGGGGA
ACAACTGCGAAGAGGAAAAACCCGCTCAGCTCAACAATTAGCAATGCATCATGGCATGTG
GCACTTGAACAATATGATATCAGCACATCAATATTTTTATTTGTCTATACAATGAGGCAG
ATATATAAATATGTCTAAAGGAACAGTGGAACACAAATATTTTCGTTTTGAACATTTGCT
CATCATATATACTTAAATGGCTGATGCCCGCTAACTCTAATTTTTTCAACATGCAACTAT
GCCAACCCACCATGCCACCATGCATGACAAAAGGCCCAGCTTAACGCGCACCATTCATGC
TACTCATATTTAATAAATATTCTACAACTGCTCCCTCCGTCCCAAAATTCTTGTCTTAGC
ATTGTCCAAAAATGGATGTATCAAACTACTAAAATATGACTAGATACATTCANNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGGACGGAGGGAGTATATAATAATAATCAAATACATTAT
ATTATGTATTTTAATTTCAGATTCTCATACCGTTAATCTAAATACTAATGTTTCATACAA
CCAAATGTAACTGAAATAATTGCGCATAATTCTTGCAGCAACGTGCAGGGTATAATCTCT
AGTGTTTTAGACATCTGATCCAGTTAGCAAGTAATCAAAGGGACAATCTCACCCAGTCAC
AATAGGCTAAACAATCTGGTGTTTCCTTGAGTTTGCTTTTATGCACCATAGCTTTGTAAA
AAGTGGGAAAAGATTCAGTGTGTTCCATTTACCCAAATATTTCTGTACAAGCTGGAGCCA
TTTTATTGGCCTGCATCTAAACATCAGTTTATCATCCATTAGAAGTGCTAGTGTGCACAG
CAACATCAGGGATCTTTTACTGTTATTATTTGTCATGCCATGAAAGTAGTAGGCCATTGT
TGCTAATAACTTGCCATCTATATGTGTACGTGTAGGTGTGGGCCAGAATATGGTCGGTGT
TGGCTCAGCATTTTATTGCTGCTGGGAGCCACCATGATGAGAAAGTTGCTATGTATGCCA
TTGACTCACTGAGGCAGCTTGGCATGAAGTACCTGGAACGTGCAGAGCTGAACAAATTCA
CATTTCAGAATGACATACTGAAGCCTTTTGTTATTTTAATGAGGAATAGTCGCAGCGAAA
AGATCCGTGGTCTAATTGTCGACTGCATTGTTCAGGTATGTCATTATGCACTTTCTTTTG
ACAATCAATGAAATCTAATGACGTAGGCTTTTATACCAAATAGTGCTAAGTAAAAAAATG
TTGTATGAACCTGCAGCTGATCAAGTCAAAAGTTGGTAGCATAAAGTCAGGTTGGCGTTG
CGTGTTCATGATATTCACTGCAGCAGCTGATGATGAGAATGAATATATTGTTGAAAGTGC
TTTTGAAAACGTTGAACAAGGTTAGTTTTAAAATAACCTGTATAAATGGCATGCTAATTG
CTTTTCCCCCAACTTATATTTTAACATTATTGTTTTTCCCCCTTCCTGGCCTAAATTTTG
AACTGAATGGATGTGCTTTGCAGTTATCTTGGAACATTTTGATCAAGTTGTTGGTGATTG
CTTCATGGATTGTGTTAACTGTCTTATTGGTTTCGCGAATAACAAATGCACTCCTCGGAT
TAGTTTGAAGGCTATTGCTCTCCTACGTATATGTGAAGATCGTTTGGCAGAGGTTGGGAC
AATGAATACCCTTTGCTGCACATAATCATTTTGCAACCCTGTTAATATCTGCAGTTCTGT
TGCACTCTTATTTATGGAAATGACTTATCTTTCCCTCATCCATTTCTTTGTATAGGGGTT
TATTCCTGGTGGTTCTGTTAAGCCTGTTGATGTTCTCCCAGAGGCCAATTTTGATGTGAC
GGAGCATTACTGGTTTCCTATGCTTGCTGGCTTGTCTGATCTGACCTTAGACTCCAGACC
GGAAGTTAGACATTGTGCTCTTGAAGTTTTGTTTGATCTGCTGAACGAGAGAGGACATAA
ATTCTCCTCTCCCTTTTGGGAGAGCATTTTCCATCGTGTACTCTTTCCTATATTTGATCA
TGTAAGACATGCTGGAAGGGATGGCCTTTCTTCCGGGGATGATTGGCTTCGTGATACTAG
CATTCATTCTCTGCAGTTAATCTGCAACCTTTTCAATACTTTCTATAAGGTAAGAAATGC
CTCTGTCCTTTTGACTTTAGTTGCTTAATGGAAATCATTTGGATCTTTTGGAACACCAAT
ATCACGAAAACTTTTGATGTTAGTAGATTTACTTCATTTTTGTATCCATAGTACTTGCTA
TATTTTCAGTTGTCTACTTGTCCTGCATGTAGAAGAGATCCAACTGGAAAGTTGTTTGGT
TGGTTATCATCTCATTGTGATTTTTCAGGAAGTGTCATTTATGCTTCCACCTCTACTGGG
CTTACTGCTAGAGTGTGCCAAGAAAACAGACCAAACTGTTGTCTCAATTGCTCTTGGAGC
TTTAGTTCATCTAATAGAGGTTGGTGGTCACCAATTCAGCGATGGTGATTGGGAAACACT
ACTAAAGAGTATTAGGTATTTTTATCAAACTCTTCCTTGTAAAATGTACTCCCTCTGTAA
ACTAATATAAGACCGTTTATATAGATCACTAAAGTAGTGATCTAAATGGTCTTATATTAG
TTTACAGAGGGAGCATTTATCTTTCATATATTAATGTTGCTTTTAACATTGCAGGGATGC
ATCATACACAACACAACCCCTTGAACTCCTCAATTCACTAGGATTTCAGAAGACAAACAA
TCAACATTTACTTCCAAGAGAATCTGAGACCGATGCCAGTAGTTACCATGATATCAGGGA
AGGAGAAGCATCGATAAGTAATAATGGTGAACAGGAGGGTCATCAGGAAACAAGTCCGCA
GATTGGATTGGAAAGTTCAGAAGGTACAGTAAGCTAAAGTATTCCTCTAGTTGTTTTATA
CACCCAGCAATACTTTCATATGAATGGAATACTGAATATGTTCCACATATCTAGGTTTGC
CATCACCATCTGGGAGAGCACAACCTGCAATATCCCCACCTAATCAAACCTTTGGACAAA
GATTTATGGGAAATATGATGGGTAATCTCTTGGTCAGAAGTCTTACATCCAAATCAAAGG
CCAAAATGGACGATGCTGCTCCACCCTCACCTGCAAAGGTGCATGTTCTTTCCTCTTGCC
CATATTGATTAGGTATCATTAGTTATGTATATACTATTATATGAGTACAGCTTTTTGGTG
CTCGAGCTCCATGGAGTTTTTTTTTGAAAAATTCAAAATTCACATTTCAAAGAAGGGGCA
GCCCAGTGCAAGTAGCTCCCCGCTTGCGCAGGGTCAGGGGAAGGGTCCGACCACTTTGGG
TCTTTTGTATGCATATTTTCCCCACATTTTTGCAGGAGACTGTTTCCAGGACTCGAGCAT
GTGTCCTCATGGCACAAAATTCACATTTCAGAGTTTCAAAAAAATTACATATTGACATAT
GGAATACCTTGACACACGAGCTACACAAAAATGACAAATTGCGATTTTGAAAACAATGAC
CAGTGATTGTACTGTTCACCATAAACAACGCTTTTCACTTTCTTCAGTTTTTGTTTAGTT
CGCGTGCCAATCTATTTTTCTCATGAAATTTCAAACACATGTAGTATACATCTATATGTC
AGTATGTTATTTTTTTCAGAATTTTTTGAAACTTTGAAATTTTCAAAACAACCGAGTTCC
ATGGAGCTCGAGCACCAAACTGTGTTTTCTGCTATGAGGACATTAATAGATTACATGTAC
TGTAGGTGTCATTAGCACATATGCCTCTAGGCGTCTGTTGCTTGCTATATCTATCTGCAC
ATAAACCTCACCAAAGTGTGGTAAATAAAATGGTTTTTCCTGTGCTTCACACAAAACATA
GGTTCTTGGTTTAACTTGTCGACACCCGAGTTCATTGGGTATGTGAATAAGGATAGACGG
AGTTATATAAAGTACTGAATATTATATTGTAAATCGACATGTTTAGATACCTTTGGAATG
TTACTACTTTGTTGCCATGCTAGGCAGTTTTGGACCAGTTTTCTTGGCCGGCTTAAAAAA
TAACCTGCCTCTGCCCAGCTTAAAAAAAATAAGCCGCCCCCTAAATTTGTTGAAACTTCT
AAATTTGTTATCCCATAACTAGCTTTGAAGCCCTAATGAATAAGAAAGGCGGCTTATGAA
AAAAACTGGGGAGGAGGTGGCTTATTTTTTAAGCTGCGAGAAGAACTGGCCCTATATATA
CTATGAATCATAATCAGTATATATATGACCAAATAAAATTGAGTTTCTTCCCGTCTCTTT
CTTCAACCGACATCTTGTCCATTTTAAATCAATGTTCTCAGCACCTGTGATTATAGTTGT
AACCTGCCATAAGTAATATCTGTGCTAGGCTGAGCTGGCATCCATGAAGGAGTTGTGCAA
CCTATTGAATTCAATATGCTGAAGC