Map Locations of contig_131741 (2836 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location No map location




Predicted Genes from contig_131741

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_3577 1 241 bp AK375388 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_3577






Contig Sequence (2836 bp)

>contig_131741 2836 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTGCTACTCCTGTCATTGTCCCTGCTTGCCAGACGGGCGCGCTGGTGGTGGTGCCGCGAG
GACGACGAGGGGTGCTCCCTCATGGGGTTCAGGGGCGATGACTTGCCGGCCACCGGAGGC
AGGATCAGGTGAGCCTCCCTTTCCCCCTACCCGCACGCCCTGCTTGCTTGGTGTGGCTGC
TTCTCTTGGTTCGTTGATTCGTTCTAGGTGCTTGCGTGGCTGGTAGTGTCGTTGTGAGAC
GGAGAGGAGGAGAGATCCGTAGCCGTTGTGAAATATCGATTTAATTTGGCCCTTGTATTA
ACTGCAGTATTACCGTGACTCTGTACCTGATTAACCATCTTTGTGTCCACACAGTTTTGA
ATCAACTGTAATTTAAGGCGAGATATAGTGAGACATTCATTAAATAATCATAGGAGCAGA
TGAAAATCCATGGCATGTATAGGAACCATATCTATGTGAGATACTCGTACTTAATACAAG
ACTCTGCAAATTTACTCACGCATGCTTTTGTATACTTCGGAAGAAAATTTGATGAAAGTG
AAGACAAAATATGTGAAACTGTTACCTGAAAATACTCTGTTCCATATATTGGAAGTTCAG
AAAGTAGCCATGTTTTTAGAAGGAAGTATGATGCATCTGGTTTCACATGAAATGTTGTGG
TATAATATGTGCCGTGAGCCCGTGAATTTGGATCTTCTGTTAAGTGTTAAAATTGTTTTC
CCTCCACTTGCCATTGCAGTGAAAAAGGCAGGTTCAATTTTTGGTTCGCAAGCTGTCCTG
AGAAAAGGGCATCAATGGAGGATTTCTACGAGACAAGAGTGGATGATGTTGATGGAGAGA
CTGTTGGGTTGTTTGGCGTATTTGATGGTATGTGATGCCTTGTGCCAGTTTTTCAATATT
AATTATTCAGTGTTTTCATATATATCTTTTCGATGGATGGGGAATATATCTAGAAGATGT
TCGTTTCGTCAATGAAATTGTTTTGTGCATAGACCAAGATGGTAGTTTTTTGTATCAGTA
CATCAACTATCAATGACATGCTTCATTTGTTATTGTTCTAGCTAGAGCCCGCAGATTTGT
TAACATTTATCTTAGCCAAATGTATTAGTAAATTTTGCTGTGGTGCTGGACACATTACCT
TGAAAATAAAATATAAAAATGGGATGAACTGATCCAATCTAAGGGGCTACCAATGCTAGC
CTGCATCTTAGTAAGTGGGGGATCGTTTGAACTTTAGTATCTTGCTGAGATATATATGCT
GTCCTACTGTTATGGGAGAAAACTAGTGCACAATCTTGTATAGCTAGGAAATGGAAATAC
TCACTCTGGAAAGATAAAATCTTATTCTATTGTGATAATCTTGGAGGCAAAATCTTATTC
TATTGTGATAATTTTTCCAGTGTACCTCATGACCTGTGAATATATATTTGTTTTGATGTT
CCAGAATGGCTACAGAGCTAAAGAAGATTTTCACCGAACAAATGCTCTTAGCTAACCCCT
AGGAGAGCCCTTCTCATTTTTGTGTTCTGTCATGATATTGCAGCTTACACCATGCATGGC
GTTATATGATACCATGCTAAGCCTAAAGAGTCAAATTGGTAGCCATTGCCTGGGCTTTGC
ATTCAACCTGGNNNGATTCATTCTTGCAGCTGGTGAAAAGATATTACACTTACATACCGA
CTTCCTTCTGGAATTGTTTATTTTTTATACCAACCATAATGCTTGTTCTGCTGCTATTTA
TACCGTATAGCGTTCACGTACTGGTATGCCTCTTTGCCGTGTTTCACTTCAGTCACCTGC
TGGAGCAGCTCAAGGCCAGGTCTGGGCTTTAGCAGAAGCTTACTCATCAGTTCGTTGTTA
AAAACCCATATGGTGTACAATTATTGTTGTTATTGCTGAAGTATCTTATCATATGCTTCT
TTTCTCCTACAGGCTGATGATATAGAAAATGAATCAAACAAACTTAATCGGATCAAGAAC
TATCTTTATGGCAAGCTAGTAGAGCACACAGGTCAGTCTGTTGAAAAGGTCAGCATTTTC
TGTTGAATGTTCCTGCCACTCTGTCGCACATCACGTGCAGTTACAGTTAGCTTTCAGTTA
CTCTGCAAAAGCGTATTAGCGTTTCCTGCTTAATCTCACTATGCCTAAGAAGGCTTTGAT
TTGTTCTTGTTTTCTCATATATCATACTAACAGAAATAATCTGATGTGAATACTGTACTG
CCACTTTGCCTATATGCACAACATACTTTCCCTATAGGCGCAACATTTTACAGATGCAAC
AAGGTTGATCTCCACAAATACGATCCTAGCTGCATTCCTCTCATCTCAAGTCTTTGCTTA
CTTTGGGTTAGTACACGAGCGCCGGCCCTTATGCGCAGCCTCTCGTTTTGCTTGTTGTAT
CGATATTGTGCGGTGTGGTGCTGCACATTCGCCATGTGTTTGTTCAGTCCTCATTTTAGG
TGGTAGTTGACTAGCTACGCTTGCTGTGCTTGCTCATGTAATTATCTCTGTCGACGTACC
AATTGACGGATGATTCCGAGTTTTGATGATCGCGTCGAGTGGCTTTGTACATTTGTGACC
TCTATATAACTTTTCGATGGATTGGGAATATTTAGAAGATGTTCGTTTCGAGTGGCTCTG
TACATTATTGACCTCTATATATACATGGTGCTTTGTGTATTTGTTGATGCTTTATTAATA
TAAATTATATTGTTGGCATAAGTGGTCTTTCTTATATGTGATGCTTTGTTAATACTTAAG
AACATGCCTGATGACCTGTTTGATTCAATTTGGTTTGCTTTCTCAAACATAAATATCCAT
ATGCAAATGTCGGTCT