Map Locations of contig_131463 (9148 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_131463

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_3525 3 2278 bp AK250433.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_3525






Contig Sequence (9148 bp)

>contig_131463 9148 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATTTATATATATATAAGATAAAAAAACCCAATAGGTTAAAATTAAGGCCCTGTTTGGGAC
TGCTTTAATTCACTAAAATCAGCTTCACTTCATGAAATTCACTTTGGAGCAGTTTCATAC
AGAAGCTACAACACTATCAAGAGAGTGTTTGGCTTCCATCTAGCTCGAGCTTCAAGAATA
AAAAAACTGGTGAAAAGAATCTATTTGATTAGTTGATGGAAAAGAAATGAAGGAGTATTC
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CGGTCCAAATAATAGCCGAACAGGCTGAAATCGGCCCAAATAACGGCCTAAAATACTAAA
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AAGGACCTCCTCTCCGCCCCCTCCTTCCCCTTCCATCCTCCTCTCCATGATTCCATTTAT
GGTCGCGTTTCGCCTTTGTTTTCTTCAAATTTGTGCGACCAATCTGAGACGCCGCAGTTA
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TTGCTTGCTTGCTCGGCTTGCCCATGATTATTTTCTCGTGACGGCTTCTGTTTTGGACTG
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GTTGGTAATTTCAGTTGTACGTTATGTATGATGCTATGGTAAACCTAATGCACCTCCTTA
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CTTACTAGCTGTAATCGTCCTAAGATTGGTTTTCTTGGTTGAAATATTCGATGCCATGTT
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TCCACATCTTTCTTGCCAAACTATTGTGAGGTGCAAATGATGTTTACATTAAATATTGGT
GCTTCCTGTTGCCATTTAACTTTGCAATCCGATGATTGGGTATATGTTAGCACAGCATCT
GTTGCAGAGCATTAGGTGTAGGGTCAAATGGTCAGTGATCACATGATACTGGAGGAGCAT
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TGACTTTGGCTGGACCCAAAATGTTGATAGTATGGGCTGCAGTGTGTCATGGCAAATATA
TGTGCTTACATGGCCATGATTTTTAGAAGGGCCAGAACTACCCATTCACCTATTGTGCAA
TAATTTGGAGAGACATGTAGGATTCCAAACCTACGCTTCGTAACCACTCCAATTAGGATA
CAAATTGCCTATTTCTTATATTGTCACCTTTTCCTCGATTGATTATTGCCGCAGCACAAC
CTTCATAGCTCTGTCGAGGAACTAGTTACCATGACCCTGGTACAACCATAGGTTTTGGCA
TTGCAAGCCACATCTACTCAATTTACACACCACATCATATTCTGCCATTATTAATTCATT
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CTGTTGCTATTATACTGCTGAGCCCGTTGCTTTAAGTGAACTGCTGCTGATAGCAAATTT
GTTGAAGTAAACTCTCGTTGCTTTATATTCATGGTCCTTTTGCAGCTAGCAAACTTGCTA
GGCTTATTTGTTCTGCTGATTATTCATTGGACTAATGCCAAGCTTGCTTGGAGACTTGGG
ATCAGAGTTGATTCTCTTACAGCTCGGCCATACTCACTTTGGATGATCACGCTATTACTG
TTATTTGCTATTCATTTAGGATTCTATGTCACTGTACTGGAATGTCTCGAACATCAGATT
TGAGGAAATTCTCGAGAACTGACTGTTTTTTGGTTAGGTCAGAGCCACTATCTAAGATGC
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TTATTTTCTCTACATACATTGCTTCTTTGTTATGTCTTCTTACTAACCCCCTTTATTTGT
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TGACCTTGGCCTCCACATTGGGAAGGTGAGTAGCAACCAATCATGGCATCAAGGGCAATC
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CTTGAGCAAAGCTTAGGGGACTCGAAGTCTGAGAAGGAGAAGGAGCAATATAGTGTCAAT
TTTACAAAGGGGGGTCTGCTAGGTCCTGATAACGGGCTTCTGCGACGTCCAGCTCACGTG
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TGTTGCTGTGTTCATTGTTGTCCCATTCATGGAATTCCTACTACCAGTGTTTCTTAAGTT
GTTTCCAAATATGCTGCCATCAACTTTCCAAGACAAGATGAAAGAAGAGGTTTGTGATGT
AACCACTTGAATTACTAAATGTCTTGGTATGATTATACCGTTCATTAATGTTTTTCAGCA
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CTGTTCTCTCGCCGGTAGATGTGCAGTGCAGTATCATTATGATTCCATGGCTTCTTACCC
TGTTGTAGTCCATTTCTGCTGATACGGCAGATTTAGTGTATCACATTTGAATCGTCCTCG
TAGTTCCATTTGTATAGGAACTACCAACATAACTACTTTGCATATTGATTGTCTCATGAA
TGTAGCCCACTTTCATGTGCAGGAAGCGTTGAAAAGGAAACTGAAAGCAAGGATGGAGTA
TGCAAAGTTTCTACAAGATACTGCAAAAGAAATGGCAAAGGAAGTTCAAACATCACGTAG
TGGAGAAACAAAACAGACAGCTGAAGATCTGGACGAATTTTTAAACAAGGTATTGCTACC
AGCTCTTCTGTAATTCAGAGTGCCAAATCCTTTTAAATGTATATTATGAATATCCTTATA
TTTTGTTGGATAATTTACATTAAAGTAAACTGCAATCAGGTTAGGAAAGGTGAACGTGTA
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TAAGCACTATTTTGTGTTATGCGTATATACCCGGAACCACCAATTTTGGTGATAAGCCCA
TGATGGAGACATTAGGTTCTGTAATTCTGTTATCATTTTTCAGAGCTTACCAAACAATCA
TTCAGATTAGAATTTCAAGTGGGTGATCTAATCTTGTAATACATAGCAGTATGTATTATG
ACATGATCACCAAAAGGGTAAATTGTGTATATGACTTCTCCTAGTAAAATAAATGAAGTT
ATTCAGCGGATATTTTGGAGCACTTTATGTTAATTCATACACGAAGAGAAAACACATAGT
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GAGTCTGCATTTGAATAGATCTAACATGTTCTTGACTCAAACTGTACATAACGTTCAGCA
TATATGTTTATTTACTGTAATTATAAGATGGTCCTGATAACTTATCATTTACTGGATTTT
CCCTTTGTCTTACTGTTTTTGACATTTATTTCAATGCAATCTGGCATTTATGTTTAGAAT
TGTGGTGTAAAAATGTAAAATATCTGTTCATTTCTTGCTAATGATACTCTCACGTATGCA
GCATTAAGAATGATGATAAAATGATTCAAGCTGAGGGTGTTGATTCTCTTTCTGAAGAGG
AGCTCCGGCAAGCTTGCCGTGATCGCGGTCACCTTGGTCTGCGGTCAACAGAAGAAATGC
GTAAACAGGTTTACCAGCATCATTCCTGCGATACTCACAATTTCAAGAGAATACCTGTTT
GTTTTGTAGCTTTTTCAGACTGTACATCAATGTGCTATTCAGTGCCATGATGACCTATTA
TCCTAGTAGTTACCATGTTCTTGGTGTATTATAGTTTATTTATTTGTTTTCATTTTTCTT
GCTGCCATTATATTAGTTTATCCTGTTGCACTGTTGAAGGAAAACAACATCCATTACCTC
AGCTTCCACTTAGAATTAAGCATATCTGAAGTTGGATTGCACTGCCTTTCACCACAACTT
CTGTGTGTTCAATTTTTTAATCTGCTACCTTGTAAATGGATATTAAACTTTGGTAGTAAT
TCCTTGCAATTTTATTTTCTGCCCAGCTACGAGACTGGCTGGACCTGTCACTTAATCATG
CTGTGCCATCTTCTCTTCTCATACTTTCAAGGTAAATTTGATTATGTATTTCCCATTGGC
TAGTGGCTAGAACAGCTCTGTTAGGACTTGCGCCCTTATTCATCTTTGCTAATGCCGTCA
GAGCTTTTACCCTGGCTGGGAGAATGAAACCCGAGGATGCTGTTGTAGCAACATTGTCTT
CTTTGCCAGATGAAGTTGTGGATACAATTGGGACAGTATTGCCATCTGAAGATTCAGTTT
CTGAGAGGAGGAGAAAACTGGAATTCCTTGAGATGCAGGAAGAACTTATCAAGGTGTGTA
ACATATAAGATTGATTGTATTGTTTTTTTATGTATAGGTTATCCATACTAAAAAATTGCG
TACTACTTTACGTCGTTTGTCAATGCAAGTATGCAACCATGATACTTGGCATAAGTATGA
AACCCACACTGGTAGTACGTGTGATAAGCTAACACATGAATGCTCTCTTTCAACCCGGCC
TTCATATTTGTATTTTTAGCGGAGCGGGCACGTACTGGCTCCTTATTTTATTAGCTTGTT
TATCTGTTGTTAATTCAGACACTCATTTACCTGATGTCCTTTTTTTTCCTGACACCCCAT
GGTAACATATGTACCCTGCACTGCTTCAGATTTTGGAATGTGTCTAATATCCTGTCATGC
CCTTCTTCTTGTAATTGAACCTCAAGAGTCTTGCCTATTCATGTCCTCCTTGTATGCAAT
ATATGTATTAATATTTAAAAAGCATGTGCTATTCCATGGTAAAAGTAGATTATGTCTAGT
AGAAAGGGCATATAACTAAAATGTCATTGTGGAAGTAAAATTTTGTCTGAACTCTTGATA
TGCCTTTATTTGTTACTTAAGGCCATGTAGTGTAGTGTCAACTGTCAACATATCATATCA
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GGGCTTGTCTAAAAGCAGCTGTGGTTGGGCTGTGCTGGAAAAGCTGTTATGGAGCTGTAC
GGTCATTTGGCAAACTAGCAGTGAGAGCTGTGGCTGTGTGTGAGAATGTCTAAGATGCAC
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CATCAAAGCCGTGAAAGCACCGCCCGACCAGCTTTGCATAATATAAACAAGCCATTGTTT
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CTCAGCTGTTACCTGTTTATTTTAACTTTAGCGTAATGCTGCTACTGACCATGTAATCAG
TTATTTTAATGCTTTGTATGAAAATATTCAGGAGGAAGAGAAGAAGAAAGAGAAAGAAGA
GAAGGCAAAACAAAAGAAGGAAGAAAAGGCAAATCTCACAGAACAGGAGGCTGCTGAAGA
AGATTTGGCTTTAAAGGAAATGACTGAGCCTACTGCTAGGGAAGAAGAAGAACTGACTGA
CGCAAAACGACATGACAAGGAACAGCTCTGTAATATCAGTCAAGCATTGGCTGTGCTGGC
ATCTGCATCGGTATGATCCTAGTCAATCTGTATTTCTGCCAGTACTTTGCGGACTCTTAG
TGATAGTGCATAATTACTTACATTGCAGTCTGTTAGCAAGGAGCGTCAAGAGTTCCTGAG
CCTTGTCAACAAGGAGGTACGATGTGAATTTTTGAAGTGGGGTCAGAGTGACATATACCA
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GCAGATAAAACTATATAACTCCATGCTTGAAAGAGAAGACACAGAGGGGGCAGAAGAAGC
TAAGAAGGCATATATGGCTGTTAGAGGGGAGTCAGACGACACCACAGAGGTTGCTTCAGA
GGAAAAGGTCTCGTCGGCGCTGATTGACAAGGTATGTATTTCTTCCATGCTTGAAAAGTC
AAAGCTTGTAACATTCTGGTTCTATTGGTACACGATATATTTGCTTTGGTTCGCTGTTTA
AGGTAATTGCTTTTTCCCTGACTCCTGTTGGCTACCGATGACTAGCTTGAGATGCAGAAA
CAGTTAAATTAATTGGGCACAATTTTGTCAGATAATGATTTACTTCTTTTCCTTCGTTCT
TAGGGTATGGTAACATCTTAAATACTTTTCTCAACAGTTGTAGAAATAAGCATTGTTTGA
TTGCGTGCTGTTGGCAATTTATGTGATACTCACTCTGTAAACTAATGTAGGATGTTTTAT
TTGAACTGCAAAAACGTCTTATATTAGTGCACAGAGGTGGTACAAGCTTAACTGTTACCC
ATTGGTTCCTACTTTGGAGTGAGTATATGGGTTAACTGGCCTTGTATTCGGCCTTATACC
CAGTTGTTCCGGTAACCCGGTGACAGTATGTGGTACCAGTTTTCGCTCTAGTAGTCTACT
AGACCTAGTTTGGTTTGATTCCGTTGTTAATTGGAGATAATAAACATAACAAACGGATCT
CTTCATCATAAACTGTATCCTAAATTAGACAGTATGAATGGATCTCTTCATCATAAACTG
CATCCTTAATTAGTCCTGGCCTGCATATACTGTTGACACGTGCTTGATTGAATTTCACCT
TTATTTTACGTGTTCATTTGGTACGAAATGCTGAACTAGCATCAACAGAGTTATACTACA
AGGTTACTGTGTTACTCCCTCCGTTTCTTAATATAAGGTGTATTAGTTTTTCAAAAAGTC
AAAGGATGTCTATGTTTGACCAACTTTATAGAAAAATATATAAACATTTACAATACTATA
AATACAAAATATAAAAATATATTTCATG