Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_131992 (4529 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_131992

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_3606 1 105 bp AK251514.1 Not available Available None
MLOC_3608 1 170 bp MLOC_3608.1 Not available Available None
MLOC_3609 1 1124 bp MLOC_3609.1 Available Available None
MLOC_3605 1 238 bp AK251514.1 Not available Available None
MLOC_3607 1 1013 bp MLOC_3607.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_3606






CDS Structure of MLOC_3608






CDS Structure of MLOC_3609






CDS Structure of MLOC_3605






CDS Structure of MLOC_3607






Contig Sequence (4529 bp)

>contig_131992 4529 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTACAAATTATATGCATCGAAGTATTTATCTCTGCAGTTTTTTTGGTTTCAGTTTTTTTT
TGGCACCTTAGGCTCACATGGGCGCCAAGGTGCAGTCTTTGCAGAAGTTGTTCACCCCGA
AGGTCGTTTCTCCAAGGCCTCACTAGCCATCAAGCAGGATCGCTCCATCAAGGTATCTAC
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TTTATTCACCATTGCGGTCATACTAAGCAGTTATGCATGCTATAATAGGTGTCTTCCTTC
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TGGTAGTATATGCAGAGTCGATGGCCATGGTGGAAGAGGACCCTGAGCATCACTGGTGCC
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ATTTGCATCTTAGTTAGTGGAATAATCTGTTTCGATGGCAACTTGCCATAGACTATTCGC
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TCTACGCTCGCTGTACATTTTTTATTTTGATAATTAGATTGTGTGTATAAAGATTTGTGT
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TCATATACGGTTTGTTGAATCATTAGATTTTCATCTTTAGGAACAAATCATTAGAATATA
TATGTCCCGCTTGCAACACATGTGCAATTGACTATTTCTAAACAAAAGAGGTGAAAAATG
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TTATTTTTATACAGTATGAGAGAGGCGAAGATGGATTAGGTTGACGTTTAAAAAGAATCC
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GGGCATTCTACTAGTATATATATATTACAACCGGGCACGACTCTAAATAAAACCCAACAC
ACTTAGTCTCTTATCCAGCCCAACCCATGTTGGCTTTACGGTTAATCTAGGTCATTCTCT
GTCTCATTCTCCCCTATTCTAATCGATCCTATAGGCTCCCACGTCGGCCGCCGGCCGCCG
GCCGCCGCCCCTCGATCGATCTACACCCCGGAGCGTCGCCGCACACCCTCCCCTATTATC
CACTGTCCTGGAACGCCGCCCCACACCAGATCCGTGCGACCCTCCATCCCGGCGCGCCGC
CCCTCGGCAACACTCCCCTGCAACCCTGCTTCTGTGGTGCGCCGTTCCTCGTCACTGCTC
CCCTGCGGCCAACTGCGTCTGCTACCTCTACACGGGGTCCTGCGGCTATGGGGAGAGTTG
CCGCTACAACCACCCTCGCGGTCAAGCTGTCGTGGTGAGCCGGGCAGCTCCTCTTCTCCC
AATTTTATTACTCCATCTTGCTTTGCTTGACTTACGACTTGCCAGTCCCTGATGATGACC
AACAGGTTGAATTAGAGCTAATTGGTGCGAAGGGGAGATTCCAGCTGAAGCCTCTTGTTG
TGACTGAATTGATACAGTTTGTCATAGATTTTTTTAAAGATACAGAAAGATTCCAGCTGA
AGCCTCTTGTTGTTTAGGCCTGATCGGTCACTATGTCATACAGTCATATTTCTGTTGGGA
AGATCCTATTTTTTACCACAGTATTACAACTCAAGTAGGTAGTCATGCTCATTTGTTCCA
ATGAGTTGTAGAAGTGAAAACATCCGCGACTGTTGTATCACCTATAGCCATCTACTCAGG
TCTAACCACCATAACTTTGATGTTTGTTAGTTGTTACGCAATGGGCTCACTTCTTTCTAA
TCAAATATGCTTGGTGGACTAATTGGTCGCATTGCCCTGCCTCCACCCATGATGTAAGCA
CTAGGTCTACTAAATTGCATGCATAACAGTAGCCTAATTAACTTGAATGTGTGATGCTTG
AGTTTGTGTGCCAATGCCTACATGGGTGTAGGTCCACGATTAGTTTAATATCAGCATGGT
GGCTATTTCCTTATACTAAGAAGTTTATATAATTATGCGTACATATAGTCAGCCGGTGTG
ATACATGTGCGAAAGCAAAAGCTGTTAGC